1KEQA

Crystal structure of f65a/y131c carbonic anhydrase v, covalently modified with 4-chloromethylimidazole
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
238
structure length
238
Chain Sequence
GTRQSPINIQWKDSVYDPQLAPLRVSYDAASCRYLWNTGYAFQVEFDDSCEDSGISGGPLGNHYRLKQFHFHWGATDEWGSEHAVDGHTYPAELHLVHWNSTKYENCKKASVGENGLAVIGVFLKLGAHHQALQKLVDVLPEVRHKDTQVAMGPFDPSCLMPACRDYWTYPGSLTTPPLAESVTWIVQKTPVEVSPSQLSMFRTLLFSGRGEEEDVMVNNYRPLQPLRDRKLRSSFRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of F65A/Y131C-methylimidazole carbonic anhydrase V reveals architectural features of an engineered proton shuttle.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Mus musculus
molecule keywords F65A/Y131C-MI Carbonic Anhydrase V
total genus 73
structure length 238
sequence length 238
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2001-11-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1keqA00
3IBLA 4G0CA 5EH5A 5DSMA 4Q6DA 3IBNA 2NNOA 1Z9YA 2WEHA 3RYZA 4FRCA 2FW4A 3DC9A 1LZVA 3N4BA 2HKKA 3S75B 2X7SA 4ZWIA 1CVEA 4Q49A 1YO2A 4WUPA 4LP6A 1TB0X 2AX2A 3FFPX 1ZSAA 4RIUA 4QJ0A 3KS3A 1YO0A 4Y0JA 2POVA 1CAYA 5A6HA 1OKMA 1I9MA 3UYQA 3TVOX 4Z0QA 3DCSA 2FNMA 3K7KA 5E5RA 1I8ZA 5AMLA 4E3FA 5C8IA 5FLPA 3NI5A 3P3HA 1CAKA 5SZ2A 1HEBA 3V3FA 5JDVB 5DOGA 4CACA 3HFPA 2FOYA 4YGFA 3IEOA 4Q83A 1CVAA 1Z97A 4QJPA 3RZ0B 3HKNA 1G53A 4BF6A 3RG4A 4QSJA 3F4XA 3S9TA 2CBDA 4KNJA 2IT4A 4HU1A 4IDRX 4PYXA 5SZ4A 4Q87A 2CABA 4PXXA 1BNTA 1XQ0A 1CIMA 3DC3A 1JCZA 5DSPA 3MHOA 2WEOA 5E2NA 5EZTX 1IF7A 5G01A 3SBHA 1EOUA 3MNHA 4Q78A 3K2FA 4Q8XA 1CCUA 1KEQA 3NB5A 1G3ZA 4Z1EA 3IBUA 4G7AA 4M2RA 1FQLA 1I9LA 5JGSB 1T9NA 3T5ZA 3TVNX 5A25A 1RZCA 2AW1A 3U3AX 1MOOA 3OYQA 4YGKA 3D8WA 1XEVA 1ZFQA 3IAIA 4CA2A 1TH9A 3RYVB 4CNXA 3BL1A 1FQRA 1HECA 3DAZA 4Q90A 1CNKA 4HF3A 3V3IB 1FQMA 2QP6A 9CA2A 5EHWA 1CVHA 4YGNA 1CANA 3T83A 3SAPA 4RN4A 3RZ5A 1CCSA 4YWPA 4ILXA 2GD8A 1BV3A 3U7CA 3OILA 4KNIA 4E5QA 4MDMA 2POUA 2CBAA 1H4NA 3OIMA 4CNVA 3M1QA 4HEWA 3RLDA 5IPZA 4QIZA 3KIGA 4KUYA 4RUYA 4K0ZA 3CAJA 4K1QA 2Q38A 3M96A 5E2MA 4ZWXA 1BN1A 4CNWA 5EOIA 5FDIA 4Q07A 1BN4A 5FLQA 5JGTB 1JD0A 5E2SA 4GL1X 4Q7PA 4ZX0A 4ZX1A 1AVNA 3JXFA 3TMJA 3IGPA 4R5AA 3DCWA 4K0SA 4FU5A 3B4FA 1RZEA 1DCAA 1BNUA 1CALA 4QIYA 3T82A 1HEDA 