1TEQ | Genus

Total Genus 72

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	72
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__38637448497173654__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__38637448497173654__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/1TEQ/X/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__38637448497173654__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"38637448497173654","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/1TEQ/X/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__38637448497173654__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Structural and Kinetic Characterization of Active-Site Histidine as a Proton Shuttle in Catalysis by Human Carbonic Anhydrase II pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase II
total genus	72
structure length	258
sequence length	258
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2004-05-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
X	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	1teqX00

1DMYA 5DVXA 1ZH9A 1CVDA 3TVOX 2VVAX 5E2MA 1XPZA 2NNSA 3DD0A 4JS6A 3V3GB 1BNTA 4Q07A 3ML5A 1KWRA 2NWOA 2WD3A 4Z0QA 1I91A 5SZ5A 1BN3A 5AMLA 1G54A 5DSLA 3JXGA 4KNMA 4YHAA 4PZHA 1LG6A 4E5QA 3BL1A 1CNYA 3P44A 3MZCA 2NNOA 1BNNA 1CIMA 1ZSBA 4CNVA 4KNJA 4YGNA 3MNIA 1CNBA 4L5WA 3DC9A 1BZMA 1I90A 4LP6A 3S97A 3IBUA 3MWOA 4QJMA 3P55A 3M5TA 2FMGA 5DSPA 1UGCA 1TEUX 3P3HA 3ZP9A 4QK3A 3SAPA 1F2WA 3RZ8A 2QP6A 4ZAOA 5J8ZA 3OY0A 4Q7VA 2IT4A 1THKA 5L6KA 2X7TA 4YGFA 3IAIA 4IDRX 4R59A 3M04A 3P4VA 1BNVA 3P5LA 5AMGA 3T5UA 3U47A 5EZTX 1Z93A 1FLJA 4Z1JA 5EH7A 4MDLA 2H15A 1OQ5A 5JEGB 1RZAA 3RYZA 1AVNA 5EKJA 1MUAA 3MHOA 2NWPA 4E9OX 3S78B 4RIUA 1G52A 4WW6A 4Q08A 3OYQA 5FLRA 3D8WA 1H9NA 4ZX0A 4YX4A 3DA2A 5JGTB 4Y0JA 3JXHC 1RZEA 4YXUA 3DV7A 4COQA 4WW8A 2FOSA 3M2XA 3V3IB 4QSBA 4FRCA 3MNKA 1HCBA 1CVCA 1G3ZA 5E2KA 4RN4A 1CALA 4KV0A 2CBAA 3K7KA 4Q6DA 4LU3A 1AZMA 4RFCA 5SZ1A 3PJJA 4MLXA 1CAKA 4HT0A 1TG3A 1CNKA 3KLDB 