2AW1A

Carbonic anhydrase inhibitors: valdecoxib binds to a different active site region of the human isoform ii as compared to the structurally related cyclooxygenase ii "selective" inhibitor celecoxib
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carbonic anhydrase inhibitors: Valdecoxib binds to a different active site region of the human isoform II as compared to the structurally related cyclooxygenase II
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase II
molecule tags Lyase
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2aw1A00
5BRUA 3C7PA 4WR7A 5SZ0A 4CACA 3S77B 1V9EA 4LHIA 1I9QA 5CLUA 3DCCA 3IAIA 1EOUA 4Q8YA 1UGBA 1BZMA 4XIXA 3F8EA 3P44A 5JGTB 4K0ZA 4Q78A 5DSRA 1CAIA 3S97A 3T84A 4WL4A 4WW8A 1BNUA 4ITOA 4YXIA 3DD8A 1LG6A 1CAJA 3OIKA 3M1KA 1HEAA 2NNOA 3JXGA 1G3ZA 2NXSA 4Q6EA 3UYNA 3M96A 4YGNA 1KEQA 1TEQX 1CNJA 1CVFA 3V3FA 3W6HA 4Q07A 2X7TA 5FLSA 1ZH9A 4Z1EA 2FW4A 4E3HA 1KWRA 3KWAA 4Z1JA 3M1WA 3MYQA 4M2RA 3U47A 1KOPA 1CA3A 3RZ0B 4QJ0A 4E3GA 3T5ZA 1OKLA 4QY3A 4YXUA 1BNMA 2OSMA 4KUWA 3VBDA 4CNWA 1CZMA 1RZCA 5DSJA 2CBDA 4FVNA 4KV0A 4QSAA 3RG4A 1RAZA 1ZGFA 3S74B 4ITPA 5G0CA 4R5AA 5HPJA 3M5TA 1CVDA 1FSRA 2WEJA 1UGEA 4E5QA 3IEOA 3MNJA 5IPZA 4JSSA 3V3GB 2NMXA 3TMJA 3L14A 5JQ0A 5E2KA 3U3AX 2FNKA 3ML2A 4ZWXA 3U7CA 5BNLA 2QP6A 4JS6A 2VVAX 2ABEA 1AZMA 2CBBA 5E2SA 4XZ5A 2AX2A 1BICA 3P3HA 4HT2A 4K0SA 1CNHA 2CA2A 1MUAA 4FL7A 3MNHA 4MO8A 5E5UA 4PYXA 1URTA 3M3XA 3JXFA 4MDLA 1ZFKA 3N3JA 4MLTA 1F2WA 5EH7A 2FOVA 1DCAA 2NNSA 4WUPA 3T85A 1CNCA 4ILXA 3MWOA 1FQMA 1LG5A 4Q6DA 1CCTA 3SBHA 1THKA 3OIMA 2FMZA 4UOVA 1G53A 1DMXA 1UGGA 5FL6A 5EIJA 1XEGA 4FPTA 5BRWA 3RZ5A 2NXTA 4QK1A 1BNWA 3ML5A 1BN4A 1BNNA 5FL4A 3D92A 5FLOA 4FU5A 4ZX1A 5EKJA 3DD0A 4WW6A 2FNNA 3V7XA 3MNKA 1TG9A 1G46A 1CVCA 3FFPX 4RUYA 1A42A 8CA2A 3P3JA 4YX4A 4ETQC 2Q38A 1CINA 5DOGA 4HBAA 3P4VA 4PXXA 1MOOA 1ZSCA 3T5UA 2GEHA 3M2YA 1RZDA 5JEHB 3SAPA 4RFDA 4CNVA 4Q83A 3U45X 3N0NA 3F4XA 3JXHC 5G03A 3DAZA 1YDCA 1RAYA 3KLDB 4Q7SA 4C3TA 1G48A 1FR7A 4QSBA 4Q99A 9CA2A 1YO0A 1UGFA 2EZ7A 1TB0X 4E3FA 1T9NA 1YO2A 4HEZA 4G7AA 1UGDA 5FNLA 2WD2A 1YDBA 3M1JA 2Q1QA 