1TE3X

Effect of shuttle location and ph environment on h+ transfer in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and Kinetic Characterization of Active-Site Histidine as a Proton Shuttle in Catalysis by Human Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase II
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1te3X00
4Q7WA 5E5UA 1G4OA 4JS6A 2FNKA 1BNMA 4E4AA 3OY0A 3FFPX 4N0XB 1KOQA 1HCAA 4G0CA 5G01A 1HECA 5FNIA 4MDGA 3M96A 4HEWA 4QSJA 3V3GB 4YX4A 2AX2A 4FVOA 3EFIA 1BZMA 5L6KA 1BNWA 5FL5A 1CNHA 4KAPA 4Q90A 1CNGA 5FNKA 1TE3X 3IGPA 4YXOA 3FW3A 3DD8A 1BNUA 3NB5A 2CABA 3RZ5A 4Q6EA 4E5QA 4WL4A 1ZNCA 3MHIA 5DSNA 1CNIA 2HOCA 4E9OX 1F2WA 4QJXA 4JSWA 1BN1A 1YDDA 1CNWA 1RAYA 4ITOA 1H9QA 1H9NA 1IF4A 3QYKA 3KS3A 5DSKA 2QP6A 5JEPB 1G48A 1KWRA 4KNNA 3JXFA 2QOAA 4YXIA 1DMYA 4Q7PA 4Q09A 4Q8ZA 3D0NA 2NN1A 5SZ5A 4FU5A 3PO6A 1LG6A 2FOUA 4YGFA 2ZNCA 3KOIA 1URTA 1RZAA 1OKMA 3SBHA 4ZAOA 1AZMA 4E3HA 2WEHA 1AM6A 1G6VA 1YDAA 5SZ0A 3HFPA 3DCWA 3ML2A 5DOHA 1G0FA 3MHMA 4PXXA 1MOOA 2EZ7A 2CBDA 5JG3B 1BNQA 4RN4A 5DSMA 3S74B 3M2NA 4CA2A 5FNHA 3OIMA 4K0SA 1RZCA 4C3TA 4WUPA 3TMJA 4ZWYA 1BNTA 1A42A 1IF6A 1Z97A 2Q1BA 2HKKA 4RFDA 3T5ZA 3TVOX 4KNJA 3SAPA 4Z0QA 3OILA 4K13A 5JEHB 4FL7A 1OQ5A 4QK2A 5FLQA 3IEOA 4MLTA 4Q06A 1UGEA 5E5RA 3U3AX 4Z1JA 2FOSA 1HCBA 3MNHA 4Q49A 3CZVA 3CYUA 3R16A 1CA2A 4RFCA 3BL0A 3RZ1B 5FL4A 4KNMA 5DRSA 5EHEA 3M40A 2Q1QA 9CA2A 4TWMA 6CA2A 2Q38A 3RZ0B 1DCBA 5DSPA 1FLJA 4PYYA 2F14A 4M2WA 5SZ2A 1YO2A 4YGKA 4QJWA 4L5VA 3U45X 1Z93A 4QIYA 1G52A 4WR7A 5A25A 4YWPA 1HEAA 1FQRA 1YO0A 4R59A 1J9WA 5DVXA 3S77B 3V2MA 5HPJA 1UGDA 4CNRA 3T82A 3P5AA 4M2UA 4MDMA 3NI5A 3SAXA 1FSQA 1CNJA 5C8IA 2W2JA 4Q99A 4RUXA 3IBIA 5AMGA 5EKMA 3S78B 2WD2A 3M04A 4CACA 5G03A 1YO1A 4XZ5A 2POUA 4WW6A 2H4NA 1CAJA 1G53A 3KONA 5FNLA 4YYTA 4JSAA 1CAIA 3M5EA 4Q9YA 4MTYA 3F7UA 1TG9A 3CAJA 4KUWA 4E3GA 3M5SA 2IT4A 4GL1X 3U7CA 1CNYA 3M1KA 1CVDA 4Q6DA 1I91A 1BCDA 4HT2A 2FMZA 5JDVB 4ZX1A 3S71B 3T85A 2AW1A 1G0EA 3D93A 1TBTX 5FNGA 2FMGA 5SZ1A 4MLXA 1I9MA 3DA2A 5SZ3A 3L14A 1G54A 3MWOA 