1CNHA 5BRVA 4QIYA 3VBDA 1V9IC 3IBNA 4BF6A 3OKVA 1YO1A 3DCCA 4Q78A 4RIVA 1YO2A 5JDVB 3M1QA 4KNIA 2EZ7A 4FVNA 3T5ZA 4MDGA 2FOUA 1TG9A 1UGFA 4QY3A 3IBLA 4CNRA 5G0CA 1CCTA 4YVYA 2FMZA 4KNNA 4DZ7A 3F4XA 4QSAA 4YXOA 2X7SA 3JXFA 3TMJA 3KWAA 3IBIA 3UYQA 3NB5A 1BNMA 5FLQA 1HUHA 4Q7SA 3NJ9A 5DSOA 3V2MA 3R17B 5FNKA 7CA2A 3DVBA 1UGAA 1HVAA 4Q8XA 5DRSA 4HT2A 3T85A 4QSIA 3DC3A 3DAZA 4Q81A 1FQRA 1BNWA 1CVHA 3SBHA 1G1DA 4MLTA 1CAJA 3CA2A 3SBIA 4JSWA 2FOVA 3S9TA 3EFTA 4Q99A 3M3XA 4Z1NA 3HKQA 3M67A 4R5AA 4YGKA 3RYJB 3KONA 1TB0X 5JEHB 3N4BA 3ML2A 2GEHA 4QTLA 2HOCA 3RZ0B 3M98A 4HF3A 5SZ3A 5FNLA 4TWMA 4WL4A 1JCZA 4TWLA 3U3AX 3KNEA 5A25A 2F14A 9CA2A 1CINA 4ZWYA 1UGEA 1I9PA 4XIXA 3PO6A 1I8ZA 4XFWA 3F7UA 4QJXA 4XZ5A 3F7BA 1CVFA 3MNHA 1CAZA 4Q8ZA 2NNVA 5EIJA 3RG4A 3SAXA 5JG5B 1ZSCA 4E3DA 1CAOA 4Q8YA 3OYSA 5JEPB 3RYVB 12CAA 3D93A 5DOHA 8CA2A 5FL6A 5FLTA 1CAMA 3M1JA 5G03A 3M1WA 1Z97A 4Z1KA 1HEAA 3T83A 1I9NA 1DCAA 1FQMA 3NI5A 5DSKA 1CVAA 2POUA 4WR7A 4K0SA 4QK1A 4Q49A 1Z9YA 1OKNA 2Q1BA 1RJ5A 1G53A 3Q31A 4RUYA 5E28A 4Q7PA 5E2RA 2W2JA 3V7XA 3C7PA 4KP5A 1ZGFA 2EU2A 5DSIA 2ABEA 3MNAA 4WUPA 1ZFQA 5IPZA 4HU1A 3HKUA 1G48A 4IWZA 1CILA 3L14A 5FDCA 2WEGA 4FPTA 5FLPA 3D0NA 3MYQA 2WEOA 4QJPA 3R16A 1TE3X 3QYKA 1IF6A 5FL4A 3W6IA 4K1QA 3T84A 4ZWXA 5E5UA 4Q6EA 1CVBA 3HKNA 1J9WA 1BNUA 5EKHA 1CNXA 1DMXA 3K2FA 3M5SA 4KUVA 4PQ7A 4YXIA 4M2WA 1IF5A 2FNNA 4KUYA 1KEQA 4RH2A 1CNIA 3M14A 1YO0A 3RG3A 2X7UA 4M2UA 4M2RA 4E4AA 4QJWA 3HFPA 5EHVA 3M40A 2FOYA 4HBAA 3DD8A 2NNGA 5DSNA 1FQLA 1EOUA 4ZWZA 3P5AA 3HS4A 4UOVA 3MHLA 3RYYA 1V9EA 2NMXA 2CABA 1RJ6A 1CAIA 1OKMA 5L3OA 4E3GA 1XEVA 3MHMA 4CQ0A 2Q38A 1RZCA 4QK2A 2QOAA 5DSRA 1I9OA 5C8IA 3S76A 5EOIA 4E3FA 1LG5A 4BF1A 4HEWA 1BV3A 2NN7A 1YDCA 4HEZA 1G45A 4KUWA 5FNHA 4GL1X 2EU3A 4Q09A 1HEDA 2HKKA 3KKXA 5A6HA 4QSJA 5HPJA 2HD6A 2VVBX 4QJ0A 3RZ1B 3OIMA 4L5UA 4G7AA 2AW1A 3S77B 3S75B 1KWQA 1OKLA 4Q06A 2OSFA 3OIKA 4N0XB 5FLSA 5SZ4A 2CBDA 2POVA 4KP8A 3HLJA 4YYTA 1Y7WA 1XQ0A 3M5EA 4CNWA 3RJ7A 4FL7A 2NXRA 4LHIA 3MDZA 1BNQA 4JSZA 4K13A 1HECA 