1TEUX

Effect of shuttle location and ph environment on h+ transfer in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Structural and Kinetic Characterization of Active-Site Histidine as a Proton Shuttle in Catalysis by Human Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1teuX00
1YO2A 4QJOA 4YGLA 2FOSA 4WW8A 5JDVB 5CJFA 4ITOA 1CAJA 3RLDA 1J9WA 1YDBA 1ZNCA 2X7SA 3MHCA 5FLOA 3PO6A 3R16A 5SZ1A 1OKNA 5EKJA 3V3GB 4HEWA 5FNMA 3M2XA 3V7XA 1MOOA 3TMJA 5SZ3A 1TE3X 4RUYA 5EKMA 1G52A 4FU5A 5DOHA 1ZFKA 2NWPA 3BETA 1YDAA 2FOYA 3M1KA 4QJ0A 5L6KA 1G54A 1CVFA 3W6IA 4KV0A 4Q06A 4Q9YA 2VVAX 5BNLA 1CAIA 2X7UA 1RZAA 4MO8A 5FLSA 4LHIA 5JGSB 5DSMA 3M3XA 5EHWA 1I8ZA 3DCSA 5AMGA 3HKUA 3MNAA 4Q7SA 4X5SA 4RUXA 2AW1A 5FL6A 5G0BA 1RZBA 5SZ0A 3OIKA 4G0CA 1I9NA 1I91A 1BV3A 1KOQA 1BNQA 1BCDA 4Z1KA 5DSQA 1TTMA 3SAXA 1G0FA 3MNUA 3SAPA 4M2WA 3U45X 4BCWA 4Q7VA 1Z93A 2ABEA 3IBNA 4L5WA 1JD0A 1DMXA 2OSFA 4QJWA 4Q83A 3T85A 4CNXA 1CA2A 4MLXA 3RG4A 1FLJA 1UGBA 5SZ6A 5A25A 3S9TA 2IT4A 4RH2A 1UGAA 1CNWA 1ZSCA 3M67A 1BZMA 5FDCA 1ZE8A 5JESB 4JSZA 4YGNA 5DSNA 3MNJA 1HUHA 3OIMA 3IGPA 5DSKA 1DMYA 3JXFA 3NJ9A 3RYJB 1G45A 3K7KA 4YX4A 4PZHA 1TEUX 3OYSA 5E2RA 1CAHA 3OILA 5FDIA 1YDDA 3V5GA 3D8WA 4PYXA 4KNIA 3KIGA 2Q1QA 1ZGFA 1MUAA 1T9NA 1CNHA 1CNXA 3KS3A 3OYQA 1UGCA 2HL4A 3MWOA 2NWZA 3S8XA 3SBIA 4UOVA 1G4JA 1CCUA 1AZMA 2QO8A 3IBUA 3MDZA 1EOUA 1IF9A 1Z97A 3D9ZA 2WEOA 3C7PA 5JEPB 1HECA 4RFDA 2POVA 2POWA 5FNKA 4E3DA 1RAYA 4Z1JA 3P5LA 2FOQA 4QSBA 4WR7A 1CAMA 2Q38A 4HT2A 3M1JA 3RZ1B 3M1WA 5AMDA 4ZWIA 4Q07A 1YO0A 3K34A 4RIUA 1ZFQA 1V9IC 3HKQA 4ZX1A 1IF7A 3S75B 1LZVA 3P44A 4WL4A 3OKVA 3RGEA 4Y0JA 3M14A 3F8EA 3DVDA 3CAJA 5E2KA 4HBAA 5EIJA 1I9MA 1Y7WA 3IAIA 5CACA 3BL0A 3QYKA 5JG5B 2FW4A 1A42A 1Z9YA 5EOIA 5LMDA 2NXRA 3NB5A 1F2WA 4KNJA 5DSRA 4QSJA 3M5SA 3B4FA 2CBDA 1CVCA 5BRUA 2CBBA 8CA2A 3V3IB 3U3AX 1CVAA 1ZH9A 2WEHA 4CQ0A 6CA2A 4FVOA 3CZVA 4Q6EA 5FLPA 1CILA 3DD8A 2OSMA 4CNVA 3KONA 3L14A 5BRWA 4YGKA 4ZX0A 3JXHC 4LP6A 4BF6A 5E2SA 1HVAA 5DSIA 5G03A 1RZCA 5FLRA 1BNTA 2Q1BA 