1A42A

Human carbonic anhydrase ii complexed with brinzolamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structures of murine carbonic anhydrase IV and human carbonic anhydrase II complexed with brinzolamide: molecular basis of isozyme-drug discrimination.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 78
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1a42A00
4FIKA 1IF5A 3B4FA 1CNIA 8CA2A 1I9NA 3P4VA 5DSLA 1TTMA 1BN1A 3JXHC 4YXIA 1UGGA 3DA2A 3M5SA 3DD8A 4Z1EA 1HUHA 3P3HA 1H4NA 1BNVA 5E2RA 3RLDA 5EH7A 4WW6A 1HVAA 3IBNA 4RIUA 1G48A 4FPTA 1RZEA 4JSSA 3S97A 4HT0A 1YO1A 3MNIA 1CA2A 1UGCA 4CNVA 2ZNCA 1FQNA 1V9EA 4QSAA 2VVBX 1CAHA 1TB0X 2FOUA 5FL5A 5BRUA 4Y0JA 5CJFA 2NMXA 3S9TA 3M67A 4JSZA 4IWZA 4CA2A 3RZ7A 4RFCA 4HF3A 3ZNCA 4E49A 3HS4A 2AX2A 4XIXA 1FSQA 4QIYA 1KOQA 2Q1QA 3DC3A 4N16A 5JDVB 1KEQA 1BNTA 4QJXA 2FMZA 2FOYA 3OYSA 4WUQA 5FLPA 3MHMA 3IBLA 4QJOA 1A42A 2POWA 3KOKA 1ZSAA 3GZ0A 4WUPA 3MHIA 3DCWA 1CANA 1CAMA 1CCTA 3JXGA 1I8ZA 4GL1X 4Q90A 5JGSB 1YDAA 5FNMA 4L5VA 4WR7A 4YXUA 5FL6A 3M5EA 4DZ9A 3OY0A 4QIZA 5E5RA 2NNGA 4HU1A 4KP8A 4PXXA 5E5UA 3MHLA 5DVXA 5IPZA 1G3ZA 3ZP9A 4Q8XA 1JV0A 1CNWA 3MNHA 4RH2A 4DZ7A 4QK3A 4LP6A 3M2YA 5C8IA 5SZ3A 5A25A 1HEBA 2WEJA 3K7KA 3PYKA 4YGKA 5FNKA 3NJ9A 4PYYA 1DCBA 3OYQA 1FQMA 4E5QA 5G0BA 3CAJA 4Z1NA 4FL7A 1G1DA 3N4BA 5EKHA 3U7CA 1RJ6A 3T84A 1CNHA 5E2KA 3UYNA 5FLOA 2GD8A 5DSPA 4YXOA 4E3FA 1CNCA 3RYXB 3KWAA 2NN7A 1YDBA 1G4OA 4Q7PA 4XE1A 3HKTA 5EZTX 4KAPA 4BF6A 4Q8YA 5DOGA 1CIMA 5SZ1A 1ZH9A 2HD6A 1CVDA 1BNQA 3MHOA 1RZCA 1IF7A 3OILA 4Q83A 3Q31A 4Z0QA 4QSBA 3SAPA 1G46A 4Q9YA 5JG3B 1CNBA 4R59A 1CVCA 2FNKA 4ILXA 3MNJA 4ZX0A 4Q06A 1EOUA 1YO2A 3DVDA 4UOVA 1AZMA 3D0NA 1ZSBA 4KP5A 2HNCA 3MNAA 2NWOA 5EH8A 2W2JA 3V3GB 2FNMA 4CACA 3RZ0B 4Q6EA 1OQ5A 5JQ0A 5AMDA 3FW3A 3TVNX 3W6IA 4Q99A 1IF6A 3IBIA 3M40A 2NNSA 3SBHA 2CA2A 3P5LA 5DSJA 5BRWA 4E9OX 4ITPA 5DSNA 5G01A 4FVOA 5CACA 3RJ7A 3IGPA 3V3JA 4M2VA 1CAJA 1ZFQA 5DSMA 1FR4A 4Q7SA 1F2WA 4E3DA 5EHWA 1G53A 2FMGA 1J9WA 1TEUX 1CNYA 4KNJA 4JSWA 3RZ8A 1KWQA 3P3JA 3PO6A 1BN3A 2NXSA 