2FOVA 2HL4A 3M1WA 3M5TA 4WUQA 4Q8YA 1CCSA 5FNMA 1ZE8A 3K7KA 2NNVA 2ILIA 4TWLA 1ZSBA 4ZWXA 1G3ZA 4HEYA 4RIUA 1CAZA 3DBUA 5JGSB 1FQNA 1CVHA 1XPZA 3KWAA 4Q78A 2CBBA 4Z1KA 5A6HA 5JGTB 3C7PA 3MNAA 2CBAA 3R17B 4PQ7A 5EH7A 3P3HA 5EHVA 1UGFA 3PYKA 4UOVA 3DVBA 3HKNA 5G0BA 3RLDA 3M67A 4YGJA 5CA2A 4IWZA 3RYVB 1FR7A 3IBUA 1TG3A 3OKUA 1BNVA 1UGCA 12CAA 3M2ZA 5EKJA 4QSAA 1LG5A 1RZEA 2NXSA 3S72B 1CNXA 5DSRA 3M3XA 3KNEA 5JG5B 3B1BA 5E2SA 1XEVA 3IBNA 1CAYA 1RZDA 1XEGA 4K1QA 3LXEA 4R5BA 4CNWA 5DOGA 5EIJA 4HEZA 4LHIA 3PJJA 1BN4A 1I9OA 3DVDA 2WD3A 5FLOA 3M2XA 2NXTA 3MNKA 1ZFKA 2X7TA 4Z1EA 1KWQA 3TVNX 2NWZA 4Q07A 4HBAA 5SZ4A 1KEQA 3B4FA 3V3IB 1YDBA 1UGBA 3ZP9A 3DC9A 4KP5A 7CA2A 4N16A 4ETQC 5DSIA 3M14A 1CVEA 2O4ZA 4KUYA 3EFTA 3HLJA 1ZGFA 1CVFA 1UGGA 3HKUA 3P58A 1G45A 4Q8XA 5FDIA 1ZSCA 1CRAA 1KOPA 3FE4A 1CNBA 1CNCA 8CA2A 1MUAA 2EU2A 2WEJA 3DV7A 4Q83A 2GEHA 3OYQA 3MNUA 4X5SA 5EOIA 5EHWA 1TTMA 4QY3A 3HS4A 4PYXA 5SZ7A 3MNJA 5JQTA 3IAIA 5JQ0A 1CRMA 4YVYA 3RJ7A 5DSJA 2NWPA 3M2YA 3VBDA 3RZ8A 1FSRA 1RJ5A 1DCAA 1HEBA 4Q0LA 2FOYA 5JESB 3ZNCA 1EOUA 3MHCA 4QK1A 4YXUA 1HUGA 5FLRA 4M2VA 3V3JA 1RAZA 1IF5A 3MNIA 3S9TA 4RIVA 2FOQA 1CCTA 1CVBA 4HU1A 2HFWA 3RYZA 3M1JA 3V3FA 3RGEA 2NNOA 3S73B 3K2FA 3KLDB 3HKTA 1FQMA 1CAHA 2H15A 4QSBA 1BN3A 3RYJB 1FSNA 4KUVA 4MO8A 2NXRA 1TB0X 4R5AA 1HEDA 3V7XA 1XQ0A 1Y7WA 1RZBA 2CBCA 3D9ZA 4Q7SA 5E2NA 4RH2A 2ABEA 3S76A 3MMFA 1CANA 4Z1NA 4Q7VA 3V5GA 3P44A 4IDRX 4DZ9A 1I8ZA 1I9LA 1CAOA 3P55A 3V2JA 1V9IC 3S97A 1UGAA 3UYQA 5FLTA 3T84A 3IBLA 3N0NA 4G7AA 4COQA 3UYNA 2WEOA 5BYIA 4K0ZA 2POWA 4LP6A 5CLUA 2NWOA 4HT0A 5EH8A 3NJ9A 5DSOA 2HD6A 3DD0A 4JSZA 1G1DA 4L5WA 3DC3A 4BCWA 2POVA 1BNNA 4KV0A 4ZWZA 3F8EA 5J8ZA 2NMXA 4Q87A 5BRUA 1OKLA 1LZVA 4ZWIA 1BICA 2OSFA 2FNNA 4XIXA 5IPZA 5FNJA 2X7SA 1CZMA 2VVAX 4K0TA 4KNIA 1TEUX 2NNSA 2NN7A 1JCZA 4XIWA 3U47A 2X7UA 1V9EA 3BETA 4KP8A 2NNGA 3ML5A 3KOKA 5CACA 4QJPA 2NWYA 5FLPA 5JEGB 4QEFA 3T83A 3CA2A 1CAKA 1I9PA 3HKQA 4QJ0A 1THKA 4QSIA 5FDCA 5AMDA 5BRWA 4BF6A 5G0CA 5CJFA 3W6IA 4E3FA 2VVBX 3DAZA 2QO8A 1CNKA 1FR4A 1YDCA 