1CIMA

The positions of his-64 and a bound water in human carbonic anhydrase ii upon binding three structurally related inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Positions of His-64 and a bound water in human carbonic anhydrase II upon binding three structurally related inhibitors.
pubmed rcsb
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 75
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cimA00
3S74B 1XEGA 3OKVA 1RJ5A 1IF7A 4PQ7A 3M3XA 3M14A 3HS4A 3MHLA 1ZGFA 2H15A 3OIKA 4RUXA 4E3GA 5DSNA 4QIYA 2WD2A 3SBHA 5SZ7A 4M2VA 5DSRA 3V3HB 4N0XB 2VVAX 3CZVA 2HKKA 3N0NA 5EIJA 1CNIA 3LXEA 5DSPA 3F4XA 1G48A 1MOOA 4YGNA 5DSIA 1TBTX 1ZSBA 2POWA 1CAIA 1G4JA 2FNMA 4E9OX 3S8XA 4QSAA 4HEYA 1Z93A 4YGFA 4COQA 4YXIA 1G0EA 4ZWXA 4TWMA 4YGJA 1TB0X 1FSQA 1UGBA 5SZ6A 4Q6EA 4RFDA 1TEUX 1BNNA 1BNWA 3MNHA 4PYXA 2QP6A 1Z9YA 3W6IA 3OY0A 5DSLA 3EFIA 4GL1X 5EHWA 3P55A 2POVA 1CAYA 2F14A 1LG6A 3ML2A 5E2NA 3ZNCA 1FSRA 1YO0A 3S72B 2FW4A 5CLUA 3DCWA 3M5TA 3MYQA 5DVXA 3MDZA 1LG5A 3P4VA 1JD0A 4KNJA 3T84A 1ZH9A 2CA2A 2ABEA 1CINA 5FL6A 5FLSA 3RGEA 4KNIA 5AMDA 5BRWA 3DCCA 4HT2A 4QSJA 1G54A 2EU3A 3T5ZA 5JGTB 5DSMA 1LZVA 2H4NA 4WUPA 2CBCA 4XE1A 4N16A 3S77B 4R5BA 3P44A 1CNCA 2GD8A 4RIUA 2NNOA 4XFWA 1V9IC 3P3JA 1CVAA 3S97A 5EHEA 5JEHB 4MLXA 3QYKA 4FL7A 4MDLA 4WR7A 3OIMA 5SZ0A 1BN3A 3RZ8A 4WW6A 5DOGA 1TTMA 3KONA 1HEAA 3B1BA 3S75B 2FNNA 6CA2A 3DV7A 5JG3B 4Q90A 1BNUA 1UGGA 4FRCA 3DCSA 1JCZA 5BRVA 5JEPB 1RAYA 3W6HA 5JG5B 1HEBA 3M40A 3RZ7A 12CAA 1H9NA 1RZCA 8CA2A 1HCAA 4Q07A 3JXGA 2NNGA 1EOUA 3KWAA 1UGCA 2IT4A 2NWPA 4M2UA 4BF1A 4YGLA 4Q08A 4Q8XA 5JQTA 2FNKA 3FE4A 4KV0A 1CNHA 4Z0QA 1BV3A 3MHMA 5DRSA 1ZGEA 4KAPA 5JDVB 3M2NA 4ZWYA 5DOHA 4L5WA 4R5AA 5CA2A 3Q31A 5EKHA 3DA2A 3M96A 3R17B 4JS6A 1JV0A 3HKNA 1XPZA 1ZE8A 1CAJA 1KWRA 2HFWA 3MHIA 1TG9A 1IF9A 1BCDA 1YDBA 1TEQX 2FMZA 4K0SA 4BF6A 2CBAA 4IWZA 1CA2A 4ILXA 3T5UA 2NWOA 1G52A 1RZEA 2X7SA 2AX2A 1CCTA 2O4ZA 3MHOA 3MNAA 2QOAA 3MHCA 4RFCA 1HCBA 1IF5A 1I9NA 5C8IA 4LP6A 4RUZA 1I9OA 1DCBA 1OKMA 4ETQC 1I9MA 2FOQA 4Q7VA 1DCAA 3RG3A 1CVEA 4Q0LA 4WW8A 