2NN7A

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase i
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
PDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nn7A00
1BN3A 1CAOA 5SZ3A 3IGPA 3U3AX 1LZVA 2HNCA 4G7AA 3S97A 1G0FA 3M5EA 1ZH9A 3RYYA 4JSAA 1UGFA 4UOVA 3MYQA 3D0NA 3IBUA 4HU1A 4KAPA 1H9NA 1I9PA 4QIYA 4IDRX 4KUVA 4WW6A 2POUA 4YGNA 1H4NA 4L5WA 4YX4A 3PJJA 4CNRA 1XEVA 4Z1EA 4XIWA 1AZMA 1BNWA 4QK1A 1UGCA 3SAXA 2FNKA 3V7XA 2EZ7A 1T9NA 2IT4A 3FFPX 4MDLA 4KUWA 4Q6EA 4Q7WA 5FDCA 3RG3A 2HOCA 3R16A 2H15A 2NWPA 1HEDA 1XPZA 3MHOA 3JXGA 3U45X 4Q99A 2ABEA 1TG9A 4LHIA 4FIKA 1YDCA 4FVNA 3MHMA 3N4BA 1TBTX 4RUZA 3D93A 4E3HA 1CVAA 1CZMA 3DVCA 4HBAA 5J8ZA 4YGFA 4PXXA 3V3HB 3DC9A 4Q83A 2QO8A 4CQ0A 4FL7A 5EH5A 2ILIA 1CNBA 3VBDA 4E3GA 3RLDA 2GD8A 3V3JA 2FW4A 4DZ9A 1RJ5A 2NNSA 5SZ6A 1CVDA 1J9WA 4RN4A 1CNHA 4QJOA 4R5BA 5FNLA 3CAJA 3JXFA 3K34A 3D9ZA 2NWOA 3K7KA 3P5AA 4YXOA 3B1BA 4ZAOA 4Q8YA 5FNMA 5C8IA 3M2NA 4Q9YA 3M67A 1CVCA 4RUYA 4ZWYA 5JG5B 1OKLA 5DRSA 3NB5A 4QY3A 3MNUA 3M2ZA 4QJWA 2HL4A 1CILA 4JS6A 2POWA 2ZNCA 1G3ZA 4QSIA 4Y0JA 1CRMA 4Q8XA 1HCAA 4Q07A 3N2PA 3M1KA 5EZTX 4ZWZA 2POVA 3CYUA 4FPTA 3HKNA 1EOUA 5FNHA 2CBBA 1CAJA 4N0XB 4L5VA 4WUPA 5FNIA 4HT0A 4R5AA 4XZ5A 3S74B 2FMGA 3M98A 1CAMA 2FOUA 5SZ0A 3M2YA 5DSQA 3RZ1B 3DD8A 3JXHC 4KV0A 4Q0LA 1TG3A 1ZSAA 1UGAA 1JCZA 4KNJA 1A42A 5FNKA 5L6KA 4Q7SA 1IF9A 1BNQA 4Z1JA 4XE1A 3KWAA 3OIMA 3ML5A 1CRAA 4JSWA 4BF1A 1FLJA 5JG3B 3Q31A 1CAKA 3MNAA 3BL1A 1RAZA 5G0BA 4RUXA 1CAZA 1G6VA 5FNGA 3S71B 1RZBA 5A6HA 1FQLA 1BICA 1XQ0A 1CA2A 2FNNA 2QOAA 5EHWA 1CAHA 4Q09A 5BRWA 4M2UA 4Q6DA 4KNNA 1URTA 3D92A 1YDAA 5AMGA 3RG4A 1BV3A 5DVXA 3V3GB 1KWQA 5JEHB 1I90A 3MNHA 5FLOA 3MHIA 2FOQA 5BRUA 4Q7PA 1G1DA 3M14A 2FMZA 3P3HA 4Q90A 3M04A 1I9QA 1G45A 1YDBA 2FNMA 3HFPA 4WR7A 1BZMA 7CA2A 4Q87A 3KONA 4YGJA 1CALA 5L3OA 3S73B 1BN1A 1CCSA 3FW3A 3GZ0A 1H9QA 3M40A 1MOOA 4E4AA 4E3DA 3P5LA 3T5ZA 4L5UA 3RGEA 3M2XA 4Q81A 2W2JA 2CBEA 1CVHA 5SZ4A 2CA2A 4FU5A 5CLUA 3M1QA 5CACA 4Q7VA 