1J9WA

Solution structure of the cai michigan 1 variant
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
DWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFRVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE I
publication title Crystal structure of a zinc-activated variant of human carbonic anhydrase I, CA I Michigan 1: evidence for a second zinc binding site involving arginine coordination.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 70
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2001-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1j9wA00
5E2MA 1CA2A 3T85A 3S72B 8CA2A 1BICA 1YO0A 3HKNA 2WD3A 2IT4A 5EZTX 1ZSCA 4M2UA 5DSLA 1RZCA 1CNXA 1G48A 4E3DA 4MTYA 4HEYA 4Q8YA 5FNIA 5FL4A 1LUGA 1I9QA 1MOOA 3B1BA 5SZ2A 3RZ5A 4KUWA 3MNHA 3M40A 3SAXA 5AMDA 1RAYA 1ZH9A 1FR7A 4FRCA 1BNNA 3KOKA 4RIUA 5SZ0A 2NNSA 4K0TA 1UGAA 2WEJA 4Z1JA 4FL7A 3OYSA 4E3HA 4Q90A 4Q49A 1YO2A 4R59A 4RUYA 4YWPA 4FPTA 3PJJA 4ZWZA 1CILA 1H9QA 4KNNA 4QSJA 1I9OA 1JCZA 3HKQA 4COQA 5DSPA 4JSSA 1EOUA 5JG3B 2FNNA 3DVDA 4E3FA 3M96A 3W6IA 1CVAA 3DCCA 5BNLA 3P58A 1G53A 1TTMA 4LU3A 4KUYA 4Q83A 5SZ6A 1BN4A 4Q8ZA 1FSNA 3RG4A 2NN1A 3KOIA 1ZGFA 3ZP9A 3QYKA 1CCTA 1CZMA 1KEQA 1CAHA 4KNIA 1CAKA 1HEAA 4WL4A 1G4OA 3P44A 4RIVA 3FFPX 3M2YA 5E2KA 3S78B 4QSAA 4Q99A 1JV0A 4CACA 1ZGEA 5G03A 3OKUA 5CJFA 4QIYA 1YDAA 1AM6A 1TG9A 5EH8A 4E4AA 4L5VA 3UYQA 3P55A 4RUXA 3VBDA 5AMGA 5JGTB 5JEGB 1RJ5A 5DRSA 1FLJA 5FDIA 3K34A 4K13A 4YX4A 4MO8A 4YGKA 4R5AA 1CAOA 1CRAA 3FW3A 5A6HA 3MNUA 3MHLA 5FNKA 2Q1BA 3HKTA 4QSIA 3N0NA 3PYKA 4QIZA 4KP8A 3L14A 2HNCA 3KS3A 4Q08A 4MDGA 4MLTA 1TG3A 1Z97A 1CANA 3JXGA 1UGBA 4Q09A 5AMLA 4K0SA 3RYJB 1G0EA 2WEHA 1JD0A 1RZBA 3HS4A 3RYYA 3HFPA 3RJ7A 4K1QA 1IF6A 3BL0A 3BL1A 3OILA 4ITOA 4K0ZA 4XIXA 5HPJA 4Q6DA 5IPZA 3S9TA 3DVCA 3U3AX 3V3GB 3RYXB 4UOVA 1FR4A 2QO8A 4LHIA 3V2MA 2EZ7A 2CBBA 5BRVA 3S8XA 4PYYA 4CA2A 1TEUX 2NXSA 2QOAA 4PXXA 5E5UA 1OKMA 3D8WA 1G54A 1BNWA 4XZ5A 2CBCA 4HEWA 1CIMA 5FLRA 1FQNA 2HFWA 2NXRA 4PZHA 4Z0QA 3S76A 2FNKA 1CNIA 1RZAA 1CVEA 2GD8A 4YGNA 2NNOA 3UYNA 5JG5B 4WUQA 4FVNA 2AX2A 4XE1A 5DSOA 4KUVA 4JSZA 1F2WA 4QJPA 