5DRSA 3S78B 4IWZA 5J8ZA 1Z97A 5A6HA 4PZHA 4ZWYA 2Q1BA 3RZ1B 5AMDA 5EOIA 1ZSBA 5DOHA 1G1DA 5SZ3A 3KOKA 4K13A 3RYZA 1CVAA 3BL1A 3N4BA 4XE1A 2GD8A 4QSIA 4Q7PA 2F14A 2ZNCA 1BNTA 2QO8A 3HFPA 5DSLA 2W2JA 1CALA 4KP5A 3RYXB 3V5GA 4QK3A 1RJ5A 5E2MA 1I9LA 1XQ0A 3MZCA 4ZX0A 1CNIA 2NNGA 3DCSA 4R59A 1CVHA 1Z9YA 4LP6A 5CA2A 3K2FA 1CAZA 3SBIA 1J9WA 1BN3A 4QJXA 2WEHA 3R16A 4Q08A 2FOYA 4JSAA 4E4AA 4RUZA 1HECA 4DZ7A 5DSIA 2ILIA 3D0NA 1CVBA 4RUXA 3S71B 1YO1A 3PO6A 3S9TA 5FLQA 1FLJA 1KOQA 3M5EA 3M67A 5EHVA 4M2VA 3OYSA 1G54A 5A25A 1FQLA 1KWQA 4YHAA 3DVCA 5EKMA 3KONA 4CNXA 2X7UA 3RYVB 1CAHA 1TH9A 4YWPA 2NWPA 4KUVA 1CILA 1JD0A 4Z1NA 4E3DA 4N0XB 1LUGA 2WD3A 3N2PA 4YGFA 3OYQA 3NI5A 4QJMA 5CACA 1YDAA 1G0FA 1HUHA 2VVBX 4YYTA 4KP8A 1CVEA 2OSFA 3FW3A 3T83A 1H4NA 5DSMA 4HT0A 4N16A 1BN1A 4HF3A 4L5WA 2POVA 3S76A 5FNJA 3V2MA 4XIWA 3TVNX 3MNUA 1Y7WA 6CA2A 2NWYA 4HEWA 3M98A 1TE3X 4RH2A 1Z93A 3V3JA 4YGJA 1RZAA 4HU1A 3HLJA 4QIZA 3RZ7A 1BNQA 1I9PA 1XPZA 3CZVA 5JQTA 4R5BA 1CCUA 5FNKA 5EH5A 4CA2A 3DC9A 3NB5A 4QEFA 1H9NA 1G52A 3M1QA 3P58A 3DC3A 3ZNCA 4TWMA 1AM6A 4Q49A 5EHWA 3HKQA 4MLXA 4X5SA 3TVOX 4CNRA 1V9IC 3D9ZA 3KNEA 3UYQA 5EH8A 4YGLA 5JDVB 5G0BA 2HD6A 5FDCA 4RFCA 1FSNA 2NWOA 4QTLA 1G6VA 1TTMA 4PQ7A 1FR4A 5DSKA 4BF6A 1CNWA 3M04A 5JGSB 3HKNA 1HCAA 3Q31A 4GL1X 3S8XA 3K34A 4ZAOA 1ZFQA 3S75B 3MHIA 4COQA 3M2XA 5EZTX 1CAMA 1CRAA 4K0TA 5SZ6A 3BL0A 4XFWA 4Q9YA 3EFTA 1CAKA 5FNMA 3RGEA 3B1BA 4Q87A 4ZWIA 5E28A 4CQ0A 5JG3B 5BRVA 1LZVA 1TG3A 5EHEA 1BV3A 5DSNA 2FOQA 1CRMA 2NN1A 4FVOA 5L6KA 5FNHA 3B4FA 4KAPA 3OY0A 1HUGA 1FQNA 1CNXA 1CANA 5DSQA 2CBEA 2POUA 3R17B 7CA2A 3HKUA 2CABA 4ZWZA 3CYUA 1RJ6A 2QOAA 1CCSA 3CA2A 3P5LA 3FE4A 5E5RA 1UGAA 3M2NA 3MHCA 4JSWA 2HL4A 2NNVA 1BCDA 3RZ8A 1IF4A 2HKKA 4YGKA 1I9NA 3RYYA 3F7BA 5FNIA 3RYJB 1RZBA 3M40A 5C8IA 1ZE8A 4Q8ZA 2WEGA 5FL5A 4M2UA 3K7KA 4Q7VA 4YXOA 3MNAA 4Q7WA 1IF7A 1HEBA 1RZEA 1H9QA 3IBNA 5FNGA 3W6IA 4L5VA 3IBUA 5SZ4A 3IGPA 2EU2A 3PJJA 3V3IB 4RIUA 3IBIA 4MDGA 4KNNA 3CAJA 3RJ7A 4KUYA 3RG3A 2FOSA 1DMYA 3DVBA 4Z1KA 5SZ2A 2FNMA 1ZNCA 3V3HB 1IF5A 3F7UA 4Q90A 1I9MA 1UGCA 3KKXA 5AMLA 3BETA 2POWA 1JCZA 3KIGA 1ZGEA 4Z0QA 3P55A 