1LGDA

Crystal structure analysis of hca ii mutant t199p in complex with bicarbonate
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLPTPPLLESVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Organization of an efficient carbonic anhydrase: implications for the mechanism based on structure-function studies of a T199P/C206S mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2002-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1lgdA00
3M2ZA 4Q7SA 5DSIA 3IAIA 4Q8YA 1G48A 8CA2A 3V3FA 4CACA 4K1QA 1BNVA 2CABA 1G46A 3RZ1B 4DZ7A 1XEVA 1IF6A 3D8WA 4X5SA 4COQA 3DVCA 3RG4A 3U3AX 1Z9YA 4YGKA 1BNTA 1G52A 1H9QA 4RH2A 1XEGA 1ZSBA 2NNOA 1BNQA 4LU3A 1ZH9A 2NWZA 3N2PA 1OKLA 2FOUA 1CNWA 4QJXA 1G0EA 1CVHA 2VVAX 5A6HA 4Q8ZA 4ZWXA 5FNLA 5DSJA 1RAZA 1BNNA 4PYYA 4JS6A 3N4BA 3V3GB 1CINA 1FSRA 3OIMA 1ZFQA 1THKA 3N3JA 4K0SA 2WEGA 1YO2A 1CNHA 4K0TA 4RIUA 1JD0A 4JSWA 4M2WA 3M40A 4ZX1A 5JDVB 2X7SA 3ML5A 5SZ5A 4Z1NA 3M5TA 3BETA 3DA2A 4QIYA 2EU2A 5G01A 5JESB 5SZ4A 3MYQA 5DSRA 4XFWA 3TVOX 4M2RA 5EKMA 1FR7A 3W6IA 3T5ZA 1DMYA 1HCAA 3QYKA 4CQ0A 4ZWYA 1TG3A 1RZAA 4KUYA 2H4NA 4Q08A 3ML2A 5E2RA 3M2YA 3RJ7A 1I9QA 1CIMA 4MO8A 3DC9A 5DSPA 5E2SA 3W6HA 1TTMA 4WUQA 3UYNA 12CAA 1ZSAA 3Q31A 1CAJA 2QO8A 3CYUA 2CBDA 3KONA 3MNUA 5J8ZA 3UYQA 1DMXA 3TMJA 1OKMA 5FLSA 1HCBA 4E3DA 1URTA 1CNXA 1FQMA 2CBEA 2FOYA 2AW1A 1FR4A 5LMDA 3DBUA 3BL1A 2HFWA 3HKQA 2WD2A 2NXSA 1TH9A 1BNMA 3U7CA 5FLQA 2H15A 1OKNA 4N0XB 3R16A 1XPZA 5JGSB 4QSIA 1YDDA 3DC3A 5EOIA 3EFIA 3S75B 4Y0JA 3P3HA 5EH7A 3TVNX 5CA2A 5G03A 5IPZA 2O4ZA 5L6KA 3RG3A 3N0NA 4QEFA 5JGTB 1RJ6A 4KNNA 1IF4A 1YO1A 3OY0A 1CNBA 4G7AA 4YXUA 5JEGB 4KNIA 3OYSA 5E28A 1CZMA 1HEDA 5JG5B 4YX4A 1CCUA 4ZX0A 3T82A 3P5AA 4L5VA 3PYKA 3FFPX 5DSKA 1CILA 4G0CA 4RUXA 4E3HA 4MDMA 2NNVA 2EZ7A 3ZNCA 3IEOA 1Z93A 3OILA 2NXTA 4Q06A 3V3HB 2FMGA 3HFPA 5DSOA 5G0BA 1H9NA 1HEBA 3RYZA 3P55A 2WEHA 5L3OA 4Q87A 3SAXA 5FNIA 4E3FA 1BICA 2CA2A 1UGDA 3D92A 2HKKA 4YGFA 1CAMA 3DV7A 1LZVA 2NN7A 1I9OA 4PXXA 5HPJA 1MOOA 3KOKA 4MLTA 3D0NA 4RFDA 4QJMA 1G1DA 3K34A 1XQ0A 2FMZA 3EFTA 4FRCA 4KP8A 4E3GA 3KNEA 5DSQA 