1TG3A

Effect of shuttle location and ph environment on h+ transfer in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNHGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Structural and Kinetic Characterization of Active-Site Histidine as a Proton Shuttle in Catalysis by Human Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1tg3A00
4Q99A 1V9IC 5DOHA 4QK1A 3S75B 1XEVA 3T84A 3MHLA 3V2MA 7CA2A 3DVBA 4QJWA 2QOAA 2VVAX 2NWYA 3K34A 5SZ4A 4E49A 1UGEA 3EFIA 3D92A 1G4JA 1LZVA 3IBUA 1RZAA 5E2SA 4MTYA 2HNCA 3S73B 4Z1KA 1TG9A 3W6IA 1CVHA 3CA2A 3TVNX 1ZNCA 3P44A 3V7XA 1ZGEA 3PYKA 3V3JA 3T82A 1THKA 1RJ6A 3DC3A 4KV0A 5FLQA 4JSAA 4Q06A 5G01A 4E5QA 4BCWA 5DSJA 5DSIA 2Q1QA 4M2RA 3PO6A 4M2WA 4LU3A 4YGFA 1CCSA 1ZGFA 2NWOA 1CAHA 1CNIA 2FMGA 1DCAA 3MNAA 5FNKA 4FIKA 4YYTA 3DCSA 4BF6A 3MNIA 3CZVA 3ZP9A 4MDGA 3V3GB 5JGTB 5JEPB 5E2RA 4RFDA 4RUYA 4E3GA 1UGBA 1YDBA 4HF3A 3HKNA 2FNKA 4X5SA 4FRCA 1KWRA 4QK2A 3S78B 3RZ7A 1FQLA 5FDCA 1AVNA 4E3HA 3KWAA 3SAXA 1RZBA 4ZAOA 4RIVA 3T5UA 2HFWA 3JXHC 2EU2A 4DZ7A 1CAIA 3MYQA 2CA2A 3R16A 3F8EA 4K0SA 4YGJA 1FSRA 3MNKA 3DD8A 4JSWA 2FMZA 4ETQC 1FQRA 1I9OA 2EZ7A 4HT2A 4Z1EA 3ZNCA 3DD0A 1G45A 3V2JA 4QJ0A 2NNGA 3HLJA 1T9NA 1ZSCA 3SBIA 4K13A 4CNRA 1G3ZA 8CA2A 2H15A 3N2PA 5DVXA 1FR4A 4Q7WA 2NMXA 1BCDA 3RYZA 4FVOA 4HT0A 1CVEA 2HKKA 5BYIA 4HBAA 4BF1A 1FQMA 1FLJA 1CAYA 4YWPA 5SZ3A 3OIMA 3IAIA 4KNMA 4YHAA 1CRMA 3P3HA 3OIKA 4PQ7A 3M3XA 1XQ0A 1BICA 3KIGA 3QYKA 4KUYA 5FNJA 2WEOA 3S77B 4WUPA 1UGGA 5FLTA 2ABEA 1G46A 2WEGA 5E5UA 4G0CA 5CJFA 5FNGA 3IEOA 3M1QA 5G0CA 3T85A 4YX4A 4MLTA 1BN4A 1HEDA 4QTLA 4MDMA 5JESB 2POWA 3ML2A 4M2VA 1RAYA 5FL6A 3V3FA 3NB5A 3D8WA 1Z93A 2EU3A 1BNWA 5E5RA 3M5EA 5HPJA 4Q9YA 1XEGA 4PZHA 4KAPA 1BNTA 1I9MA 3P5LA 5EZTX 3RZ1B 5FLSA 4E9OX 2W2JA 3MNHA 5BNLA 3P3JA 3KOKA 2WEJA 2FW4A 4CQ0A 4MDLA 4FVNA 4RFCA 2FOVA 2GEHA 3KONA 3KKXA 3D0NA 1TB0X 4WW6A 5JG3B 4IDRX 1BNUA 2CBDA 4KNJA 3MHCA 1BN1A 4PYYA 2CBCA 1FR7A 4ZWXA 1RZDA 3RYXB 1TG3A 5L6KA 4L5VA 4ZWZA 4L5UA 1G54A 4QSBA 2HD6A 4CNWA 2WEHA 1BZMA 5G0BA 4ZWYA 4GL1X 2POVA 1TE3X 