1CA3A 4ETQC 4K0TA 4M2VA 1IF8A 4ZWIA 3M2YA 5FNGA 5DSJA 2CBEA 5SZ6A 3K34A 2WD2A 2H4NA 4Q87A 4ITOA 5LMDA 4N16A 3RZ7A 1HCAA 1LZVA 3CYUA 4G0CA 1KOQA 1T9NA 3FW3A 1CRAA 4X5SA 2O4ZA 3RZ5A 5E5RA 5CLUA 1CAHA 1UGBA 3M1KA 4JSAA 4R5BA 5E2SA 2WEJA 1A42A 1FR4A 3MHCA 3RYXB 4E3HA 2ILIA 2GD8A 4RFDA 3S73B 5SZ0A 5BNLA 1CA2A 3V5GA 1HUGA 1ZNCA 3ZNCA 3S71B 1ZSAA 5AMDA 4Q9YA 3V2JA 3HKTA 1FSNA 4ILXA 1FSRA 3OKUA 4Q83A 5BRUA 5JESB 1BN1A 5EH8A 2FNMA 1I9QA 3M96A 3IGPA 1ZE8A 3N3JA 3S8XA 3N2PA 4QEFA 4Q90A 1TH9A 4L5VA 3LXEA 4YGJA 3KOIA 2ZNCA 3B4FA 3S74B 1IF4A 1UGDA 4BCWA 1G0EA 1KOPA 1RAYA 3M2NA 1URTA 4FU5A 4MDMA 2OSMA 3RLDA 5DSQA 1CCUA 1IF9A 3OILA 4CA2A 3TVNX 3D92A 3RGEA 5E2NA 1YDAA 5G01A 3U7CA 4CNXA 4DZ9A 5SZ2A 4XIWA 3MHIA 5FNMA 2POWA 3PYKA 3CZVA 3DCSA 1FSQA 5FNJA 1CNGA 1JV0A 1HEBA 2NWYA 2NXTA 4PXXA 1CAYA 3T82A 4ZX1A 2NXSA 1G4OA 2AX2A 1XEGA 4RUZA 3M2ZA 1RZDA 4FIKA 1MOOA 5EH5A 3DBUA 3FE4A 5CJFA 1RAZA 3D9ZA 1UGGA 3W6HA 1CNJA 1LUGA 4CACA 3MNJA 2WEHA 2Q1QA 3N0NA 1CZMA 3DVDA 4YWPA 4YGLA 2FNKA 3IEOA 3B1BA 4RUXA 5EHEA 1TBTX 3P3JA 2CA2A 2CBCA 1TTMA 3BL0A 4XE1A 4Q0LA 5JG3B 3UYNA 4PYYA 1I9LA 5FNIA 1IF7A 1ZGEA 1AM6A 1I9MA 1RZBA 3P58A 5EHWA 3U45X 4ITPA 2HNCA 1BCDA 4E49A 5FDIA 1CCSA 3BETA 1DCBA 2FW4A 1LGDA 1TEQX 5FL5A 5G0BA 3V3FA 6CA2A 1G46A 1CANA 2HFWA 1G6VA 1BN4A 1H4NA 4MO8A 2CBBA 4WUQA 5CA2A 1G4JA 4KAPA 5DOGA 5EKMA 1G0FA 3KIGA 1CRMA 4QJOA 3EFIA 5CACA 3GZ0A 1BICA 3DVCA 5JQ0A 1CNWA 3V3HB 3KOKA 5SZ7A 1FR7A 1YDBA 5BYIA 3F8EA 2NWZA 4Z1EA 5JGSB 2QO8A 3CAJA 3MMFA 4MTYA 2FOQA 1CNCA 3V3JA 1JD0A 4K0ZA 4QIZA 5JQTA 4JSSA 4C3TA 5FLOA 5DSMA 2NN1A 3DCWA 4FVOA 3KS3A 2HL4A 4PYXA 4HEYA 1ZFKA 3FFPX 5BRWA 1CVEA 1H9QA 4Q7WA 3S72B 3MNUA 1YDDA 1FQNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1DMY A;  5DVX A;  1ZH9 A;  1CVD A;  3TVO X;  2VVA X;  5E2M A;  1XPZ A;  2NNS A;  3DD0 A;  4JS6 A;  3V3G B;  1BNT A;  4Q07 A;  3ML5 A;  1KWR A;  2NWO A;  2WD3 A;  4Z0Q A;  1I91 A;  5SZ5 A;  1BN3 A;  5AML A;  1G54 A;  5DSL A;  3JXG A;  4KNM A;  4YHA A;  4PZH A;  1LG6 A;  4E5Q A;  3BL1 A;  