1F2WA

The mechanism of cyanamide hydration catalyzed by carbonic anhydrase ii revealed by cryogenic x-ray diffraction
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mechanism of cyanamide hydration catalyzed by carbonic anhydrase II suggested by cryogenic X-ray diffraction.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1f2wA00
3RZ0B 1G46A 1HEAA 4HBAA 1TEQX 4XFWA 2AX2A 4KV0A 4ZWXA 1IF4A 3JXFA 3FW3A 1FQRA 3P58A 4YGFA 5G0BA 1CIMA 1UGFA 3DA2A 4M2RA 5FLOA 5DSQA 2HL4A 4ZX0A 3V7XA 3EFTA 5SZ7A 3PYKA 4PYYA 3N3JA 1MOOA 2FNNA 4RUXA 1TTMA 2Q1QA 3MNJA 5FNMA 1HCAA 2CA2A 3KOIA 4Q49A 4YWPA 1XQ0A 3CYUA 4HU1A 1G48A 4Q8YA 1RZAA 2WEHA 4KUVA 12CAA 3BL0A 3DV7A 1LG6A 4TWMA 4RIVA 1CNJA 1RAYA 4ZWZA 1I90A 4KNJA 4CNRA 1AZMA 3C7PA 1UGAA 3B4FA 1BNTA 4KP5A 5AMGA 3SBIA 1CCSA 1G4JA 4HT0A 2WEJA 3KKXA 4Q83A 1BNMA 3S78B 3DC9A 5JEPB 2Q38A 3MNHA 4Q06A 2QP6A 3MHMA 4QY3A 3IBNA 1DMYA 3KIGA 5G0CA 1CINA 1HCBA 3HKTA 1ZGFA 3TVNX 3IBIA 5JG3B 1H9QA 3RZ7A 4Q08A 4E3GA 3V2JA 3OYSA 3NI5A 2WEGA 3MHLA 3L14A 3RYXB 4IDRX 1RZEA 4GL1X 5E2NA 5BYIA 4QJPA 4QSJA 2FOYA 1G45A 1BNVA 1FSNA 3JXGA 5BNLA 1CVHA 3RLDA 3M2XA 3P5LA 3T83A 3M3XA 4QEFA 1H9NA 1BNWA 4MDGA 5A6HA 1DCAA 4ZWYA 1Y7WA 3MWOA 1RJ5A 3NB5A 4FIKA 4RH2A 5C8IA 5E28A 3SAPA 2CBBA 4CNXA 4WW8A 3CA2A 5CACA 3RG4A 3S74B 1J9WA 4QTLA 4CNWA 1LGDA 4LHIA 2NNSA 1I8ZA 1ZE8A 1I9OA 3F4XA 5FLTA 4COQA 2FOQA 1RJ6A 5CLUA 3ZP9A 2NWYA 4N0XB 1CVBA 1HEBA 5EIJA 4Q7PA 1CAIA 1G54A 1UGBA 5EHWA 3T85A 4MO8A 3M2ZA 5FL5A 2FMZA 2GEHA 5CA2A 2W2JA 5DVXA 1CNWA 3RYJB 1HUGA 5JQTA 1BV3A 5EKHA 4HF3A 3S75B 5LMDA 5EKMA 3RGEA 1RZCA 3SBHA 3U47A 2FNKA 3DCCA 3GZ0A 1UGEA 3IAIA 3MNUA 3M1QA 2FW4A 3PO6A 3HKNA 1I9MA 1ZFKA 5BRWA 4KUYA 5JESB 4ILXA 3M5TA 1CVCA 4Z1EA 4UOVA 4X5SA 5DSRA 2QOAA 7CA2A 1HEDA 3TVOX 4Q7SA 1YO0A 3RZ1B 1YO1A 5FLQA 4FU5A 3M1WA 5DSLA 5SZ6A 2GD8A 5E2MA 4ITPA 2NWPA 1TE3X 1TB0X 2NWOA 1ZSAA 5DRSA 3HLJA 1CCUA 3W6HA 5DSNA 4KNNA 1YO2A 5SZ0A 1ZGEA 3UYQA 3KS3A 3DCWA 6CA2A 4QJXA 4RFCA 5FLPA 1CZMA 4Q07A 4E3FA 3MNIA 5SZ1A 3V3HB 4IWZA 2WD2A 5FL4A 5FNLA 3ZNCA 1T9NA 4Y0JA 