1G48A 1IF6A 1CALA 4XZ5A 1Z97A 1CVBA 1A42A 4FPTA 5DSOA 3S72B 5SZ5A 1CNWA 3M1JA 5EOIA 1CNGA 5EIJA 2POUA 4MLXA 3U7CA 3KOIA 3TMJA 3S9TA 4XIXA 4Q78A 1OKMA 3P58A 2NXRA 4Z1NA 3P5AA 2FOYA 1I9PA 3BL0A 3OILA 3DC9A 1IF8A 3N0NA 5LMDA 3N3JA 4QY3A 4L5WA 5FL5A 2NXSA 4YXUA 3MDZA 5FNMA 3OYQA 4RIUA 3RYJB 4ITOA 4Q7VA 3OYSA 4Q90A 2CBAA 2H4NA 1TEUX 1I9NA 2NNVA 4Q07A 1H9NA 5JEGB 3PJJA 1BNQA 3HKTA 5JEHB 3HKQA 1CA2A 4PYXA 4QJMA 1UGAA 4R5AA 4RH2A 5EKJA 4LHIA 1CAOA 1HCBA 2ZNCA 4CA2A 3BL1A 5EHWA 5BRWA 2FOSA 1CRAA 1KOQA 1I91A 3CYUA 4UOVA 4IWZA 5DSLA 1HVAA 4E4AA 1CZMA 1KWQA 1G4OA 3T5ZA 1CNHA 1KEQA 2FNNA 1G0FA 3M5SA 1I90A 1BNNA 3K2FA 1HCAA 3M67A 2QO8A 4COQA 2FOUA 5FNLA 1H4NA 3DVCA 1EOUA 1JD0A 4ITPA 1HEBA 4K0TA 5SZ1A 2WD2A 3IBIA 1CNKA 4KNIA 3S8XA 4QJXA 3DAZA 3M2NA 3S76A 4ZX1A 2F14A 4KUVA 1BNMA 5A25A 1CAMA 1MOOA 5AMGA 4MO8A 4Q0LA 4Q7SA 3S74B 4YGLA 3B4FA 1G53A 1CVCA 3OY0A 3FE4A 2CBBA 5FLRA 4QJOA 3DBUA 3OKVA 2HOCA 1IF4A 3R17B 4Q6DA 3M2YA 4TWLA 3ML5A 4Q6EA 3K7KA 3M5TA 1OKNA 3MWOA 2NNSA 5G03A 3M96A 5JG5B 3MNJA 3DV7A 3P55A 5EH5A 5JDVB 3F4XA 3LXEA 4JS6A 1CNJA 5FNIA 3V5GA 5SZ2A 3V3IB 3F7BA 1CVDA 2Q38A 1G1DA 5FLOA 1AZMA 1DCBA 3U3AX 3IGPA 1CAKA 1OKLA 1TH9A 1KOPA 3L14A 1G6VA 3U47A 4M2UA 3DCWA 1RZCA 2NXTA 2O4ZA 3C7PA 1ZSAA 1XPZA 1ZE8A 1CAJA 2OSFA 4QK3A 4WW8A 4Q7PA 5EKHA 5DSNA 4PXXA 2CABA 4KP5A 4CNVA 1IF5A 5EHEA 1HECA 2Q1BA 3CAJA 1BV3A 3KLDB 5DSKA 2WD3A 3RGEA 1IF7A 1G0EA 1Y7WA 1G52A 4N0XB 4CACA 1CA3A 5DSQA 3RYYA 3MHOA 1RAZA 1FSNA 1F2WA 1CVAA 2FNMA 2ILIA 3D93A 1CIMA 1CINA 5CA2A 4Y0JA 1UGCA 3EFTA 4YGKA 4XIWA 4WUQA 3KS3A 4Q49A 4RUZA 2QP6A 4TWMA 1URTA 4QSIA 3B1BA 3M14A 5DRSA 5E2MA 1UGFA 1CCUA 1CILA 4CNXA 1CNXA 3RZ8A 3DCCA 3RG4A 3HS4A 1LG6A 1ZH9A 4N16A 4Q8XA 5CLUA 4HEWA 2X7UA 3M1KA 3MMFA 3MHIA 5A6HA 1RZEA 1HUHA 5CACA 4QJPA 1BN3A 4HEYA 4KP8A 5JGSB 2FOQA 1YDDA 1IF9A 1YO1A 3F7UA 4Q8YA 1CCTA 4LP6A 5BRVA 4R5BA 5EKMA 3RZ0B 1TBTX 4DZ9A 4YXIA 2X7SA 1FQNA 4QEFA 1J9WA 3MZCA 3JXGA 4RUXA 3M2ZA 1H9QA 1JCZA 4ZWIA 2NN7A 5DSPA 5EHVA 1OQ5A 3N4BA 4Q08A 2CBEA 5EH7A 2IT4A 4Q81A 1AM6A 1LGDA 3FFPX 3OKUA 