1Y7WA

Crystal structure of a halotolerant carbonic anhydrase from dunaliella salina
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
NPNDGYDYMQHGFDWPGLQEGGTTKYPACSGSNQSPIDINTNQLMEPSSRSGTSAVSLNGLNVDGAQADGITLTNAKVDLEQGMKVTFDQPAANLPTIEIGGTTKSFVPIQFHFHHFLSEHTINGIHYPLELHIVMQEQDPADVATAQLAVIGIMYKYSENGDAFLNSLQTQIEGKIGDGTASYGDTGVSIDNINVKTQLLPSSLKYAGYDGSLTTPGCDERVKWHVFTTPREVTREQMKLFVDVTMGAHAGADVVNNRMIQDLGDREVYKYNY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Halotolerant alpha-type carbonic anhydrase (dCA II)
publication title Three-dimensional structure of a halotolerant algal carbonic anhydrase predicts halotolerance of a mammalian homolog.
pubmed doi rcsb
source organism Dunaliella salina
total genus 78
structure length 274
sequence length 274
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-12-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1y7wA01
4G0CA 4E3DA 3SAPA 3K34A 5CJFA 5DSNA 3CYUA 1G52A 1ZSBA 2O4ZA 1ZGEA 3KWAA 3MHLA 3V7XA 4CA2A 1CALA 1OKMA 4COQA 3S9TA 2X7SA 3KLDB 3FW3A 1ZFKA 3MNKA 4E4AA 3B4FA 1CAJA 5LMDA 3DVBA 4Z1KA 4MLTA 4HU1A 4YGFA 3IBLA 2EU2A 3PYKA 4Q09A 4Y0JA 1CILA 5BRVA 4Q07A 3U45X 4KV0A 2HL4A 3DAZA 4CNWA 1I9LA 5EIJA 5FNKA 3S75B 2NNOA 5FNGA 1CNIA 5SZ2A 3LXEA 3P55A 4QJPA 1TBTX 4Q99A 1KWQA 1CNJA 1HEAA 5FLSA 4XFWA 5EHEA 5SZ3A 3D92A 5EHVA 5SZ6A 3HKUA 1FQNA 1CNBA 3K2FA 1I90A 3N4BA 5DSJA 2FNMA 4E9OX 4PYYA 4E3GA 2NNVA 3V3HB 3DVCA 4FIKA 1RAYA 4YGNA 5CA2A 1TEUX 3SBHA 3ZP9A 2AW1A 3P4VA 4FU5A 1KEQA 3K7KA 4M2UA 3W6HA 4ITPA 2NMXA 4QJWA 1IF5A 3D93A 1CNKA 3JXFA 1LUGA 2NWOA 1XPZA 5DSRA 4MTYA 3MHOA 4DZ9A 4WUPA 3UYNA 4CNRA 3C7PA 3V3GB 4KP8A 5DSKA 1ZGFA 4BF1A 4E49A 4Q06A 4R5BA 2NWPA 4FVOA 4ZWIA 1I9PA 3U47A 1YDAA 4E3HA 2FMGA 4K13A 4XIXA 4Z1EA 1H9NA 1G54A 1I9OA 3MMFA 3IAIA 4M2WA 2NXTA 4YXIA 1UGDA 2FW4A 2GEHA 3DC9A 1MUAA 4WW6A 4Q83A 4L5UA 2CBBA 4QK2A 2NN1A 1ZFQA 4FPTA 1HVAA 1JCZA 4L5VA 5FNLA 4JSAA 4RFCA 5G0BA 5JG3B 2CBDA 2WEHA 5E2SA 3M1KA 5FLQA 5FLRA 3D8WA 3RZ1B 1IF4A 3MHMA 3OY0A 1OKLA 4ETQC 5JGSB 5A6HA 3T85A 3HKTA 1AVNA 3CZVA 1CVCA 1CAZA 1G1DA 3D0NA 1HEDA 4Q6DA 1DCAA 4FVNA 4Q7SA 1FR7A 3DD0A 5J8ZA 4K0ZA 2OSFA 4QK1A 4HT2A 4Q7PA 4XIWA 5DRSA 3S74B 2X7UA 3DD8A 5SZ1A 4RH2A 3RYZA 1LZVA 4YXUA 4QSJA 1CNHA 4RN4A 