1CVHA

Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFCWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydro-lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-11-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cvhA00
2VVAX 1CNHA 5FNIA 3ML2A 1YO1A 3DD8A 3M2YA 4KNNA 3LXEA 2Q1BA 3SAPA 1G4OA 4CACA 1TEQX 5JGSB 4QY3A 4KUWA 2NXSA 3ZNCA 4PZHA 1H9QA 5FNJA 3S76A 1RZBA 4XE1A 1LGDA 4RUZA 2POUA 4HEWA 5EH7A 1TG9A 3JXGA 3U7CA 1RJ5A 2NWYA 5FNMA 1CIMA 4KV0A 3DC9A 2CBCA 1DMXA 3V3IB 3U47A 4PXXA 1BNVA 2WEHA 3RZ7A 4YX4A 3P5AA 5DSLA 4WW6A 3CAJA 4HT0A 5DSRA 2ZNCA 4QEFA 4YYTA 4FIKA 1BICA 3OILA 5G01A 4Q90A 3N4BA 3DV7A 4M2WA 2X7TA 4E3GA 1LZVA 3P55A 4QJPA 1HVAA 2NWOA 3MNAA 4QK2A 4MDGA 4C3TA 1FSQA 2WEGA 3MHLA 3IAIA 1BZMA 1CZMA 1BN3A 2Q38A 3S71B 3KNEA 1Y7WA 3R17B 4DZ7A 8CA2A 1BNUA 1CNYA 4JSZA 1DCAA 2FMZA 4Q08A 5J8ZA 5JDVB 5C8IA 2NWPA 1RZAA 5JEHB 3IBIA 4YXOA 3RLDA 5SZ1A 2W2JA 1CRAA 2X7UA 4TWLA 1JD0A 4PYYA 3DVDA 3KS3A 5E2RA 3KLDB 2FOYA 1MUAA 5SZ5A 1CCTA 1IF6A 5FLTA 4Q0LA 5G0CA 4ZX1A 3RZ8A 4YGKA 2NNOA 1EOUA 4G7AA 4MLTA 1FLJA 3M1QA 9CA2A 3OIMA 3F7UA 3DAZA 4HF3A 1FSRA 3RYXB 1TH9A 5FL4A 4ITOA 1YDCA 3V2JA 3KONA 3MWOA 4FU5A 4ITPA 4Q6EA 1ZH9A 3RG4A 1RAYA 2EZ7A 4DZ9A 1CVCA 5EIJA 1I9OA 1BV3A 5E2KA 2FOQA 1IF9A 3P58A 4HT2A 3RJ7A 3DD0A 3DC3A 5JG3B 4KP8A 1FQRA 1CNGA 1UGAA 4IWZA 1CA2A 5SZ4A 3VBDA 3EFIA 5BRVA 4Z1NA 3W6HA 3MNHA 3V2MA 1CVFA 5FDIA 3RYZA 1DCBA 5DVXA 3PYKA 3OYSA 4Z1EA 1CNIA 4TWMA 1HUGA 3NI5A 5L3OA 3N3JA 1CVAA 3F7BA 2ILIA 2Q1QA 1RJ6A 4L5VA 4CNXA 4CQ0A 3V5GA 5G0BA 4BF1A 1CA3A 4JSWA 4Z0QA 5A6HA 1TG3A 1ZSBA 3MDZA 1IF7A 5DSNA 1BN4A 4ILXA 2CBDA 3TVNX 1BNNA 2H4NA 4QK1A 3M5SA 4QJWA 4ZAOA 1CALA 3D93A 4R5AA 1CAIA 1HUHA 4WUPA 4HU1A 1TTMA 3S9TA 2H15A 3V3FA 4PYXA 2HOCA 4E49A 3M14A 5E5UA 5DOHA 4Q8XA 1THKA 4QSAA 4Q06A 1CCUA 3T84A 4KUVA 3S72B 1ZGFA 3KOIA 4RN4A 4RIUA 3RYVB 1A42A 4IDRX 4ZX0A 3MNJA 1BCDA 1CVBA 1KWQA 1UGGA 3K7KA 5CJFA 1V9IC 4K0TA 5DSMA 3M2XA 5JEPB 5DRSA 1AM6A 1I9PA 3RGEA 4R5BA 5EHEA 3D8WA 4KUYA 1CNKA 4MLXA 3B4FA 3S73B 