2NN7A

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase i
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
PDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nn7A00
3P58A 1LGDA 1CVBA 1EOUA 4QK2A 2FMGA 1CAYA 1DCBA 1RAZA 3FFPX 5FLTA 4QK3A 3U47A 5FDIA 1KWRA 1CVFA 1ZSBA 3D93A 4N16A 4COQA 3U3AX 3T5UA 4RIVA 3IBNA 4R59A 1JV0A 4RFDA 4Q0LA 3VBDA 1J9WA 3SAPA 1HEAA 1Z9YA 3F8EA 4QSIA 4HU1A 1RZDA 2FOVA 4HEZA 5EZTX 3KOIA 4PYYA 4RIUA 1XPZA 3M40A 2WD3A 3KS3A 4KP8A 4ZWZA 3M96A 3SBIA 2ILIA 2AX2A 3DD0A 4JS6A 5FL4A 1ZFQA 4G7AA 1HVAA 2HOCA 4KUWA 5LMDA 2FNMA 4UOVA 1OQ5A 3C7PA 3DD8A 2CBBA 5EKHA 1KOQA 4R5AA 1THKA 2NXRA 5DSIA 5L3OA 3V7XA 3N4BA 1CNIA 3V2JA 1IF4A 1UGFA 1TG3A 4PZHA 3HKTA 3KKXA 1Z93A 1YO1A 5EH7A 3JXHC 4YGKA 2GD8A 5G0CA 5L6KA 3IBIA 1DMYA 4QTLA 3SAXA 1TB0X 2NNVA 3QYKA 1TBTX 4FRCA 1OKLA 3RZ0B 4TWMA 3T84A 1AM6A 1HEBA 4XIWA 2EZ7A 4Q9YA 4QJPA 1CA2A 4Q06A 3RZ1B 3IGPA 4TWLA 4JSWA 1CINA 4QY3A 1CAJA 3IBLA 3F7BA 4QJ0A 5EH5A 3S8XA 1ZGEA 4HF3A 4YHAA 3HKQA 5FLOA 4YX4A 2FOYA 2QOAA 3MNUA 5E28A 4E3HA 1CVHA 3OY0A 1KWQA 1FQRA 3DA2A 4YXUA 3DC3A 3M2ZA 1G4JA 1YO0A 5FLSA 3RLDA 1I9OA 4QK1A 1RJ5A 3RYVB 1CIMA 1DCAA 2WEGA 3FE4A 4E4AA 2CBAA 1AZMA 2H15A 1BNQA 1H9QA 1IF8A 3N0NA 1CVCA 5JQTA 1LZVA 5DSNA 2FOSA 2WD2A 1UGDA 2FOUA 1CNJA 4WW8A 3S77B 3DVDA 3RZ5A 4QEFA 4ETQC 4BCWA 1IF6A 3NB5A 1CAIA 5DSPA 1BN4A 4YGFA 3S78B 1BZMA 4Q7PA 4QSJA 4Z0QA 2VVAX 2POVA 4GL1X 5FNMA 4Q07A 1RZEA 4Z1JA 1G4OA 1OKMA 1FQLA 5EKJA 1G53A 1YDDA 4M2WA 2EU2A 5DSOA 5AMDA 4FU5A 1CAKA 4QSBA 5DOHA 2NN7A 1FSRA 3UYNA 1H4NA 1V9EA 4HEYA 4IWZA 3UYQA 1BN3A 4DZ7A 3TVNX 5CJFA 4Z1NA 2POWA 3B4FA 1UGAA 3OKUA 3L14A 5FLQA 2FOQA 1CNXA 3TMJA 9CA2A 5HPJA 5FNKA 3U7CA 1BN1A 3OIKA 5DRSA 1G45A 4ZX0A 4KUVA 1TEUX 3D8WA 1BICA 1G52A 4K0SA 4PXXA 3KNEA 3OILA 4ZX1A 1I91A 3KLDB 4WUQA 5EHEA 1URTA 3FW3A 4Q81A 1BNVA 3MNHA 5JDVB 5E2SA 2NNOA 4CACA 5EIJA 1I8ZA 5DSJA 1IF9A 5DSLA 1ZH9A 4XFWA 3MYQA 5G01A 3RYXB 1I90A 4ITPA 3MHMA 4BF6A 3DVBA 3DAZA 1RZCA 1G3ZA 3B1BA 3P5AA 5E2NA 4DZ9A 