1CNIA

X-ray crystallographic studies of engineered hydrogen bond networks in a protein-zinc binding site
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIAFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title X-Ray Crystallographic Studies of Engineered Hydrogen Bond Networks in a Protein-Zinc Binding Site
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cniA00
3M96A 2AW1A 4RFDA 4Z1KA 2NWZA 3M5TA 5BRWA 4LP6A 3NI5A 4Q49A 3L14A 3MMFA 5A25A 3MHLA 3OIMA 3S76A 1MOOA 1TEUX 2NMXA 4QK1A 3DAZA 3IEOA 4CNRA 2ABEA 1CVAA 1IF9A 3M3XA 1CVEA 3MHCA 1F2WA 3Q31A 2HOCA 5JGTB 1CNIA 3T85A 1G6VA 2IT4A 5DSJA 1HECA 1TE3X 4QY3A 4RH2A 1UGFA 5G03A 4MTYA 5JESB 4CNVA 5DSRA 2POWA 3D8WA 1XEGA 4JSZA 4KNJA 4QSJA 3DD0A 1BNTA 1ZNCA 3DVBA 1LZVA 2VVAX 3S8XA 3MHIA 4TWLA 1XQ0A 3MNKA 3OYSA 1XEVA 4KNMA 4FL7A 4Y0JA 5SZ2A 3JXHC 6CA2A 3MZCA 5JG3B 5BYIA 4JS6A 3MNUA 3M5SA 5EH5A 3DCWA 3PO6A 4E3HA 4RN4A 2Q1BA 9CA2A 3T83A 2QO8A 4ZX1A 3W6HA 3KLDB 4GL1X 2WEHA 5JEGB 5DSOA 4YGFA 3U45X 3OKVA 4QK2A 4BCWA 3N0NA 1RZEA 5AMGA 2FOUA 4XFWA 4Q06A 4Z1EA 4K0SA 4L5UA 4KNIA 1I9LA 4HU1A 3CA2A 1UGCA 4YGKA 1UGEA 4L5WA 5E28A 5EKHA 4Q90A 1I9MA 4Q7PA 3M2XA 4FRCA 5EH8A 5HPJA 1UGBA 1G54A 1G4JA 3OIKA 4Z0QA 4L5VA 2FOSA 5E5UA 1IF7A 2QOAA 4HEYA 3HKUA 1UGGA 1CNXA 1LG6A 1UGDA 1RZAA 3EFIA 3N2PA 4E3DA 3DV7A 2NNVA 5E2RA 4K0TA 1CAJA 1YDDA 3M98A 4Q7SA 4QSAA 4QJPA 3F7UA 4YGJA 1HVAA 3DVCA 4RFCA 2AX2A 1BNUA 3DC3A 2FOQA 4RIVA 4Q8YA 3U3AX 1CNHA 4YXOA 3IBIA 4Q07A 3D92A 4E49A 2CBAA 1LG5A 2NN7A 4XZ5A 1LGDA 5DSQA 2OSFA 5E5RA 1H4NA 2NXRA 1CVHA 1BZMA 1ZSBA 4G0CA 3P3HA 2POUA 1AVNA 4KUVA 3M1QA 4DZ7A 1I8ZA 1Z93A 5SZ6A 1G46A 4HT2A 1ZSAA 4XE1A 5CACA 5JGSB 1ZGEA 3M67A 5FLSA 1FQMA 5DOGA 5DSKA 3UYQA 4R5BA 1CNKA 5EH7A 1ZFQA 4HEZA 2EZ7A 3K2FA 3OY0A 5DVXA 4E5QA 3DVDA 1AZMA 4M2RA 2CBEA 3P4VA 5EHWA 4TWMA 4QSIA 4LU3A 5SZ4A 1OKNA 2ILIA 4YWPA 1CINA 3DA2A 3N3JA 3T84A 3RG3A 5SZ7A 3C7PA 3LXEA 4KP8A 3M1JA 1YO1A 2EU2A 2OSMA 4Q8ZA 3P3JA 4KAPA 4PQ7A 4CNWA 1CVCA 1I91A 3DC9A 1TEQX 4QIYA 4QSBA 3RYYA 2WD3A 5EZTX 4Q09A 1URTA 3T5ZA 3VBDA 4Q08A 1CCSA 3S74B 