5JGTB 1TEUX 5AMLA 4KNIA 5BNLA 4KNMA 1RZCA 1LUGA 4RUXA 5FLSA 2NNSA 1FR7A 4Q83A 4FRCA 1DMYA 3L14A 3MYQA 4K1QA 5JESB 3M2ZA 2EU3A 4K13A 4N16A 3KIGA 3UYNA 5G03A 5FLQA 4M2UA 4HEYA 1CANA 5AMDA 3D9ZA 1CAYA 2FOVA 4COQA 4UOVA 4KAPA 5BYIA 5FLPA 1YDDA 3F4XA 4E3DA 2FMGA 4K0ZA 1ZFKA 3JXHC 1G52A 3MHMA 4RIVA 3M1JA 5CA2A 2FOSA 3M3XA 1IF5A 2POWA 5E2SA 3MZCA 5EKMA 2HFWA 3S97A 1ZFQA 1HCBA 4Q8YA 1FQNA 3DVCA 1J9WA 1ZSCA 3RYJB 1CILA 3HKUA 3V3JA 4MDMA 3TVOX 4Q7PA 4CNRA 6CA2A 4CNVA 1BN1A 1TBTX 2FNNA 1YDAA 1CVHA 4FVOA 1BNMA 5E2MA 2FW4A 3DCSA 3DCWA 3V7XA 4ETQC 1IF4A 1UGFA 1KOPA 1KEQA 3DA2A 3P44A 1H9NA 1AVNA 1I9NA 3T5UA 1V9EA 4LHIA 4YGLA 12CAA 4R59A 3Q31A 1FSNA 3S8XA 3S74B 1OKMA 2O4ZA 3IEOA 3IBUA 4Q7SA 5EH8A 3N2PA 5DSKA 4XIXA 1Z97A 1TE3X 5DSPA 3RZ1B 1G4JA 1CAZA 5E28A 1XEGA 1F2WA 4YGFA 1I90A 3RYYA 4Q9YA 4YVYA 3S77B 1CAHA 4KP5A 3OY0A 1G48A 4JS6A 5E2NA 1I9MA 2F14A 1CINA 4WUQA 1CAJA 3M5EA 1G53A 1JV0A 1CCSA 3N0NA 3OYQA 3V3GB 4JSAA 2QP6A 4Q8ZA 2HNCA 4GL1X 1G46A 5DOGA 2CBBA 4Q07A 3PO6A 4QTLA 4Z1JA 1OKLA 1I9QA 4QIYA 3HFPA 1H4NA 3OKVA 3MMFA 4RH2A 2VVBX 3DVBA 5DSQA 3HS4A 3C7PA 3W6IA 2CA2A 4WR7A 5FLRA 2CBEA 3PJJA 2NN7A 3T85A 2WEJA 2GEHA 1XPZA 3MHIA 5HPJA 2HL4A 3DCCA 1G0FA 1CAMA 5CLUA 1BNTA 3HKNA 2GD8A 5SZ3A 4QIZA 3M67A 2IT4A 3IBNA 4QSBA 1ZGEA 3ML5A 3P4VA 4N0XB 2X7SA 1ZNCA 1CNXA 3M1WA 4MTYA 1XEVA 4XIWA 3RZ5A 3OIKA 3UYQA 4QSJA 2NWZA 1UGCA 3D0NA 2NNGA 3IBLA 5FL5A 4Q49A 5FNLA 3T83A 3FW3A 4Q09A 3D92A 2WD3A 3K2FA 3CA2A 3KKXA 3NB5A 1CAKA 3MHCA 4QJMA 5FNKA 4MO8A 5LMDA 3SAXA 4FPTA 1CAOA 1TB0X 4ZWZA 1G54A 1YDBA 3P3JA 1G45A 1I9LA 1G3ZA 4G0CA 4JSSA 2ABEA 1RZEA 1HECA 5FDCA 1YO0A 4YGNA 4Q78A 4M2VA 3P5LA 1LG5A 2NXTA 1UGEA 3P3HA 3MNKA 2QOAA 1ZE8A 1RAZA 5JQTA 4X5SA 4E3HA 3M04A 3QYKA 5IPZA 1CVEA 5SZ7A 3HKQA 3M98A 1ZSAA 1BNWA 4FVNA 2NMXA 3EFTA 1UGDA 3MHOA 5EKJA 5FNHA 5JG5B 3K34A 4YXIA 3T5ZA 3BL1A 2NXRA 2QO8A 4YGJA 4Z1KA 1FQLA 2OSFA 3R16A 4LU3A 3SBIA 3BETA 3HKTA 7CA2A 4RUYA 5SZ2A 3DBUA 3SBHA 3KOKA 3KWAA 1G0EA 1OQ5A 4FL7A 4MDLA 3F8EA 1BNQA 5EHWA 5EZTX 3JXFA 