1BNVA

Carbonic anhydrase ii inhibitor
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Structural analysis of inhibitor binding to human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
total genus 71
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bnvA00
1G3ZA 2CBDA 2FOUA 4FPTA 4RFCA 5JGSB 1HECA 1RZCA 1CVEA 3MHOA 3MNJA 5E2MA 4WW6A 3KS3A 3PJJA 1UGFA 2POUA 4KV0A 1I9OA 3KLDB 3T5UA 5CACA 5FNKA 5JESB 4QK3A 1CAZA 4C3TA 2HOCA 1KWRA 4Q6DA 4CQ0A 3HKQA 2WD3A 4WW8A 4WL4A 3MNIA 5DSMA 3P3JA 5E2SA 4Z1KA 1LG5A 4DZ7A 4PYYA 1FSRA 4K0SA 3MZCA 2FOQA 3MNHA 4BF6A 1G52A 5DOHA 3M3XA 4Z1JA 3KIGA 5E5RA 5FL4A 3V3JA 4ZWYA 4HT0A 3M14A 1T9NA 2EU2A 4PYXA 2CBBA 4Q06A 5AMDA 5EH8A 4ETQC 4Q0LA 3M5EA 2AW1A 3M40A 4LP6A 1BNWA 1TG9A 4CACA 1YDBA 5FL6A 3JXHC 4ZWXA 1BNQA 3NI5A 5DSIA 1TEQX 4HT2A 3MHMA 1CRMA 3SBHA 4QJXA 1BNMA 1Y7WA 4YGLA 2O4ZA 4Q8YA 1CNWA 3S73B 4KNNA 3M2YA 1YDAA 4M2WA 4QTLA 5BRUA 5DOGA 3MNAA 3D93A 2FOSA 1G54A 1Z97A 4QJ0A 5JDVB 3M1QA 2HFWA 5JEHB 2GD8A 1ZH9A 4M2UA 3RZ1B 5AMLA 1CINA 4R5AA 3BETA 5E2KA 4RIUA 4YXOA 3S9TA 1XQ0A 4Q49A 1BN1A 2FMZA 1UGDA 3P4VA 1IF8A 5LMDA 1UGGA 4HF3A 4YGJA 3RZ8A 5FLTA 1ZFKA 1OQ5A 5FDCA 4RN4A 4CNVA 3CZVA 3ML2A 5CLUA 4Q7VA 3S97A 1CAHA 1HCAA 3D92A 2OSMA 3S72B 2H4NA 4ZX1A 4KUVA 5DSRA 1IF9A 4MLXA 5EHVA 8CA2A 1THKA 3N4BA 5BRWA 1CNHA 4Q8XA 4G0CA 1G45A 5DSPA 1CNIA 3M1KA 3PO6A 3P44A 3U45X 3IEOA 4ITOA 5CJFA 3MHCA 4Z1NA 5SZ4A 4QJWA 1I8ZA 1CAMA 5G01A 5EZTX 1FLJA 3DCSA 2NMXA 1HEBA 2NNVA 4E5QA 5FNMA 1BNVA 4KUYA 3UYNA 2ABEA 2WEHA 4K13A 3VBDA 1G4JA 5EHWA 4X5SA 5JG3B 4CNXA 3P5AA 4ZAOA 1BCDA 1CCUA 4DZ9A 5DSQA 3S74B 3V3IB 3JXFA 4KAPA 3S77B 4E4AA 3K2FA 1CNKA 3D0NA 1RZAA 4KP5A 2QP6A 1AM6A 1I9MA 1G0FA 1YO0A 3U3AX 3S75B 3FW3A 7CA2A 3IAIA 1CNJA 5CA2A 4ZX0A 3DVDA 1RAZA 1CAYA 4IDRX 1CA3A 4Q07A 4JSSA 5SZ6A 3OYQA 5FLOA 1FR7A 4N16A 5EOIA 2CBAA 2HKKA 4Q99A 1CVFA 3S78B 2CABA 2FOVA 3DD0A 5FNGA 4JSAA 3HLJA 3C7PA 4PXXA 4L5WA 2WEJA 5EKJA 1BZMA 3DD8A 4FVOA 1I91A 4K0ZA 3K34A 4YWPA 4ZWIA 1FR4A 2CBCA 5FDIA 1YDCA 1G46A 1UGEA 1CNYA 4Q83A 