1CNXA

Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase ii influence binding constants
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase II influence inhibitor binding constants.
pubmed doi rcsb
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cnxA00
1LG6A 4K0SA 5EZTX 4Q7SA 4KUVA 1CCUA 3HKQA 4R5BA 1CCSA 1TEUX 1TBTX 1AVNA 3M1KA 4G7AA 1I9OA 1CVEA 3FW3A 4CACA 1CNCA 3BL1A 4JS6A 2WEHA 3LXEA 3M3XA 3CYUA 2HNCA 5C8IA 1KWQA 5DSMA 5JEGB 2HOCA 1FSNA 4E3HA 2VVAX 3DAZA 4IDRX 1UGBA 4IWZA 5AMDA 1G1DA 4RN4A 4HU1A 3TMJA 5SZ1A 1HECA 5JESB 4WUQA 2NWOA 3MHLA 5FLOA 1EOUA 1JV0A 3MMFA 1V9EA 4QK1A 1OQ5A 4QSIA 4Q0LA 3D0NA 4Z0QA 3PJJA 3DCSA 1G54A 4Q07A 1MUAA 3M98A 1TH9A 4Q8ZA 3SAPA 1I90A 4HEYA 1H9QA 3F7UA 5FDCA 1Z9YA 4FL7A 1HCAA 2HKKA 3JXFA 5BNLA 1CA2A 4PYXA 1UGFA 4DZ7A 1H4NA 3U47A 5FL4A 3T83A 2FMGA 2NXTA 3S75B 1G0FA 3KOKA 4PXXA 1G3ZA 2CBDA 5DSPA 4KP5A 1KEQA 3K34A 3L14A 3OYSA 2FOVA 1HUHA 4YHAA 1XEGA 4WR7A 2CBAA 4HEWA 5IPZA 2AW1A 3M1JA 4KAPA 4WL4A 4E5QA 4RFDA 3DVCA 3IBLA 4QJPA 3P55A 4Q7PA 3V2JA 3IGPA 1ZGEA 4Z1KA 4HF3A 1G53A 3KIGA 4KV0A 5FDIA 1OKNA 3CA2A 4Q8YA 4Q8XA 1Z93A 3M04A 2NMXA 1RZBA 3M40A 4G0CA 4RUZA 3U45X 1CIMA 4QSAA 3V3IB 1G52A 3OKVA 3B1BA 2FOSA 1BN4A 1CAZA 1ZSBA 4FIKA 4Z1NA 12CAA 5EH7A 4BF6A 4K1QA 1KOPA 1ZFQA 3OIMA 5G03A 4RH2A 4YYTA 1FQLA 4Q87A 3IBNA 3UYQA 1G4OA 3M67A 1CALA 3GZ0A 3T5UA 4BF1A 1CNHA 2FOUA 4HT2A 3P44A 1JCZA 3SBIA 3OKUA 4MDGA 5JQTA 3BETA 1BV3A 5FNHA 4YVYA 1I9PA 4ZAOA 3SBHA 3RJ7A 4HEZA 4KNIA 1OKMA 5E5RA 1DCBA 3D93A 2NWPA 2NNGA 3RGEA 4MLTA 4L5VA 4N16A 1CZMA 4RIUA 1CVFA 5DOHA 3IAIA 1RZEA 5BRVA 4ETQC 3M2YA 3UYNA 3RZ8A 1DCAA 1ZGFA 3CZVA 4ZWIA 1IF7A 5FLRA 5FNMA 2NNSA 1CRMA 2CBBA 4N0XB 1CINA 4PZHA 2CBCA 5J8ZA 1CNKA 3U3AX 5FNKA 5A6HA 2FMZA 2WEOA 3MDZA 1FSQA 1CNGA 4QTLA 1IF5A 1TTMA 2NN1A 3RG3A 4QJMA 3M5TA 4CNXA 5SZ6A 1BZMA 3S72B 4QSBA 4COQA 4YGKA 1BNWA 4ZX1A 5G01A 1CNWA 1CNYA 1UGCA 5SZ5A 1FR4A 3RLDA 3MZCA 5SZ2A 1G46A 8CA2A 2POUA 4CNWA 3M96A 1FR7A 1H9NA 1TG3A 3D92A 5JG3B 3M1WA 4KUYA 3MNIA 1CA3A 3MNJA 1BNMA 