1F2WA

The mechanism of cyanamide hydration catalyzed by carbonic anhydrase ii revealed by cryogenic x-ray diffraction
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Mechanism of cyanamide hydration catalyzed by carbonic anhydrase II suggested by cryogenic X-ray diffraction.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1f2wA00
3M67A 4QTLA 5E5UA 3MNJA 1CNHA 1LG5A 3P58A 1ZNCA 3M96A 4N16A 4Q78A 2Q1QA 3KLDB 2NXTA 4FPTA 4Q81A 1FSQA 3FFPX 4WL4A 5G0BA 3SBHA 3K34A 2FNMA 4L5VA 4QK2A 4PZHA 4R59A 1OKMA 3P55A 4IWZA 1HECA 1ZH9A 3OYSA 4XZ5A 3S76A 1HCBA 1I9LA 4CNWA 5E2KA 4FIKA 4QIZA 3DCSA 3MNHA 5FNGA 1CVBA 4FRCA 1ZGEA 4HT0A 3ZNCA 2EU2A 1I90A 5CACA 2Q1BA 3OKVA 4ZAOA 1IF7A 4TWLA 1YDCA 4Q8XA 3U7CA 3P3JA 4QJ0A 1CNCA 1OKLA 4WR7A 3HS4A 1TG3A 5EIJA 3S97A 3IBUA 4PXXA 1CIMA 5FNKA 3RYJB 3MHLA 3RG3A 3DCWA 4E3FA 5E2RA 5DOGA 1MOOA 3N4BA 4QK1A 3JXHC 3UYQA 2CBCA 4WUPA 3F7UA 2CABA 2NWPA 4BF1A 3RZ1B 4Q7SA 12CAA 1J9WA 1Z97A 1ZE8A 1CALA 3IBIA 5CA2A 3RZ0B 3GZ0A 4M2UA 4Q09A 1G46A 1BNVA 1XQ0A 4KNMA 4LP6A 4X5SA 1CAIA 3OKUA 4QEFA 4E5QA 3QYKA 4Q99A 1OKNA 3F7BA 2NWYA 4MDMA 5CJFA 4YHAA 5A25A 2AX2A 3DV7A 5EKHA 3M5TA 1CNIA 3W6IA 4XE1A 1HUHA 4GL1X 4Q7VA 3KIGA 2FOUA 1G3ZA 1HEAA 2WEHA 5JEPB 2NWZA 3HKQA 2VVAX 2IT4A 3OILA 1CNYA 1YDDA 1G54A 5DSQA 5EH7A 2W2JA 8CA2A 4M2WA 3KOKA 5DSLA 3KONA 1BN1A 2WEOA 4RIUA 2X7TA 1FLJA 1G45A 2H15A 3N0NA 4Q8ZA 5FNMA 1UGCA 2HNCA 3RZ7A 3S72B 3RYXB 4CNRA 2WD3A 1BNNA 2NNOA 1CAMA 1XEVA 3T5UA 5EOIA 3ML2A 4YGJA 4HEYA 3S75B 1IF4A 1CAJA 3R17B 3T5ZA 5BRWA 4RN4A 1LZVA 3M98A 1UGEA 3D8WA 1CNGA 5JEGB 3PYKA 3OIMA 3M1JA 2HFWA 3V2JA 4ZWXA 2EZ7A 3S74B 1G6VA 4KUVA 3OYQA 4KUWA 3P44A 3M5EA 5EZTX 5JDVB 1TE3X 1HCAA 1RAZA 4RIVA 3KWAA 4Z1KA 4WW6A 1CA3A 4YXOA 1TTMA 1G4JA 1CA2A 1CAZA 3TMJA 4ETQC 1ZGFA 4MDLA 4MDGA 3M40A 5EHEA 2GEHA 1RZBA 3CZVA 1HEBA 3JXGA 3HKTA 4HU1A 4Q8YA 2CBEA 3MNKA 5AMGA 1I9PA 3M1WA 3BL0A 5JQTA 9CA2A 5L6KA 5FLTA 5DSPA 2F14A 5AMDA 1CVAA 2ZNCA 5DSOA 1TB0X 1I91A 5SZ7A 1V9IC 1OQ5A 3DCCA 1BNTA 5G01A 4Q7PA 1CVHA 5FNHA 1XEGA 3ML5A 1TBTX 5DSMA 3DC9A 3S71B 