1F2WA

The mechanism of cyanamide hydration catalyzed by carbonic anhydrase ii revealed by cryogenic x-ray diffraction
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mechanism of cyanamide hydration catalyzed by carbonic anhydrase II suggested by cryogenic X-ray diffraction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1f2wA00
3D93A 5FNIA 5DSPA 4K0SA 3RZ8A 3S78B 3V3FA 1CAMA 5DOGA 1BCDA 3GZ0A 1TH9A 3M1JA 4XIXA 4ITOA 5DSKA 3M2ZA 5E5RA 3M67A 3S74B 3DCSA 3DVBA 5SZ3A 4Z0QA 1CINA 3K34A 4KNJA 1HEDA 3RZ7A 5J8ZA 3T82A 3U3AX 3KWAA 4COQA 1BICA 4E3FA 4Q6EA 5G0BA 1CVDA 1XEVA 4ZX1A 3M96A 1BNMA 1Z97A 2NMXA 1BNVA 2NXRA 3V3IB 4Q0LA 4ZWYA 5IPZA 4Q7VA 1V9EA 4HT0A 2EU3A 5A6HA 2POVA 1CAYA 3DD0A 3V2MA 2WEHA 4M2VA 2WEOA 2HD6A 3M1KA 3R17B 4DZ9A 3HLJA 4Q78A 1CVCA 3DCWA 2F14A 5SZ5A 1CNWA 7CA2A 4HEYA 1TE3X 2FOSA 4XE1A 2IT4A 4MLXA 1ZH9A 1Z93A 4LU3A 1ZSAA 3ZNCA 4CNWA 4E3GA 4YGNA 3BL0A 4N16A 4E5QA 4RFDA 5E2MA 1G0FA 3P5AA 1HCBA 4ETQC 4YGKA 4RFCA 4BF1A 1ZSCA 5EZTX 5FL6A 4R59A 3S77B 4BF6A 2NWYA 1I9OA 4KP8A 1FSRA 3VBDA 4RUYA 3HFPA 2CABA 4Q8ZA 1ZGEA 1Z9YA 3RYZA 1I9LA 1UGBA 3EFTA 2Q38A 3LXEA 3MHLA 3QYKA 3B4FA 5EKJA 5G0CA 3T5UA 1RZDA 3IBIA 1CVAA 3S8XA 3NJ9A 4QSIA 1FSQA 4Q87A 3RZ0B 1CNKA 4KNMA 1G1DA 5JGTB 4Q08A 4XFWA 3IAIA 5SZ2A 2FNMA 1JCZA 5AMDA 5JG5B 1YDDA 1KOQA 3MYQA 1TEUX 2WD2A 4GL1X 1CAOA 3T5ZA 1CAKA 4YX4A 5EH7A 3P44A 3P55A 4PXXA 1G4JA 1YDAA 4YGLA 3HS4A 2FMZA 3BETA 4FVOA 3MHCA 1XPZA 5JG3B 4Q81A 1LGDA 4Q7WA 3M1WA 1CVHA 4JSWA 1CNIA 5SZ7A 2X7UA 5FNJA 3RG3A 4RN4A 5E2RA 3MDZA 3RYYA 3CA2A 4G7AA 8CA2A 5FNLA 1MUAA 1OKLA 3OY0A 1HCAA 3U47A 1I8ZA 1F2WA 3S75B 4K0ZA 2WD3A 2AX2A 1UGGA 5L3OA 3N4BA 1YO1A 1ZGFA 2NWOA 4KUWA 5E5UA 1FSNA 3U7CA 1CCUA 1FQLA 1RAYA 4HEZA 3TVOX 4TWLA 5EKHA 4XIWA 4FRCA 2EU2A 4JSSA 2X7SA 1CNBA 3F8EA 1CAIA 2CA2A 2NWZA 4Z1KA 4WW8A 3RG4A 1KEQA 4Q09A 4CNVA 4JSAA 2FMGA 5DSNA 3SAXA 1TG9A 4FL7A 2FOQA 3CAJA 2ABEA 5DSLA 3S73B 4QJOA 1G53A 3M3XA 4ZWIA 4CACA 3OYSA 4LHIA 1CRMA 5E2SA 3MHMA 5FDIA 4TWMA 5FNMA 4Z1JA 2H15A 3D0NA 5A25A 5EKMA 1CNHA 1I9NA 1CA2A 4X5SA 