1CNXA

Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase ii influence binding constants
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase II influence inhibitor binding constants.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cnxA00
2WEHA 3S9TA 3RYZA 3V3HB 1UGDA 5FNMA 4WR7A 3RZ5A 1MUAA 4WW6A 2HKKA 3TVNX 1ZGFA 5IPZA 2WEGA 5E28A 5DSRA 1I9OA 3M04A 4QIZA 5FNIA 3B1BA 4RH2A 3M2ZA 1UGAA 4MTYA 4YYTA 4ZWYA 4YGLA 5JQTA 12CAA 3M40A 1I9QA 2NWOA 4Q7SA 3M98A 4GL1X 4XZ5A 4CA2A 4YXUA 1CVEA 3M2NA 5EKHA 3VBDA 3RZ0B 4QK1A 3D9ZA 3N2PA 1XEGA 1LZVA 2HL4A 5AMDA 4KUWA 4RIVA 5E2RA 4Q6DA 1HCAA 3M5SA 3IBIA 2AW1A 2HFWA 2FNKA 2VVBX 4CACA 3CYUA 1CNCA 1ZH9A 3IAIA 5FNJA 1HECA 5SZ7A 4ZX1A 4COQA 3JXHC 3ML5A 2QO8A 2WEOA 4RIUA 4RFCA 1TG9A 1Y7WA 1G0EA 1RZDA 3KOKA 1RAZA 1FSQA 1G4OA 1CAKA 2IT4A 2VVAX 2WD3A 3OYQA 3RYXB 4PQ7A 3EFIA 3LXEA 3HFPA 3D92A 3UYQA 1ZFKA 1LG6A 1OKNA 3MMFA 2NNOA 2NWPA 4YGFA 1CVHA 5EZTX 4CNVA 1Z93A 1TEQX 4R59A 4Q6EA 1I8ZA 2FMZA 1IF8A 3MNAA 5FL5A 5JEHB 4E9OX 1KOQA 1V9IC 2NNGA 4LHIA 4WUQA 3P4VA 1G52A 3M96A 1HEBA 2CBBA 2POUA 5AMGA 1JCZA 1J9WA 1FR4A 1G3ZA 3MWOA 4DZ7A 4X5SA 3ML2A 4YGJA 3S78B 4L5UA 4HBAA 4FVNA 3M5EA 4C3TA 1BNUA 4E5QA 1OKMA 4Z0QA 1RZBA 3UYNA 3M14A 5DOHA 1CVFA 2WEJA 1FQLA 1T9NA 2FW4A 2HD6A 3KLDB 3SAPA 3RZ8A 5FLTA 4PYYA 5L3OA 3M67A 4HF3A 3MHIA 4IDRX 4XFWA 3V3IB 4M2WA 1UGBA 2FNMA 3MNJA 1YO1A 2H4NA 2GEHA 2ILIA 3RYYA 1AVNA 4RFDA 3HKQA 5JDVB 4R5BA 2CA2A 2Q38A 1BN1A 2FMGA 1ZFQA 3U45X 5JG3B 3P5LA 2Q1QA 5L6KA 4L5WA 2POVA 5E5UA 1FSRA 1CNJA 1CZMA 3OYSA 4E4AA 4YXIA 4KNMA 4IWZA 2FNNA 1MOOA 2W2JA 1H9QA 4MDGA 2CBCA 3F4XA 3DVDA 3S97A 3DCCA 1RAYA 1CNYA 3KOIA 4MLTA 5DOGA 1HCBA 5LMDA 4CNWA 2HOCA 4KNJA 2AX2A 4PZHA 3SBHA 7CA2A 2QOAA 4E3HA 3RZ7A 4Z1KA 3MYQA 1CA3A 4YVYA 2EZ7A 4LU3A 4ZWIA 1CAJA 4FPTA 4Z1NA 5E2MA 1CAMA 5EH5A 4Y0JA 1TTMA 2NNVA 4HEYA 1YDCA 5EHWA 1KEQA 4K1QA 1ZNCA 3K7KA 3IBNA 3S76A 4Q0LA 4ZX0A 3Q31A 4Z1JA 5AMLA 5EOIA 3RG3A 1G54A 1URTA 4N0XB 3RZ1B 2OSMA 1G0FA 3V3JA 2FOUA 4G0CA 3D0NA 4ITPA 1CAYA 1FR7A 5DSOA 