1CNY A;  3P44 A;  3MZC A;  2NNO A;  1BNN A;  1CIM A;  1ZSB A;  4CNV A;  4KNJ A;  4YGN A;  3MNI A;  1CNB A;  4L5W A;  3DC9 A;  1BZM A;  1I90 A;  4LP6 A;  3S97 A;  3IBU A;  3MWO A;  4QJM A;  3P55 A;  3M5T A;  2FMG A;  5DSP A;  1UGC A;  1TEU X;  3P3H A;  3ZP9 A;  4QK3 A;  3SAP A;  1F2W A;  3RZ8 A;  2QP6 A;  4ZAO A;  5J8Z A;  3OY0 A;  4Q7V A;  2IT4 A;  1THK A;  5L6K A;  2X7T A;  4YGF A;  3IAI A;  4IDR X;  4R59 A;  3M04 A;  3P4V A;  1BNV A;  3P5L A;  5AMG A;  3T5U A;  3U47 A;  5EZT X;  1Z93 A;  1FLJ A;  4Z1J A;  5EH7 A;  4MDL A;  2H15 A;  1OQ5 A;  5JEG B;  1RZA A;  3RYZ A;  1AVN A;  5EKJ A;  1MUA A;  3MHO A;  2NWP A;  4E9O X;  3S78 B;  4RIU A;  1G52 A;  4WW6 A;  4Q08 A;  3OYQ A;  5FLR A;  3D8W A;  1H9N A;  4ZX0 A;  4YX4 A;  3DA2 A;  5JGT B;  4Y0J A;  3JXH C;  1RZE A;  4YXU A;  3DV7 A;  4COQ A;  4WW8 A;  2FOS A;  3M2X A;  3V3I B;  4QSB A;  4FRC A;  3MNK A;  1HCB A;  1CVC A;  1G3Z A;  5E2K A;  4RN4 A;  1CAL A;  4KV0 A;  2CBA A;  3K7K A;  4Q6D A;  4LU3 A;  1AZM A;  4RFC A;  5SZ1 A;  3PJJ A;  4MLX A;  1CAK A;  4HT0 A;  1TG3 A;  1CNK A;  3KLD B;  1CNH A;  5BRV A;  4QIY A;  3VBD A;  1V9I C;  3IBN A;  4BF6 A;  3OKV A;  1YO1 A;  3DCC A;  4Q78 A;  4RIV A;  1YO2 A;  5JDV B;  3M1Q A;  4KNI A;  2EZ7 A;  4FVN A;  3T5Z A;  4MDG A;  2FOU A;  1TG9 A;  1UGF A;  4QY3 A;  3IBL A;  4CNR A;  5G0C A;  1CCT A;  4YVY A;  2FMZ A;  4KNN A;  4DZ7 A;  3F4X A;  4QSA A;  4YXO A;  2X7S A;  3JXF A;  3TMJ A;  3KWA A;  3IBI A;  3UYQ A;  3NB5 A;  1BNM A;  5FLQ A;  1HUH A;  4Q7S A;  3NJ9 A;  5DSO A;  3V2M A;  3R17 B;  5FNK A;  7CA2 A;  3DVB A;  1UGA A;  1HVA A;  4Q8X A;  5DRS A;  4HT2 A;  3T85 A;  4QSI A;  3DC3 A;  3DAZ A;  4Q81 A;  1FQR A;  1BNW A;  1CVH A;  3SBH A;  1G1D A;  4MLT A;  1CAJ A;  3CA2 A;  3SBI A;  4JSW A;  2FOV A;  3S9T A;  3EFT A;  4Q99 A;  3M3X A;  4Z1N A;  3HKQ A;  3M67 A;  4R5A A;  4YGK A;  3RYJ B;  3KON A;  1TB0 X;  5JEH B;  3N4B A;  3ML2 A;  2GEH A;  4QTL A;  2HOC A;  3RZ0 B;  3M98 A;  4HF3 A;  5SZ3 A;  5FNL A;  4TWM A;  4WL4 A;  1JCZ A;  