1G0FA 5JG5B 5JEGB 3N2PA 1CNCA 4X5SA 2OSFA 2HNCA 4L5UA 4CNXA 4QJWA 5JGTB 3T83A 2WEHA 3PO6A 3T82A 3RG4A 3OKVA 1CNWA 2X7UA 4HBAA 3HFPA 5E2KA 4KNNA 5A25A 3S76A 1I9NA 2Q38A 4QSAA 1XEVA 3F4XA 4Q83A 4QJXA 4Q6EA 1CAMA 4E49A 4ILXA 5DVXA 2Q1BA 5SZ0A 3M5EA 3DC9A 1FR7A 1LG6A 2CA2A 4XIXA 4Z1EA 1CRMA 5E5UA 4Q7SA 3IBUA 5FDCA 3NI5A 3JXGA 3TVOX 1I9MA 3T85A 3ZP9A 8CA2A 4E3GA 1TEQX 4RUZA 2FW4A 2CBDA 1G0EA 2Q1QA 4MDGA 3CAJA 5FNJA 3DV7A 1G6VA 2NNGA 4KAPA 1CALA 3HKNA 4QJMA 2NXTA 4L5WA 1CAZA 4CA2A 5EHWA 2IT4A 1BNNA 3EFIA 2HD6A 4Q09A 4XE1A 4MDMA 1ZSAA 3P44A 3S71B 4ITOA 3S9TA 1I9LA 4Q8ZA 1ZFKA 1FSNA 5SZ5A 4E5QA 1CCSA 5E2MA 1CVDA 4K0TA 1UGGA 3MDZA 2NWPA 1MUAA 1CRAA 1CNKA 4JSAA 5DOGA 3BL0A 5EOIA 3CZVA 4WL4A 1Y7WA 3K34A 1YDBA 3KIGA 1TTMA 2NMXA 3RGEA 5SZ1A 5SZ2A 4KV0A 4CNRA 1HUHA 3P5LA 1RZAA 1HCBA 2FMZA 3MWOA 3OIMA 1F2WA 2CABA 4LU3A 3V3JA 4RH2A 3D9ZA 5AMLA 3IEOA 2H4NA 1TE3X 1Z97A 3ML2A 2FNKA 4Q49A 1HCAA 3CYUA 5SZ4A 2QO8A 1RAYA 3M2YA 3V3GB 3D0NA 5JQ0A 1CAOA 2HKKA 3MNKA 3OYQA 4M2VA 5BNLA 4M2UA 1A42A 1TG9A 2AW1A 4WW6A 3M67A 4Q7WA 3ZNCA 4IDRX 4Q87A 4HEWA 5FNGA 5J8ZA 5SZ6A 2NN1A 2EU3A 3MHOA 4K1QA 1HEDA 2QP6A 3LXEA 4G0CA 5AMGA 3M98A 5FL6A 1CILA 4PQ7A 3OYSA 1G54A 3S97A 4ZWIA 3P3HA 3MNAA 3RG3A 2ZNCA 1CCTA 4M2RA 2F14A 1ZGFA 1XQ0A 1YO2A 4HT2A 1XEGA 5C8IA 3M04A 5EKMA 3U45X 3W6HA 5JEPB 3V3IB 7CA2A 2HL4A 3R17B 4KUYA 3BL1A 2CBEA 5CLUA 4YXOA 5DSRA 3S72B 1CNHA 3PJJA 1UGBA 1LG5A 4RUXA 5SZ7A 3SBHA 3V5GA 5BRUA 3PYKA 4Q8XA 1HUGA 1FR4A 3HLJA 3KOKA 1YDAA 3M1WA 3JXFA 5FNLA 1LUGA 5E5RA 1FSQA 3M2NA 2VVBX 3S74B 4QIYA 3M5SA 4MLTA 1CNGA 5IPZA 4WUPA 4MO8A 5FLRA 4ZWXA 4YWPA 1CNBA 4E3FA 2WEOA 3M1KA 3D92A 3RJ7A 3T5ZA 1ZSCA 2POUA 4Q99A 4HT0A 2X7TA 1G46A 4R5BA 1FQNA 4C3TA 4XZ5A 3BETA 4LHIA 3RZ7A 3M1JA 4FIKA 4QJOA 1JD0A 5CACA 1BNMA 3RYYA 1CVEA 2NXSA 1RZBA 1V9IC 1KOPA 4Q6DA 5JGSB 4JSSA 1CNYA 1FQMA 2NWZA 1H9NA 1OKNA 3DCSA 1BNTA 4Q78A 3HS4A 5JESB 4Q8YA 1UGEA 1TH9A 3IAIA 3DCCA 4E3DA 6CA2A 3Q31A 4Q7VA 4YVYA 4MDLA 5BRWA 3KONA 2NWOA 5JG3B 3ML5A 5FNIA 