3MHOA 1H4NA 5G01A 1FQMA 4N16A 1TBTX 4YXOA 5SZ3A 4QTLA 2F14A 5HPJA 3IBLA 1A42A 3M1KA 2FOQA 3F7BA 5CLUA 4M2RA 3F7UA 4QIYA 3P3JA 3S77B 4R5AA 4HT2A 4BCWA 3DC3A 1IF5A 3DD8A 3S75B 3T83A 1OKLA 3L14A 3M5TA 4Q8YA 4FL7A 3OIKA 1YO2A 4KP5A 4KAPA 3T85A 1BZMA 3HKUA 6CA2A 5CJFA 1CRMA 1TH9A 1ZSCA 3R17B 5BRUA 4Q8XA 1DCBA 2CBAA 1RZAA 4QJXA 3U7CA 1BN4A 1G45A 1G53A 3K34A 2X7TA 2CABA 2NXSA 5EH8A 1Z9YA 3DVBA 4JSWA 4Q90A 3TVOX 1JD0A 4ZAOA 1ZSAA 1BNQA 1H9NA 3DCWA 1TE3X 3P44A 2CBDA 3MHMA 4PXXA 3BL1A 1ZSBA 5SZ2A 3DBUA 5JG5B 4RN4A 4PYXA 2X7UA 1ZGEA 4ETQC 1G4JA 2EU3A 2WD2A 3KIGA 3RYJB 1CNIA 3DVCA 1CA2A 5DSMA 4XE1A 3CZVA 2OSFA 3FE4A 4FU5A 4ITOA 4QY3A 4ZWXA 3NI5A 5EKJA 1FLJA 4MDLA 1OQ5A 5DSLA 4Q78A 5SZ6A 1HEDA 3CA2A 4WL4A 3FW3A 1CCUA 1CAOA 1CNKA 5DSJA 1I9LA 4QK2A 1CCSA 1CINA 5EIJA 3M1JA 2QP6A 4HEZA 1IF7A 1RJ6A 1DMYA 1TG3A 4Q49A 1DCAA 1BNTA 5BRWA 3D93A 5FNHA 1G1DA 4BF1A 5SZ4A 3MHLA 4KUVA 1I9PA 4QK3A 4YGNA 3T84A 5CACA 1BICA 4HU1A 3NJ9A 1YDAA 3S72B 4QSJA 1XPZA 3N3JA 5CA2A 1Z97A 2Q1BA 4ILXA 1FSNA 2GD8A 5BYIA 4RUZA 3RGEA 4QEFA 3W6HA 4E3FA 4L5VA 2FOSA 5JEPB 3MNUA 3OILA 3ZNCA 1I9NA 5A25A 4DZ9A 1UGEA 3KS3A 3JXGA 4M2UA 1CAIA 3F8EA 4BF6A 1LG5A 3U3AX 1CAZA 2EU2A 4JS6A 4FVOA 4Q7VA 2NN7A 3V2JA 5EH7A 4TWLA 3P3HA 3PO6A 4QJPA 5JGTB 3SAXA 4TWMA 4Z1EA 5DSQA 4K13A 5FLSA 2FOYA 3D8WA 1BNVA 5FDIA 3B4FA 4KP8A 3S74B 1G48A 1RZEA 3EFTA 5DVXA 1HUHA 5G0CA 1BV3A 1UGCA 1I90A 3MHCA 2NWZA 4QSAA 3IEOA 3S71B 1CRAA 4RUXA 4Q09A 1BCDA 4QJOA 1BNWA 3P55A 4ZWZA 1TB0X 3OKUA 3BETA 3OY0A 3P5AA 4K0SA 4QJ0A 4YWPA 2HNCA 1RZCA 1CVBA 3MZCA 4K0TA 4WW8A 2NWYA 1V9EA 1XEVA 3DV7A 3P58A 4QSIA 3M1QA 5SZ5A 5FDCA 1UGGA 3IGPA 1CVDA 5E2SA 1FQNA 2NMXA 1KOPA 1G46A 1BNNA 4Q7PA 4Q08A 5G0BA 4MO8A 5FL4A 3NB5A 1G6VA 3MDZA 5EHVA 1RJ5A 3DD0A 1BNMA 3V2MA 1CAHA 1JV0A 3M2XA 4HT0A 5BRVA 1YDDA 4Q07A 1LGDA 2H15A 3DCSA 1AM6A 4FRCA 3JXFA 4QSBA 4E49A 1XQ0A 4KUYA 4CNXA 3OKVA 3HKNA 3ZP9A 2O4ZA 5G03A 3BL0A 4RUYA 1HUGA 3DA2A 3S73B 5C8IA 3KKXA 5DSKA 1CNGA 3MNKA 4KV0A 4Q99A 3RG4A 3W6IA 4LP6A 4Q7WA 4YHAA 4YX4A 1CVAA 1ZE8A 