4YHAA 5JQTA 5EHEA 2CBBA 5SZ6A 5JGSB 1RAZA 4MTYA 3HKUA 5DSQA 4HU1A 3MNAA 4QSBA 4Q8XA 2HNCA 1BNTA 1H4NA 4L5VA 5DRSA 1V9IC 1UGEA 5HPJA 4DZ7A 3IBUA 1TBTX 3PO6A 4E9OX 3RZ1B 1OKNA 4Q06A 4WR7A 4Q7SA 1CNXA 4Z1NA 1UGAA 1I9QA 4HT2A 1TG3A 2AW1A 1YDCA 4ZX0A 4RIUA 1ZFKA 3TMJA 1FQRA 4C3TA 3MWOA 5JEHB 5L6KA 4E3DA 4Y0JA 5FLTA 3L14A 2HL4A 3KNEA 4KUYA 5FLSA 3DBUA 2FNKA 5E2KA 1BZMA 2ILIA 3OILA 4HEWA 2CBCA 1BN1A 3EFIA 4ITPA 4RUXA 2X7TA 4Q49A 4XZ5A 3FW3A 1OQ5A 9CA2A 4E3HA 4Q83A 3FFPX 3OIKA 4KP5A 1I9MA 4ZAOA 1LUGA 4K0TA 4KUVA 3DCCA 1CVEA 5FNHA 4CNXA 3DVCA 4R5BA 4IDRX 1AVNA 3F4XA 3KIGA 2VVAX 3OKVA 4RUZA 5JEGB 5FLQA 3PYKA 1DCAA 5CA2A 1DMYA 4QJXA 3KKXA 3M1QA 3K7KA 3R16A 5CLUA 5DSIA 3KLDB 1XQ0A 2GD8A 3OKUA 4WUPA 3MHOA 3D8WA 1AM6A 1MOOA 1G3ZA 1G6VA 3M98A 3T84A 1IF5A 5E28A 2CBEA 1AZMA 2NNVA 2O4ZA 5CJFA 4K1QA 4PZHA 1HEAA 1RZCA 4RH2A 5EHVA 5SZ4A 3ML2A 4WW6A 3MNUA 4Q9YA 3JXGA 4QK1A 3W6HA 1LG5A 3D9ZA 3HKQA 1YO2A 1YO0A 4CQ0A 1UGCA 1TEQX 5DVXA 4R5AA 3M2NA 3N2PA 4PQ7A 3V7XA 3T83A 5G01A 5JEPB 1CAJA 3M5SA 5FNGA 5BYIA 1THKA 2WEJA 4YYTA 4YWPA 5JQ0A 1BV3A 3MNIA 4HBAA 1JD0A 3W6IA 4ZWZA 3V5GA 3Q31A 4QJPA 2WEGA 3DVDA 1KWQA 2ZNCA 4Q90A 1CAZA 5C8IA 3KS3A 4Q8YA 6CA2A 4YVYA 3FE4A 5LMDA 2OSFA 2W2JA 2HFWA 4QY3A 1KOPA 3SAPA 1CNJA 4QSJA 1UGFA 4QIYA 1URTA 3S9TA 1CAHA 2NNSA 1CCTA 2QP6A 1G52A 5FLPA 4HF3A 1KWRA 5JDVB 5BRVA 3P3JA 1CA3A 3DAZA 3P4VA 3UYQA 4FVNA 5DSRA 1G45A 1G46A 3IBLA 2NNOA 4QK2A 1CIMA 4KNNA 3RGEA 4M2RA 2CBDA 4Q6DA 3TVNX 3V3JA 2NN7A 1T9NA 3DC3A 3RJ7A 3NI5A 5E2NA 1LG6A 3DA2A 1HECA 1HEBA 1XEGA 1CANA 1ZE8A 1TB0X 1G48A 1G4OA 5G03A 1CVBA 3MHIA 1G0EA 4LP6A 5AMLA 3S97A 2OSMA 3V2JA 3SBHA 1DCBA 4CA2A 3M2YA 2NXSA 2VVBX 5CACA 3RZ5A 2H4NA 4E49A 4MLTA 3S72B 1TTMA 1I9PA 4YGJA 4JSZA 4QJMA 4QEFA 1H9QA 2Q1QA 4UOVA 1J9WA 1RZBA 1CNYA 3BL1A 4L5UA 4KV0A 1ZFQA 5DSMA 3RYJB 3V3GB 3JXFA 4YXOA 2HKKA 4BCWA 3DC9A 2NN1A 4YGFA 5AMGA 1I90A 3RYVB 4YXIA 4QSAA 3HKTA 4WUQA 1IF7A 2QOAA 1FLJA 1RJ5A 4G0CA 4Z1EA 1HUGA 2FOUA 3M40A 3MNHA 1BNQA 5EH8A 5DSOA 3IBNA 1HVAA 3N0NA 4QJ0A 3MNKA 3S76A 2FNNA 5EIJA 4ILXA 1RJ6A 3JXHC 