3RYZA 2FOYA 4Q06A 5FL4A 3TVNX 3P3JA 2X7SA 1FR4A 1DCAA 5FDIA 4K0TA 5IPZA 5FL6A 3T82A 1UGDA 1TE3X 3MMFA 1ZNCA 1RZDA 1FSRA 3KNEA 5G0CA 3S9TA 4E49A 3OY0A 1FQMA 3ZP9A 1CA3A 1ZGEA 4CACA 4ITPA 4E3FA 4PZHA 2NXSA 1IF5A 4RFDA 1G48A 2HFWA 3IEOA 4LP6A 4HT2A 4WW8A 3DV7A 5DSRA 1LUGA 1TH9A 3M5SA 3V2JA 1UGBA 3P58A 4QK2A 2AX2A 1IF8A 3F8EA 4HEZA 8CA2A 3OYSA 4KP8A 1KOQA 5EKJA 3KKXA 4M2RA 3HKTA 4QK3A 1RAYA 2GEHA 5EH8A 1IF4A 3P44A 5BYIA 3OKVA 2NNGA 3ML2A 2FOSA 4E9OX 4CNVA 2NWZA 4WL4A 1YO2A 1I9LA 3CZVA 1TEUX 1OQ5A 1CVBA 4RH2A 3M5TA 4JSSA 4MDMA 5BNLA 1DMXA 5DSLA 1ZFKA 3IAIA 3U47A 1LG6A 3M3XA 3BL0A 5CJFA 5DSNA 2WEHA 1UGEA 1Z97A 1CNXA 3S76A 4XFWA 3F4XA 2OSMA 3HKQA 1OKNA 2WEGA 4ZX1A 3S72B 3DA2A 5CA2A 5DSPA 2X7UA 1RJ6A 3DBUA 5DSIA 1JD0A 3SBHA 3P55A 1IF6A 2AW1A 4XIXA 4YGKA 4QSJA 3RYVB 1THKA 3FE4A 4M2VA 1MUAA 3OIKA 1YDDA 1Z9YA 1CAIA 4RIUA 1ZSBA 5E2MA 5FLTA 1CNKA 2WEJA 3T85A 1G4OA 5EIJA 3N3JA 4K0SA 1I9OA 1OKMA 1BCDA 3RYXB 1FSQA 4ETQC 5DSOA 3HLJA 1HUHA 3LXEA 4ILXA 1HUGA 4ZWIA 1CNCA 4YXUA 1CINA 3V2MA 4CNXA 4MO8A 4ITOA 5EH7A 3EFIA 3SBIA 1BNTA 4BF6A 5G01A 5FLPA 4Q8ZA 5EKMA 4FVOA 1RZAA 1CNIA 3W6IA 4R59A 1ZE8A 1LG5A 3EFTA 3L14A 1BN4A 4MLXA 5JQ0A 1HEBA 4RFCA 3V3FA 4PQ7A 3TMJA 4E5QA 5JGTB 1CIMA 1RZCA 2Q38A 3UYNA 1RZEA 3MDZA 3DD0A 4YYTA 1G54A 1XEGA 1ZSCA 4YWPA 1DMYA 3P4VA 1AVNA 4QJ0A 4IWZA 4DZ7A 5BRVA 3V3IB 3DAZA 5HPJA 3IBLA 1G52A 5LMDA 2X7TA 3DCWA 1I9MA 1G53A 1CCTA 3OYQA 1G46A 1F2WA 4LU3A 3PYKA 3T5UA 4COQA 2O4ZA 1KOPA 5JEPB 3RZ7A 2CABA 4MTYA 2F14A 4PYXA 3T84A 3S77B 5JEGB 1DCBA 3F7BA 1V9IC 5E2NA 1CCUA 3S75B 5AMLA 2NN7A 5JQTA 3M1JA 3MZCA 4Q49A 1BNNA 4QSBA 1V9EA 5EKHA 3NJ9A 3U7CA 3B4FA 1Y7WA 4QSAA 1FQRA 5DSMA 1ZGFA 4KP5A 4G0CA 4HEYA 1TTMA 5DOHA 4MDGA 4Q78A 5EOIA 4QTLA 4K13A 3F7UA 3DVDA 3K2FA 2VVAX 3KOKA 4FRCA 4RIVA 5A25A 3PO6A 3BETA 1ZFQA 3MWOA 9CA2A 1CANA 2Q1QA 3RZ8A 3MNKA 1AM6A 3OILA 2HD6A 3S8XA 1IF7A 5E2KA 5EHVA 1CNWA 4JSZA 4QJPA 1HCBA 4YGLA 1FSNA 5E2RA 3W6HA 5E28A 5FNJA 2NN1A 2HKKA 12CAA 2CBAA 3V5GA 3D8WA 3SAPA 5SZ7A 