2Q1QA 5FLQA 4JSWA 4CNVA 5L3OA 3DBUA 1TB0X 2HKKA 4QJWA 1HEDA 5EHVA 4Z1NA 3K2FA 4PYXA 2FMGA 1FQLA 4ZWXA 9CA2A 3KWAA 4Q6EA 1ZSAA 5EH5A 1CAYA 2CBAA 4ILXA 4WW6A 2H4NA 1IF8A 5FDCA 4DZ7A 4E5QA 3DCWA 4ZWYA 2CBDA 5JGSB 4PQ7A 3V3FA 1DMXA 1BNTA 5SZ3A 5BRWA 1V9EA 1XEVA 3T5ZA 5CLUA 1G1DA 1XQ0A 4YGJA 2HD6A 1LG5A 1RZEA 5DSKA 1BZMA 1V9IC 3RG3A 2NMXA 4QK2A 2VVBX 2NWZA 1DCBA 5EIJA 5FL6A 2FOQA 4ZAOA 3TVOX 3V3IB 3KNEA 3N4BA 4RFCA 2FNMA 4Z1EA 1XEGA 2POUA 3T82A 1IF9A 5L6KA 5LMDA 3MNJA 5DSJA 2F14A 3MHCA 1CVHA 4Q9YA 5E2RA 1IF5A 1CNYA 4QJXA 3D92A 2POWA 1CCSA 1HUGA 3K7KA 5FLTA 3RZ7A 1ZNCA 3M2XA 1FQRA 4Q0LA 1I91A 1CALA 1HEBA 1KOQA 1G3ZA 3M5EA 1YDBA 4ETQC 3M3XA 2NWPA 4BCWA 4G0CA 4RUZA 4Y0JA 1HCAA 4KV0A 1OKNA 4HEZA 2OSFA 3KONA 4XFWA 4XIWA 1YDDA 3PO6A 1BNVA 3RYVB 5A25A 3M1KA 4TWLA 4HT0A 5JEPB 3MNIA 1BV3A 1OQ5A 1KOPA 5G0CA 3V3HB 1A42A 2NWOA 4GL1X 3EFIA 3IGPA 3V7XA 2X7UA 3M2ZA 4M2WA 3FE4A 1DMYA 3CAJA 3NI5A 1CVDA 4MLXA 3V5GA 3S77B 1H9NA 4KNMA 4E3GA 3TMJA 5SZ7A 1CNGA 3NJ9A 4N16A 2WEGA 3DA2A 4MDMA 3ML5A 3P3JA 1G4JA 1CNCA 1LG6A 3M5SA 5E28A 4IWZA 3M2NA 4E49A 1Y7WA 3P4VA 4M2RA 2ABEA 1CNKA 2NXTA 4QY3A 5FNHA 4CQ0A 3TVNX 5DSNA 1G45A 3P5AA 1H4NA 3MHMA 4YXOA 1BCDA 2POVA 4WW8A 5EKJA 2NWYA 5FLPA 4QSBA 4RH2A 1G6VA 3MMFA 1UGDA 5FNLA 3DCSA 4Q7VA 4YHAA 1OKLA 4L5UA 3T83A 2W2JA 1ZE8A 5FNJA 1MUAA 5G01A 1J9WA 1G46A 3M1QA 4RFDA 3Q31A 1DCAA 1IF7A 2ILIA 3MHIA 4YXUA 4IDRX 3NB5A 3M5TA 4Q06A 4ITPA 3N3JA 1CA3A 3IEOA 4N0XB 2X7TA 3D0NA 3RZ1B 5SZ1A 5JEHB 5DVXA 4QJMA 3MZCA 1BNMA 5FLSA 4DZ9A 4R5BA 1BN3A 4RN4A 1CVFA 5DOGA 4Q87A 3F8EA 1I8ZA 3DAZA 4WUPA 1I9PA 4FIKA 1BN1A 4QJ0A 2NNGA 5E2NA 4WR7A 3CA2A 5FNGA 3U47A 5JESB 2EU3A 4ZX1A 3HKUA 2AW1A 2EU2A 4X5SA 5E5RA 5BRUA 1TH9A 1I90A 1CNBA 2OSMA 4FU5A 4QTLA 3M1WA 1TE3X 1AVNA 3EFTA 3IBNA 2GEHA 3IBLA 2CBEA 3SBHA 5E2SA 1CAZA 4YGFA 1Z9YA 4BF6A 1CNHA 1CVCA 4Q78A 1CNWA 1RZDA 5EH7A 4YGLA 1CCUA 1RJ6A 3OIKA 4C3TA 5CACA 5DSMA 5SZ5A 3DV7A 3IBIA 1ZSBA 1FSQA 3MYQA 5EHWA 1HUHA 1FQMA 1FSRA 4FVOA 4YYTA 2WEOA 2ZNCA 1IF4A 2Q38A 2O4ZA 1I9LA 1UGEA 3OYQA 1CAIA 4M2VA 3T84A 3P5LA 3KLDB 5SZ4A 1I9MA 3RZ0B 7CA2A 3S74B 3CZVA 4L5WA 5J8ZA 4KNJA 2QP6A 3S71B 3GZ0A 3DC9A 