1DMXA

Murine mitochondrial carbonic anyhdrase v at 2.45 angstroms resolution
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
GTRQSPINIQWKDSVYDPQLAPLRVSYDAASCRYLWNTGYFFQVEFDDSCEDSGISGGPLGNHYRLKQFHFHWGATDEWGSEHAVDGHTYPAELHLVHWNSTKYENYKKASVGENGLAVIGVFLKLGAHHQALQKLVDVLPEVRHKDTQVAMGPFDPSCLMPACRDYWTYPGSLTTPPLAESVTWIVQKTPVEVSPSQLSMFRTLLFSGRGEEEDVMVNNYRPLQPLRDRKLRSSFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure determination of murine mitochondrial carbonic anhydrase V at 2.45-A resolution: implications for catalytic proton transfer and inhibitor design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase (oxo-acid)
source organism Mus musculus
molecule keywords MURINE CARBONIC ANHYDRASE V
total genus 68
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-10-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1dmxA00
2NNVA 1CAMA 4Q99A 1TTMA 3P5LA 1I91A 3V3GB 1CNGA 2FNKA 4QY3A 3DD0A 4PYXA 1YDBA 3M5EA 4M2RA 2QO8A 4QJXA 1UGBA 3RGEA 4JSAA 3RZ5A 5JEGB 3M5SA 2HD6A 4QJPA 2OSFA 5FLQA 3KNEA 3DVDA 1BNUA 1ZFQA 1HCAA 3P3JA 4Q7PA 4WUQA 1HEDA 1YO1A 1CVAA 1IF7A 3VBDA 1EOUA 3OIMA 1G0EA 3U3AX 4XIWA 4YGLA 1BCDA 4TWMA 4L5WA 4MLTA 4E9OX 1TG3A 1BV3A 2NNGA 3DD8A 4PYYA 3R16A 1UGEA 3OKUA 4UOVA 1URTA 4QJOA 5FNHA 3KKXA 5G0BA 4RUZA 3S9TA 1DMYA 1G48A 4RFCA 4Q6EA 3T84A 5G0CA 4KP5A 2NXRA 5EHEA 4Q7WA 3DA2A 4KNJA 3RYYA 1CAJA 1CIMA 3PYKA 5E5RA 3SAXA 1CINA 2POWA 1CAIA 5J8ZA 4JS6A 4G0CA 3S73B 1ZGFA 1FR7A 4ZWZA 4E5QA 3T83A 4DZ9A 2CABA 4N0XB 4M2WA 1HEBA 1Y7WA 3P5AA 4Q7SA 4Q8YA 4Q49A 4Q06A 4BF6A 1I9OA 3V2JA 3D93A 1A42A 5JQTA 5CA2A 2FNMA 1CNWA 1UGDA 1ZSAA 1ZSBA 5E28A 3MHMA 1BNTA 3DV7A 4L5VA 5JGTB 1TH9A 1KWRA 4Q9YA 1CVEA 4QTLA 4WUPA 4G7AA 4TWLA 4Z1JA 4GL1X 3DBUA 5DOHA 2FOVA 4KNIA 5DSRA 4Q8XA 3JXFA 3KOIA 3S78B 1G3ZA 3ZP9A 2WEJA 3MNIA 2FMGA 2O4ZA 5EIJA 1THKA 2NWYA 3DC3A 4HEZA 3TMJA 3RZ0B 3GZ0A 2H4NA 3M2NA 4WR7A 3M1QA 4R5BA 2X7UA 1G53A 1H9NA 3MDZA 5G01A 3D92A 5EH8A 5SZ1A 4BCWA 5L6KA 1J9WA 3V7XA 3DVCA 4HBAA 2NWOA 1RAYA 4IWZA 4CQ0A 3RYZA 4KV0A 3KWAA 1TEQX 4IDRX 3RG4A 2HKKA 1DCBA 4DZ7A 1LG5A 3DAZA 5JG3B 3EFTA 4MO8A 2EZ7A 4E3FA 1UGGA 3N3JA 5FDIA 5FNMA 5E2NA 1RZAA 2ZNCA 2NWZA 4MTYA 1YDAA 2WEOA 1V9IC 3C7PA 4CNWA 4RUXA 3FE4A 3CYUA 