1H9QA

H119q carbonic anhydrase ii
Total Genus 72

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELQLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI1 (8-11)TIV1 (9-12)3H1 (13-18)3H2 (21-24)TIV2 (18-21)TIV9 (241-244)AH1 (131-135)S12 (191-196)TIV3 (25-28)TIV6 (105-108)S1 (32-33)TI2 (34-37)TI4 (41-44)S6 (78-82)TVIII1 (75-78)S3 (46-50)S9 (116-124)TI5 (51-54)S5 (66-70)S11 (172-175)TII1 (169-172)S4 (56-61)TIV4 (62-65)AH2 (158-163)3H5 (164-166)AH3 (220-227)S7 (88-97)TII'1 (81-84)TII2 (233-236)TIV5 (98-101)TI6 (100-103)TIV7 (108-111)S8 (108-109)S10 (141-150)TI'1 (109-112)3H3 (125-128)O1 (128-130)TIV8 (137-140)TVIa1 (200-203)S13 (207-212)S14 (216-218)3H4 (155-157)3H6 (181-183)S2 (39-40)TII'2 (251-254)Updating...
connected with : NaN
publication title Histidine --> carboxamide ligand substitutions in the zinc binding site of carbonic anhydrase II alter metal coordination geometry but retain catalytic activity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 72
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1997-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1h9qA00
4PYXA 3MMFA 4MTYA 1I90A 3F7BA 4KNMA 3UYNA 1FQNA 4E4AA 1ZSAA 3HS4A 1TE3X 3M1QA 3M3XA 5EKHA 1FSRA 2HOCA 5SZ1A 3S75B 4DZ9A 4JSAA 4YGKA 1HEBA 2FNMA 4Q6DA 4XIXA 1ZFQA 3ZP9A 4K0SA 4YYTA 4BCWA 3NI5A 2IT4A 1XEVA 4E5QA 1DCBA 5HPJA 4DZ7A 4FL7A 2F14A 3M2YA 3OYSA 3MDZA 5FLRA 4XFWA 2NNOA 3K34A 4Q09A 1OQ5A 5DSOA 1THKA 1JCZA 3KLDB 4ZWZA 4ILXA 2POVA 1CZMA 4BF6A 3BL1A 5DSQA 3KS3A 4FRCA 1DMXA 5FLQA 1CVEA 3D92A 1YO2A 1TEUX 4QJXA 5DSKA 1BNMA 4WUQA 5BRVA 5FLSA 3CAJA 4M2WA 4L5UA 3S76A 3M2ZA 2CBCA 4QK3A 5E5UA 3N2PA 5JG3B 5SZ5A 3F4XA 3CA2A 4RFCA 2AW1A 2CABA 5DSPA 2GD8A 2WEJA 3S97A 3MYQA 1IF7A 3DVCA 3LXEA 3RYJB 4MDGA 4RN4A 3KONA 3M40A 2NWPA 1YDCA 4FVOA 3BETA 5EKMA 1CVCA 4LHIA 1UGBA 5JGSB 4QTLA 5C8IA 2HD6A 4QIZA 5DSMA 4KUWA 3OKVA 3BL0A 5E2NA 3UYQA 8CA2A 3HKTA 4QJPA 4R5BA 1Z97A 1IF9A 4Q81A 1CNYA 1FQMA 3DCCA 3MHOA 1LGDA 1CCUA 1HCAA 4QJOA 5FDIA 4Q78A 2VVAX 2POWA 5E2SA 1Y7WA 4K13A 1G53A 1BN4A 2O4ZA 1CVDA 4WW8A 4R59A 1LG6A 5JEHB 2NNGA 3MZCA 3DVBA 2CA2A 3RGEA 5L3OA 4E49A 1XQ0A 3EFIA 5DOHA 2H15A 1BNNA 1XEGA 1LG5A 2FOVA 1HEAA 3M67A 3PJJA 1CRMA 1IF5A 5CLUA 1CILA 5E5RA 3RYXB 1BNVA 5JEGB 4Q49A 5FL6A 1ZGFA 1I9LA 4PYYA 2FOSA 1CNJA 7CA2A 3N4BA 