4GL1X 2NWPA 1CRAA 4WR7A 3DCSA 3DD8A 5EHWA 1I9LA 4RUYA 4Q99A 4Q7PA 4R5BA 2GD8A 4QK1A 1IF8A 3JXGA 3B1BA 3FW3A 5AMDA 1CVCA 3RZ7A 1HECA 4KUVA 1CAHA 1CNGA 1CAZA 3P3JA 3K2FA 3M5EA 3NB5A 4N16A 5EHVA 4YHAA 1HEAA 2FOVA 5EHEA 2X7TA 5FDCA 1G45A 3T85A 3FE4A 4Q81A 2ILIA 2WD3A 2Q38A 3MNHA 2POUA 3VBDA 4BF1A 4QK3A 5FL4A 4CNWA 2HD6A 1J9WA 3V2MA 2ZNCA 1TEQX 5BRWA 4QJPA 4HEWA 1I90A 3DVBA 1CNCA 2Q1BA 3D93A 4Q6EA 3OYQA 2OSFA 3T5UA 2FNMA 3S78B 1I8ZA 3HKNA 4FL7A 3HKTA 5JG3B 3RYJB 3M14A 3MDZA 4CNRA 1DCAA 1F2WA 1DCBA 3OKVA 4ILXA 5JEHB 3DCWA 2NWOA 1CRMA 1ZSCA 4CNXA 3P4VA 2F14A 4YGJA 5SZ1A 3KIGA 4E9OX 1CAKA 1I9MA 4ITOA 1CVFA 1ZNCA 4Q0LA 4MLXA 1UGGA 4KAPA 5E2NA 3SBHA 5EH5A 3MZCA 4Q9YA 1UGFA 1TG9A 1Y7WA 1FSQA 3LXEA 2WEJA 4MTYA 1ZFKA 4UOVA 4ZWIA 5A25A 2QOAA 5DOHA 1CAOA 4FVOA 1BN4A 3JXHC 3IBNA 4IDRX 4HEYA 2CBCA 4QJ0A 4RN4A 3OIKA 2FNNA 4JSZA 5FNGA 9CA2A 4JSAA 5SZ0A 3U45X 5FLPA 3S97A 5DSLA 3V3IB 2WEOA 4KV0A 4PZHA 1CAYA 4MDLA 4HT2A 4XIXA 3KWAA 3NI5A 5SZ3A 3IBUA 3M1JA 2FOQA 5DOGA 3OKUA 4ZAOA 2X7UA 3KOIA 4M2VA 3MHOA 4HEZA 3RYVB 3RZ8A 4LP6A 3MHIA 4QSAA 4YYTA 1UGAA 4YVYA 5E5UA 1AVNA 3V3JA 1CA2A 3C7PA 2W2JA 3MNKA 4PYXA 3S8XA 5DVXA 1ZGFA 1YDCA 4KNJA 1LG5A 3V5GA 4TWMA 5BRVA 1TBTX 5E5RA 3PJJA 3M3XA 3R17B 5EH8A 1I91A 4E4AA 4PQ7A 1G6VA 2CBBA 2FNKA 3F8EA 5JQ0A 1UGBA 4KUWA 3HKUA 3MNAA 5JQTA 5FLTA 5CACA 3D9ZA 2POVA 4K13A 1MUAA 3GZ0A 3KS3A 1G4JA 3M1QA 1CVDA 3IGPA 1RZBA 1CALA 4E5QA 2NMXA 5FL6A 3M96A 5CJFA 5FL5A 4QSBA 2QP6A 5G0CA 4BCWA 5EIJA 4Q7WA 3HLJA 1T9NA 1TEUX 3V7XA 1CVEA 5DRSA 6CA2A 4E49A 3MNJA 1RZEA 1BN3A 4XZ5A 1HUGA 2NNSA 1EOUA 3CZVA 1FLJA 4Q83A 5DSNA 1RJ5A 4K0ZA 4QJOA 1BNUA 1CCSA 4HU1A 1HUHA 1YDBA 2Q1QA 1TE3X 4YXIA 4QK2A 3DVDA 1BV3A 1KOPA 4Q07A 4WUPA 1BZMA 4Q8XA 5FNJA 1CNIA 1BNWA 1H4NA 1UGEA 1V9IC 3K7KA 4TWLA 4C3TA 3P44A 5E2MA 3P5LA 5BYIA 3M67A 1JV0A 1I9PA 4YGLA 4ITPA 1IF5A 5FNMA 3JXFA 3MHMA 5EKHA 1KEQA 1UGCA 2EU3A 4QIZA 4ZWZA 3M5SA 4Q09A 2NN1A 3CAJA 5EKJA 4HT0A 4HBAA 4QTLA 4IWZA 2OSMA 2NXRA 4YWPA 1KOQA 4MDGA 2FW4A 4Z0QA 2NWYA 1YO0A 2POWA 1IF9A 3DD0A 3M1KA 5E2KA 4CA2A 5EZTX 1FSNA 4XE1A 7CA2A 3RGEA 1I9NA 4L5UA 