2AW1A

Carbonic anhydrase inhibitors: valdecoxib binds to a different active site region of the human isoform ii as compared to the structurally related cyclooxygenase ii "selective" inhibitor celecoxib
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carbonic anhydrase inhibitors: Valdecoxib binds to a different active site region of the human isoform II as compared to the structurally related cyclooxygenase II
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2aw1A00
2CBCA 4PQ7A 3MHLA 3DAZA 3MNJA 2FMGA 5DSQA 1BNUA 4K0ZA 4C3TA 1RZBA 3ML2A 1BCDA 3JXFA 1V9EA 3B1BA 3CAJA 3RG4A 5FLRA 3ZNCA 5A25A 2NN1A 1CALA 2CBAA 3U47A 1CINA 4E5QA 1CVBA 1HVAA 2H4NA 3M67A 4UOVA 4YVYA 4QK3A 1I9MA 3M5SA 3P5LA 4IDRX 3U7CA 4RFCA 4Q07A 3N4BA 1FSNA 4R5BA 4BF6A 1G48A 5BNLA 4JSZA 4DZ7A 2FNMA 2HNCA 1ZGEA 4G7AA 1CNKA 1TEQX 4WW8A 3SBHA 3RGEA 1CAKA 4BF1A 2X7UA 3M2XA 4QK1A 5DSJA 4FVNA 1CAHA 4FVOA 1RZEA 4QJ0A 4ZX0A 2WEOA 1XPZA 4JSSA 3U3AX 3RZ0B 3OKUA 4HEYA 1UGAA 4JS6A 4KUWA 3DVBA 4RFDA 1ZGFA 4XZ5A 3D9ZA 3KIGA 3OKVA 4WR7A 2CABA 5SZ1A 4QSJA 2NWPA 2NWZA 3DVCA 4LU3A 4MLXA 3EFTA 4Q7SA 4QTLA 1IF6A 2FOUA 3RZ5A 3M1JA 6CA2A 4KV0A 1Z9YA 2NXTA 3DVDA 5SZ4A 7CA2A 3FW3A 2NWOA 4QSIA 1TE3X 1XQ0A 3KWAA 3V3JA 1IF4A 3K2FA 1FR7A 4YXIA 4YYTA 2Q1QA 4E3GA 5BRVA 3D93A 5L6KA 5DSKA 3RYJB 3B4FA 1OQ5A 1DCAA 2QP6A 1CNJA 3FE4A 4Q7WA 5BRWA 3P3JA 4HEWA 3F8EA 5SZ2A 1YDDA 1ZFKA 3TMJA 3V2MA 4Z1NA 3KKXA 1THKA 5SZ6A 1MOOA 2IT4A 5DOHA 1XEGA 3IBIA 1OKMA 5JEGB 3JXGA 4L5VA 4JSAA 1FQLA 1J9WA 3RYXB 1HUHA 5AMLA 1G4OA 5CA2A 1G4JA 5FNLA 2FOSA 5CJFA 1I9PA 4KNIA 4N16A 5E2MA 3S78B 1AM6A 1G45A 3OYSA 1BN1A 1UGEA 4MO8A 5DOGA 1HUGA 3KLDB 4K0SA 3IBNA 4Q90A 4KAPA 4Q08A 4CNXA 1JD0A 4PYYA 3DV7A 4QK2A 1TG9A 4G0CA 4PZHA 3RZ1B 1Y7WA 4ITOA 1T9NA 3M1WA 1XEVA 3MYQA 4FRCA 1CCSA 1DCBA 3LXEA 4CACA 1CNWA 4YGJA 3M2YA 3S72B 5DSIA 5HPJA 1DMYA 4RIUA 2CBEA 4Q6EA 1CVCA 4KNJA 4ZWZA 1RAYA 5C8IA 2FOQA 3MHIA 3DCSA 1CVHA 3CYUA 3HLJA 2AX2A 2QOAA 1LG6A 4Q49A 4L5UA 1JCZA 4KP8A 4YGKA 4YXUA 3SAXA 5EKHA 3MMFA 5FLPA 5A6HA 1LUGA 4HEZA 4RUYA 5E5UA 3DBUA 3IGPA 5FNMA 3DC9A 1KEQA 1BNTA 4QJPA 2POVA 3T5UA 1I91A 4Z1EA 