1F2WA 1ZFQA 4JSZA 1ZSAA 3CAJA 3M98A 5BNLA 5FL5A 3V2JA 1CNBA 2FOUA 3U47A 4ZX0A 4QK2A 5FDCA 1A42A 5FNMA 1KOPA 4QTLA 5DSOA 5EZTX 3CA2A 5FLRA 3F8EA 4QEFA 3IEOA 4E3DA 4G7AA 4Z1JA 5FDIA 2QO8A 1IF6A 4Q49A 4JSAA 3UYQA 4Q99A 4CQ0A 3HKQA 3D0NA 5A6HA 1CRMA 3NB5A 4RN4A 1CVHA 4XZ5A 4MDGA 5AMGA 5FLPA 3KKXA 3T85A 3V2MA 1FQNA 4Q78A 3KLDB 1ZSCA 3RG4A 3MNUA 3MZCA 7CA2A 3PO6A 4Q8ZA 1CZMA 1OQ5A 1TE3X 2X7TA 3VBDA 5FLQA 3D9ZA 1AVNA 4RIVA 4QJOA 1KOQA 3M5EA 3C7PA 1CAOA 2Q1QA 1BNMA 2HNCA 5G01A 4MO8A 4K0TA 4QJ0A 4FVOA 4WUQA 4E3FA 3DVDA 3IBNA 4HEZA 4TWLA 3S9TA 5SZ5A 2Q1BA 5BYIA 1I9PA 1G1DA 2FOYA 1CA3A 1RZDA 2WEGA 4E4AA 2CBBA 5G0CA 2W2JA 1CNJA 1I90A 3M2ZA 2ILIA 3M1JA 3FW3A 3L14A 5JEGB 1FQMA 1BNTA 1HECA 3HFPA 3RYYA 3U7CA 4YYTA 5EH7A 3DD0A 4PZHA 3CYUA 4KP8A 5L3OA 3BL1A 4MDMA 1KEQA 3FFPX 4HEWA 4FPTA 5FNGA 1BNVA 1FR7A 2AW1A 3RLDA 1DMYA 1FQLA 3K2FA 2EZ7A 3KOKA 1CALA 5JESB 3OYSA 1THKA 4QJMA 4R59A 3RZ0B 4CNVA 5DSQA 3S78B 4YHAA 1ZNCA 3OYQA 5E5UA 4L5UA 2CABA 1BZMA 3V3IB 1BNQA 3DC9A 1MUAA 1HUGA 4ZX1A 3M2YA 5LMDA 2NN1A 5FNKA 4YXOA 5G03A 1V9EA 4FIKA 4HT0A 5E2KA 3TVOX 1AM6A 4CNWA 3MMFA 1TH9A 2NNSA 4MTYA 3OILA 4HBAA 3M67A 5FNIA 1CNGA 4M2WA 1RZBA 4L5VA 1RAZA 1CNWA 2NWYA 3UYNA 3MNKA 4Q87A 4Q6DA 4CACA 4E49A 3NJ9A 1CAZA 1Z97A 3RYJB 4C3TA 5BRUA 1CVBA 5EHVA 3K7KA 4IDRX 3DAZA 1I91A 3S73B 3KS3A 4QJXA 5JQ0A 4Q7PA 3D93A 1G45A 3T82A 1OKLA 5J8ZA 1CVDA 1CAHA 1URTA 4JSSA 5EH5A 3PYKA 1LGDA 3V3GB 2HD6A 1YDCA 4YXUA 3V7XA 1G0FA 3M2XA 3IAIA 3M1WA 4Y0JA 2EU2A 3EFTA 4Q83A 3RYXB 5A25A 1CIMA 3F7BA 3BL0A 4K1QA 4YWPA 2X7UA 3IBIA 2FOVA 5E2RA 3D8WA 3KNEA 3P5LA 4YVYA 5EH8A 5SZ2A 4K13A 1UGDA 1CANA 4Q09A 5SZ3A 4Q9YA 3RYVB 1G3ZA 4KP5A 1CCUA 3DC3A 3KIGA 3N3JA 3D92A 4K0ZA 1FR4A 4QJPA 4FVNA 3B4FA 5DSKA 1FLJA 4Q81A 3ZP9A 4HF3A 3DVCA 1DMXA 3RZ5A 1OKNA 4KUWA 4Q06A 3DBUA 5DSJA 3DVBA 5IPZA 5FLTA 2WEJA 3P5AA 3JXFA 4UOVA 3IGPA 1FQRA 2ZNCA 4QK3A 4QJWA 2NXTA 3KOIA 4RH2A 1I9LA 5E2SA 3V5GA 3M1KA 1BN1A 4PXXA 5G0BA 4YX4A 5CJFA 1CAMA 4KUVA 3P3HA 2HOCA 5E28A 1CCSA 5FNJA 4JSWA 5EKMA 4Q8YA 4QSIA 3V3FA 1YDDA 1CRAA 4X5SA 3M1QA 3SAPA 4XIWA 3HKTA 2NXRA 2VVBX 