1CCTA 3R16A 2X7SA 1HVAA 4M2VA 4HEWA 3HLJA 3N4BA 4YGKA 1I9MA 1F2WA 5DSIA 5FLRA 3CAJA 4K0ZA 4E3GA 2NN1A 1CNBA 3IBUA 4WUPA 3QYKA 1KWQA 3KWAA 3KONA 4KNIA 5FNKA 3S8XA 4XIWA 4KNNA 4Q8ZA 5SZ0A 5FLOA 1AZMA 1KWRA 4XIXA 1CALA 1FQRA 3DC9A 1I91A 3N0NA 4E3DA 3OIMA 4QJMA 3RYVB 5EHEA 1THKA 5JESB 4Q87A 5EKMA 3RJ7A 3SBIA 3T82A 3V3FA 4CQ0A 5SZ1A 3V7XA 3TMJA 4Q06A 3PJJA 5E2KA 5A6HA 4JSAA 5FLQA 2ABEA 3T5ZA 5FNLA 3K2FA 3KNEA 3FFPX 1YO0A 3MNHA 3M3XA 4Q9YA 1LUGA 5DSNA 5DSPA 5BNLA 3MNIA 3GZ0A 5J8ZA 3HS4A 3PYKA 4MLXA 9CA2A 1DMXA 1EOUA 1CILA 3V3GB 4CNRA 1BN3A 3C7PA 1CNWA 4FIKA 3M1WA 1CVCA 2NXTA 1UGFA 2ZNCA 5FL6A 3DAZA 4MDMA 5FNGA 3HKTA 4G7AA 4JSZA 2FOVA 3M2YA 5JGSB 5E2NA 5DRSA 4Q83A 1YDBA 4QJWA 1CNXA 4Q81A 5FLPA 5JQ0A 3V5GA 1CNHA 4UOVA 1IF9A 4JSSA 2CBEA 5JEGB 1CANA 1IF6A 2NXRA 1CIMA 3U47A 1HEAA 8CA2A 1IF4A 2POWA 2NNSA 3RLDA 1TEUX 5E5RA 3T5UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WEH A;  3S9T A;  3RYZ A;  3V3H B;  1UGD A;  5FNM A;  4WR7 A;  3RZ5 A;  1MUA A;  4WW6 A;  2HKK A;  3TVN X;  1ZGF A;  5IPZ A;  2WEG A;  5E28 A;  5DSR A;  1I9O A;  3M04 A;  4QIZ A;  5FNI A;  3B1B A;  4RH2 A;  3M2Z A;  1UGA A;  4MTY A;  4YYT A;  4ZWY A;  4YGL A;  5JQT A;  12CA A;  3M40 A;  1I9Q A;  2NWO A;  4Q7S A;  3M98 A;  4GL1 X;  4XZ5 A;  4CA2 A;  4YXU A;  1CVE A;  3M2N A;  5EKH A;  3VBD A;  3RZ0 B;  4QK1 A;  3D9Z A;  3N2P A;  1XEG A;  1LZV A;  2HL4 A;  5AMD A;  4KUW A;  4RIV A;  5E2R A;  4Q6D A;  1HCA A;  3M5S A;  3IBI A;  2AW1 A;  2HFW A;  2FNK A;  2VVB X;  4CAC A;  3CYU A;  1CNC A;  1ZH9 A;  3IAI A;  5FNJ A;  1HEC A;  5SZ7 A;  4ZX1 A;  4COQ A;  3JXH C;  3ML5 A;  2QO8 A;  2WEO A;  4RIU A;  4RFC A;  1TG9 A;  1Y7W A;  1G0E A;  1RZD A;  3KOK A;  1RAZ A;  1FSQ A;  1G4O A;  1CAK A;  2IT4 A;  2VVA X;  2WD3 A;  3OYQ A;  3RYX B;  4PQ7 A;  3EFI A;  3LXE A;  3HFP A;  3D92 A;  3UYQ A;  1ZFK A;  1LG6 A;  1OKN A;  3MMF A;  2NNO A;  2NWP A;  4YGF A;  1CVH A;  5EZT X;  4CNV A;  1Z93 A;  1TEQ X;  4R59 A; 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