4JSSA 4RIVA 4PZHA 2FMGA 1TBTX 4R5AA 2ILIA 5DSRA 12CAA 3M1KA 4JSZA 4YX4A 2Q1BA 2VVBX 3F7UA 4RUXA 3TVNX 4Z1JA 4N16A 5BYIA 5JGTB 4Q87A 3M5SA 4Z1NA 4KP8A 4E9OX 3IBIA 5AMGA 3DD8A 3DCWA 4LU3A 1BNTA 1RJ6A 3S72B 5JQ0A 1TG3A 3GZ0A 3DCSA 2FOUA 3M5EA 3DV7A 2NMXA 3V3IB 4QSJA 1KOQA 4Y0JA 1BNUA 1JV0A 1OKNA 1RZEA 3P5AA 1YDBA 1KWRA 4WUPA 3CYUA 3F8EA 2POUA 3D9ZA 3P44A 4K0ZA 4HF3A 5JESB 1CCTA 1I9QA 4QSAA 5G0CA 4QJWA 3TVOX 3D93A 4YWPA 3RYZA 3QYKA 3DC9A 2WEGA 1G3ZA 3HKUA 4M2VA 4Q8YA 3K2FA 4YGJA 3S77B 5SZ7A 4YGNA 3M2NA 5JEPB 4HEWA 4BF1A 4CNWA 5A6HA 2NNSA 3MNJA 5LMDA 3V3JA 4ZX0A 5FNJA 3MNAA 5FLTA 4QK1A 3TMJA 3RLDA 1FQLA 1RZCA 4YXIA 3SAPA 1BV3A 5BRWA 1YDDA 3ML2A 1ZE8A 1XPZA 3W6HA 1UGFA 3SBIA 3KKXA 3HFPA 3SBHA 5DSJA 1CNIA 1BN3A 1JD0A 4Z1EA 2HL4A 2WEHA 5CA2A 4Q6EA 3OYQA 3EFTA 3W6IA 3V2MA 2NXTA 3T85A 4ZX1A 3P5LA 2QO8A 5FLPA 2ABEA 4ITOA 4QY3A 1UGCA 3M5TA 3RZ5A 4Q9YA 1CA3A 3M14A 1Z9YA 1MOOA 1CRAA 4RH2A 4HBAA 3Q31A 3RZ1B 3IBNA 3M2XA 1YDAA 3V7XA 1BN1A 4WR7A 4KNJA 3M1JA 3D8WA 2FMZA 3RJ7A 3M1WA 4QK2A 3C7PA 4KNIA 1FR4A 1TTMA 4Z1KA 3NJ9A 5DVXA 1CINA 4WW6A 3MHIA 1KEQA 3M96A 2OSMA 2Q1QA 2QOAA 5G01A 4K1QA 1H9QA 3MNIA 2EZ7A 1CNXA 3T5ZA 1F2WA 1J9WA 3SAXA 5L6KA 3OY0A 4MO8A 1CAJA 1TEQX 3MHCA 2CBBA 4ZWXA 1IF4A 3DAZA 3T5UA 4XIWA 1G52A 3JXFA 4TWLA 1CAKA 3PYKA 2WD2A 5E2MA 3U3AX 1T9NA 4HEZA 3HKNA 3P58A 1AM6A 4YGFA 1I9PA 1UGGA 4FPTA 4Q7VA 5FNKA 1G4JA 1V9EA 3ZNCA 2OSFA 3S71B 4FIKA 4KUYA 4Q7PA 4CNVA 3U45X 2NN7A 4Q7WA 1CANA 5FL5A 3KOKA 4G0CA 2NXRA 4M2UA 4CNXA 3FFPX 1LZVA 2CBEA 3P3HA 5EKJA 2X7UA 1BZMA 1ZSCA 1I8ZA 4YGLA 4COQA 1KWQA 2H4NA 1G54A 5EH7A 4CQ0A 1G6VA 4UOVA 3V2JA 4QJ0A 1HUHA 1CAOA 9CA2A 2QP6A 3OIKA 6CA2A 3HLJA 1TH9A 1G4OA 1FR7A 2WEOA 1FSQA 5FLOA 3V5GA 1I9MA 4RUYA 4FVNA 5AMLA 4Q7SA 1TB0X 3R16A 1CAMA 5FNHA 1ZGEA 1FSNA 2HNCA 3N0NA 4QJMA 4MDLA 4PXXA 4Q08A 3S9TA 4KP5A 2X7SA 5SZ4A 3RZ8A 1AVNA 5BRUA 5JDVB 5DSNA 1CAHA 4ZAOA 5A25A 1OKLA 1BICA 4Q8XA 1ZFKA 4CNRA 1CA2A 2GEHA 2Q38A 3MHLA 1CVFA 4KV0A 3T82A 1HVAA 3V3GB 1HECA 1IF6A 3NB5A 3M04A 1I91A 4RFDA 5FL4A 4ETQC 5EHVA 1CNWA 1G0EA 3U7CA 4JSWA 1CCSA 3PO6A 4L5WA 5SZ0A 1BCDA 1IF8A 1Z93A 3V3FA 2FOQA 3HKQA 1I9OA 4QIYA 1CAIA 4Z0QA 1CALA 1UGDA 3KNEA 4C3TA 3RZ0B 1CNGA 5E28A 2NWYA 1UGEA 4GL1X 3MNUA 4YVYA 3S8XA 5JG5B 1CNKA 1ZSBA 3DA2A 1RZAA 1CAZA 2HFWA 2WD3A 3FW3A 4HT2A 1ZNCA 4E3HA 3MWOA 1DCAA 1H9NA 