1FQRA 1TG3A 5FLOA 5E2MA 4WUPA 1CANA 4JSWA 1T9NA 5G01A 5G0BA 4Q0LA 5IPZA 1MUAA 3S9TA 3HKQA 3BETA 1CNCA 1TB0X 5FL4A 1BV3A 3P5LA 3OILA 3FE4A 3RZ5A 2H4NA 3M40A 2X7TA 4R5AA 2HNCA 3ML5A 4Q87A 4MLTA 4YGNA 4QJ0A 4RIUA 3NJ9A 3BL1A 5DSPA 1ZSCA 2ZNCA 2QP6A 5E2NA 1H9NA 5DRSA 3IGPA 4M2UA 5CA2A 4ZWXA 1OQ5A 1ZFKA 3P5AA 5L3OA 5AMLA 5SZ0A 1J9WA 3K34A 4KV0A 3KOIA 3OYQA 2VVBX 2HL4A 2FMGA 3N4BA 7CA2A 3MHMA 2FNMA 5FDIA 1RZBA 3S97A 2H15A 2Q1QA 4QEFA 5DOHA 5FLQA 3F4XA 5AMDA 2X7UA 1HCBA 1CAHA 1TBTX 1XPZA 4M2VA 1HEBA 1H9QA 1Z9YA 1TH9A 3M2ZA 5E2SA 4Q6DA 1CNYA 2POVA 2HD6A 1G48A 3HKTA 5EHVA 1Y7WA 3M2NA 1CNGA 4FVNA 4JSAA 4YXIA 4IWZA 2NN1A 4ZWYA 5C8IA 4HBAA 2CBBA 3MWOA 4IDRX 1G0EA 4HF3A 3HKNA 4Q9YA 1RAYA 2NNSA 5FNLA 3SBHA 3RYXB 5BRUA 2O4ZA 2FNKA 1Z97A 4N0XB 4RUYA 2GEHA 5FLTA 3PYKA 4ILXA 4ZX0A 1CRAA 3RLDA 4ITOA 3QYKA 1JD0A 3V3HB 3RGEA 1AM6A 4ETQC 1CAZA 1CZMA 3KS3A 3F8EA 3V3JA 1CNWA 4R59A 1YO0A 1ZH9A 3DCCA 4E3FA 1G45A 1FQNA 3FW3A 1DMYA 1V9IC 5SZ3A 5CJFA 1V9EA 2GD8A 1FSRA 1DMXA 3KNEA 3V5GA 3MYQA 1RJ6A 4QIZA 3U47A 1EOUA 4COQA 4ZAOA 2WEOA 8CA2A 4HT0A 1CAIA 1IF5A 3M1KA 2CA2A 3MNHA 2X7SA 3DBUA 1CALA 1I9QA 5JEPB 2FW4A 5J8ZA 2NWYA 3D9ZA 3KKXA 1CIMA 3V3IB 4Q99A 1CNJA 4QJWA 1FSNA 2NXSA 4PZHA 5FNGA 1CVDA 3SBIA 1I9NA 3HLJA 2WEGA 4G7AA 1JV0A 1FR4A 3PJJA 4YHAA 5LMDA 4HEWA 5EKMA 5BRVA 1TTMA 3V7XA 4Z1JA 3M2YA 4E9OX 3CZVA 1CVBA 4BF1A 1BNMA 1YDAA 4Q78A 4FVOA 1BICA 5SZ1A 3M1WA 1JCZA 5L6KA 1CNBA 4PXXA 3TVNX 4MLXA 1I90A 5DSIA 3S78B 2FMZA 4MDMA 3S72B 4CNXA 1CILA 4WL4A 3SAPA 1CAOA 3DD8A 3R17B 2FOVA 3GZ0A 1DCBA 1CAMA 3ZP9A 5EIJA 3OKUA 5FNMA 4YVYA 2FOYA 5FNIA 5FNJA 2NXTA 3ML2A 4YGLA 4PYYA 3M04A 1BCDA 2W2JA 4KUWA 3KIGA 3RYVB 4Q83A 1BNNA 3TVOX 3FFPX 4YX4A 4QJOA 1G4OA 4QJXA 4CQ0A 3MDZA 5JG5B 1G1DA 5JQTA 3V3GB 4Q7VA 1FQLA 1KEQA 2FNNA 2F14A 1HUGA 2WEJA 4MO8A 4FPTA 1LUGA 3S71B 3JXGA 3F7BA 4Z1NA 4FIKA 4KP5A 1BN3A 4KUYA 4DZ9A 1RAZA 3IBLA 4QJMA 3V2MA 3RZ0B 4BF6A 4MDLA 4CACA 5FDCA 4CA2A 5A6HA 1CAKA 1CVFA 4X5SA 5SZ5A 3MNIA 1TG9A 3B4FA 3B1BA 5FNKA 3R16A 3P58A 4ITPA 4E3GA 3KWAA 1CRMA 2WD2A 1A42A 1RZCA 4QTLA 5FLPA 1IF8A 