3CAJA 4XIXA 1BZMA 1G4OA 3V2MA 3W6IA 3DD8A 3U3AX 4HT2A 5BRVA 1ZFQA 5A25A 2FNMA 1G3ZA 3S72B 4JSWA 4QK2A 3V3JA 1KOQA 3OIKA 5E2RA 3RYVB 1A42A 3KLDB 4R5AA 3UYNA 5JGTB 4RUZA 1CAYA 3QYKA 4YGNA 5FNHA 5J8ZA 1CA3A 5EHEA 4K13A 1Z97A 4Z1JA 1H4NA 3KNEA 3Q31A 3K7KA 1ZNCA 3S8XA 5DSJA 2WD3A 4XE1A 1CVFA 3RZ8A 1TG9A 3M1JA 3F8EA 3DVBA 8CA2A 3DVDA 3MHOA 2HFWA 1CVEA 1KEQA 4E5QA 1UGGA 2Q1BA 4WUPA 3VBDA 4RIUA 4M2UA 1HVAA 1ZSCA 1OKLA 3IBLA 5FDCA 5JEGB 2CBCA 4ITOA 5G03A 4Q87A 4CACA 1KWRA 1FQLA 1HUHA 1JD0A 3OKVA 1IF7A 1CCTA 4Z1KA 4Q8XA 1V9IC 5G01A 5EH5A 1G0EA 1V9EA 4L5VA 3S71B 2EU2A 3B1BA 4WR7A 5DSKA 4YXOA 2FOUA 2NXSA 1CILA 4HEZA 3M40A 2AW1A 3DAZA 3HS4A 3DBUA 2FOSA 3M04A 5EHVA 1G52A 1CNXA 1I9QA 4MLXA 4R5BA 3M98A 1LG5A 4K0SA 4TWLA 1CA2A 5DOGA 5BRUA 4Q7WA 4PYXA 1XEVA 4FVNA 2X7TA 4R59A 5AMDA 3HFPA 3M14A 4YGLA 5IPZA 4QK1A 4RFDA 1AVNA 4C3TA 2ILIA 1BNNA 3BETA 4LP6A 1TG3A 9CA2A 1THKA 3S97A 3KOKA 1YDAA 1CNCA 3S9TA 1OKMA 2X7SA 3MDZA 5DSPA 4DZ9A 3OY0A 5EZTX 1KOPA 3V3IB 4Q9YA 4QK3A 4E49A 1I9LA 4HEYA 3RJ7A 3M2NA 4L5WA 1DMXA 3OILA 4Q78A 4QIZA 5SZ3A 5L3OA 4RUYA 1IF8A 4FL7A 1FR7A 1FLJA 2VVBX 3P3HA 1FSQA 1I9NA 3R16A 3TMJA 3PJJA 2FMGA 4Q7VA 2CBDA 5FL6A 1IF9A 3P44A 3FE4A 1RZDA 1UGDA 2VVAX 3RZ5A 3MHIA 4BF6A 1BN4A 1CALA 2NXRA 4LU3A 5JDVB 5SZ5A 3D0NA 4Q09A 1ZSBA 3IBUA 1YDDA 4XZ5A 2X7UA 1FQNA 1LUGA 1Z9YA 2NMXA 2QO8A 3NJ9A 1MUAA 4G7AA 5DOHA 4KP8A 4L5UA 3U7CA 3N4BA 4WUQA 1CNYA 4YX4A 2EU3A 1Z93A 4CA2A 5CJFA 3OYQA 4K1QA 2POVA 1HECA 3N0NA 3MMFA 4KNIA 2OSFA 4QIYA 2F14A 4QSAA 4Z1NA 3DC3A 3FFPX 3D93A 1I91A 1LZVA 2NNVA 3ML2A 5AMLA 1BICA 5EH8A 4YYTA 4E4AA 4M2WA 4YHAA 1CVDA 2HD6A 1CNBA 4Q6EA 5EOIA 3M67A 4YGKA 4K0TA 1BN3A 1TH9A 3LXEA 4QJ0A 3S76A 5E2KA 3S77B 1FR4A 3K34A 4MTYA 1XPZA 4YXUA 3S73B 2POUA 5SZ2A 3P55A 2NNGA 4BF1A 3F7UA 1CNGA 1RZBA 4KNMA 1IF6A 4QJMA 4N16A 3D9ZA 1F2WA 1EOUA 2FOVA 4FPTA 3M96A 3U45X 5FNGA 1FQMA 1CRMA 1RAZA 3DCSA 2NN7A 3M5SA 2NN1A 3OIMA 4Z0QA 1ZH9A 3BL1A 2HOCA 1G0FA 3KWAA 5FDIA 5JG5B 4HEWA 5JQ0A 3M2YA 4ZX1A 2OSMA 4MDMA 1OQ5A 3K2FA 2IT4A 3T82A 2CABA 3F7BA 4QSBA 1UGCA 4PQ7A 3MNAA 