3M1KA 4ZX1A 2EU3A 3RJ7A 1CVCA 3DVBA 1CAYA 4JSZA 5E2MA 1G4OA 3DC3A 4LHIA 1ZFQA 2POVA 5SZ4A 3DVDA 4HEZA 5J8ZA 4FVNA 3C7PA 4MO8A 4QJOA 1YDAA 4FVOA 1HVAA 1Z9YA 1CILA 4IDRX 3HFPA 3MDZA 4YGKA 3KOIA 3D92A 3RGEA 3K7KA 4Q7WA 4ZWZA 1ZSCA 3FE4A 4Q83A 5DVXA 5FLQA 3NB5A 1UGAA 1FQRA 4C3TA 5SZ2A 4JSSA 3T84A 1CRMA 2WD2A 5SZ6A 5EHWA 5SZ3A 1G0EA 5AMLA 3DD8A 2H4NA 3OIKA 4RFCA 5EH8A 2X7SA 5E2SA 3U3AX 2POUA 5JG5B 4Z1NA 5JG3B 1BNWA 2FW4A 3D93A 3M2YA 4QSJA 3LXEA 5IPZA 1BN3A 2QP6A 4YVYA 3FW3A 5SZ1A 4E3HA 3TVOX 1G52A 4N0XB 3IEOA 3M2NA 1H4NA 1IF9A 3IBNA 4BF6A 1CNKA 5CLUA 2ABEA 1CNBA 1I9MA 5DSIA 7CA2A 1TH9A 3V3HB 2ILIA 5DSNA 2CBDA 1LG6A 1I8ZA 1UGFA 5C8IA 4E3DA 3CYUA 4MLTA 4Q08A 3RZ8A 5EKMA 4Q9YA 1RZDA 5DSRA 3N2PA 1G0FA 3RG4A 3EFTA 1FSRA 4QK3A 2NXSA 2NMXA 4UOVA 4QJWA 1LUGA 5FDIA 1RZCA 4HF3A 2AW1A 5FLPA 1HUGA 4YXIA 1CVEA 4RUYA 4Z1EA 1CNWA 1CAKA 1FSNA 2CBAA 3MZCA 4HT2A 1CNJA 4QJMA 1BNMA 4QSAA 5FL5A 1H9NA 3U45X 3TVNX 1KWRA 3JXFA 4YXUA 1G53A 3V3FA 1JV0A 5JESB 3T82A 4M2RA 2QOAA 4Q07A 4YYTA 1UGBA 3NJ9A 1BN4A 2GD8A 4ZWIA 1URTA 1I9QA 4KV0A 4Z0QA 1TEQX 1ZSAA 2NNVA 5A6HA 3ZP9A 5JEHB 4RFDA 1CVFA 1RJ6A 2CA2A 5G03A 3IGPA 3MNIA 4XIWA 3V3IB 4CA2A 3HKNA 3Q31A 2FMGA 3MHCA 1JD0A 2NN1A 3M3XA 1AZMA 1MUAA 4L5WA 2HKKA 4DZ7A 4Q6DA 3D9ZA 3MNAA 3OY0A 1AVNA 3UYNA 4G0CA 2QO8A 3KS3A 4HBAA 4E9OX 4FL7A 1Y7WA 1JCZA 4WUQA 2NNGA 5DOHA 2Q38A 1THKA 1CNXA 1XPZA 4PQ7A 5HPJA 2HOCA 2O4ZA 3IAIA 5FLRA 1KOQA 2WEGA 5FDCA 1H9QA 4RH2A 5JQ0A 1UGGA 1KOPA 4JSAA 1BNUA 1FR7A 3M14A 1CZMA 4CACA 1DCAA 3V2MA 5FNLA 4YGNA 1Z93A 5LMDA 2NN7A 5G0CA 3HLJA 3BL1A 3SBIA 1FR4A 4QJPA 4Q0LA 3MHMA 5EHVA 1BCDA 4QSBA 1V9EA 3F4XA 3VBDA 4K1QA 5SZ0A 3RYZA 3V3GB 1I9OA 3P5AA 4ZX0A 4XIXA 4K0TA 2VVBX 4RUXA 3SAXA 3BETA 2FOYA 4QIYA 5BNLA 2HL4A 4G7AA 4ILXA 3P3HA 3R16A 4E3GA 4E4AA 2OSMA 4YWPA 6CA2A 1T9NA 5L3OA 3MWOA 5E5RA 4BCWA 1IF5A 5SZ5A 3DVCA 3KKXA 1BV3A 3K2FA 3EFIA 5JGSB 4LU3A 4KNNA 4R5AA 1TG9A 5E2NA 4YGLA 3P5LA 1CCUA 4WW8A 1G1DA 3RZ5A 3SAPA 3S8XA 3MHOA 1YO1A 3HKUA 1TEUX 5FNIA 4YX4A 3T85A 1DCBA 4RUZA 1BICA 4K0SA 4Q90A 5JGTB 5DSJA 1KEQA 3F8EA 