1CCUA 3KKXA 2WEGA 4Q81A 1JD0A 4WW8A 3KIGA 3RYXB 3RZ7A 4CNVA 2OSMA 3RYYA 4MDLA 4ITPA 3P4VA 3MHLA 5BRVA 1ZH9A 1ZSAA 4Y0JA 4ZX0A 4YGLA 4FVNA 3S8XA 5SZ6A 3OIKA 3D8WA 4QJMA 1ZFQA 4QIZA 3JXGA 1HUHA 1CIMA 2CA2A 1TH9A 4E49A 4XE1A 1Z9YA 1G4JA 3RG3A 4FIKA 4CNXA 3DCSA 2GD8A 3F4XA 1FQLA 1HVAA 5BNLA 4M2RA 2FNMA 4Q08A 5FLSA 3N2PA 1I9QA 3Q31A 2CBEA 1IF9A 1CA3A 4L5UA 5FL6A 3M98A 3OYSA 3RG4A 3JXHC 3MYQA 3MZCA 4QK3A 5LMDA 1G46A 4E3DA 1TEQX 4HF3A 1LGDA 1ZGEA 3OKVA 5E28A 4BF1A 4YHAA 3W6HA 3P3JA 4RUZA 3N4BA 3DCCA 4PZHA 4RUYA 3MHOA 1I90A 1CVCA 3SBIA 3F7BA 4XFWA 1CILA 1LUGA 3DVCA 4DZ7A 3BL1A 3MDZA 3N3JA 4JSSA 5DSLA 4LU3A 1CAMA 2FW4A 3V3HB 5E2MA 4QJOA 1AVNA 1OKNA 5L3OA 5AMLA 1I9NA 5EH5A 5EZTX 3P5LA 1DMXA 1JV0A 2HNCA 1H4NA 3K34A 1BV3A 1IF7A 4QTLA 5E2RA 3T5UA 1RJ6A 5E2KA 4FPTA 4YGNA 1CALA 3S75B 3M1QA 4FRCA 3GZ0A 5EKHA 4CQ0A 5DSQA 1CVAA 4ILXA 1CINA 1IF8A 2EU3A 3D92A 1T9NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q7W A;  5E5U A;  1G4O A;  4JS6 A;  2FNK A;  1BNM A;  4E4A A;  3OY0 A;  3FFP X;  4N0X B;  1KOQ A;  1HCA A;  4G0C A;  5G01 A;  1HEC A;  5FNI A;  4MDG A;  3M96 A;  4HEW A;  4QSJ A;  3V3G B;  4YX4 A;  2AX2 A;  4FVO A;  3EFI A;  1BZM A;  5L6K A;  1BNW A;  5FL5 A;  1CNH A;  4KAP A;  4Q90 A;  1CNG A;  5FNK A;  1TE3 X;  3IGP A;  4YXO A;  3FW3 A;  3DD8 A;  1BNU A;  3NB5 A;  2CAB A;  3RZ5 A;  4Q6E A;  4E5Q A;  4WL4 A;  1ZNC A;  3MHI A;  5DSN A;  1CNI A;  2HOC A;  4E9O X;  1F2W A;  4QJX A;  4JSW A;  1BN1 A;  1YDD A;  1CNW A;  1RAY A;  4ITO A;  1H9Q A;  1H9N A;  1IF4 A;  3QYK A;  3KS3 A;  5DSK A;  2QP6 A;  5JEP B;  1G48 A;  1KWR A;  4KNN A;  3JXF A;  2QOA A;  4YXI A;  1DMY A;  4Q7P A;  4Q09 A;  4Q8Z A;  3D0N A;  2NN1 A;  5SZ5 A;  4FU5 A;  3PO6 A;  1LG6 A;  2FOU A;  4YGF A;  2ZNC A;  3KOI A;  1URT A;  1RZA A;  1OKM A;  3SBH A;  4ZAO A;  1AZM A;  4E3H A;  2WEH A;  1AM6 A;  1G6V A;  1YDA A;  5SZ0 A;  3HFP A;  3DCW A;  3ML2 A;  5DOH A;  1G0F A;  3MHM A;  4PXX A;  1MOO A;  2EZ7 A;  2CBD A;  5JG3 B;  1BNQ A; 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