5FLSA 5FLRA 1CAMA 4MDLA 3ML5A 3IGPA 3HKUA 5JGSB 5EH7A 1YDBA 3MYQA 1OKNA 5SZ4A 4JSSA 4QJWA 3P5AA 1CAKA 4ZAOA 4Q90A 4FRCA 1G1DA 4Q81A 1IF5A 2H4NA 4Q6DA 4YVYA 1JV0A 1CANA 1KWQA 1URTA 2O4ZA 4WL4A 2CBAA 4BCWA 4JSAA 3RYZA 4E3DA 1CAZA 3CZVA 3DD0A 4DZ7A 3EFIA 1DCBA 1FSRA 2NNOA 1CNKA 1AM6A 4YXIA 4QSIA 5L6KA 1BCDA 3RYYA 1TEUX 3OKUA 2HNCA 2POWA 4KAPA 4FVOA 2ABEA 3M1KA 3MZCA 3D92A 3P3JA 1XEGA 4Q8ZA 4KUWA 1G53A 4JS6A 5FNJA 4JSZA 3N2PA 1I9PA 1CAHA 4WW6A 3DVCA 4Q0LA 5DSOA 3KONA 3R17B 3D8WA 1JCZA 1G6VA 3SAXA 2WEOA 5DSIA 4G0CA 4Q99A 3T5UA 5FNKA 1CRAA 3V5GA 5E5UA 2HKKA 3V3GB 3HKQA 4ETQC 4ZWIA 5JEHB 5EKJA 1BN1A 5FNIA 4QJOA 4RN4A 4YGJA 3RG3A 1CAOA 5E2SA 1YDCA 2ZNCA 5DSMA 4E3HA 1CVAA 2NWZA 1CAJA 3T5ZA 5E5RA 1CNIA 3M5EA 4M2VA 4K0ZA 5HPJA 3MHCA 2H15A 1BNUA 2EZ7A 1TBTX 2CBEA 1BNQA 3JXHC 4MLTA 4PXXA 1CNHA 3T84A 3V3FA 3P4VA 4XIWA 4PZHA 3IEOA 3MNKA 4E9OX 4CQ0A 2NXTA 4CNVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RZ0 B;  1G46 A;  1HEA A;  4HBA A;  1TEQ X;  4XFW A;  2AX2 A;  4KV0 A;  4ZWX A;  1IF4 A;  3JXF A;  3FW3 A;  1FQR A;  3P58 A;  4YGF A;  5G0B A;  1CIM A;  1UGF A;  3DA2 A;  4M2R A;  5FLO A;  5DSQ A;  2HL4 A;  4ZX0 A;  3V7X A;  3EFT A;  5SZ7 A;  3PYK A;  4PYY A;  3N3J A;  1MOO A;  2FNN A;  4RUX A;  1TTM A;  2Q1Q A;  3MNJ A;  5FNM A;  1HCA A;  2CA2 A;  3KOI A;  4Q49 A;  4YWP A;  1XQ0 A;  3CYU A;  4HU1 A;  1G48 A;  4Q8Y A;  1RZA A;  2WEH A;  4KUV A;  12CA A;  3BL0 A;  3DV7 A;  1LG6 A;  4TWM A;  4RIV A;  1CNJ A;  1RAY A;  4ZWZ A;  1I90 A;  4KNJ A;  4CNR A;  1AZM A;  3C7P A;  1UGA A;  3B4F A;  1BNT A;  4KP5 A;  5AMG A;  3SBI A;  1CCS A;  1G4J A;  4HT0 A;  2WEJ A;  3KKX A;  4Q83 A;  1BNM A;  3S78 B;  3DC9 A;  5JEP B;  2Q38 A;  3MNH A;  4Q06 A;  2QP6 A;  3MHM A;  4QY3 A;  3IBN A;  1DMY A;  3KIG A;  5G0C A;  1CIN A;  1HCB A;  3HKT A;  1ZGF A;  3TVN X;  3IBI A;  5JG3 B;  1H9Q A;  3RZ7 A;  4Q08 A;  4E3G A;  3V2J A;  3OYS A;  3NI5 A;  2WEG A;  3MHL A;  3L14 A;  3RYX B;  4IDR X;  1RZE A;  4GL1 X;  5E2N A; 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