1DMYA

Complex between murine mitochondrial carbonic anyhdrase v and the transition state analogue acetazolamide
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
Knots found
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
GTRQSPINIQWKDSVYDPQLAPLRVSYDAASCRYLWNTGYFFQVEFDDSCEDSGISGGPLGNHYRLKQFHFHWGATDEWGSEHAVDGHTYPAELHLVHWNSTKYENYKKASVGENGLAVIGVFLKLGAHHQALQKLVDVLPEVRHKDTQVAMGPFDPSCLMPACRDYWTYPGSLTTPPLAESVTWIVQKTPVEVSPSQLSMFRTLLFSGRGEEEDVMVNNYRPLQPLRDRKLRSSFR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure determination of murine mitochondrial carbonic anhydrase V at 2.45-A resolution: implications for catalytic proton transfer and inhibitor design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MURINE CARBONIC ANHYDRASE V
molecule tags Lyase (oxo-acid)
source organism Mus musculus
total genus 67
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-10-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1dmyA00
5BRWA 3PO6A 5DSNA 1ZGFA 4K0TA 5JG5B 1T9NA 3NI5A 5FLPA 1RJ5A 4RIUA 4WR7A 4N0XB 1FLJA 2ILIA 4RFCA 1TG3A 1TH9A 5E2NA 2EU3A 4Q81A 1J9WA 1YDCA 3MHOA 4YXUA 3M67A 4JS6A 3V2JA 2HD6A 3S8XA 1CVHA 3K34A 1FSQA 3W6IA 4R59A 5SZ4A 3QYKA 3M5SA 4E3HA 4LP6A 3HKUA 1OKMA 4QSAA 1FR7A 4Z1KA 1OKNA 4E4AA 5BNLA 1BCDA 1UGDA 1CZMA 5SZ3A 1CNXA 5CLUA 4ZWZA 3EFIA 5EHEA 1HVAA 5FDIA 4CNXA 4KAPA 4ETQC 3MNHA 4M2VA 4KNJA 1CVEA 3M98A 4ZWXA 4K13A 5FLTA 3TVNX 2WD2A 3SBIA 1CAIA 4Q07A 4ZWIA 4E49A 4PYYA 4GL1X 5DSJA 3S71B 4Z1JA 4YGJA 3KOIA 1KOPA 4ZAOA 1CAHA 5G01A 4YYTA 3HKTA 2W2JA 5LMDA 3DBUA 2HOCA 1ZNCA 5BYIA 1TB0X 3KONA 3F7BA 1CNHA 1TEQX 4LU3A 1RZAA 3P55A 3S74B 3MWOA 3L14A 3B1BA 4QK1A 4RUYA 4TWLA 4BF1A 3M1JA 1I90A 4CQ0A 3D93A 4ILXA 2EU2A 4Q9YA 5JQ0A 1CNIA 1UGEA 5JG3B 1JD0A 3OKVA 1KOQA 2QO8A 3HFPA 3MHIA 3S97A 3M5EA 1G6VA 4QK3A 5G0CA 1FQRA 4JSWA 2NWOA 2H15A 3U45X 4FVNA 1LUGA 5FNLA 1BICA 1CAKA 5FLRA 1BNTA 1G3ZA 2NNSA 1RAZA 5DSPA 4YGNA 3IGPA 1G4OA 4JSSA 2FNMA 4Q87A 3V3FA 3PYKA 1G45A 4FRCA 5EHVA 3U47A 3LXEA 2VVAX 2WEHA 3NJ9A 5SZ7A 4QJWA 1G1DA 5SZ1A 3P5LA 3MHLA 3MZCA 1YO0A 3U3AX 1FSRA 4E3DA 5A6HA 2NXRA 4KUYA 1LZVA 5JGTB 4IDRX 4YXIA 3OYSA 4WW6A 4Q08A 4RN4A 5IPZA 4HU1A 2CBAA 3D92A 3DV7A 3IEOA 3P5AA 4Q83A 4RIVA 5E28A 1RJ6A 5FLQA 2VVBX 4HBAA 1KWQA 2HNCA 