1BV3A 4N0XB 5BNLA 3RZ0B 4XZ5A 1TB0X 4E9OX 4QY3A 5JQ0A 1HVAA 3N3JA 4E49A 2WEOA 3T84A 1H9QA 1CCTA 4M2RA 1G0EA 4RUXA 2QO8A 5SZ3A 1YO1A 4E3GA 3EFTA 1CIMA 4RUZA 4XFWA 1CAOA 4KNIA 1TE3X 2ILIA 1OKNA 4HEYA 1G1DA 1CAJA 4Q87A 3RG4A 4R5BA 4MDGA 3CA2A 5E28A 4YGFA 3B1BA 3MNKA 1UGBA 3M98A 1FSQA 1G53A 9CA2A 3M2XA 3MWOA 4QK1A 1TH9A 3KONA 1OKLA 3EFIA 4WR7A 1IF7A 4Q78A 1Z93A 5SZ7A 5JG5B 3V3GB 3FE4A 1MUAA 4CNRA 4LHIA 5L3OA 2IT4A 3D9ZA 4KUWA 4E3HA 1LG6A 4ZWZA 4L5UA 2NN7A 1HUGA 5JEPB 1EOUA 4MDLA 6CA2A 2NWZA 3RYYA 3F4XA 1CALA 1DCAA 5DSLA 4RIVA 2NXTA 5L6KA 1MOOA 1KOPA 3OIMA 4HEWA 3P58A 2NWPA 4QJPA 4YGKA 1LZVA 3HKUA 1CVCA 4TWMA 2EU3A 1V9EA 3M5SA 1XPZA 3PYKA 4K0TA 3QYKA 3HKTA 3JXGA 1RZBA 1CVHA 1CNGA 3MYQA 1RZEA 2CA2A 3TMJA 1CCSA 1CILA 4HBAA 4Q81A 3R16A 1ZFQA 5A25A 5EHEA 3SAXA 5JQTA 2NNSA 12CAA 1FQRA 2X7TA 2AX2A 3IBIA 1TTMA 1UGCA 3GZ0A 3HS4A 3MDZA 4PQ7A 5DRSA 5FNIA 3V2JA 3T82A 4Q8ZA 1J9WA 4MTYA 5EH5A 3U7CA 2HNCA 4QK2A 1G48A 1CZMA 5E2NA 3BL0A 1I90A 3UYQA 4KNMA 3MNUA 1CAIA 2ZNCA 4RUYA 3M04A 2X7SA 1H4NA 5EKMA 1CNCA 1BN3A 5FNLA 1HCBA 3DCCA 1FQNA 5BRVA 3R17B 1CANA 1AVNA 1I9LA 1YO2A 1I9NA 1CA2A 1CAKA 3HKNA 5DSOA 1CNBA 5DVXA 1BNTA 4Q9YA 5EKHA 5BYIA 4UOVA 3OIKA 3DBUA 3P5LA 1ZSAA 1RJ6A 5EH7A 1JV0A 3B4FA 3KNEA 3ZP9A 3RYZA 4BCWA 2Q1BA 3OY0A 2QOAA 1LUGA 4QIYA 4BF1A 3NB5A 1G4OA 4FVNA 1UGAA 4ITPA 4K1QA 3KOIA 4KP8A 3DCWA 3TVOX 4WUPA 3T5ZA 2NWYA 1RZDA 5C8IA 4E3DA 4PZHA 4Q6EA 1OKMA 4YX4A 1RJ5A 4Y0JA 3BL1A 5EIJA 1TG3A 3M1JA 3M96A 4KNJA 3RG3A 3M67A 1ZNCA 2FNKA 3M2NA 5FNJA 3V7XA 4Z0QA 3DVCA 4WUQA 2OSFA 1ZGFA 4QJMA 3RYJB 4YGNA 1LGDA 4MO8A 5SZ2A 1URTA 3K7KA 4Q7WA 1HEAA 3RZ7A 3F8EA 4JSZA 1JCZA 5G0BA 1HEDA 4RFDA 5DSKA 3DA2A 4CNWA 3IBUA 2X7UA 4TWLA 2W2JA 1KWQA 5JGTB 2H15A 3M2ZA 5J8ZA 1KOQA 4M2VA 5HPJA 1ZSBA 2Q38A 1ZE8A 3V2MA 4Q08A 4R59A 2GEHA 4Q7PA 3FFPX 4YHAA 3N2PA 1FQLA 2NXSA 4YVYA 3ZNCA 1BN4A 5DSJA 2CBEA 4Q09A 1F2WA 3MMFA 1CRAA 5G03A 2VVAX 1ZGEA 1BICA 2NNOA 1XEVA 1BNNA 3DC3A 1TBTX 3P55A 4LU3A 4YYTA 3S8XA 5G0CA 4RH2A 2POWA 4YXUA 1RAYA 4QSBA 2FOYA 1DMXA 2FMGA 2NWOA 