4ZAOA 9CA2A 1T9NA 5FNLA 4QY3A 3U3AX 3SAXA 5HPJA 4Q7SA 1CNXA 2WD3A 2FMGA 3OKUA 4KNMA 3F7UA 1RZAA 1XEVA 4Z1NA 3M5SA 2NN7A 1HVAA 2HL4A 2NMXA 1BN4A 1LUGA 2NNVA 2OSMA 1J9WA 3IBUA 4YGKA 1I8ZA 2WEHA 3TVNX 5JGSB 5AMLA 1I9QA 4M2RA 1CNKA 2GEHA 4ZWIA 4CA2A 3IBLA 3BETA 3T83A 5FNHA 3MWOA 1CVFA 4MLTA 4ZWZA 3R16A 3DD8A 3HLJA 3RZ1B 4CNXA 3S71B 4BCWA 5FLOA 1HUHA 4CNRA 1G53A 3MNIA 1CILA 4DZ7A 5CACA 1ZFKA 2WEOA 2OSFA 3MNJA 3N4BA 5FL4A 3RJ7A 3TMJA 1G46A 4LHIA 3GZ0A 5SZ1A 5L6KA 5EKJA 2CBEA 4KNNA 5EOIA 3NI5A 1HEDA 4HU1A 3N2PA 3V3JA 4Q7WA 3HKUA 1AZMA 4E3HA 3RYZA 3K34A 2NXSA 4QIZA 1YO2A 2NWZA 3SBIA 4PYYA 1UGEA 4QSBA 3S76A 5SZ4A 4KUYA 4RUYA 3M04A 1H9QA 1G4OA 1G6VA 5E5RA 1Y7WA 4G0CA 4WL4A 1RJ6A 1IF4A 1H4NA 5E2MA 1CAKA 3PJJA 4LU3A 4FU5A 4ITOA 1UGAA 3P58A 1CNYA 1FSNA 1CVCA 4ITPA 2CBDA 4XIXA 4E5QA 1KWQA 2Q38A 1BICA 4DZ9A 4Z1KA 1UGFA 1YO1A 1IF8A 4Z1EA 4QK1A 3U45X 3ML5A 1TG3A 1YDAA 3JXHC 2FOSA 2POUA 1XQ0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3S74 B;  1XEG A;  3OKV A;  1RJ5 A;  1IF7 A;  4PQ7 A;  3M3X A;  3M14 A;  3HS4 A;  3MHL A;  1ZGF A;  2H15 A;  3OIK A;  4RUX A;  4E3G A;  5DSN A;  4QIY A;  2WD2 A;  3SBH A;  5SZ7 A;  4M2V A;  5DSR A;  3V3H B;  4N0X B;  2VVA X;  3CZV A;  2HKK A;  3N0N A;  5EIJ A;  1CNI A;  3LXE A;  5DSP A;  3F4X A;  1G48 A;  1MOO A;  4YGN A;  5DSI A;  1TBT X;  1ZSB A;  2POW A;  1CAI A;  1G4J A;  2FNM A;  4E9O X;  3S8X A;  4QSA A;  4HEY A;  1Z93 A;  4YGF A;  4COQ A;  4YXI A;  1G0E A;  4ZWX A;  4TWM A;  4YGJ A;  1TB0 X;  1FSQ A;  1UGB A;  5SZ6 A;  4Q6E A;  4RFD A;  1TEU X;  1BNN A;  1BNW A;  3MNH A;  4PYX A;  2QP6 A;  1Z9Y A;  3W6I A;  3OY0 A;  5DSL A;  3EFI A;  4GL1 X;  5EHW A;  3P55 A;  2POV A;  1CAY A;  2F14 A;  1LG6 A;  3ML2 A;  5E2N A;  3ZNC A;  1FSR A;  1YO0 A;  3S72 B;  2FW4 A;  5CLU A;  3DCW A;  3M5T A;  3MYQ A;  5DVX A;  3MDZ A;  1LG5 A;  3P4V A;  1JD0 A;  4KNJ A;  3T84 A;  1ZH9 A;  2CA2 A;  2ABE A;  1CIN A;  5FL6 A;  5FLS A;  3RGE A;  4KNI A;  5AMD A;  5BRW A;  3DCC A;  4HT2 A;  4QSJ A;  1G54 A;  2EU3 A; 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