2NWYA 3K2FA 3M40A 4TWMA 1CNWA 5DSLA 3HS4A 1CCUA 2FOQA 4G7AA 4PQ7A 1HUHA 4MDMA 4HEZA 1CIMA 2QOAA 4MTYA 4FPTA 3IBNA 9CA2A 5FLSA 5BRVA 4Q06A 3M3XA 4RUXA 4Q7VA 2WD3A 4YGFA 4LHIA 5CACA 1G48A 1CA3A 5FL6A 4L5WA 1TG9A 3OY0A 1TBTX 4X5SA 2CBEA 3N3JA 3OYQA 4ZWYA 3IBIA 4PYXA 3KKXA 3P58A 4ZX1A 4PXXA 5SZ0A 1MUAA 5FNGA 1ZFQA 3ML2A 3CAJA 4Q7WA 1CALA 3MMFA 3UYNA 1IF4A 2AX2A 5FL4A 4QJ0A 1CCTA 3KS3A 3UYQA 1V9EA 3M2ZA 4FVOA 3MNUA 2WEJA 4R5AA 2WEOA 1V9IC 1EOUA 4ZX0A 5JEPB 1TTMA 5G0BA 5FNMA 4E9OX 1G53A 3MNKA 1I9OA 2FOYA 1CAYA 4Z1NA 1XEVA 5DRSA 4E3GA 1BNUA 3M04A 3RZ8A 1YDDA 1FR4A 4QJXA 4QJPA 5DSRA 1I91A 4KNNA 2ABEA 5BRUA 1JCZA 2HFWA 2NMXA 1JV0A 3MHMA 3OIKA 3M1KA 1IF7A 1H4NA 3SBHA 1AVNA 1RZDA 4HEYA 4YX4A 1CVBA 1ZSCA 4WUPA 4XFWA 3F7UA 4Q6EA 1YDBA 2CBDA 3RZ7A 5DSIA 1THKA 3FE4A 3MNIA 5E5UA 1BN1A 1ZSBA 2CA2A 1Y7WA 2Q1QA 4Q99A 3OKUA 1BN4A 2O4ZA 2X7SA 1Z93A 1Z97A 3DD8A 5FNIA 5FNJA 4CNWA 3KNEA 1BNQA 1HCAA 4XZ5A 5L3OA 4Q8YA 3M1QA 1AM6A 3KIGA 4FU5A 6CA2A 1CVCA 2X7TA 1DCBA 4HT0A 3N4BA 1RZBA 5DSQA 3RG4A 3R17B 4K0ZA 1CAMA 1G46A 2NNVA 3DVCA 1TE3X 2FOUA 3OIMA 4JSZA 4KP5A 1IF9A 5JEGB 3GZ0A 1YO2A 3D8WA 3P44A 3DVBA 4ITPA 1ZGEA 4Q09A 3V3GB 4XIXA 3EFTA 1UGGA 5FDCA 4Q0LA 1G52A 5FNKA 1CNGA 3TVOX 2CABA 2FOSA 2NXSA 4YHAA 4Q8ZA 1UGAA 5E2RA 3K7KA 3W6HA 4E3FA 5HPJA 1YO1A 5EH7A 5EOIA 3DAZA 4XE1A 1G4JA 5DSMA 1LG6A 3T83A 3HKQA 1CRMA 5CJFA 2OSFA 3OILA 2Q1BA 4Z1EA 3HLJA 2F14A 2FW4A 1RZCA 3IBLA 1HUGA 1BNVA 1CAJA 5FNHA 3KWAA 4QJOA 1ZE8A 3S77B 1I9QA 4RUZA 3F4XA 2FMZA 4WW8A 4L5UA 5EH8A 3PJJA 4QIYA 5AMLA 3FFPX 2GD8A 1CNYA 2NWPA 4K1QA 4XIWA 1CNBA 4L5VA 4K0SA 5C8IA 4G0CA 3RLDA 3MYQA 2POUA 4Q6DA 4YVYA 4HT2A 3RGEA 5CA2A 5JGSB 3V7XA 2AW1A 3RZ5A 2FNNA 1CNJA 1KEQA 3CYUA 4MO8A 3N2PA 1G0EA 4JSAA 2X7UA 5J8ZA 5AMGA 4Q49A 5EKJA 1CAOA 2EZ7A 1BN3A 1MOOA 1ZH9A 1YDAA 1H9NA 1I9MA 4QEFA 2NXTA 3V3HB 3P3HA 5EIJA 3D0NA 1CRAA 5FL5A 5AMDA 3T5ZA 4Q78A 1CNKA 3ZNCA 4Q90A 3DCWA 1ZFKA 3RYJB 4MDGA 4CACA 1CVFA 1DMYA 3RZ1B 4MDLA 5JDVB 2HKKA 12CAA 3P3JA 3IAIA 2NNOA 5JEHB 5E2MA 1CNCA 3HKNA 3M96A 3Q31A 2CBCA 4KNMA 2HL4A 4CNVA 1FQNA 3RYXB 3T84A 1RZEA 4C3TA 3DD0A 3FW3A 1Z9YA 4COQA 1FQLA 3M5TA 4M2UA 3R16A 3JXHC 3RJ7A 5L6KA 3BL1A 5DOHA 1HECA 3DCSA 3MNAA 4Q8XA 4BF6A 3KLDB 4E5QA 1I9LA 1FQMA 1RAYA 3M2NA 5SZ6A 4YXOA 1CILA 2FNKA 4Z0QA 