3M1WA 5DSNA 3S76A 4FU5A 4QSAA 3CAJA 3MHIA 3DAZA 4YXIA 5IPZA 5SZ5A 3RGEA 3F7UA 5FNHA 3S71B 2FNMA 1I9QA 3OYSA 5FLRA 5FLPA 4JS6A 3V3HB 3DV7A 3DC9A 2FW4A 4FIKA 1HUHA 5E2RA 3LXEA 3RJ7A 3W6IA 3Q31A 1KEQA 3IBLA 5E5UA 1FSNA 4G7AA 5A6HA 4QEFA 4QIZA 2EZ7A 3T85A 4L5VA 1JD0A 2NXRA 3V3FA 3KWAA 3NJ9A 4MDMA 3M5TA 3RLDA 3RYVB 4COQA 1IF5A 1V9IC 4CA2A 1XEGA 4MLTA 3L14A 3IBNA 2WEGA 3F7BA 1I9PA 2VVBX 3OILA 3IGPA 3V5GA 4E3FA 3N0NA 3CYUA 4QSIA 4HU1A 1CVDA 1ZSCA 2F14A 4XE1A 4FL7A 3HFPA 1AZMA 4FRCA 3T83A 2NN1A 2NNGA 1H9NA 4Z1EA 2POVA 5JEGB 1IF4A 3TVNX 1G6VA 3SBIA 3SAPA 3OKUA 5SZ1A 4QJOA 1CVAA 3ML5A 3RYXB 1TEUX 1CVBA 2HD6A 3MHLA 5FL5A 1A42A 4HEZA 5AMGA 1BNUA 1Z9YA 3KKXA 4IWZA 4ILXA 3RZ5A 2Q1QA 4Q90A 1FQMA 5SZ0A 4QSJA 1DCBA 1CNXA 3DVBA 4XIXA 2HL4A 5FLQA 1IF6A 3W6HA 2WD2A 3D8WA 3KOKA 3P3HA 4XIWA 4Q7SA 1YDDA 3OKVA 1DMYA 2FNNA 4JSWA 3U47A 5FLSA 4GL1X
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1G3Z A;  2CBD A;  2FOU A;  4FPT A;  4RFC A;  5JGS B;  1HEC A;  1RZC A;  1CVE A;  3MHO A;  3MNJ A;  5E2M A;  4WW6 A;  3KS3 A;  3PJJ A;  1UGF A;  2POU A;  4KV0 A;  1I9O A;  3KLD B;  3T5U A;  5CAC A;  5FNK A;  5JES B;  4QK3 A;  1CAZ A;  4C3T A;  2HOC A;  1KWR A;  4Q6D A;  4CQ0 A;  3HKQ A;  2WD3 A;  4WW8 A;  4WL4 A;  3MNI A;  5DSM A;  3P3J A;  5E2S A;  4Z1K A;  1LG5 A;  4DZ7 A;  4PYY A;  1FSR A;  4K0S A;  3MZC A;  2FOQ A;  3MNH A;  4BF6 A;  1G52 A;  5DOH A;  3M3X A;  4Z1J A;  3KIG A;  5E5R A;  5FL4 A;  3V3J A;  4ZWY A;  4HT0 A;  3M14 A;  1T9N A;  2EU2 A;  4PYX A;  2CBB A;  4Q06 A;  5AMD A;  5EH8 A;  4ETQ C;  4Q0L A;  3M5E A;  2AW1 A;  3M40 A;  4LP6 A;  1BNW A;  1TG9 A;  4CAC A;  1YDB A;  5FL6 A;  3JXH C;  4ZWX A;  1BNQ A;  3NI5 A;  5DSI A;  1TEQ X;  4HT2 A;  3MHM A;  1CRM A;  3SBH A;  4QJX A;  1BNM A;  1Y7W A;  4YGL A;  2O4Z A;  4Q8Y A;  1CNW A;  3S73 B;  4KNN A;  3M2Y A;  1YDA A;  4M2W A;  4QTL A;  5BRU A;  5DOG A;  3MNA A;  3D93 A;  2FOS A;  1G54 A;  1Z97 A;  4QJ0 A;  5JDV B;  3M1Q A;  2HFW A; 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