2EU3A 5FNHA 1CCUA 3RZ8A 3JXFA 1HEDA 1CCTA 4E4AA 1OKMA 1HUHA 4WW6A 4Q8XA 5FLRA 5JDVB 3D0NA 4LHIA 5DSNA 4WUQA 1BN1A 1KWRA 3V2JA 3CYUA 3DCSA 4RUZA 5BNLA 3RJ7A 3MHOA 1FLJA 4PYXA 3MNAA 3IBNA 3EFTA 4MDGA 1KOQA 3M5EA 1CA2A 3RZ7A 1G52A 1IF6A 5DSLA 4WR7A 5FL6A 4ZWZA 4JSSA 4KNNA 4YYTA 3UYNA 3K7KA 1BN4A 1KWQA 4QK3A 1OKLA 3HS4A 1BNWA 3BL0A 2CBDA 3HFPA 3KOKA 1THKA 4Q7WA 4K0ZA 1HEAA 3CAJA 1FR7A 4K1QA 5EOIA 1UGAA 3W6IA 3T5UA 3IAIA 1CA3A 1BNQA 1ZE8A 3S77B 3S73B 5G0CA 1G3ZA 5EKJA 2CABA 2NNGA 3IBUA 5JEHB 5EHEA 4N16A 3RYZA 4WW8A 3T82A 1YO2A 1RJ5A 3NB5A 1FSQA 1G0FA 3P44A 4Q6EA 1HCAA 4Q81A 1ZGFA 5E2KA 4K13A 1I9PA 12CAA 2NWOA 3V3FA 5DSMA 3RYJB 3ZNCA 1YDBA 5CLUA 3RG4A 2Q38A 1BNVA 1IF4A 1RZDA 4XIWA 1CAYA 3M14A 3D93A 3U7CA 4RUXA 1KOPA 2CBCA 2HFWA 2HKKA 3TMJA 3RZ1B 5JQ0A 4M2WA 1DCAA 4FU5A 4XIXA 4ZWIA 3P55A 1I9OA 1YDCA 2NNOA 2NWPA 4YXUA 3SAXA 3MNJA 1G53A 5FL5A 3S75B 4UOVA 4C3TA 3KONA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M96 A;  2AW1 A;  4RFD A;  4Z1K A;  2NWZ A;  3M5T A;  5BRW A;  4LP6 A;  3NI5 A;  4Q49 A;  3L14 A;  3MMF A;  5A25 A;  3MHL A;  3OIM A;  3S76 A;  1MOO A;  1TEU X;  2NMX A;  4QK1 A;  3DAZ A;  3IEO A;  4CNR A;  2ABE A;  1CVA A;  1IF9 A;  3M3X A;  1CVE A;  3MHC A;  1F2W A;  3Q31 A;  2HOC A;  5JGT B;  1CNI A;  3T85 A;  1G6V A;  2IT4 A;  5DSJ A;  1HEC A;  1TE3 X;  4QY3 A;  4RH2 A;  1UGF A;  5G03 A;  4MTY A;  5JES B;  4CNV A;  5DSR A;  2POW A;  3D8W A;  1XEG A;  4JSZ A;  4KNJ A;  4QSJ A;  3DD0 A;  1BNT A;  1ZNC A;  3DVB A;  1LZV A;  2VVA X;  3S8X A;  3MHI A;  4TWL A;  1XQ0 A;  3MNK A;  3OYS A;  1XEV A;  4KNM A;  4FL7 A;  4Y0J A;  5SZ2 A;  3JXH C;  6CA2 A;  3MZC A;  5JG3 B;  5BYI A;  4JS6 A;  3MNU A;  3M5S A;  5EH5 A;  3DCW A;  3PO6 A;  4E3H A;  4RN4 A;  2Q1B A;  9CA2 A;  3T83 A;  2QO8 A;  4ZX1 A;  3W6H A;  3KLD B;  4GL1 X;  2WEH A;  5JEG B;  5DSO A;  4YGF A;  3U45 X;  3OKV A;  4QK2 A;  4BCW A;  3N0N A;  1RZE A;  5AMG A;  2FOU A;  4XFW A;  4Q06 A;  4Z1E A;  4K0S A;  4L5U A;  4KNI A;  1I9L A;  4HU1 A; 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