4GL1X 5E5RA 1I8ZA 5JGSB 5DSJA 3MNJA 2CBCA 1HECA 4CA2A 4Z1KA 4X5SA 3RYJB 5SZ5A 3RZ5A 4C3TA 4N16A 1KWRA 1CVEA 1G4JA 1BNMA 3HS4A 4M2WA 4Q08A 2CBDA 4HF3A 3CA2A 4YHAA 1TEQX 4QJXA 3RJ7A 3DCCA 3C7PA 2WEOA 1CAYA 3QYKA 5G03A 2NNVA 5FLSA 1BNVA 3TVOX 5E2SA 1FR7A 3M96A 4K0ZA 4CNWA 4ZWXA 4ZX0A 5EHEA 5FL5A 2NXTA 2NXRA 1I91A 3KLDB 5FLQA 3R17B 3RZ0B 3MHLA 1YO0A 3N0NA 1KEQA 2H4NA 1FQNA 4QEFA 3IBNA 3M1WA 1CNJA 5JDVB 2FOVA 4HEWA 1JV0A 4KNMA 5DSKA 6CA2A 2QP6A 1HVAA 5SZ1A 4WUQA 3MNIA 3S78B 5E5UA 2VVBX 4YVYA 1CNGA 2WD3A 2EU3A 1I9NA 3UYQA 4BCWA 3OKUA 1CVFA 4YXIA 5AMDA 1TB0X 1UGGA 4TWMA 4Z1NA 2WD2A 1LGDA 4QJMA 1G0EA 3NI5A 2OSFA 4PYYA 3KIGA 2NNOA 3MHCA 3HKUA 5JESB 1YO1A 2EU2A 3T83A 3IBIA 4KNIA 2Q1BA 1BNUA 5FLRA 4TWLA 3ZNCA 4QIZA 3DC3A 4Z0QA 4KUYA 1Z93A 3KS3A 1HEAA 4MLTA 5DOGA 5SZ2A 1CNYA 3DCSA 3DVBA 2NWYA 3KOIA 2NMXA 4K1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BN3 A;  1CAO A;  5SZ3 A;  3IGP A;  3U3A X;  1LZV A;  2HNC A;  4G7A A;  3S97 A;  1G0F A;  3M5E A;  1ZH9 A;  3RYY A;  4JSA A;  1UGF A;  4UOV A;  3MYQ A;  3D0N A;  3IBU A;  4HU1 A;  4KAP A;  1H9N A;  1I9P A;  4QIY A;  4IDR X;  4KUV A;  4WW6 A;  2POU A;  4YGN A;  1H4N A;  4L5W A;  4YX4 A;  3PJJ A;  4CNR A;  1XEV A;  4Z1E A;  4XIW A;  1AZM A;  1BNW A;  4QK1 A;  1UGC A;  3SAX A;  2FNK A;  3V7X A;  2EZ7 A;  1T9N A;  2IT4 A;  3FFP X;  4MDL A;  4KUW A;  4Q6E A;  4Q7W A;  5FDC A;  3RG3 A;  2HOC A;  3R16 A;  2H15 A;  2NWP A;  1HED A;  1XPZ A;  3MHO A;  3JXG A;  3U45 X;  4Q99 A;  2ABE A;  1TG9 A;  4LHI A;  4FIK A;  1YDC A;  4FVN A;  3MHM A;  3N4B A;  1TBT X;  4RUZ A;  3D93 A;  4E3H A;  1CVA A;  1CZM A;  3DVC A;  4HBA A;  5J8Z A;  4YGF A;  4PXX A;  3V3H B;  3DC9 A;  4Q83 A;  2QO8 A;  4CQ0 A;  4FL7 A;  5EH5 A;  2ILI A;  1CNB A;  3VBD A;  4E3G A;  3RLD A;  2GD8 A;  3V3J A;  2FW4 A;  4DZ9 A;  1RJ5 A;  2NNS A;  5SZ6 A;  1CVD A;  1J9W A;  4RN4 A;  1CNH A;  4QJO A;  4R5B A;  5FNL A;  3CAJ A;  3JXF A;  3K34 A; 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