4TWMA 4HU1A 3IAIA 5CA2A 5FL5A 1UGFA 3M14A 2H15A 4JSAA 1UGCA 3D93A 4QJOA 3SBIA 3M04A 4G7AA 2FMZA 5FNMA 4CNRA 4YXIA 4KAPA 5EHEA 1CAMA 5DSIA 1CAJA 3N2PA 1LGDA 2WD2A 3F7BA 4ZWIA 3S73B 3RLDA 4MDLA 1YDCA 4QK3A 3R17B 1HVAA 1ZFKA 3SAPA 4Q8XA 1YO1A 1THKA 4QEFA 4CNXA 3JXFA 3D9ZA 3M1JA 1TEQX 3W6HA 5G0BA 5JQTA 12CAA 3F7UA 4LP6A 3LXEA 5EOIA 1T9NA 3U45X 5FLOA 4HT2A 3R16A 5DSRA 1URTA 3ZNCA 1G0FA 3IBUA 3S75B 1CINA 1UGGA 5DSQA 2CABA 2FOYA 2VVAX 1XPZA 5C8IA 4HBAA 1G52A 4JS6A 3OIMA 1CRMA 1ZFQA 3V2JA 1LZVA 3MDZA 3RGEA 3DVBA 4ZX0A 1Z93A 1HECA 3MNKA 2FW4A 1BNQA 5JDVB 1AZMA 3P3HA 1TBTX 3KKXA 3M98A 1KWRA 3CYUA 3OY0A 3JXHC 2X7SA 5BYIA 4Q7SA 3BETA 3HLJA 3V3JA 3DD0A 4KP5A 3F4XA 4CNWA 3RYZA 4Z1KA 4Q81A 1RAZA 1KWQA 2NN7A 4YVYA 3M67A 1BNUA 3DC3A 3OKVA 6CA2A 3RZ8A 1CNJA 3C7PA 3KIGA 2FOSA 5EKMA 5DOHA 2FOVA 3MHOA 5JQ0A 3DD8A 4HF3A 4Q07A 4BF1A 2HOCA 5EKHA 3ML2A 4QK1A 3T5UA 3MWOA 4Q7WA 1HCBA 4Q7PA 3S97A 1I9NA 3MNAA 1CVBA 2FOUA 4E9OX 3U7CA 2CA2A 2HL4A 3B4FA 2NNVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5E2M A;  1CA2 A;  3T85 A;  3S72 B;  8CA2 A;  1BIC A;  1YO0 A;  3HKN A;  2WD3 A;  2IT4 A;  5EZT X;  1ZSC A;  4M2U A;  5DSL A;  1RZC A;  1CNX A;  1G48 A;  4E3D A;  4MTY A;  4HEY A;  4Q8Y A;  5FNI A;  5FL4 A;  1LUG A;  1I9Q A;  1MOO A;  3B1B A;  5SZ2 A;  3RZ5 A;  4KUW A;  3MNH A;  3M40 A;  3SAX A;  5AMD A;  1RAY A;  1ZH9 A;  1FR7 A;  4FRC A;  1BNN A;  3KOK A;  4RIU A;  5SZ0 A;  2NNS A;  4K0T A;  1UGA A;  2WEJ A;  4Z1J A;  4FL7 A;  3OYS A;  4E3H A;  4Q90 A;  4Q49 A;  1YO2 A;  4R59 A;  4RUY A;  4YWP A;  4FPT A;  3PJJ A;  4ZWZ A;  1CIL A;  1H9Q A;  4KNN A;  4QSJ A;  1I9O A;  1JCZ A;  3HKQ A;  4COQ A;  5DSP A;  4JSS A;  1EOU A;  5JG3 B;  2FNN A;  3DVD A;  4E3F A;  3M96 A;  3W6I A;  1CVA A;  3DCC A;  5BNL A;  3P58 A;  1G53 A;  1TTM A;  4LU3 A;  4KUY A;  4Q83 A;  5SZ6 A;  1BN4 A;  4Q8Z A;  1FSN A;  3RG4 A;  2NN1 A;  3KOI A;  1ZGF A;  3ZP9 A;  3QYK A;  1CCT A;  1CZM A;  1KEQ A;  1CAH A;  4KNI A;  1CAK A;  1HEA A;  4WL4 A;  1G4O A;  3P44 A;  4RIV A;  3FFP X;  3M2Y A;  5E2K A;  3S78 B;  4QSA A;  4Q99 A; 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