3S78B 5JGTB 5E2NA 4WW8A 4DZ9A 2HD6A 3V2MA 1BNNA 3KOIA 3M5EA 3HKNA 5FLTA 3T85A 4QJXA 4KNNA 1ZNCA 2VVBX 5EHVA 2X7SA 5JEPB 3S76A 5DSOA 3DC9A 1BN1A 5EKJA 1RAZA 5AMLA 3SAXA 4XIWA 4YWPA 3S8XA 3V7XA 4HT0A 3DCWA 1I9QA 2WEGA 3OIKA 3KNEA 4BCWA 4Q7WA 3IEOA 4FVOA 3KONA 1BN3A 3RG4A 3V3HB 5HPJA 4Q90A 2F14A 1FQNA 4RFCA 2POWA 5EH8A 4CNVA 5E2RA 1TB0X 5DSIA 5EOIA 3W6IA 3DVDA 4M2WA 3RZ5A 2NWYA 1YDBA 4Q6EA 3TVOX 4QIZA 1J9WA 4K0TA 3DCCA 1ZFKA 4Q09A 5E2KA 4M2RA 5JEHB 1CILA 4Q49A 3P5LA 4LHIA 5E28A 1MOOA 4YGNA 5SZ0A 3R16A 1HEDA 2CBEA 2O4ZA 3ML5A 3V3GB 2FNNA 3KS3A 3M14A 1CVHA 5DVXA 4XFWA 2X7TA 5FNGA 4YXIA 2CABA 1V9IC 1XQ0A 4C3TA 3DBUA 4Q06A 5SZ7A 4E3DA 1RZCA 2H4NA 2NXSA 5FNIA 3HFPA 4Z1JA 1DMXA 3Q31A 4UOVA 5CACA 3MHOA 3ZP9A 1DMYA 3KKXA 2CA2A 4JSAA 1CVBA 1BNQA 5DSQA 1A42A 1HVAA 4QY3A 1RZAA 5E2SA 3V5GA 2WD2A 3V3FA 3DV7A 4ILXA 5DSLA 4QK2A 1YDAA 1XPZA 3EFIA 3P4VA 1UGEA 3K7KA 1LG5A 2FOQA 5SZ3A 1G6VA 2NXRA 1G0EA 3C7PA 1ZSAA 3VBDA 1G4JA 5JQ0A 1UGAA 3D9ZA 3QYKA 4E3GA 3S71B 4JSSA 3KLDB 3S77B 4KNJA 1THKA 3F4XA 3TVNX 4L5UA 3KWAA 6CA2A 1CAMA 5DRSA 4HBAA 1CAJA 3HS4A 4PYYA 1I8ZA 2OSMA 3B4FA 4WW6A 2AX2A 2GD8A 1FQMA 1YO1A 5FLQA 3NB5A 3RZ1B 5EHWA 5DSNA 1CVDA 1LUGA 4MDLA 3HLJA 2HFWA 2H15A 1YO2A 3JXHC 4E3FA 4LU3A 1Y7WA 1RZDA 4XIXA 4R59A 1BNUA 7CA2A 2X7UA 4TWMA 3M5SA 3P5AA 1ZE8A 5CJFA 4Q9YA 3DD0A 3DVBA 4XZ5A 3RZ0B 3S74B 4KP8A 1YDDA 5EKMA 2FW4A 3ZNCA 3DC3A 3FFPX 1I9LA 4CNRA 1AZMA 4XE1A 3ML2A 5EH5A 3EFTA 4E4AA 3U7CA 3RYZA 1CNIA 4Z1EA 1I9NA 1YDCA 2ZNCA 4ZWZA 3OY0A 1CNJA 5BYIA 4FRCA 5L6KA 2FNKA 2ABEA 4MLXA 4QJOA 3P58A 1IF8A 4RUXA 1TEQX 4QJWA 1T9NA 5BRUA 1RJ5A 2POVA 1KOQA 1RJ6A 4KUWA 4Q78A 1CRAA 1Z97A 3PO6A 4FVNA 3S97A 5JG5B 3R17B 4M2VA 2ILIA 3MHMA 1URTA 5G0CA 2FNMA 4GL1X 3S9TA 2QO8A 3BL0A 3MHIA 3N2PA 5FLSA 3N0NA 5G0BA 1BICA 3DA2A 3IBIA 3OILA 1IF4A 1KWRA 2Q1BA 3K2FA 1HEBA 4QSJA 5FL6A 1CAKA 4LP6A 1IF9A 3MHCA 4MDMA 1LGDA 3M1QA 1CVCA 3MNUA 4X5SA 4ZWXA 4ZWYA 4JSWA 3D8WA 4Q99A 5FLPA 3V3JA 2FOYA 5LMDA 1CAOA 2HL4A 5CLUA 1I91A 4CQ0A 4RIVA 1LZVA 1FSRA 1BNVA 3RYXB 3HKUA 3M2ZA 