1IF9A 1BNMA 4E4AA 5JQTA 4C3TA 4K13A 2EU2A 4TWMA 1H9NA 1CAHA 3DVDA 4MLXA 1HVAA 3M04A 2HNCA 2HOCA 4KNNA 2NXSA 3DBUA 3LXEA 1RAZA 4XIXA 3MYQA 1JV0A 1UGFA 2CBBA 3M1KA 5FLRA 5BNLA 1FSRA 3MHMA 4QSBA 3IBIA 1G4JA 1URTA 1CCTA 3MNUA 4QJXA 2NWZA 5DOHA 3MMFA 2WEJA 1CNYA 8CA2A 1RZAA 4M2WA 3MHCA 2HL4A 5JQ0A 3PYKA 4E3DA 1AM6A 1BZMA 6CA2A 5FL5A 3C7PA 3RGEA 1CNWA 5FNLA 1V9EA 4RH2A 4HEZA 3V3HB 5JG5B 3HLJA 4ZWYA 1CAOA 2X7UA 3D0NA 4Z1KA 1HCBA 1TG9A 3T84A 1ZH9A 4Q7WA 1RZBA 1CAZA 4FVOA 5EKMA 4KV0A 3OKVA 2W2JA 3UYNA 5DSJA 2OSFA 5AMDA 1LUGA 3M1JA 5FNMA 2NXTA 1CA3A 3EFIA 4COQA 1UGCA 2ILIA 4QJWA 4Q8YA 1G0FA 4Q08A 5FNGA 2NN1A 3R16A 1BNNA 2NWYA 4E9OX 3D92A 2CA2A 2H4NA 4QK1A 4WR7A 3D93A 4Z1JA 1CRMA 1DMYA 4Q06A 3RZ7A 4FL7A 5FNHA 3RG3A 2HFWA 3KLDB 4ZWZA 5E5UA 3P5LA 1TG3A 4K0TA 1CAIA 1CVBA 5HPJA 3M40A 4JS6A 4JSWA 4MO8A 2FNKA 2FNNA 2F14A 4BF1A 2Q1BA 4M2VA 5L3OA 3P58A 4L5WA 1UGEA 5G0BA 2FOSA 2NWPA 4Q6EA 3M5SA 4JSAA 2NNSA 1CRAA 3MHIA 1RAYA 1FQNA 1ZGFA 3OKUA 4JSZA 3M2YA 2ZNCA 3S77B 5BRWA 5CACA 4XFWA 4QTLA 2FOUA 3S73B 1J9WA 5E2RA 3CYUA 2NXRA 1OKLA 3ML5A 4Q81A 3RZ8A 2Q1QA 1HCAA 3M14A 4MDGA 1IF4A 1LG5A 4L5UA 4QK2A 4RFCA 1BNWA 2ABEA 1FR4A 4E3HA 2NN7A 4FIKA 4QSIA 3CA2A 1CVDA 3FW3A 5AMGA 1TBTX 1I9NA 3PO6A 1KWQA 4YX4A 5SZ5A 1CNBA 4MLTA 3R17B 1A42A 7CA2A 1G4OA 3V2JA 3F7UA 4QSAA 3S97A 4DZ9A 3MZCA 3RYYA 1H9QA 1FR7A 1Y7WA 1G6VA 4M2UA 4KUWA 3OIKA 1YDBA 5E2KA 3RJ7A 1TTMA 2NNGA 3W6HA 1UGDA 3MNIA 3VBDA 1LG6A 3DVBA 5SZ3A 1CNGA 3RYJB 4KNMA 1BICA 1XEGA 5G0CA 5LMDA 3P5AA 3SBIA 1G46A 2WD3A 5FNIA 4WW8A 3P3JA 3N0NA 1TE3X 4ITPA 2QOAA 4YXOA 4ZAOA 3F7BA 4UOVA 3KONA 5FDCA 5BRUA 3OYSA 4XZ5A 3W6IA 4JSSA 5EHVA 3V2MA 3KKXA 1IF5A 4DZ7A 1UGGA 3T85A 3P4VA 5DSNA 3DVCA 3N2PA 3Q31A 4FPTA 1RJ6A 4HT0A 5G03A 3V7XA 5JEHB 4Q09A 3N3JA 1BNQA 5JEGB 4YHAA 1CAJA 4YVYA 3V3GB 4E3GA 2WEGA 5SZ7A 4MTYA 3MNAA 3T5UA 4PYYA 5EKJA 2POWA 1BN3A 1ZGEA 5JESB 4R5BA 3V5GA 3DD0A 2O4ZA 3HKUA 4XIWA 4N16A 1YDDA 1HEAA 4YGJA 2GEHA 2EU3A 5FL4A 1RJ5A 1YDAA 3M5EA 1G48A 12CAA 1IF8A 2FOVA 5FL6A 3S76A 1KOQA 4HEYA 5EH7A 3S78B 4WW6A 3K34A 1KWRA 3M3XA 1I9OA 5DSRA 3KOKA 5DVXA 5J8ZA 5BYIA 3U45X 3BL0A 3OY0A 5L6KA 1I9QA 3M98A 5EIJA 4QJMA 4YXUA 5SZ6A 1CILA 3S8XA 1AZMA 1UGBA 4ITOA 1FSQA 5FNKA 1V9IC 1DCBA 3CZVA 4YXIA 1THKA 1CNCA 5CLUA 1F2WA 5EKHA 3L14A 3M2NA 