3MHOA 1CRMA 4PQ7A 3V3FA 4KAPA 1I9LA 2AX2A 3F7BA 1CAZA 1JV0A 3M40A 2FOUA 3DVBA 1CNHA 3ZNCA 4RFDA 4LP6A 4Q90A 2FMZA 4E3GA 3IBNA 3M3XA 4QIYA 4KNNA 5HPJA 4CNVA 4RIVA 1Z9YA 4HT0A 3IBLA 5JESB 4XFWA 4FPTA 4Q0LA 5BRVA 1ZE8A 3M1WA 1XEVA 5FNLA 3SAPA 1ZH9A 4QJ0A 5FNJA 3T5ZA 3V3HB 1CAKA 3RZ1B 4WW6A 4HU1A 2X7TA 6CA2A 3IEOA 3OYQA 5A25A 3NI5A 2WD3A 4YGFA 5DSMA 4Q7VA 4YHAA 4E3DA 1XEGA 4PZHA 3N4BA 1KOQA 5SZ2A 3S97A 4YYTA 4FL7A 4MDMA 5EZTX 3SBIA 4YGNA 3F4XA 3OKVA 1I9NA 3U7CA 5FNKA 1YDDA 3UYQA 7CA2A 2CBAA 2X7SA 4KUWA 2POUA 3N2PA 1FQLA 4QJMA 1HVAA 5BYIA 1CCTA 4HT2A 3HKUA 3KS3A 4QK2A 3JXHC 4E4AA 5E2SA 4Q08A 5E5UA 1UGCA 5FLOA 1KWQA 4BF1A 3OIKA 3PO6A 3F8EA 4R59A 3M67A 3FFPX 4X5SA 4XZ5A 5A6HA 3MNUA 5EKMA 4KUVA 3S72B 1CNIA 3R17B 3ML5A 3MZCA 3P3HA 4L5UA 4YXUA 1FSRA 3N0NA 2EU3A 1CNBA 3IBIA 1DMXA 5FLTA 4FIKA 3CAJA 5FNGA 5EH7A 1KEQA 4YXOA 3CA2A 3MWOA 5JEPB 12CAA 5DSQA 3ML2A 1MUAA 3W6HA 1IF6A 1DCAA 1YDCA 2NN7A 4HEWA 2CBEA 2WEHA 1TE3X 4CACA 4YWPA 1OKMA 4Q78A 2NNSA 1G54A 5FLRA 2Q1BA 3RLDA 1BN1A 5DRSA 4XE1A 1FSNA 4JSZA 4FU5A 3P58A 1BNQA 5L3OA 4HF3A 3D9ZA 3IAIA 5DSNA 1HECA 2CBBA 1F2WA 5FLPA 4YX4A 5FL4A 8CA2A 1I9MA 3RYVB 5SZ5A 4M2VA 4ETQC 3W6IA 1CVDA 1LUGA 5BNLA 1HCBA 2VVAX 4QSIA 1TEUX 3HLJA 3JXGA 5AMLA 4Z1NA 2H15A 3EFIA 4CNXA 3RZ7A 4Q81A 5AMGA 1IF5A 2HOCA 3IBUA 3V5GA 2HNCA 1CAYA 5IPZA 3M14A 4ZX0A 5CJFA 1CNYA 4ZWIA 1G0FA 3KOKA 5FLSA 3KIGA 3Q31A 4K0TA 3RZ8A 1AM6A 2F14A 3M2ZA 5JQ0A 3K7KA 5E2MA 2EU2A 1OKNA 1CAHA 4N16A 4QSAA 1AZMA 5FL5A 1BNVA 3BL0A 2IT4A 3KLDB 4LHIA 4R5AA 1OKLA 4MLXA 5SZ6A 3SBHA 5SZ0A 3HKNA 3MHIA 4RUYA 4QEFA 3BETA 4HEYA 3FW3A 5EH5A 1FLJA 3P55A 4ITPA 4E49A 4ZX1A 2FOSA 4FVOA 2WEGA 3HKTA 2CA2A 3T5UA 1CVHA 3S74B 2NMXA 3DCSA 3S71B 2WD2A 1KOPA 1ZNCA 3CZVA 3NB5A 1I90A 1TG9A 3T85A 3PJJA 4E3HA 1H4NA 3K34A 4QSJA 3MNAA 1BNMA 2CBDA 3S76A 1I9PA 2ILIA 4RN4A 4QK1A 4XIXA 5SZ4A 1G4JA 1CCUA 1FQNA 2FW4A 3B1BA 2AW1A 3U47A 5EHWA 1CAOA 1G1DA 3M1JA 2GEHA 4K0ZA 4ZWXA 1CA2A 2FOQA 1UGAA 4Q07A 4WL4A 5CACA 1RZCA 3HS4A 1RJ5A 2GD8A 3M98A 1BNWA 3B4FA 4MDGA 5DSOA 2QOAA 1IF8A 4Q6DA 2VVBX 4MDLA 3IGPA 4Z1KA 2CBCA 1Z93A 4Y0JA 5EOIA 5DSKA 1CZMA 3QYKA 2NWPA 4QK3A 4QJWA 1G52A 3RG3A 1LZVA 1CCSA 5DSPA 1I9QA 5EHVA 1OQ5A 4ZAOA 4Z0QA 4LU3A 3TVOX 3DC9A 2NN1A 1FQRA 1UGFA 