3HKUA 3GZ0A 3MZCA 5E2NA 3RYZA 4M2WA 1HECA 4M2RA 5AMGA 3S71B 5EKJA 1ZSBA 5JG3B 5L3OA 2VVBX 1CANA 2OSFA 5DSOA 4RUXA 1AZMA 2ILIA 5BYIA 4ZWXA 4LHIA 5DSRA 1BICA 2CA2A 1LGDA 3EFIA 3R17B 4CA2A 5G0CA 1HEDA 5EH5A 1TH9A 3C7PA 3S97A 2POUA 3FFPX 2NXRA 4YGNA 2FNNA 4XFWA 4YGFA 5EH7A 1OKLA 4XE1A 3DCWA 1TTMA 5CLUA 3K7KA 4CNWA 2HOCA 1UGBA 4JSWA 4XIWA 3CZVA 5CACA 1YO1A 4HU1A 4RN4A 3T85A 3K34A 4HT2A 3SAPA 4ZAOA 8CA2A 1I8ZA 5JQTA 1BNMA 3N2PA 4ETQC 1YO2A 1ZSCA 3BETA 3S77B 3V3IB 2NNVA 1ZFQA 1BNWA 4QJMA 5E28A 4XIXA 4FL7A 4MDGA 3S76A 3OIKA 4K1QA 1CRMA 1ZH9A 1CIMA 4R5AA 5JDVB 2HD6A 2VVAX 2GD8A 1G46A 2FMZA 5G01A 1H4NA 2NN7A 5FDCA 5BRUA 3RLDA 1HCAA 4QJOA 2O4ZA 5SZ3A 3T5ZA 5G03A 4FU5A 3DCCA 4Q06A 3S75B 5DSLA 3RJ7A 2QO8A 4KP5A 4E49A 2FNKA 1CAIA 2WEJA 1CAJA 3IBUA 3M96A 5EKMA 3IBLA 1CA3A 3S8XA 4HF3A 1DMXA 5FLSA 5FDIA 3MHMA 2Q38A 4QIYA 5FNHA 1KWQA 5IPZA 4YHAA 1YO0A 3N0NA 4Z0QA 1G6VA 2X7TA 1EOUA 5DVXA 2ABEA 4Q9YA 3UYQA 3OILA 3RYVB 2NNGA 4YGLA 1F2WA 4ZWYA 1LG5A 1TG3A 4Q81A 4M2VA 4COQA 2OSMA 4FPTA 2NNSA 3KNEA 4K0TA 3T82A 5EZTX 4YXOA 3M14A 5EOIA 1CZMA 4Q7PA 5FNIA 3RG3A 3T84A 1AVNA 3P3HA 5FNJA 4WUPA 1RJ5A 4GL1X 5JQ0A 2WEGA 4Q83A 5JEHB 4E9OX 4R59A 2H15A 3N3JA 2NNOA 3M40A 3R16A 4RH2A 4Y0JA 5SZ7A 1G54A 1CCTA 5JESB 5FL6A 2WEHA 1ZNCA 4LP6A 3OYQA 3KOKA 3V5GA 3OY0A 3M2ZA 3IAIA 3KOIA 3P44A 1G1DA 1TB0X 4MLTA 1RZCA 1HEBA 1CNXA 1YDBA 5J8ZA 3NB5A 4FIKA 2CBBA 3TVOX 4Q99A 4QY3A 1A42A 2FW4A 4PYXA 1UGGA 4MTYA 5EHEA 3RYYA 4Q8ZA 3PYKA 2NXSA 2EZ7A 4KNMA 1BV3A 4L5WA 3HS4A 4ITPA 3NJ9A 4Q0LA 4Q09A 4BCWA 4TWLA 4DZ9A 1BN4A 3DA2A 1BZMA 1CAOA 1CVFA 3DD0A 3M5TA 1FQNA 3PJJA 1FLJA 4X5SA 5AMDA 3V7XA 1CCUA 2AW1A 4Q78A 1IF7A 3ML5A 4E4AA 4Z1JA 2HL4A 1RZAA 1I9LA 4QJXA 3S73B 5E2RA 1CVAA 3DC3A 3IEOA 1ZSAA 3TVNX 4MDMA 5JGSB 3P55A 3D8WA 1KOQA 3U45X 3HFPA 2POWA 3M3XA 1RJ6A 4ZX1A 3BL0A 3Q31A 3F7UA 3HKQA 4PXXA 5EH8A 3UYNA 1I9OA 5E2KA 4Q8YA 1BNQA 4M2UA 3JXHC 5FNGA 1I90A 1UGFA 4WW6A 4RUZA 1YDAA 1JV0A 2Q1BA 3S74B 4Q7VA 5EHVA 4CNVA 4E3DA 1CRAA 1RZDA 1H9QA 4HT0A 4YWPA 2EU2A 1OKNA 4ZWIA 1TBTX 3KONA 3MNIA 1FR4A 4Q8XA 3W6HA 1BN3A 1RAZA 2NWYA 1IF8A 3BL1A 1CNYA 5DSMA 4E3FA 2NMXA 