1CILA 3DV7A 3ML5A 5DOHA 5BRUA 1FQMA 2GEHA 4E4AA 2CBAA 5FL5A 1IF4A 1FQNA 4WL4A 3M14A 1JV0A 1BN4A 3KONA 5JESB 5FL4A 1BNNA 3CYUA 3DD8A 4MO8A 3IGPA 1DMXA 3P58A 5FNKA 4YXUA 5BNLA 3N3JA 5FLOA 3M04A 4FU5A 5EOIA 3KOIA 4IWZA 4KAPA 1IF6A 4MDMA 4N0XB 4MDGA 3U45X 3UYNA 1OKMA 1ZNCA 2NNGA 2POUA 1H9NA 3OYQA 1UGDA 1Y7WA 1BNWA 5EHWA 1A42A 1CNCA 1ZSBA 3SBIA 4PYYA 5SZ1A 3T85A 5FLRA 4M2UA 1CALA 1CVFA 1LZVA 3RLDA 1CCSA 4CNRA 3CZVA 3MNJA 1IF8A 1IF9A 1HUHA 3B1BA 3K2FA 1G54A 3RYXB 3F7BA 4Q99A 3M5TA 2NXTA 4ZWXA 4MDLA 4PYXA 4FPTA 1BNUA 3D92A 1CNGA 1RZEA 4L5WA 3V3HB 1RZAA 2EZ7A 3MZCA 1FR7A 4Q7PA 4RIVA 4QIZA 3ZP9A 3C7PA 5SZ0A 1CRAA 3OIMA 2NWPA 4M2WA 3MMFA 3PJJA 4QK3A 1FR4A 1EOUA 3KOKA 1BN3A 3M2XA 2FOVA 2FW4A 4FIKA 3F7UA 3NB5A 4Q07A 5DSJA 4QJWA 2FOYA 4KNIA 2POWA 1I91A 2HOCA 1YDBA 3M5EA 3P3HA 5BRWA 12CAA 3S71B 4K13A 4JS6A 3HKNA 2Q1BA 3P5LA 1CZMA 5EH5A 2QO8A 3IEOA 5FDCA 4QTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3D93 A;  5FNI A;  5DSP A;  4K0S A;  3RZ8 A;  3S78 B;  3V3F A;  1CAM A;  5DOG A;  1BCD A;  3GZ0 A;  1TH9 A;  3M1J A;  4XIX A;  4ITO A;  5DSK A;  3M2Z A;  5E5R A;  3M67 A;  3S74 B;  3DCS A;  3DVB A;  5SZ3 A;  4Z0Q A;  1CIN A;  3K34 A;  4KNJ A;  1HED A;  3RZ7 A;  5J8Z A;  3T82 A;  3U3A X;  3KWA A;  4COQ A;  1BIC A;  4E3F A;  4Q6E A;  5G0B A;  1CVD A;  1XEV A;  4ZX1 A;  3M96 A;  1BNM A;  1Z97 A;  2NMX A;  1BNV A;  2NXR A;  3V3I B;  4Q0L A;  4ZWY A;  5IPZ A;  4Q7V A;  1V9E A;  4HT0 A;  2EU3 A;  5A6H A;  2POV A;  1CAY A;  3DD0 A;  3V2M A;  2WEH A;  4M2V A;  2WEO A;  2HD6 A;  3M1K A;  3R17 B;  4DZ9 A;  3HLJ A;  4Q78 A;  1CVC A;  3DCW A;  2F14 A;  5SZ5 A;  1CNW A;  7CA2 A;  4HEY A;  1TE3 X;  2FOS A;  4XE1 A;  2IT4 A;  4MLX A;  1ZH9 A;  1Z93 A;  4LU3 A;  1ZSA A;  3ZNC A;  4CNW A;  4E3G A;  4YGN A;  3BL0 A;  4N16 A;  4E5Q A;  4RFD A;  5E2M A;  1G0F A;  3P5A A;  1HCB A;  4ETQ C;  4YGK A;  4RFC A;  4BF1 A;  1ZSC A;  5EZT X;  5FL6 A;  4R59 A;  3S77 B;  4BF6 A;  2NWY A;  1I9O A;  4KP8 A;  1FSR A;  3VBD A; 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