2OSFA 1DMXA 1F2WA 4Q6EA 4PYXA 1IF6A 4Q87A 3PJJA 2HD6A 3B4FA 3MHIA 2CBBA 1KWQA 4TWMA 4Z1JA 3PO6A 3V5GA 5FL4A 3V3JA 1FQLA 1AM6A 5FL6A 2FNNA 4JSWA 3L14A 4Y0JA 2FOSA 4K0ZA 1RZEA 1CAOA 4YGFA 4MTYA 1YO2A 4KUYA 4KNJA 1YDBA 5BRVA 4E49A 4QSIA 1ZFKA 2NXRA 3NI5A 2FMZA 3CAJA 4QY3A 3T83A 2NWOA 1LGDA 4HEWA 5E28A 4XFWA 1UGDA 1RJ5A 3M2XA 2NNSA 1CRAA 3D0NA 5FLSA 5DSKA 3RYYA 1BZMA 4PYYA 1CANA 1CCTA 4FU5A 3S78B 1YO0A 4COQA 2X7UA 3RYVB 1CVDA 5DRSA 2WEJA 3RLDA 3MMFA 1RZAA 4JS6A 1FQNA 1RAYA 5BYIA 3M5SA 1BNQA 3KNEA 4ITPA 4Q49A 3M1QA 5BRUA 4CQ0A 3DBUA 4K13A 1CCSA 3CA2A 4MLXA 4Q06A 3W6HA 1EOUA 3MNUA 4CNVA 5EKJA 4CNXA 4ZWYA 4KNIA 4KP8A 4QJXA 3DA2A 2FOVA 3M04A 4L5UA 2FNKA 1A42A 3S9TA 1CAHA 4ITOA 1FQMA 3U47A 1ZSBA 3N3JA 4DZ9A 3S77B 5EH5A 3V7XA 4KAPA 1G48A 3M2ZA 1CINA 4R5BA 1HEDA 2FOQA 3DD0A 2POWA 5FNJA 3P4VA 1I9NA 3MYQA 4KP5A 1DMYA 3B1BA 3DAZA 5FLOA 3S73B 4M2VA 1IF8A 3IBLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M67 A;  4QTL A;  5E5U A;  3MNJ A;  1CNH A;  1LG5 A;  3P58 A;  1ZNC A;  3M96 A;  4N16 A;  4Q78 A;  2Q1Q A;  3KLD B;  2NXT A;  4FPT A;  4Q81 A;  1FSQ A;  3FFP X;  4WL4 A;  5G0B A;  3SBH A;  3K34 A;  2FNM A;  4L5V A;  4QK2 A;  4PZH A;  4R59 A;  1OKM A;  3P55 A;  4IWZ A;  1HEC A;  1ZH9 A;  3OYS A;  4XZ5 A;  3S76 A;  1HCB A;  1I9L A;  4CNW A;  5E2K A;  4FIK A;  4QIZ A;  3DCS A;  3MNH A;  5FNG A;  1CVB A;  4FRC A;  1ZGE A;  4HT0 A;  3ZNC A;  2EU2 A;  1I90 A;  5CAC A;  2Q1B A;  3OKV A;  4ZAO A;  1IF7 A;  4TWL A;  1YDC A;  4Q8X A;  3U7C A;  3P3J A;  4QJ0 A;  1CNC A;  1OKL A;  4WR7 A;  3HS4 A;  1TG3 A;  5EIJ A;  3S97 A;  3IBU A;  4PXX A;  1CIM A;  5FNK A;  3RYJ B;  3MHL A;  3RG3 A;  3DCW A;  4E3F A;  5E2R A;  5DOG A;  1MOO A;  3N4B A;  4QK1 A;  3JXH C;  3UYQ A;  2CBC A;  4WUP A;  3F7U A;  2CAB A;  2NWP A;  4BF1 A;  3RZ1 B;  4Q7S A;  12CA A;  1J9W A;  1Z97 A;  1ZE8 A;  1CAL A;  3IBI A;  5CA2 A;  3RZ0 B;  3GZ0 A;  4M2U A;  4Q09 A;  1G46 A;  1BNV A;  1XQ0 A;  4KNM A;  4LP6 A;  4X5S A;  1CAI A;  3OKU A; 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