1IF6A 4RIVA 5EKHA 1G4JA 4QK2A 1I9OA 1CNKA 3D93A 4PYYA 5FLPA 5CJFA 5JEPB 5BYIA 1CAYA 3SAXA 4FIKA 1I90A 1CNYA 5DSOA 1I8ZA 4TWLA 1G4OA 3D8WA 3NJ9A 4Q09A 2HFWA 4IDRX 4KNJA 2EU3A 3M5SA 4HEYA 4QIYA 2IT4A 5E2RA 3DVDA 1CIMA 4QSJA 3RLDA 2FMGA 2H15A 5JESB 1DCBA 1OKNA 4MTYA 3DBUA 3OKUA 3M14A 1OQ5A 3OKVA 1ZSAA 3KS3A 3DA2A 1G45A 1OKMA 3MHMA 5FLRA 2WEOA 4WUQA 2H4NA 3QYKA 5FDIA 3MMFA 1BNVA 12CAA 1LGDA 4Q06A 4L5UA 3S72B 1FSQA 2AW1A 4Q81A 4Y0JA 5JG5B 2HOCA 1TBTX 1IF9A 2CBCA 4DZ9A 5SZ7A 2NN7A 3EFIA 5FLTA 1YDDA 3MNIA 2FOUA 4QJOA 3ZP9A 1CAOA 1I91A 1HCBA 5DVXA 2O4ZA 3DV7A 4FRCA 3MHLA 2HNCA 3PYKA 4E9OX 3T82A 4KNMA 3S73B 5G01A 4G0CA 3V2JA 3IBLA 3OILA 3HS4A 3GZ0A 3KOIA 1G0EA 1CNBA 4KNIA 4LU3A 3M2ZA 5L3OA 1CA2A 2X7SA 4BF1A 1AVNA 4Q8XA 1IF8A 2CBAA 1CNGA 1JV0A 4K1QA 1FQRA 4BCWA 4E49A 1XEVA 5AMGA 2NWZA 3P5AA 3MDZA 4RN4A 4M2WA 4YVYA 2NXRA 1HEDA 1HVAA 5LMDA 4JSZA 4QJPA 3DCWA 4Q0LA 1TEUX 5SZ1A 5JEGB 5SZ5A 4QJWA 3LXEA 4MDMA 5E2NA 5DSPA 3MHOA 3HKTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5BRU A;  3C7P A;  4WR7 A;  5SZ0 A;  4CAC A;  3S77 B;  1V9E A;  4LHI A;  1I9Q A;  5CLU A;  3DCC A;  3IAI A;  1EOU A;  4Q8Y A;  1UGB A;  1BZM A;  4XIX A;  3F8E A;  3P44 A;  5JGT B;  4K0Z A;  4Q78 A;  5DSR A;  1CAI A;  3S97 A;  3T84 A;  4WL4 A;  4WW8 A;  1BNU A;  4ITO A;  4YXI A;  3DD8 A;  1LG6 A;  1CAJ A;  3OIK A;  3M1K A;  1HEA A;  2NNO A;  3JXG A;  1G3Z A;  2NXS A;  4Q6E A;  3UYN A;  3M96 A;  4YGN A;  1KEQ A;  1TEQ X;  1CNJ A;  1CVF A;  3V3F A;  3W6H A;  4Q07 A;  2X7T A;  5FLS A;  1ZH9 A;  4Z1E A;  2FW4 A;  4E3H A;  1KWR A;  3KWA A;  4Z1J A;  3M1W A;  3MYQ A;  4M2R A;  3U47 A;  1KOP A;  1CA3 A;  3RZ0 B;  4QJ0 A;  4E3G A;  3T5Z A;  1OKL A;  4QY3 A;  4YXU A;  1BNM A;  2OSM A;  4KUW A;  3VBD A;  4CNW A;  1CZM A;  1RZC A;  5DSJ A;  2CBD A;  4FVN A;  4KV0 A;  4QSA A;  3RG4 A;  1RAZ A;  1ZGF A;  3S74 B;  4ITP A;  5G0C A;  4R5A A;  5HPJ A;  3M5T A;  1CVD A;  1FSR A;  2WEJ A;  1UGE A;  4E5Q A;  3IEO A;  3MNJ A;  5IPZ A;  4JSS A;  3V3G B;  2NMX A;  3TMJ A;  3L14 A;  5JQ0 A;  5E2K A;  3U3A X;  2FNK A; 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