2ILIA

Refine atomic structure of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Atomic crystal and molecular dynamics simulation structures of human carbonic anhydrase II: insights into the proton transfer mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2iliA00
3OIMA 1CAJA 4K0ZA 4ZWZA 4YX4A 3N0NA 3V3JA 1YDAA 5G0CA 3KS3A 1CCTA 1H4NA 1ZH9A 4Q49A 3V7XA 4QJMA 3OIKA 3V3IB 3MWOA 4Q8XA 3S75B 1CINA 5EHEA 3HS4A 3CAJA 5E2SA 2HFWA 4ZX0A 5SZ0A 4E9OX 2VVAX 1ZSBA 4CNXA 4FL7A 2WEJA 3V5GA 1UGEA 2HOCA 1AZMA 4MDGA 1CAYA 4RIUA 1MUAA 1XEVA 4IDRX 3RYXB 2NWPA 6CA2A 3U45X 2IT4A 3P5LA 4QJPA 1TE3X 4GL1X 1HECA 3DC3A 1Z9YA 5JESB 1FQMA 3K7KA 1IF4A 4M2RA 5FL6A 1I9QA 3BETA 3P3JA 3T82A 4Q6DA 2CBCA 5FDIA 5FLQA 4CQ0A 5JGTB 3MNJA 4ITOA 4LHIA 4DZ7A 3KONA 1CNYA 1G52A 3P3HA 4ITPA 1JD0A 5BNLA 5JEGB 1G48A 3B1BA 1BN4A 1FQNA 4FVNA 5AMGA 2NMXA 1DMXA 4HEYA 5L6KA 1CVBA 2OSMA 3KKXA 2CBEA 3T5ZA 1BICA 4PQ7A 5E5RA 5SZ1A 3S97A 4L5UA 4JSSA 5L3OA 3IBLA 4G0CA 3TVNX 1I8ZA 1RAZA 1CNWA 3ML2A 1XPZA 5BRVA 5FNHA 1Y7WA 1BN1A 5DSIA 4QY3A 3CA2A 4HU1A 4ILXA 3T83A 1YDDA 2HKKA 4E3HA 1V9EA 1I9LA 3R17B 4TWMA 3ML5A 3S76A 1UGGA 5FNGA 3S9TA 4QSIA 5C8IA 4K0TA 3RZ8A 4FVOA 5FL5A 3MNKA 1CAOA 2QO8A 3NI5A 4QJWA 4QSJA 3DCSA 4QSAA 5DSQA 1IF6A 2WEHA 3HKQA 4ZWYA 1H9NA 4PXXA 4YXIA 3D92A 1CNIA 4MTYA 5EH7A 4Q87A 3KLDB 4RFDA 5E2MA 2POVA 4WL4A 5FLPA 1JV0A 3W6HA 3RZ7A 1G1DA 2NXTA 5EHVA 1CVFA 3IBIA 2NNSA 5JG3B 1G4OA 3MHMA 4Q7SA 4LU3A 4YGNA 3HKNA 3N4BA 4R5AA 4ZWXA 3P5AA 3S74B 5CACA 2NWYA 2FOUA 1HEBA 2WD2A 4KP8A 4KV0A 4E4AA 1URTA 2CA2A 1OKLA 5DSKA 5EIJA 4Z0QA 3V3HB 4QK1A 4Q8YA 3OY0A 2EZ7A 3K34A 1LG6A 2CBAA 4YVYA 4JSZA 1A42A 3N2PA 4ZAOA 2HNCA 3PJJA 5JEHB 1ZGEA 3RYYA 3RYJB 4YGJA 1KWQA 2X7TA 4Z1JA 3RGEA 5DSNA 3RJ7A 1CNBA 5FLTA 1I9OA 1BCDA 3RYZA 1THKA 1RJ5A 4YGKA 3P55A 3U3AX 3M14A 1HCBA 1G45A 4Z1NA 4QK3A 1TB0X 1G0FA 2HD6A 1CZMA 4ETQC 4R59A 3RZ1B 2NXRA 4PYXA 4E49A 3CZVA 4M2WA 3M67A 4PYYA 3DD8A 1HEDA 2CABA 4QJOA 1CILA 5EZTX 4WUQA 1KOPA 4QK2A 3GZ0A 2NNVA 3R16A 5DSLA 4Z1EA 3BL0A 1BNVA 4HEWA 4XIWA 