5DSOA 1KWRA 5CACA 3CZVA 5DSJA 4ZWIA 1CNJA 5FNGA 2NNVA 3RZ0B 1LG6A 1RZDA 4YXUA 1G1DA 5SZ6A 1T9NA 4QJXA 5EH5A 4L5UA 1CNBA 4KNJA 4CA2A 2POVA 5DSIA 1I8ZA 2HD6A 3RG3A 2OSMA 2EU2A 4Q7VA 5SZ0A 4E9OX 4Y0JA 4ZWXA 3S78B 4QK3A 1HEAA 3MNUA 4E4AA 5AMGA 1HEBA 5EKHA 1FQMA 1Z9YA 4CNWA 2WEOA 4Q81A 1CNWA 1KOQA 4LP6A 5FL6A 2WD2A 5JEGB 5BRUA 5BRWA 2AX2A 3S75B 3NJ9A 1AZMA 4QJ0A 1CRMA 1URTA 4Q6DA 2HKKA 4XZ5A 4QSIA 5E5RA 1YO2A 1CNCA 1CVDA 3MNIA 1FR4A 1OKNA 1XQ0A 3OKUA 3FFPX 3U3AX 2FOUA 4L5WA 4RFCA 4YHAA 2FNMA 3V3HB 5A25A 5L6KA 3FE4A 4HBAA 2AW1A 3BL0A 3GZ0A 5EOIA 3IGPA 1JCZA 4YWPA 3M1KA 3M2NA 1HCAA 1HEDA 1MOOA 1UGBA 4E5QA 4PQ7A 5FLOA 5EHVA 2CABA 4RFDA 3ZP9A 3M40A 1IF8A 1I91A 4Q87A 4WL4A 4WW8A 2CBAA 4BCWA 4ZWYA 4QJOA 2FNKA 3T82A 3CYUA 3U45X 4BF6A 3M96A 4E3FA 3M5TA 5JQ0A 4HEZA 4Q7WA 1G6VA 1Z93A 4K0SA 2NN1A 3TMJA 4M2RA 3B1BA 4XFWA 3HLJA 4Q99A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VVA X;  1CNH A;  5FNI A;  3ML2 A;  1YO1 A;  3DD8 A;  3M2Y A;  4KNN A;  3LXE A;  2Q1B A;  3SAP A;  1G4O A;  4CAC A;  1TEQ X;  5JGS B;  4QY3 A;  4KUW A;  2NXS A;  3ZNC A;  4PZH A;  1H9Q A;  5FNJ A;  3S76 A;  1RZB A;  4XE1 A;  1LGD A;  4RUZ A;  2POU A;  4HEW A;  5EH7 A;  1TG9 A;  3JXG A;  3U7C A;  1RJ5 A;  2NWY A;  5FNM A;  1CIM A;  4KV0 A;  3DC9 A;  2CBC A;  1DMX A;  3V3I B;  3U47 A;  4PXX A;  1BNV A;  2WEH A;  3RZ7 A;  4YX4 A;  3P5A A;  5DSL A;  4WW6 A;  3CAJ A;  4HT0 A;  5DSR A;  2ZNC A;  4QEF A;  4YYT A;  4FIK A;  1BIC A;  3OIL A;  5G01 A;  4Q90 A;  3N4B A;  3DV7 A;  4M2W A;  2X7T A;  4E3G A;  1LZV A;  3P55 A;  4QJP A;  1HVA A;  2NWO A;  3MNA A;  4QK2 A;  4MDG A;  4C3T A;  1FSQ A;  2WEG A;  3MHL A;  3IAI A;  1BZM A;  1CZM A;  1BN3 A;  2Q38 A;  3S71 B;  3KNE A;  1Y7W A;  3R17 B;  4DZ7 A;  8CA2 A;  1BNU A;  1CNY A;  4JSZ A;  1DCA A;  2FMZ A;  4Q08 A;  5J8Z A;  5JDV B;  5C8I A;  2NWP A;  1RZA A;  5JEH B;  3IBI A;  4YXO A;  3RLD A;  5SZ1 A;  2W2J A;  1CRA A;  2X7U A;  4TWL A;  1JD0 A;  4PYY A; 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