3L14A 3SBIA 1CNIA 9CA2A 2FOYA 1CNBA 3MNKA 3MNUA 3M1KA 4E3HA 5JG5B 1I9QA 3M2NA 4Q87A 3MHOA 1UGDA 3F7BA 3MHCA 4IWZA 1KOPA 5SZ0A 4Q6DA 1I9NA 1MUAA 2CBDA 5SZ5A 1G53A 4TWMA 1CILA 3P4VA 4MDLA 2W2JA 1IF9A 1KWRA 1URTA 2ZNCA 2HKKA 4QIZA 3RZ7A 3MNHA 5FL4A 5G0BA 4QEFA 1UGCA 3M5EA 1V9IC 1FSQA 2EU3A 3CA2A 3P5AA 5DRSA 1CA2A 3ZP9A 3M1QA 3QYKA 2F14A 1H9NA 3KS3A 1Z97A 4QSBA 5JEPB 1G0EA 3M98A 2X7SA 5DSNA 4KUYA 3W6IA 3HKNA 2WD2A 1ZE8A 5FLQA 4HBAA 1Z93A 3D0NA 5FNKA 5EHWA 3D92A 3DD8A 4KUVA 4Z1KA 1CAMA 1CNGA 3S9TA 5FL5A 12CAA 2HFWA 4WL4A 4WUQA 2WD3A 1TEUX 3HKTA 1YDCA 4K13A 3OIMA 3F4XA 1G3ZA 5JGTB 1G0FA 3NI5A 3V3GB 5FLOA 1LZVA 4KNNA 1CAZA 4N0XB 1CNCA 3MNAA 1CVDA 4RIVA 5E2SA 1G52A 2FOVA 3RZ8A 1FSRA 1FQRA 3MWOA 1FQMA 4CNRA 3T83A 3MDZA 3M04A 3V3FA 3V2JA 1BNNA 3PO6A 1HEAA 5FLTA 1BNVA 4CQ0A 4ILXA 3VBDA 1CAYA 2GEHA 5DSPA 3V3HB 1IF5A 5EIJA 4QSAA 5E5RA 5LMDA 1CNHA 4YX4A 1CVEA 1HCBA 4QJWA 3P58A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CBC A;  4PQ7 A;  3MHL A;  3DAZ A;  3MNJ A;  2FMG A;  5DSQ A;  1BNU A;  4K0Z A;  4C3T A;  1RZB A;  3ML2 A;  1BCD A;  3JXF A;  1V9E A;  3B1B A;  3CAJ A;  3RG4 A;  5FLR A;  3ZNC A;  5A25 A;  2NN1 A;  1CAL A;  2CBA A;  3U47 A;  1CIN A;  4E5Q A;  1CVB A;  1HVA A;  2H4N A;  3M67 A;  4UOV A;  4YVY A;  4QK3 A;  1I9M A;  3M5S A;  3P5L A;  4IDR X;  3U7C A;  4RFC A;  4Q07 A;  3N4B A;  1FSN A;  4R5B A;  4BF6 A;  1G48 A;  5BNL A;  4JSZ A;  4DZ7 A;  2FNM A;  2HNC A;  1ZGE A;  4G7A A;  1CNK A;  1TEQ X;  4WW8 A;  3SBH A;  3RGE A;  1CAK A;  4BF1 A;  2X7U A;  3M2X A;  4QK1 A;  5DSJ A;  4FVN A;  1CAH A;  4FVO A;  1RZE A;  4QJ0 A;  4ZX0 A;  2WEO A;  1XPZ A;  4JSS A;  3U3A X;  3RZ0 B;  3OKU A;  4HEY A;  1UGA A;  4JS6 A;  4KUW A;  3DVB A;  4RFD A;  1ZGF A;  4XZ5 A;  3D9Z A;  3KIG A;  3OKV A;  4WR7 A;  2CAB A;  5SZ1 A;  4QSJ A;  2NWP A;  2NWZ A;  3DVC A;  4LU3 A;  4MLX A;  3EFT A;  4Q7S A;  4QTL A;  1IF6 A;  2FOU A;  3RZ5 A;  3M1J A;  6CA2 A;  4KV0 A;  1Z9Y A;  2NXT A;  3DVD A;  5SZ4 A;  7CA2 A;  3FW3 A;  2NWO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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