5JQTA 1CAOA 3N3JA 1XQ0A 2NNGA 1ZNCA 6CA2A 3D9ZA 1CVHA 2NXSA 4ZWYA 5CLUA 1UGCA 3M96A 5EH8A 3F4XA 4Q7VA 3M3XA 1YO2A 2WEOA 3S97A 1HCBA 3TVOX 1I91A 1MOOA 4JSZA 1AM6A 4YGLA 4WL4A 3RZ0B 4HEWA 4RIUA 4QJMA 5C8IA 8CA2A 3T5UA 1F2WA 1BNTA 5DSQA 1FQLA 1YDDA 3UYQA 4ZX1A 2HKKA 3V3JA 3S78B 3KIGA 4KUYA 4LU3A 3RYVB 1Z97A 5AMLA 3KOIA 4BF6A 2EZ7A 3KKXA 2NWZA 1YO1A 4C3TA 1G46A 3S73B 3IEOA 3Q31A 1IF9A 2POWA 3S76A 2FOSA 2ABEA 3R17B 5FNMA 3P5AA 1XEVA 1V9EA 1BICA 2ILIA 4Q81A 4WR7A 5EOIA 3T5ZA 5JQ0A 4GL1X 5L3OA 4CQ0A 2OSMA 4MDLA 4HEZA 1T9NA 1G48A 1DMXA 4RFDA 1Z93A 3MNJA 4QIZA 5FNHA 4QSBA 3HS4A 3OKUA 5FL4A 3ML2A 3RYXB 1I9NA 1TG3A 5EZTX 2GD8A 4RUZA 2HNCA 2FOQA 1CAMA 4Z1NA 1HCAA 1G6VA 3S71B 3IBUA 2CBEA 3M5TA 5BYIA 1CAYA 1BZMA 1H4NA 3S72B 1FR4A 3MHIA 1JV0A 2CA2A 5DVXA 4Q8ZA 4MDGA 4M2VA 4KUVA 3HKQA 1EOUA 1V9IC 3M98A 1CNWA 1KOPA 3HLJA 9CA2A 2Q38A 3V3FA 3VBDA 1CVDA 3EFTA 3F7BA 5DSLA 3SAXA 2EU3A 4FRCA 4QJOA 3W6IA 7CA2A 3BL1A 1G4OA 3RJ7A 4LP6A 1CA3A 4Q8XA 1ZH9A 4MLXA 4RUYA 12CAA 2NWYA 1RAZA 4QK3A 4PYXA 1OKNA 5HPJA 1OQ5A 1FSNA 2POVA 3PJJA 3BL0A 3MNIA 4X5SA 4WUQA 5E2KA 5FDCA 3RZ8A 2WD3A 1DCBA 1G3ZA 3ML5A 3MNUA 4KNNA 5EH5A 1CCSA 4HBAA 1I8ZA 4XE1A 1RZEA 3M1WA 3OYQA 3S8XA 3ZNCA 4R59A 3HFPA 1CVBA 1AZMA 5EH7A 4K0SA 3RYJB 3DCSA 4TWLA 3RZ5A 3M1JA 3DBUA 4JSSA 4ZWZA 4YYTA 4Q7WA 2POUA 1FLJA 4TWMA 4KNJA 1CZMA 4R5AA 3P3HA 5EKMA 4K1QA 1YDBA 3CAJA 2WD2A 3JXHC 2FMZA 1H9QA 5JEGB 1G45A 1KOQA 3NI5A 1TG9A 3KNEA 3U7CA 1BNVA 4DZ7A 4K0TA 4LHIA 1CAHA 1HUHA 1XEGA 5DSMA 1BN4A 3RG3A 3M2XA 5JEPB 1HEBA 5DSIA 3M14A 4HEYA 2NN7A 3M1QA 2VVBX 3RGEA 2FNNA 3P44A 5L6KA 5EKJA 1UGGA 4E3FA 3M5EA 1LG5A 3IBNA 1CVFA 5BRWA 3TVNX 5FLOA 1RJ6A 4RUXA 3M04A 1UGFA 1G4JA 4Q90A 5EHWA 2CABA 1Z9YA 1TH9A 4CACA 1BN1A 2WEGA 4WW8A 5DOHA 5JGTB 1CNYA 1J9WA 3DC3A 4MDMA 1THKA 4KNMA 1CNXA 5E5RA 1G53A 4ZAOA 2Q1QA 3M2YA 3N0NA 5JG5B 2H15A 2Q1BA 3M5SA 1KWRA 2NXRA 4Z0QA 5JDVB 1UGAA 1CRAA 3L14A 3MWOA 3U3AX 5IPZA 4Q9YA 2F14A 4ZWXA 5E2NA 3OIKA 1FQMA 4QJXA 1TTMA 1RZDA 5FLTA 1CIMA 3PO6A 4PQ7A 5G0CA 4YX4A 3P58A 5FL6A 4YXOA 3FFPX 4QIYA 1ZSCA 4QSIA 5AMDA 3MZCA 1IF8A 2CBAA 4N16A 5FLPA 1A42A 1FSRA 1URTA 1BNMA 5G01A 1BNQA 3NJ9A 5A25A 4ZX0A 5DOGA 1CINA 5E5UA 1LGDA 2QP6A 3M2NA 4Q08A 4E5QA 4G7AA 1ZE8A 3BETA 2WEJA 4JSWA 3RG4A 