4G0CA 4YGNA 4MO8A 5E2MA 3DAZA 1CNJA 3RG3A 3K2FA 1RZDA 3D8WA 5JQTA 3DC9A 1THKA 1UGEA 3DVCA 4Q0LA 4QJ0A 4TWLA 4CNRA 5L6KA 4XFWA 4RN4A 3VBDA 3B1BA 1CVHA 1OKMA 4R5AA 5SZ7A 3SAXA 3K34A 1ZE8A 3T5UA 5LMDA 1RZAA 3M2ZA 5DSQA 1G54A 1G45A 3V3HB 1CA3A 4TWMA 1LZVA 4JS6A 3V3FA 3M1KA 5HPJA 1CILA 1RAYA 3M1JA 4M2RA 4G7AA 1BNUA 1ZGEA 5FLRA 3HLJA 1CNXA 2FOQA 1XQ0A 1DMXA 1HUGA 1FQLA 2X7UA 2QOAA 3N0NA 3MYQA 4RIVA 4KNIA 4QY3A 4ZWZA 6CA2A 5FLSA 3KNEA 5DSKA 3RZ1B 3T85A 4K0TA 3MDZA 3S74B 4MTYA 3S78B 5BRVA 1MUAA 5FDIA 3JXFA 1BCDA 3CYUA 3KONA 3DCSA 5BYIA 5EOIA 2WEGA 3F7BA 4YX4A 3MWOA 1ZSCA 5E2NA 5G03A 3V2MA 9CA2A 4Q8ZA 4YGJA 1BNNA 4HEYA 1ZNCA 3RZ5A 2NNOA 3M2XA 1CVAA 4Q07A 2ABEA 1TEQX 4CNXA 4RUXA 4YYTA 3P58A 5FNHA 1CINA 4YWPA 3CA2A 4Q08A 4XIWA 4Q7WA 4Q87A 4KUYA 3DVBA 2HKKA 1JCZA 3ML5A 3FFPX 5JEGB 4Q81A 2WEOA 4YVYA 3SBIA 1FQRA 2FOVA 1FSRA 4QSIA 5CA2A 2ILIA 1BNMA 1G0FA 1IF9A 1G4JA 3MNUA 3MNKA 3N2PA 2NWYA 4KUVA 4QJMA 5FL4A 3N3JA 3L14A 3QYKA 4HBAA 4KV0A 5JEPB 3TVOX 4CQ0A 2WD3A 3P44A 3MZCA 3M2NA 4ITOA 5EKJA 3OKUA 1OKNA 3D92A 5SZ2A 4QTLA 5FDCA 1I91A 3W6HA 4E4AA 1Z9YA 2IT4A 5DSRA 5FNJA 3KOIA 4RFDA 2POUA 5DSOA 4Q49A 1V9IC 4LU3A 5DOHA 2F14A 1CNKA 3HKNA 1TE3X 1TBTX 2CABA 4R5BA 3BL1A 3V3IB 4FRCA 2H4NA 2GEHA 2X7TA 1TG9A 1KWRA 3BL0A 2CBDA 1I9MA 1XEGA 1IF4A 4KUWA 1XPZA 3V7XA 3PJJA 3HKQA 4PQ7A 3R16A 2VVAX 1AM6A 4KNMA 3CZVA 5BNLA 4L5WA 1RJ5A 2OSFA 3DD0A 1CAYA 4K0ZA 4ZWIA 5AMLA 1LG6A 4KNNA 3IAIA 3NB5A 3TMJA 2NWPA 3OIKA 1DCAA 1I9QA 4PYXA 5J8ZA 4M2WA 4QJPA 5EH5A 3M96A 3RGEA 1CAOA 4K1QA 1CALA 1CZMA 4WL4A 3RG4A 5EHEA 1XEVA 3LXEA 4PZHA 1Y7WA 3F7UA 3MHCA 3D9ZA 1UGFA 4HEZA 5DSIA 1UGDA 5FNLA 3KKXA 1FR7A 2FOSA 3F8EA 1BN4A 1CVBA 2WD2A 3C7PA 5DRSA 5G0CA 3S72B 3U47A 4FVNA 4M2UA 4FU5A 4Q6DA 1HEAA 1AVNA 1TG3A 3S8XA 1H9QA 1CRAA 3M04A 4MDGA 5E28A 5FLTA 2FW4A 3MMFA 1MOOA 4Q09A 4K13A 4ZWXA 3F4XA 2POVA 3S77B 4COQA 4X5SA 1JD0A 1CNGA 3HFPA 1YDCA 1UGBA 5SZ5A 4LHIA 1Z97A 2CBAA 1CCSA 3M5TA 1HEDA 4QEFA 1G52A 2X7SA 5E2SA 1YDDA 2CBCA 2Q38A 3P5AA 3BETA 5EKMA 4YGLA 3RYYA 4ZWYA 4Z1KA 1KOPA 1FSNA 3HKUA 1DMYA 4N0XB 5L3OA 