3M98A 5SZ2A 4FU5A 4KUVA 1CNBA 4ITPA 4L5VA 4Q06A 2AX2A 4XZ5A 1I9NA 3CZVA 5EHWA 2NN1A 1TG9A 4HT0A 1CNCA 3JXHC 4HEYA 3JXGA 3MNKA 4IWZA 4Q90A 2EU2A 4QEFA 1LUGA 1CVHA 4IDRX 4MLTA 1EOUA 3RZ7A 3N3JA 2CBAA 3RG4A 5JQTA 5J8ZA 1YO1A 3RYYA 3KIGA 3MHMA 3R17B 4Q0LA 3P3JA 3IAIA 3OIMA 3P55A 1ZH9A 4QSBA 4XE1A 5EOIA 1H4NA 3ML5A 4ZWYA 1G0FA 2CBDA 1KOPA 3IGPA 4ZWIA 3S78B 4Q83A 3S74B 3V3HB 1DMYA 1RAYA 5EH8A 1HUGA 3RYVB 4CA2A 4X5SA 5IPZA 2FNKA 1CIMA 4YHAA 1CNHA 5DSIA 3RG3A 3IBLA 1BNQA 5E2RA 1G45A 3K7KA 1FQRA 3KOIA 5E2KA 4RIUA 1HEDA 4JS6A 3L14A 3OILA 5EHEA 3U47A 3FE4A 4YXUA 5BNLA 1RZBA 1G1DA 4QSIA 1YO0A 4E3DA 1HCBA 3IEOA 4Q99A 4M2RA 1UGAA 3DC3A 3P4VA 3DD0A 4G7AA 5EIJA 5FDCA 5G03A 1A42A 1RAZA 2HKKA 3OKUA 4K0TA 5CJFA 4WL4A 3D0NA 2FNNA 4KAPA 1BNWA 2NNVA 1AZMA 1G46A 3VBDA 4N0XB 1G48A 4E3FA 4HU1A 4E3GA 4TWMA 5DSLA 5DRSA 1CVBA 4CACA 4PQ7A 5CACA 1CVAA 3DVDA 1RJ5A 5FNLA 2FOYA 2FW4A 4LP6A 5EZTX 2X7TA 5FNGA 3T84A 1FLJA 4MLXA 5FNIA 2EU3A 3S73B 1URTA 3DBUA 4KNNA 1CAYA 5EH5A 5FNMA 5AMDA 4YXOA 3B4FA 5DOGA 3IBUA 1MUAA 5G0BA 4MDMA 2NWZA 5SZ3A 4RUZA 2NXSA 2NWOA 3T83A 2W2JA 3MNHA 4Q07A 3B1BA 4Q8ZA 1OKMA 5SZ6A 1RZDA 2ZNCA 3KWAA 1V9IC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PYX A;  3MMF A;  4MTY A;  1I90 A;  3F7B A;  4KNM A;  3UYN A;  1FQN A;  4E4A A;  1ZSA A;  3HS4 A;  1TE3 X;  3M1Q A;  3M3X A;  5EKH A;  1FSR A;  2HOC A;  5SZ1 A;  3S75 B;  4DZ9 A;  4JSA A;  4YGK A;  1HEB A;  2FNM A;  4Q6D A;  4XIX A;  1ZFQ A;  3ZP9 A;  4K0S A;  4YYT A;  4BCW A;  3NI5 A;  2IT4 A;  1XEV A;  4E5Q A;  1DCB A;  5HPJ A;  4DZ7 A;  4FL7 A;  2F14 A;  3M2Y A;  3OYS A;  3MDZ A;  5FLR A;  4XFW A;  2NNO A;  3K34 A;  4Q09 A;  1OQ5 A;  5DSO A;  1THK A;  1JCZ A;  3KLD B;  4ZWZ A;  4ILX A;  2POV A;  1CZM A;  4BF6 A;  3BL1 A;  5DSQ A;  3KS3 A;  4FRC A;  1DMX A;  5FLQ A;  1CVE A;  3D92 A;  1YO2 A;  1TEU X;  4QJX A;  5DSK A;  1BNM A;  4WUQ A;  5BRV A;  5FLS A;  3CAJ A;  4M2W A;  4L5U A;  3S76 A;  3M2Z A;  2CBC A;  4QK3 A;  5E5U A;  3N2P A;  5JG3 B;  5SZ5 A;  3F4X A;  3CA2 A;  4RFC A;  2AW1 A;  2CAB A;  5DSP A;  2GD8 A;  2WEJ A;  3S97 A;  3MYQ A;  1IF7 A;  3DVC A;  3LXE A;  3RYJ B;  4MDG A;  4RN4 A;  3KON A;  3M40 A;  2NWP A;  1YDC A;  4FVO A;  3BET A;  5EKM A;  1CVC A;  4LHI A;  1UGB A;  5JGS B; 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