1CVHA 4MDLA 4PZHA 4Q81A 7CA2A 1I9NA 3DC9A 4Q08A 5DVXA 4E3GA 4HT2A 4WW6A 3KOIA 2Q1QA 2ZNCA 3M2XA 3MNIA 4Q78A 1RAYA 4HT0A 4RUXA 2OSFA 3NJ9A 4M2VA 1BNQA 5JQTA 1HUHA 1TTMA 4IWZA 3TMJA 1YDBA 3EFIA 1OKNA 3K2FA 3DD0A 2NXSA 1KEQA 3LXEA 3T5UA 5A6HA 1RJ6A 2CBBA 3MZCA 4MLTA 4K0SA 4QSBA 1Z97A 3S8XA 4E5QA 2POUA 3M2NA 3MNUA 1BNUA 5SZ3A 5AMLA 3DVCA 1FLJA 5E5UA 2FOQA 4BCWA 4XE1A 3ZP9A 3M1WA 4HF3A 1F2WA 3VBDA 1XQ0A 4CNRA 4JSAA 3EFTA 1ZGFA 3M2ZA 3CYUA 3UYQA 3IGPA 3FW3A 5SZ5A 1OKMA 2NNGA 4YHAA 5DSMA 1FR4A 5CA2A 4N16A 4TWLA 5SZ4A 1CVEA 4UOVA 1DCAA 12CAA 4L5WA 2HL4A 4YXUA 1CCSA 4HEZA 4YXOA 1BNNA 1CANA 2FNKA 2Q38A 3V3FA 3PO6A 3MNAA 1ZE8A 1CVAA 4COQA 3N3JA 4HBAA 4LP6A 1LUGA 5JG5B 2H15A 1CA3A 1FQRA 4RIVA 1UGAA 3M2YA 3BL1A 4KNNA 3SAPA 2FNNA 4JS6A 4XZ5A 5FDCA 2WEOA 1ZFKA 1G0EA 1OQ5A 1CAKA 4Q9YA 4KP5A 1ZNCA 3D0NA 5EKJA 4Q90A 4MDMA 3U47A 1CIMA 3OILA 4Q7WA 3DVBA 1BNMA 2CBDA 1ZFQA 4Q0LA 4CNVA 5SZ6A 3D8WA 4C3TA 3HFPA 3DVDA 2QP6A 3M04A 3S73B 3Q31A 1I91A 3MHOA 5DOGA 5G01A 3B4FA 3V2MA 2O4ZA 1XEGA 2NNOA 3RZ0B 5DRSA 3V3GB 5EOIA 3RYVB 1TBTX 5EKMA 3T85A 3ZNCA 4CA2A 1TEQX 5JQ0A 3KOKA 3NB5A 5DSRA 1HEAA 5EH5A 3F7UA 4Q8ZA 1CRMA 5FL4A 1CAHA 1TG9A 1CVDA 1CNJA 1UGCA 3MMFA 3P44A 4Q07A 5A25A 3S71B 1J9WA 2FOSA 1YO2A 3JXFA 3C7PA 3HKUA 2FMZA 1CA2A 5E28A 1G3ZA 2W2JA 3HKTA 2NN1A 3DA2A 5LMDA 4YWPA 2FW4A 5FNKA 3RLDA 2FOVA 3M5TA 3S72B 1I9MA 4KUVA 1CAMA 3PYKA 5BRUA 5E2KA 2FOYA 4Q06A 4G7AA 3M1KA 2EU2A 2FMGA 1RZAA 5DOHA 2NWOA 5BRWA 5SZ7A 1IF9A 5FNJA 2ILIA 5G0BA 4ZX1A 1G4JA 4KAPA 3S78B 4KNJA 5J8ZA 5FLRA 1UGDA 1FSQA 3DAZA 3UYNA 1I90A 3D9ZA 1G53A 1FQLA 3OYSA 4QJXA 1CNHA 3RG4A 5JGSB 2Q1BA 2AW1A 4YYTA 3M1JA 4FRCA 5FLOA 5FNLA 4K13A 1G46A 1UGBA 4M2UA 1CVCA 2GEHA 4BF6A 4QEFA 1CCUA 1TH9A 4Q6EA 3D93A 4WR7A 3IBUA 1FSRA 4XIXA 4ZWIA 1CAZA 1G6VA 5DSJA 3HLJA 4K1QA 4KUYA 1CNXA 1YO1A 3MDZA 1ZSAA 3F8EA 4XFWA 1MOOA 4KUWA 5EKHA 9CA2A 3DBUA 3M40A 5JEPB 4QIZA 1FSNA 5CJFA 1I9PA 2WD3A 4KNIA 4E3FA 1RZDA 3RZ5A 5SZ2A 2POWA 4Q83A 4QJ0A 4CACA 1Z93A 1ZSCA 3IBNA 2VVBX 4X5SA 1LZVA 3MHLA 5CLUA 1CNGA 