3DBUA 1Z93A 2HOCA 4RUZA 5JG5B 5FNIA 5JEHB 5JGTB 1G6VA 2CBBA 1CCUA 2OSMA 4IDRX 3M3XA 3RYVB 2QP6A 3V5GA 1HECA 1H9NA 4WW8A 3RYZA 2WEHA 5JESB 1FLJA 5SZ0A 3NI5A 1CRMA 2O4ZA 2EU2A 3DCCA 3DV7A 1CVEA 4QSJA 2NNVA 1YO0A 3D93A 3EFTA 3IEOA 3EFIA 2H15A 12CAA 3S76A 2EZ7A 2AW1A 3KS3A 4ZAOA 4RUYA 2NWZA 7CA2A 1LG5A 3S73B 1CAZA 5CLUA 3T82A 1TH9A 4JSAA 4YGFA 4Q7VA 4HEWA 3RYJB 3ML2A 3T83A 1CVFA 4Q78A 3M1QA 3KLDB 4CNWA 4ZX1A 2HFWA 5SZ6A 1ZGFA 3S75B 4Z1JA 1BICA 1BNWA 3KIGA 3M98A 2FNNA 1CAKA 3IBUA 3M14A 3P55A 3R17B 1T9NA 1I9OA 1URTA 3U45X 1RZBA 2CBEA 1I9LA 2EU3A 4E3GA 5EHVA 3FE4A 5AMGA 5FLQA 1G0EA 2HL4A 2NN1A 2NXTA 3T5ZA 4C3TA 4BF1A 4MDMA 1UGAA 3M1WA 3OKVA 4MDLA 1I9PA 4QK1A 1BV3A 1I90A 1OKLA 4QJWA 1HCAA 4XZ5A 4MLTA 4QK2A 5FNGA 1IF8A 2Q1BA 5A6HA 2NXRA 1LGDA 3S71B 4L5UA 1BZMA 5EIJA 3UYQA 4E3HA 4MLXA 4K0SA 2QO8A 3OIMA 1LUGA 3U3AX 3V2JA 1HCBA 1RAZA 4YHAA 5SZ4A 4BCWA 4ETQC 1ZFKA 1CAIA 4HT2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FIK A;  1IF5 A;  3B4F A;  1CNI A;  8CA2 A;  1I9N A;  3P4V A;  5DSL A;  1TTM A;  1BN1 A;  3JXH C;  4YXI A;  1UGG A;  3DA2 A;  3M5S A;  3DD8 A;  4Z1E A;  1HUH A;  3P3H A;  1H4N A;  1BNV A;  5E2R A;  3RLD A;  5EH7 A;  4WW6 A;  1HVA A;  3IBN A;  4RIU A;  1G48 A;  4FPT A;  1RZE A;  4JSS A;  3S97 A;  4HT0 A;  1YO1 A;  3MNI A;  1CA2 A;  1UGC A;  4CNV A;  2ZNC A;  1FQN A;  1V9E A;  4QSA A;  2VVB X;  1CAH A;  1TB0 X;  2FOU A;  5FL5 A;  5BRU A;  4Y0J A;  5CJF A;  2NMX A;  3S9T A;  3M67 A;  4JSZ A;  4IWZ A;  4CA2 A;  3RZ7 A;  4RFC A;  4HF3 A;  3ZNC A;  4E49 A;  3HS4 A;  2AX2 A;  4XIX A;  1FSQ A;  4QIY A;  1KOQ A;  2Q1Q A;  3DC3 A;  4N16 A;  5JDV B;  1KEQ A;  1BNT A;  4QJX A;  2FMZ A;  2FOY A;  3OYS A;  4WUQ A;  5FLP A;  3MHM A;  3IBL A;  4QJO A;  1A42 A;  2POW A;  3KOK A;  1ZSA A;  3GZ0 A;  4WUP A;  3MHI A;  3DCW A;  1CAN A;  1CAM A;  1CCT A;  3JXG A;  1I8Z A;  4GL1 X;  4Q90 A;  5JGS B;  1YDA A;  5FNM A;  4L5V A;  4WR7 A;  4YXU A;  5FL6 A;  3M5E A;  4DZ9 A;  3OY0 A;  4QIZ A;  5E5R A;  2NNG A;  4HU1 A; 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