5A6HA 3MYQA 3M2ZA 3T82A 3N0NA 1CIMA 2EU2A 1CNBA 2F14A 1CVDA 3M5EA 3TVOX 2FOUA 1TH9A 4XZ5A 3OKUA 1HEBA 5DSLA 2NN1A 3LXEA 4E3GA 5JQTA 4KP5A 3M40A 1CCSA 4YHAA 4YXUA 4C3TA 1I9LA 4JSAA 4YXIA 5EKHA 1CVHA 3DA2A 3DV7A 4M2UA 5EH7A 5E2MA 3MNKA 4HU1A 4CNRA 3M2NA 4WW6A 3MHIA 4HEZA 4XE1A 1V9EA 1XQ0A 3NI5A 2FMGA 5EHVA 3S76A 4HEYA 3ZNCA 4Q8ZA 3P58A 1ZGEA 3HLJA 4FIKA 3W6HA 1CVEA 2WEJA 5CA2A 2NWOA 1LG5A 4QEFA 1UGEA 4RUZA 3Q31A 3HFPA 3DCWA 3V2MA 1UGGA 5SZ5A 3HKTA 4Q99A 4WUQA 3PYKA 5SZ7A 3MNHA 1CAZA 4M2VA 1CNIA 1OQ5A 3PJJA 5J8ZA 3DC3A 1AM6A 4Z0QA 2H4NA 2HKKA 3RZ0B 4KUWA 1RZEA 5FL5A 4LU3A 3RYZA 5FL4A 3DCCA 3P55A 3S71B 1RJ6A 4E5QA 5EH5A 4MLTA 2NN7A 4N0XB 5SZ2A 1URTA 4XIXA 1HEDA 2CBEA 1H4NA 3DBUA 1XPZA 4JSWA 3OY0A 5IPZA 1LG6A 1UGDA 3DC9A 1CNCA 4E4AA 2CABA 3M98A 3RYVB 3MHMA 2HFWA 1DCAA 5JGTB 1YDCA 2HD6A 1CCTA 5AMLA 5DRSA 5EHEA 4CNWA 5JG3B 4R5BA 3N2PA 4COQA 3VBDA 2FNKA 3P3HA 1G53A 1CAOA 2ILIA 4YYTA 3KOKA 3V3JA 2AX2A 3FW3A 2WD2A 4Q08A 1JCZA 1G0EA 1I9PA 1CNGA 1CNKA 1DCBA 1FQNA 1THKA 2NWYA 2NNGA 4Q78A 4KUYA 1HCAA 3T5ZA 4Q8XA 3RYYA 5DOGA 1AVNA 3TVNX 4Q81A 1H9NA 3M2YA 3P4VA 3U7CA 5C8IA 4MDMA 1CVBA 4M2RA 3RZ5A 1CRAA 1BNMA 5L3OA 3S77B 4PYYA 4YXOA 4Q90A 4YGJA 2POUA 3RYXB 3ZP9A 3K2FA 4KP8A 3D93A 4QJMA 4R59A 3IBLA 4ZWYA 1BNNA 4KUVA 2NNSA 5E28A 1FR7A 1G48A 4YGFA 4N16A 1IF5A 4KNNA 3UYQA 4QK1A 3P3JA 3B1BA 3N4BA 3T84A 1KEQA 1TBTX 4RN4A 4Q7WA 4JS6A 4YWPA 2EU3A 4K0SA 5FLQA 1CA3A 4Z1EA 4MDGA 9CA2A 4RFCA 1CINA 5JEHB 4Q0LA 3S97A 2NMXA 2NNOA 3RG3A 1YO1A 2EZ7A 1CANA 5FLTA 3KKXA 4K0ZA 4Q6DA 5JQ0A 4FPTA 3FE4A 4QIZA 4K1QA 4MDLA 1TB0X 4TWLA 4XFWA 3KOIA 1HCBA 2H15A 3M96A 1G1DA 3MZCA 4FL7A 4QSAA 3IBIA 1FQLA 5G0CA 2GD8A 4QY3A 3ML2A 1CAKA 4DZ7A 3RZ7A 2QOAA 4ILXA 4QK2A 3KNEA 4E3HA 1G6VA 3RZ8A 2HOCA 3S72B 3T5UA 4G7AA 4L5VA 4TWMA 1ZSBA 3RJ7A 1ZSAA 4FRCA 4QJPA 5E5UA 3M1QA 5HPJA 1BICA 4R5AA 1RZDA 4IWZA 1CAYA 4K13A 1BNVA 5EH8A 2CBCA 5FNIA 1IF4A 1RJ5A 3M5TA 1BN4A 4E3FA 3GZ0A 2GEHA 2CA2A 4YVYA 3DAZA 3V3HB 2CBAA 1BNUA 2NXSA 1FQMA 4CA2A 2QP6A 3DVBA 4E9OX 4Q7PA 3EFTA 4KNMA 1G3ZA 2FMZA 