3T5UA 4QSIA 3RYZA 2FOVA 4FL7A 3TMJA 1HEDA 5E2KA 5EKMA 4HEWA 4RFDA 3NB5A 5DVXA 5E5RA 7CA2A 3CA2A 4WL4A 3KOKA 5DOGA 1CVAA 1G54A 5A25A 3M1WA 2OSMA 1UGBA 4DZ9A 1IF8A 5DSKA 3SAPA 1CANA 5EHWA 1TEUX 4CA2A 1XPZA 2NN7A 3M2YA 4YWPA 4QJMA 1OKLA 4IWZA 4CNRA 1HEAA 1CVDA 3RG3A 5E2SA 4M2WA 1CA2A 4PZHA 1XQ0A 2QP6A 3RZ0B 1LG5A 2POVA 4ITOA 3U7CA 3P4VA 4R5BA 3DVDA 3S76A 1BNNA 4YGLA 3S78B 3ZP9A 1HEBA 3S72B 3B4FA 1CCSA 1OQ5A 3V3IB 8CA2A 3ML5A 5SZ5A 1BNWA 1I9NA 2CBBA 2POWA 1LGDA 1CAZA 2GEHA 3DA2A 4Q7SA 3T82A 1DCAA 3SAXA 1BNMA 3M14A 5EKHA 5JQTA 3F8EA 3VBDA 1I9PA 1UGCA 4QTLA 1IF5A 1G0FA 4MLTA 3V3JA 4KUWA 2IT4A 3V5GA 1URTA 1A42A 4QY3A 4RH2A 1BZMA 1UGFA 5G03A 4FIKA 3RYVB 1F2WA 3V2MA 2FMGA 3MHCA 4M2RA 4MLXA 4YGKA 3DC9A 1H9QA 3MDZA 4QIZA 4WUQA 3RYYA 1BV3A 1CINA 3D9ZA 2NNGA 3BL0A 2NN1A 4KUVA 5EH5A 1XEGA 3DC3A 3BETA 2H4NA 3S73B 4BCWA 1AZMA 3T85A 3JXFA 4Q7PA 4Y0JA 2NWZA 1DMXA 4KV0A 3S9TA 1ZSAA 4UOVA 3DCCA 5JESB 4KP8A 1I8ZA 1IF6A 4HF3A 4N16A 2ZNCA 1KWRA 5DSOA 5SZ2A 1HCBA 3IBUA 3JXGA 4QSJA 5EZTX 4DZ7A 3C7PA 2WEGA 5FLOA 1FSNA 4KNIA 4QSBA 3S75B 2Q38A 3MNJA 4QK2A 3N0NA 3CZVA 3M2XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5BRW A;  3PO6 A;  5DSN A;  1ZGF A;  4K0T A;  5JG5 B;  1T9N A;  3NI5 A;  5FLP A;  1RJ5 A;  4RIU A;  4WR7 A;  4N0X B;  1FLJ A;  2ILI A;  4RFC A;  1TG3 A;  1TH9 A;  5E2N A;  2EU3 A;  4Q81 A;  1J9W A;  1YDC A;  3MHO A;  4YXU A;  3M67 A;  4JS6 A;  3V2J A;  2HD6 A;  3S8X A;  1CVH A;  3K34 A;  1FSQ A;  3W6I A;  4R59 A;  5SZ4 A;  3QYK A;  3M5S A;  4E3H A;  4LP6 A;  3HKU A;  1OKM A;  4QSA A;  1FR7 A;  4Z1K A;  1OKN A;  4E4A A;  5BNL A;  1BCD A;  1UGD A;  1CZM A;  5SZ3 A;  1CNX A;  5CLU A;  4ZWZ A;  3EFI A;  5EHE A;  1HVA A;  5FDI A;  4CNX A;  4KAP A;  4ETQ C;  3MNH A;  4M2V A;  4KNJ A;  1CVE A;  3M98 A;  4ZWX A;  4K13 A;  5FLT A;  3TVN X;  2WD2 A;  3SBI A;  1CAI A;  4Q07 A;  4ZWI A;  4E49 A;  4PYY A;  4GL1 X;  5DSJ A;  3S71 B;  4Z1J A;  4YGJ A;  3KOI A;  1KOP A;  4ZAO A;  1CAH A;  5G01 A;  4YYT A;  3HKT A;  2W2J A;  5LMD A;  3DBU A;  2HOC A;  1ZNC A;  5BYI A;  1TB0 X;  3KON A;  3F7B A;  1CNH A;  1TEQ X;  4LU3 A;  1RZA A;  3P55 A;  3S74 B;  3MWO A;  3L14 A;  3B1B A;  4QK1 A;  4RUY A;  4TWL A;  4BF1 A; 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