2NWPA 5FLPA 4FU5A 3UYNA 1V9EA 3RYVB 3W6HA 4E3DA 3MNUA 5L3OA 3TVOX 3UYQA 1CAZA 1I9LA 3IBLA 4HEZA 3V3HB 12CAA 1HUGA 2OSMA 5SZ0A 5AMDA 2NN1A 3DVDA 3JXFA 4ILXA 4Q83A 1CNYA 4QIZA 4WL4A 1DMYA 1BNVA 5DOGA 1YDAA 5AMLA 5FL4A 3S71B 1YO2A 3RJ7A 1ZSBA 3HFPA 4RN4A 4JSSA 4KUWA 1TTMA 2VVBX 3VBDA 4K1QA 1JV0A 3RLDA 3RG3A 4Q09A 4XE1A 5C8IA 1TEQX 4JSZA 4WR7A 3M04A 1RJ5A 3RZ5A 5EH8A 4C3TA 4QSJA 5E2KA 3FW3A 2NNOA 3MHMA 3IBNA 1YO0A 4YVYA 4Q87A 3HKUA 4Z1JA 4ZX0A 9CA2A 5DSMA 2HL4A 3P4VA 5J8ZA 5BRUA 4FL7A 1LG5A 1YDCA 5E28A 1I8ZA 4K0ZA 1HEAA 2AX2A 4Z0QA 1ZFQA 2GD8A 3S97A 1Z9YA 6CA2A 2NWZA 5IPZA 1UGDA 4Q8ZA 4YXOA 1I9QA 5FDIA 1DMXA 1CVFA 4G7AA 4HU1A 1ZFKA 3M2XA 2AW1A 1LUGA 4QIYA 4XFWA 3SBHA 4E3FA 1MUAA 5JQ0A 5SZ7A 3DA2A 5JQTA 1FSQA 3U45X 5FNHA 3Q31A 3D9ZA 2X7TA 3GZ0A 3BETA 4KNNA 4YGNA 3M98A 4QSAA 5DSRA 1CNBA 3M1WA 4R59A 3NJ9A 5E2NA 3M40A 3SAPA 3NI5A 1CNCA 5SZ6A 3KNEA 1CANA 3T83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q99 A;  1V9I C;  5DOH A;  4QK1 A;  3S75 B;  1XEV A;  3T84 A;  3MHL A;  3V2M A;  7CA2 A;  3DVB A;  4QJW A;  2QOA A;  2VVA X;  2NWY A;  3K34 A;  5SZ4 A;  4E49 A;  1UGE A;  3EFI A;  3D92 A;  1G4J A;  1LZV A;  3IBU A;  1RZA A;  5E2S A;  4MTY A;  2HNC A;  3S73 B;  4Z1K A;  1TG9 A;  3W6I A;  1CVH A;  3CA2 A;  3TVN X;  1ZNC A;  3P44 A;  3V7X A;  1ZGE A;  3PYK A;  3V3J A;  3T82 A;  1THK A;  1RJ6 A;  3DC3 A;  4KV0 A;  5FLQ A;  4JSA A;  4Q06 A;  5G01 A;  4E5Q A;  4BCW A;  5DSJ A;  5DSI A;  2Q1Q A;  4M2R A;  3PO6 A;  4M2W A;  4LU3 A;  4YGF A;  1CCS A;  1ZGF A;  2NWO A;  1CAH A;  1CNI A;  2FMG A;  1DCA A;  3MNA A;  5FNK A;  4FIK A;  4YYT A;  3DCS A;  4BF6 A;  3MNI A;  3CZV A;  3ZP9 A;  4MDG A;  3V3G B;  5JGT B;  5JEP B;  5E2R A;  4RFD A;  4RUY A;  4E3G A;  1UGB A;  1YDB A;  4HF3 A;  3HKN A;  2FNK A;  4X5S A;  4FRC A;  1KWR A;  4QK2 A;  3S78 B;  3RZ7 A;  1FQL A;  5FDC A;  1AVN A;  4E3H A;  3KWA A;  3SAX A;  1RZB A;  4ZAO A;  4RIV A;  3T5U A;  2HFW A;  3JXH C;  2EU2 A;  4DZ7 A;  1CAI A;  3MYQ A;  2CA2 A; 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