1AM6A 1KWQA 1A42A 1CNKA 3CA2A 4Q90A 1ZGEA 3MWOA 1V9EA 3DCCA 4L5WA 3IBLA 3T83A 3M98A 4WL4A 1FQRA 1OQ5A 1CAIA 4FVNA 3SAPA 3SBIA 4LHIA 3S9TA 3RYYA 3IBIA 1LUGA 4Q78A 3RLDA 5DSMA 1CVAA 2IT4A 5FNHA 3T84A 3HS4A 1CCTA 5SZ7A 4YXOA 4FU5A 4FIKA 5FNKA 5FLRA 2ABEA 1FQLA 4RFCA 1JCZA 1CVBA 3P58A 1IF7A 5AMLA 5FDIA 1RZCA 4WW6A 3DAZA 3RYXB 3RZ0B 2GEHA 2HL4A 3NJ9A 4BF6A 1RZDA 1G4OA 1LG6A 5SZ6A 3V2JA 1KWRA 1CNJA 3M2NA 4R59A 3MMFA 4WW8A 2AX2A 3B4FA 4Q6DA 4ETQC 4KP5A 5FLOA 5BRUA 4CNVA 4Z1JA 1G3ZA 3S74B 1YDAA 3M2XA 3U47A 4HF3A 4Z1EA 3M04A 3MHLA 2VVBX 4KNMA 5SZ2A 1RAYA 4QSJA 3MNIA 1HVAA 1FQNA 1CNYA 2NNGA 3PO6A 3KLDB 3RZ5A 3F7UA 4JSSA 4RIVA 1BCDA 3L14A 3ZP9A 5CLUA 2CBAA 1G53A 1ZE8A 3MHCA 4FPTA 4M2UA 5BNLA 3BL0A 4Q7VA 4QJWA 4YGNA 2HNCA 3S71B 1CANA 1G54A 1LGDA 3F7BA 3KKXA 3S77B 4Q49A 2HOCA 1BN1A 2FOSA 1AZMA 1Z97A 3S72B 3S73B 4XIWA 4DZ9A 5C8IA 1CA3A 4RUZA 5AMGA 3M1WA 3S76A 1TB0X 1G0FA 5JEPB 4Z1KA 3F4XA 4R5AA 4QY3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M2Z A;  4Q7S A;  5DSI A;  3IAI A;  4Q8Y A;  1G48 A;  8CA2 A;  3V3F A;  4CAC A;  4K1Q A;  1BNV A;  2CAB A;  1G46 A;  3RZ1 B;  4DZ7 A;  1XEV A;  1IF6 A;  3D8W A;  4X5S A;  4COQ A;  3DVC A;  3RG4 A;  3U3A X;  1Z9Y A;  4YGK A;  1BNT A;  1G52 A;  1H9Q A;  4RH2 A;  1XEG A;  1ZSB A;  2NNO A;  1BNQ A;  4LU3 A;  1ZH9 A;  2NWZ A;  3N2P A;  1OKL A;  2FOU A;  1CNW A;  4QJX A;  1G0E A;  1CVH A;  2VVA X;  5A6H A;  4Q8Z A;  4ZWX A;  5FNL A;  5DSJ A;  1RAZ A;  1BNN A;  4PYY A;  4JS6 A;  3N4B A;  3V3G B;  1CIN A;  1FSR A;  3OIM A;  1ZFQ A;  1THK A;  3N3J A;  4K0S A;  2WEG A;  1YO2 A;  1CNH A;  4K0T A;  4RIU A;  1JD0 A;  4JSW A;  4M2W A;  3M40 A;  4ZX1 A;  5JDV B;  2X7S A;  3ML5 A;  5SZ5 A;  4Z1N A;  3M5T A;  3BET A;  3DA2 A;  4QIY A;  2EU2 A;  5G01 A;  5JES B;  5SZ4 A;  3MYQ A;  5DSR A;  4XFW A;  3TVO X;  4M2R A;  5EKM A;  1FR7 A;  3W6I A;  3T5Z A;  1DMY A;  1HCA A;  3QYK A;  4CQ0 A;  4ZWY A;  1TG3 A;  1RZA A;  4KUY A;  2H4N A;  4Q08 A;  3ML2 A;  5E2R A;  3M2Y A;  3RJ7 A;  1I9Q A;  1CIM A;  4MO8 A;  3DC9 A; 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