3BL1A 4Z1EA 9CA2A 3D0NA 4CNRA 5DSIA 1I8ZA 4JSSA 5DOGA 5JEHB 1XPZA 3RYXB 3DCCA 3P4VA 1ZGEA 5DSLA 3MNKA 3V2MA 3K2FA 1G45A 1CA3A 4FRCA 1G6VA 2FNNA 3MYQA 4YGKA 1CNJA 2Q38A 3V3JA 5E2KA 3OILA 4ZWYA 1IF9A 3T82A 5CLUA 1CALA 4KP8A 3DCWA 1FSQA 3MNHA 3UYNA 1RZDA 1TB0X 3MMFA 5FNIA 3RJ7A 1LG6A 5C8IA 1CNXA 4K0SA 3S77B 1TBTX 4KNMA 4CA2A 3OYSA 1LGDA 3HFPA 4PXXA 1HUGA 2ABEA 3MNJA 3V3IB 5SZ3A 1V9EA 4Q8ZA 4WW8A 1CNCA 1XQ0A 2HFWA 2FOYA 1CVCA 5LMDA 1RZEA 1CILA 5AMDA 1T9NA 1CANA 4ILXA 1RJ6A 1RZBA 5EKHA 1HEAA 2OSMA 3MHCA 3P44A 1JD0A 3NJ9A 5BRUA 5SZ7A 4QIZA 4COQA 1HUHA 1BNNA 1RAZA 1ZSCA 1FQMA 4K13A 5FL6A 2QP6A 2POVA 2NNOA 1BN4A 2Q1QA 3D8WA 3U45X 3HKQA 3TVNX 4C3TA 4ITOA 5E2RA 1MOOA 3M1KA 4RIUA 1CVFA 1Z97A 3MHLA 4RH2A 1CNKA 3OY0A 1ZFKA 5BRWA 5JG5B 4YXIA 4YGJA 1BZMA 5EKJA 1YO0A 1BICA 1CRAA 1IF4A 3S75B 1H9QA 3M2XA 1JCZA 3F7UA 1YO2A 4Q87A 1G46A 4JSWA 2NXSA 1CVBA 3M5TA 4KUYA 5DSJA 3KONA 3LXEA 3M96A 4Q83A 5JGSB 2NXTA 4K1QA 3RYJB 3L14A 5DVXA 1AVNA 2HL4A 1BN3A 3M2YA 1FR4A 5G03A 4YVYA 4FVNA 1G4OA 5JDVB 3S8XA 5FDCA 4QSBA 2W2JA 4Q09A 3M04A 4M2UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NNV A;  1CAM A;  4Q99 A;  1TTM A;  3P5L A;  1I91 A;  3V3G B;  1CNG A;  2FNK A;  4QY3 A;  3DD0 A;  4PYX A;  1YDB A;  3M5E A;  4M2R A;  2QO8 A;  4QJX A;  1UGB A;  3RGE A;  4JSA A;  3RZ5 A;  5JEG B;  3M5S A;  2HD6 A;  4QJP A;  2OSF A;  5FLQ A;  3KNE A;  3DVD A;  1BNU A;  1ZFQ A;  1HCA A;  3P3J A;  4Q7P A;  4WUQ A;  1HED A;  1YO1 A;  1CVA A;  1IF7 A;  3VBD A;  1EOU A;  3OIM A;  1G0E A;  3U3A X;  4XIW A;  4YGL A;  1BCD A;  4TWM A;  4L5W A;  4MLT A;  4E9O X;  1TG3 A;  1BV3 A;  2NNG A;  3DD8 A;  4PYY A;  3R16 A;  1UGE A;  3OKU A;  4UOV A;  1URT A;  4QJO A;  5FNH A;  3KKX A;  5G0B A;  4RUZ A;  3S9T A;  1DMY A;  1G48 A;  4RFC A;  4Q6E A;  3T84 A;  5G0C A;  4KP5 A;  2NXR A;  5EHE A;  4Q7W A;  3DA2 A;  4KNJ A;  3RYY A;  1CAJ A;  1CIM A;  3PYK A;  5E5R A;  3SAX A;  1CIN A;  2POW A;  1CAI A;  5J8Z A;  4JS6 A;  4G0C A;  3S73 B;  1ZGF A;  1FR7 A;  4ZWZ A;  4E5Q A;  3T83 A;  4DZ9 A;  2CAB A;  4N0X B;  4M2W A;  1HEB A;  1Y7W A;  3P5A A;  4Q7S A;  4Q8Y A;  4Q49 A;  4Q06 A;  4BF6 A;  1I9O A;  3V2J A;  3D93 A; 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