3RYZA 1CZMA 4KP5A 2NNSA 1CANA 3S73B 3RZ8A 4WR7A 1ZNCA 3M1QA 1CCUA 4PYXA 4Q90A 4YYTA 4YGLA 1I9PA 1MOOA 5CA2A 1CAHA 5SZ3A 5BRVA 3KWAA 4FPTA 4YGNA 3R16A 4E9OX 3M14A 3P4VA 1HECA 3MHIA 3W6IA 4CNVA 2OSMA 3F7UA 3K2FA 3MNIA 5JEHB 1JCZA 2W2JA 3RYJB 2WEJA 5FLPA 12CAA 3MHLA 4RFCA 1CVAA 5FL5A 4FVOA 4ZWYA 1BNWA 5G03A 5A6HA 1RJ6A 1BV3A 1G1DA 1FLJA 4KNMA 3MZCA 3V2MA 4CNWA 3S75B 1IF5A 1ZE8A 1G48A 3HKUA 4KNJA 4MTYA 5BYIA 3MMFA 4FL7A 3P55A 4N0XB 3V3FA 5DSKA 3M3XA 1IF7A 2CBCA 2FNNA 1T9NA 5EHVA 4ZAOA 4Y0JA 5EH8A 4K0ZA 1UGCA 2ABEA 3CA2A 4Z1KA 1BNUA 5DSQA 4FVNA 3N3JA 1KEQA 3P3JA 2HFWA 2X7SA 3M5TA 4K13A 5E2RA 4L5VA 3EFTA 4MLXA 3V3HB 4YXIA 3DBUA 4LP6A 2NWYA 4KNIA 3NJ9A 3MHCA 2GEHA 4QIZA 5FNHA 5DSMA 1BCDA 3GZ0A 1CA3A 4YGJA 3M2XA 1DMXA 1I9QA 4Q08A 5G0BA 3DVCA 3MNJA 1AVNA 4RUYA 4RN4A 1YDCA 3K7KA 4JSZA 4CQ0A 4BF1A 3DCWA 2O4ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P58 A;  1LGD A;  1CVB A;  1EOU A;  4QK2 A;  2FMG A;  1CAY A;  1DCB A;  1RAZ A;  3FFP X;  5FLT A;  4QK3 A;  3U47 A;  5FDI A;  1KWR A;  1CVF A;  1ZSB A;  3D93 A;  4N16 A;  4COQ A;  3U3A X;  3T5U A;  4RIV A;  3IBN A;  4R59 A;  1JV0 A;  4RFD A;  4Q0L A;  3VBD A;  1J9W A;  3SAP A;  1HEA A;  1Z9Y A;  3F8E A;  4QSI A;  4HU1 A;  1RZD A;  2FOV A;  4HEZ A;  5EZT X;  3KOI A;  4PYY A;  4RIU A;  1XPZ A;  3M40 A;  2WD3 A;  3KS3 A;  4KP8 A;  4ZWZ A;  3M96 A;  3SBI A;  2ILI A;  2AX2 A;  3DD0 A;  4JS6 A;  5FL4 A;  1ZFQ A;  4G7A A;  1HVA A;  2HOC A;  4KUW A;  5LMD A;  2FNM A;  4UOV A;  1OQ5 A;  3C7P A;  3DD8 A;  2CBB A;  5EKH A;  1KOQ A;  4R5A A;  1THK A;  2NXR A;  5DSI A;  5L3O A;  3V7X A;  3N4B A;  1CNI A;  3V2J A;  1IF4 A;  1UGF A;  1TG3 A;  4PZH A;  3HKT A;  3KKX A;  1Z93 A;  1YO1 A;  5EH7 A;  3JXH C;  4YGK A;  2GD8 A;  5G0C A;  5L6K A;  3IBI A;  1DMY A;  4QTL A;  3SAX A;  1TB0 X;  2NNV A;  3QYK A;  1TBT X;  4FRC A;  1OKL A;  3RZ0 B;  4TWM A;  3T84 A;  1AM6 A;  1HEB A;  4XIW A;  2EZ7 A;  4Q9Y A;  4QJP A; 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