3F4XA 5SZ4A 2FNNA 2X7TA 3MHOA 4ITPA 3V2JA 2ZNCA 1OKLA 1TG3A 1KOPA 1LGDA 2W2JA 3N3JA 3BL1A 3V3FA 4L5UA 3F7UA 1FSQA 1OKMA 3FFPX 5E5RA 5FNJA 1JV0A 4Q87A 3S74B 1TEQX 2FNMA 3KLDB 1HUGA 4HT0A 1FSRA 5JEGB 1XEVA 3IEOA 3HKNA 4JSSA 4CACA 4E49A 1FSNA 3EFIA 1I9OA 4ZAOA 1CRMA 1BN1A 3M04A 4XIWA 4QIYA 4HF3A 5BYIA 3JXGA 4IDRX 1H9QA 1I9QA 4ETQC 3DD0A 4RIVA 1RAZA 1TG9A 1CNYA 3SBHA 1BN3A 4ZWXA 1G4OA 5CLUA 2HNCA 5DSJA 1IF6A 4KAPA 3U47A 3S73B 2WD3A 1KWQA 3CA2A 5BRVA 2VVBX 4BF1A 12CAA 3T83A 1CNJA 1IF8A 3HS4A 4DZ9A 4PQ7A 1G46A 3UYNA 7CA2A 3P5AA 4Q49A 1FQRA 4WUPA 3MHLA 1CZMA 3S78B 4Z1NA 2NXTA 1UGFA 3MMFA 4MTYA 1FR4A 3KWAA 1HEAA 1I90A 4QSIA 5EZTX 4QTLA 5FNHA 4K0TA 5E2NA 4FVNA 4Q09A 1LUGA 5FNLA 5DSPA 2WEGA 5DVXA 1XEGA 5FNGA 1CALA 3DVCA 1BNWA 3ML5A 3D92A 4QK3A 3MNIA 2O4ZA 5G01A 4GL1X 4ZWZA 4Q8YA 4QJXA 3R17B 2NNVA 4PXXA 1KWRA 3CYUA 3F7BA 5DSOA 3D0NA 2FOVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YO2 A;  4QJO A;  4YGL A;  2FOS A;  4WW8 A;  5JDV B;  5CJF A;  4ITO A;  1CAJ A;  3RLD A;  1J9W A;  1YDB A;  1ZNC A;  2X7S A;  3MHC A;  5FLO A;  3PO6 A;  3R16 A;  5SZ1 A;  1OKN A;  5EKJ A;  3V3G B;  4HEW A;  5FNM A;  3M2X A;  3V7X A;  1MOO A;  3TMJ A;  5SZ3 A;  1TE3 X;  4RUY A;  5EKM A;  1G52 A;  4FU5 A;  5DOH A;  1ZFK A;  2NWP A;  3BET A;  1YDA A;  2FOY A;  3M1K A;  4QJ0 A;  5L6K A;  1G54 A;  1CVF A;  3W6I A;  4KV0 A;  4Q06 A;  4Q9Y A;  2VVA X;  5BNL A;  1CAI A;  2X7U A;  1RZA A;  4MO8 A;  5FLS A;  4LHI A;  5JGS B;  5DSM A;  3M3X A;  5EHW A;  1I8Z A;  3DCS A;  5AMG A;  3HKU A;  3MNA A;  4Q7S A;  4X5S A;  4RUX A;  2AW1 A;  5FL6 A;  5G0B A;  1RZB A;  5SZ0 A;  3OIK A;  4G0C A;  1I9N A;  1I91 A;  1BV3 A;  1KOQ A;  1BNQ A;  1BCD A;  4Z1K A;  5DSQ A;  1TTM A;  3SAX A;  1G0F A;  3MNU A;  3SAP A;  4M2W A;  3U45 X;  4BCW A;  4Q7V A;  1Z93 A;  2ABE A;  3IBN A;  4L5W A;  1JD0 A;  1DMX A;  2OSF A;  4QJW A;  4Q83 A;  3T85 A;  4CNX A;  1CA2 A;  4MLX A;  3RG4 A;  1FLJ A;  1UGB A;  5SZ6 A;  5A25 A;  3S9T A; 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