4TWL A;  3U3A X;  3KNE A;  5A25 A;  2F14 A;  9CA2 A;  1CIN A;  4ZWY A;  1UGE A;  1I9P A;  4XIX A;  3PO6 A;  1I8Z A;  4XFW A;  3F7U A;  4QJX A;  4XZ5 A;  3F7B A;  1CVF A;  3MNH A;  1CAZ A;  4Q8Z A;  2NNV A;  5EIJ A;  3RG4 A;  3SAX A;  5JG5 B;  1ZSC A;  4E3D A;  1CAO A;  4Q8Y A;  3OYS A;  5JEP B;  3RYV B;  12CA A;  3D93 A;  5DOH A;  8CA2 A;  5FL6 A;  5FLT A;  1CAM A;  3M1J A;  5G03 A;  3M1W A;  1Z97 A;  4Z1K A;  1HEA A;  3T83 A;  1I9N A;  1DCA A;  1FQM A;  3NI5 A;  5DSK A;  1CVA A;  2POU A;  4WR7 A;  4K0S A;  4QK1 A;  4Q49 A;  1Z9Y A;  1OKN A;  2Q1B A;  1RJ5 A;  1G53 A;  3Q31 A;  4RUY A;  5E28 A;  4Q7P A;  5E2R A;  2W2J A;  3V7X A;  3C7P A;  4KP5 A;  1ZGF A;  2EU2 A;  5DSI A;  2ABE A;  3MNA A;  4WUP A;  1ZFQ A;  5IPZ A;  4HU1 A;  3HKU A;  1G48 A;  4IWZ A;  1CIL A;  3L14 A;  5FDC A;  2WEG A;  4FPT A;  5FLP A;  3D0N A;  3MYQ A;  2WEO A;  4QJP A;  3R16 A;  1TE3 X;  3QYK A;  1IF6 A;  5FL4 A;  3W6I A;  4K1Q A;  3T84 A;  4ZWX A;  5E5U A;  4Q6E A;  1CVB A;  3HKN A;  1J9W A;  1BNU A;  5EKH A;  1CNX A;  1DMX A;  3K2F A;  3M5S A;  4KUV A;  4PQ7 A;  4YXI A;  4M2W A;  1IF5 A;  2FNN A;  4KUY A;  1KEQ A;  4RH2 A;  1CNI A;  3M14 A;  1YO0 A;  3RG3 A;  2X7U A;  4M2U A;  4M2R A;  4E4A A;  4QJW A;  3HFP A;  5EHV A;  3M40 A;  2FOY A;  4HBA A;  3DD8 A;  2NNG A;  5DSN A;  1FQL A;  1EOU A;  4ZWZ A;  3P5A A;  3HS4 A;  4UOV A;  3MHL A;  3RYY A;  1V9E A;  2NMX A;  2CAB A;  1RJ6 A;  1CAI A;  1OKM A;  5L3O A;  4E3G A;  1XEV A;  3MHM A;  4CQ0 A;  2Q38 A;  1RZC A;  4QK2 A;  2QOA A;  5DSR A;  1I9O A;  5C8I A;  3S76 A;  5EOI A;  4E3F A;  1LG5 A;  4BF1 A;  4HEW A;  1BV3 A;  2NN7 A;  1YDC A;  4HEZ A;  1G45 A;  4KUW A;  5FNH A;  4GL1 X;  2EU3 A;  4Q09 A;  1HED A;  2HKK A;  3KKX A;  5A6H A;  4QSJ A;  5HPJ A;  2HD6 A;  2VVB X;  4QJ0 A;  3RZ1 B;  3OIM A;  4L5U A;  4G7A A;  2AW1 A;  3S77 B;  3S75 B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1TEQX

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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