5EKHA 5SZ4A 4Q6DA 3JXGA 4L5WA 5JDVB 1CNBA 1F2WA 1ZSCA 4ITPA 4ITOA 4Y0JA 3T5ZA 3DD8A 1HUGA 1AM6A 2NNVA 3MNKA 4QK3A 4MTYA 3IBUA 4Q83A 5A25A 4YXOA 3P3JA 4Q7VA 2WD3A 3FE4A 4MO8A 1YO0A 3NI5A 3P3HA 3PYKA 5FNLA 4WUPA 4CA2A 4Q81A 1UGDA 1IF6A 2GEHA 1BNTA 4QEFA 5CA2A 3F7BA 3W6HA 4Q08A 2EU3A 1CAHA 3RYVB 1FLJA 1OKLA 2NN7A 2W2JA 3N3JA 4QJ0A 4ZX0A 4YGFA 1XEVA 4RUYA 2EZ7A 3OYQA 5BRWA 2OSFA 1HEAA 3RZ7A 5E2MA 5EHEA 5AMGA 1CANA 5DSKA 4TWLA 2Q38A 2WEJA 3CAJA 4M2UA 4FPTA 2QOAA 2EU2A 5FL5A 1TE3X 3MWOA 4K13A 1CAYA 2NWZA 3RYYA 1G48A 3MNHA 1CVAA 4JSZA 4YGLA 5FNJA 4E9OX 3MYQA 3N4BA 1CCTA 4YGJA 3MNAA 4FU5A 3S73B 3NJ9A 5DSRA 4YXUA 5JGSB 1BCDA 3T84A 1TG9A 5E5UA 1ZH9A 4R5AA 5DOGA 4E49A 2IT4A 1HCBA 5EIJA 1CAIA 1UGGA 1JD0A 1G45A 3M2XA 4KNMA 4K0ZA 3F8EA 9CA2A 2Q1QA 3M2NA 3RYJB 4YX4A 1RAYA 1FQRA 5DSJA 3HKTA 2QP6A 1I9MA 4PQ7A 4QIYA 2NNOA 5L3OA 1CNXA 3T82A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LG6 A;  4K0S A;  5EZT X;  4Q7S A;  4KUV A;  1CCU A;  3HKQ A;  4R5B A;  1CCS A;  1TEU X;  1TBT X;  1AVN A;  3M1K A;  4G7A A;  1I9O A;  1CVE A;  3FW3 A;  4CAC A;  1CNC A;  3BL1 A;  4JS6 A;  2WEH A;  3LXE A;  3M3X A;  3CYU A;  2HNC A;  5C8I A;  1KWQ A;  5DSM A;  5JEG B;  2HOC A;  1FSN A;  4E3H A;  2VVA X;  3DAZ A;  4IDR X;  1UGB A;  4IWZ A;  5AMD A;  1G1D A;  4RN4 A;  4HU1 A;  3TMJ A;  5SZ1 A;  1HEC A;  5JES B;  4WUQ A;  2NWO A;  3MHL A;  5FLO A;  1EOU A;  1JV0 A;  3MMF A;  1V9E A;  4QK1 A;  1OQ5 A;  4QSI A;  4Q0L A;  3D0N A;  4Z0Q A;  3PJJ A;  3DCS A;  1G54 A;  4Q07 A;  1MUA A;  3M98 A;  1TH9 A;  4Q8Z A;  3SAP A;  1I90 A;  4HEY A;  1H9Q A;  3F7U A;  5FDC A;  1Z9Y A;  4FL7 A;  1HCA A;  2HKK A;  3JXF A;  5BNL A;  1CA2 A;  4PYX A;  1UGF A;  4DZ7 A;  1H4N A;  3U47 A;  5FL4 A;  3T83 A;  2FMG A;  2NXT A;  3S75 B;  1G0F A;  3KOK A;  4PXX A;  1G3Z A;  2CBD A;  5DSP A;  4KP5 A;  1KEQ A;  3K34 A;  3L14 A;  3OYS A;  2FOV A;  1HUH A;  4YHA A;  1XEG A;  4WR7 A;  2CBA A;  4HEW A;  5IPZ A;  2AW1 A;  3M1J A; 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