5BYIA 2EU3A 1KWRA 3W6IA 3F7BA 3M96A 5EH8A 5G03A 3M5SA 1TG3A 1IF8A 2QOAA 3JXGA 3M3XA 1BZMA 1YO0A 1RZEA 2WEGA 1BNTA 3F4XA 4Q7PA 4WW8A 1H9QA 2X7UA 4FPTA 2AX2A 4YGFA 3IAIA 3FE4A 3KNEA 4RUZA 3RG3A 2GD8A 3OYQA 5FLSA 3OKUA 4E3DA 3T84A 4RH2A 5E2RA 1T9NA 1RZBA 4BF1A 5AMDA 1EOUA 3KIGA 4Q7VA 3M98A 3MNHA 3DCWA 1DMYA 1CNKA 3S77B 1BV3A 4CNWA 4Z1KA 1G54A 5EHWA 4MO8A 1V9IC 3MHIA 1KOQA 2F14A 4QIYA 4FIKA 3QYKA 5DSOA 3DCCA 3M1QA 1JCZA 2ABEA 4MLXA 5IPZA 3SBHA 1CALA 1IF5A 2NWZA 3JXHC 4L5VA 1DCBA 1YDCA 4Y0JA 3SBIA 3V2JA 1CAIA 2FNMA 3MHCA 4QTLA 2H4NA 1AVNA 4Q09A 4R5BA 3DV7A 3L14A 4RN4A 5FNMA 3IEOA 2NN7A 3KWAA 5DSPA 1BN3A 3TVOX 3P4VA 1FR7A 5FNIA 1CNCA 4WUPA 5E2NA 1TEUX 3FFPX 8CA2A 3U7CA 4DZ9A 1IF7A 3SAXA 4KNMA 2X7SA 1LGDA 1CRAA 3OKVA 3MYQA 1AM6A 4RFCA 1HVAA 3M5EA 4N0XB 1BNWA 1HCAA 5HPJA 1RZCA 4RUYA 5JDVB 1LG5A 3P58A 4FU5A 4Q99A 1UGFA 1HUGA 4YGLA 4JSWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OIM A;  1CAJ A;  4K0Z A;  4ZWZ A;  4YX4 A;  3N0N A;  3V3J A;  1YDA A;  5G0C A;  3KS3 A;  1CCT A;  1H4N A;  1ZH9 A;  4Q49 A;  3V7X A;  4QJM A;  3OIK A;  3V3I B;  3MWO A;  4Q8X A;  3S75 B;  1CIN A;  5EHE A;  3HS4 A;  3CAJ A;  5E2S A;  2HFW A;  4ZX0 A;  5SZ0 A;  4E9O X;  2VVA X;  1ZSB A;  4CNX A;  4FL7 A;  2WEJ A;  3V5G A;  1UGE A;  2HOC A;  1AZM A;  4MDG A;  1CAY A;  4RIU A;  1MUA A;  1XEV A;  4IDR X;  3RYX B;  2NWP A;  6CA2 A;  3U45 X;  2IT4 A;  3P5L A;  4QJP A;  1TE3 X;  4GL1 X;  1HEC A;  3DC3 A;  1Z9Y A;  5JES B;  1FQM A;  3K7K A;  1IF4 A;  4M2R A;  5FL6 A;  1I9Q A;  3BET A;  3P3J A;  3T82 A;  4Q6D A;  2CBC A;  5FDI A;  5FLQ A;  4CQ0 A;  5JGT B;  3MNJ A;  4ITO A;  4LHI A;  4DZ7 A;  3KON A;  1CNY A;  1G52 A;  3P3H A;  4ITP A;  1JD0 A;  5BNL A;  5JEG B;  1G48 A;  3B1B A;  1BN4 A;  1FQN A;  4FVN A;  5AMG A;  2NMX A;  1DMX A;  4HEY A;  5L6K A;  1CVB A;  2OSM A;  3KKX A;  2CBE A;  3T5Z A;  1BIC A;  4PQ7 A;  5E5R A;  5SZ1 A;  3S97 A;  4L5U A;  4JSS A;  5L3O A;  3IBL A;  4G0C A;  3TVN X;  1I8Z A; 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