4RFDA 3HKQA 3JXGA 4L5VA 4QEFA 1OKNA 4Q0LA 5CJFA 1G52A 1HUGA 1XPZA 3HS4A 4XE1A 1MUAA 2X7TA 4KUVA 5JEPB 1DMXA 3RZ1B 4QK3A 4QY3A 4WUQA 1CNHA 2QO8A 4CNRA 1ZSBA 2NNVA 1IF6A 1G1DA 3RYXB 4R59A 2H15A 5DSLA 1RZDA 3MNJA 3V3JA 3S71B 1CVCA 1CNIA 4Q9YA 5E28A 2CBEA 3MHLA 2WD2A 3D9ZA 4X5SA 1YDCA 3JXHC 4Z1NA 2HD6A 3F8EA 4MDLA 4KAPA 2FOQA 3MWOA 3PJJA 5SZ0A 1I91A 5CA2A 3M5TA 4TWLA 1LGDA 3KNEA 1CZMA 4HT2A 4QJOA 3U47A 4Q8ZA 3QYKA 3S74B 3ZP9A 1BCDA 1CA2A 5DSOA 4IWZA 3FE4A 1ZNCA 3M2XA 5FLOA 5JG3B 1UGAA 2CBCA 4LU3A 4WL4A 3DV7A 3EFTA 4Q7SA 1TEUX 5DSIA 1CAMA 2EZ7A 4BCWA 3DA2A 1I9PA 3BETA 3KWAA 4LHIA 5EH8A 5BRVA 1BNVA 3M67A 4E49A 1CINA 4RIVA 5FLTA 5DSKA 1ZFKA 2NWOA 1I90A 2VVBX 3MNKA 4RUXA 5EHEA 1CVFA 4KP5A 3KOIA 3DD8A 3ZNCA 1G0EA 1CNXA 3NJ9A 1HUHA 3P55A 4PZHA 3P44A 1FSNA 5DRSA 4YYTA 3M1WA 1Z93A 2VVAX 1CNJA 2NMXA 1YO1A 5SZ1A 4KP8A 3DCCA 3GZ0A 3MDZA 4N0XB 4HBAA 1G54A 2FMZA 1KOPA 2FMGA 3SAXA 4YGLA 1G45A 4Q99A 5DSQA 3HKTA 4ETQC 4Q7VA 4RUZA 4FVNA 1FLJA 1OQ5A 3M2ZA 5FLSA 2OSMA 1ZSCA 4PQ7A 5FNJA 3S72B 4CQ0A 1TEQX 3ML2A 3B1BA 1ZE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IBL A;  4G0C A;  5EH5 A;  5DSM A;  4Q6D A;  3IBN A;  2NNO A;  1Z9Y A;  2WEH A;  3RYZ A;  4FRC A;  2FW4 A;  3DC9 A;  1LZV A;  3N4B A;  2HKK A;  3S75 B;  2X7S A;  4ZWI A;  1CVE A;  4Q49 A;  1YO2 A;  4WUP A;  4LP6 A;  1TB0 X;  2AX2 A;  3FFP X;  1ZSA A;  4RIU A;  4QJ0 A;  3KS3 A;  1YO0 A;  4Y0J A;  2POV A;  1CAY A;  5A6H A;  1OKM A;  1I9M A;  3UYQ A;  3TVO X;  4Z0Q A;  3DCS A;  2FNM A;  3K7K A;  5E5R A;  1I8Z A;  5AML A;  4E3F A;  5C8I A;  5FLP A;  3NI5 A;  3P3H A;  1CAK A;  5SZ2 A;  1HEB A;  3V3F A;  5JDV B;  5DOG A;  4CAC A;  3HFP A;  2FOY A;  4YGF A;  3IEO A;  4Q83 A;  1CVA A;  1Z97 A;  4QJP A;  3RZ0 B;  3HKN A;  1G53 A;  4BF6 A;  3RG4 A;  4QSJ A;  3F4X A;  3S9T A;  2CBD A;  4KNJ A;  2IT4 A;  4HU1 A;  4IDR X;  4PYX A;  5SZ4 A;  4Q87 A;  2CAB A;  4PXX A;  1BNT A;  1XQ0 A;  1CIM A;  3DC3 A;  1JCZ A;  5DSP A;  3MHO A;  2WEO A;  5E2N A;  5EZT X;  1IF7 A;  5G01 A;  3SBH A;  1EOU A;  3MNH A;  4Q78 A;  3K2F A;  4Q8X A;  1CCU A;  1KEQ A;  3NB5 A;  1G3Z A;  4Z1E A;  3IBU A;  4G7A A;  4M2R A;  1FQL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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