1ZSAA 4CNXA 4ILXA 5EKHA 5FNIA 5SZ4A 3RLDA 3MHCA 1I9MA 2W2JA 2VVAX 3N2PA 3RZ7A 1LG6A 1RZCA 1BCDA 5E2MA 3P5LA 1FSQA 1CANA 4JS6A 4YWPA 1G0FA 1RJ5A 2ZNCA 4L5WA 2HOCA 1CVEA 5BNLA 4QSAA 1RZAA 4Q0LA 1CAKA 4CNVA 3KOKA 4KNIA 4Z1JA 4YGJA 5AMGA 2FOYA 3MDZA 3V5GA 3CA2A 3S77B 4Q8YA 2HD6A 4QTLA 4XZ5A 1BNNA 3T82A 1CVAA 1HECA 4QY3A 4Q87A 4PXXA 2FOUA 2QOAA 3DA2A 4N0XB 4PZHA 4YHAA 3DCCA 4HT0A 1HUGA 4ITOA 5CACA 1FQRA 3B1BA 3V2MA 3OKVA 5SZ0A 1BNUA 5SZ5A 2HFWA 3R16A 3RYYA 2X7TA 4KAPA 5FL5A 3KS3A 3KONA 3MNAA 2NNSA 4RIVA 4KP5A 3QYKA 1CRMA 1IF6A 3NB5A 3OIMA 5E2RA 4YGKA 3DV7A 1G0EA 1JD0A 3IGPA 4Q6EA 3IBIA 1CNCA 4MO8A 3F7UA 3T83A 3OYSA 5DSPA 1CA2A 1BNWA 3TMJA 1CCUA 3GZ0A 2QO8A 1TEQX 5JEHB 1UGBA 2FNKA 3JXGA 3EFIA 3M67A 4BCWA 3SBIA 3DCWA 1UGEA 5SZ7A 4Q49A 1Y7WA 3MYQA 4IWZA 5FDIA 4YVYA 1TE3X 2IT4A 4HF3A 4QEFA 5JESB 2FOVA 1RZBA 5FNJA 3DVDA 4FL7A 1CAIA 1IF7A 1YDCA 1YO0A 3MNHA 5G03A 2CBCA 1TB0X 3FE4A 3V3IB 5E28A 3T84A 3M2ZA 3HKNA 2H4NA 4QJ0A 3V2JA 1BV3A 3P3JA 5DSOA 1CNGA 2AX2A 4M2RA 4Q78A 3F8EA 1DMYA 3M40A 1BN3A 4IDRX 1I9QA 3OILA 5BRUA 4UOVA 1CCTA 4KUWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4G0C A;  4E3D A;  3SAP A;  3K34 A;  5CJF A;  5DSN A;  3CYU A;  1G52 A;  1ZSB A;  2O4Z A;  1ZGE A;  3KWA A;  3MHL A;  3V7X A;  4CA2 A;  1CAL A;  1OKM A;  4COQ A;  3S9T A;  2X7S A;  3KLD B;  3FW3 A;  1ZFK A;  3MNK A;  4E4A A;  3B4F A;  1CAJ A;  5LMD A;  3DVB A;  4Z1K A;  4MLT A;  4HU1 A;  4YGF A;  3IBL A;  2EU2 A;  3PYK A;  4Q09 A;  4Y0J A;  1CIL A;  5BRV A;  4Q07 A;  3U45 X;  4KV0 A;  2HL4 A;  3DAZ A;  4CNW A;  1I9L A;  5EIJ A;  5FNK A;  3S75 B;  2NNO A;  5FNG A;  1CNI A;  5SZ2 A;  3LXE A;  3P55 A;  4QJP A;  1TBT X;  4Q99 A;  1KWQ A;  1CNJ A;  1HEA A;  5FLS A;  4XFW A;  5EHE A;  5SZ3 A;  3D92 A;  5EHV A;  5SZ6 A;  3HKU A;  1FQN A;  1CNB A;  3K2F A;  1I90 A;  3N4B A;  5DSJ A;  2FNM A;  4E9O X;  4PYY A;  4E3G A;  2NNV A;  3V3H B;  3DVC A;  4FIK A;  1RAY A;  4YGN A;  5CA2 A;  1TEU X;  3SBH A;  3ZP9 A;  2AW1 A;  3P4V A;  4FU5 A;  1KEQ A;  3K7K A;  4M2U A;  3W6H A;  4ITP A;  2NMX A;  4QJW A;  1IF5 A;  3D93 A;  1CNK A;  3JXF A;  1LUG A;  2NWO A;  1XPZ A;  5DSR A;  4MTY A;  3MHO A;  4DZ9 A;  4WUP A; 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