2NXSA

Structural and kinetic effects of hydrophobic mutations in the active site of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGFGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Speeding Up Proton Transfer in a Fast Enzyme: Kinetic and Crystallographic Studies on the Effect of Hydrophobic Amino Acid Substitutions in the Active Site of Human Carbonic Anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nxsA00
4Q0LA 1CVDA 5AMLA 4Q8XA 3V2MA 4WW6A 4JSAA 3V3JA 5JQTA 5DSQA 4ZX0A 3OKUA 3R17B 2WEGA 4TWMA 1IF7A 3M2ZA 3PYKA 5DOHA 1CVCA 3IBUA 5DSNA 3EFTA 1I9LA 4QJMA 3RYYA 1IF6A 3CZVA 1G3ZA 5DVXA 5FNLA 3M1QA 1HCAA 1CVAA 1FSNA 2Q38A 4RUZA 3OY0A 1UGEA 4RIVA 1CZMA 4QEFA 4KUVA 4Z1EA 5SZ0A 4CNVA 3BETA 4KP8A 1LG5A 5DSRA 2NXRA 1DCBA 3RLDA 3TMJA 3UYQA 5DSIA 1OQ5A 3IBIA 4Q90A 1KOQA 3D0NA 4QY3A 4HEWA 4HBAA 9CA2A 5G03A 2HNCA 2CBCA 3RZ0B 3S76A 5JQ0A 4WR7A 1G4JA 4ZAOA 1ZGEA 2FOYA 3V3GB 3ML5A 1CNCA 4QJPA 3KS3A 3NJ9A 4Q9YA 5BYIA 2EU2A 1H4NA 4Q09A 1CVFA 1I90A 3KONA 1RAYA 5JDVB 3KNEA 4Q7PA 5DSMA 3RYZA 3M67A 5EH5A 2HFWA 5SZ4A 4HEZA 1UGCA 5EH7A 5A25A 3RJ7A 1T9NA 4Q08A 3RG3A 1CVBA 4R59A 3IBNA 5EZTX 3RYVB 1F2WA 4E3FA 1I9MA 1LUGA 4DZ9A 4MDLA 5FNJA 3M2NA 1G54A 4E4AA 8CA2A 1ZSAA 1UGFA 4GL1X 2QP6A 5JEGB 3M40A 1Z93A 3F7UA 2HL4A 2CABA 3HLJA 5BRVA 4E5QA 3K34A 4JSSA 1IF8A 1THKA 2WEJA 3S97A 4MLXA 1HCBA 1TBTX 2WEHA 4ZWYA 3S8XA 3V3IB 1G6VA 4RN4A 5G01A 2QOAA 5HPJA 1AZMA 3S77B 3V5GA 1J9WA 1CILA 3NI5A 5CJFA 3HS4A 2POUA 3HKTA 3MMFA 3MNKA 3S74B 3TVOX 3T84A 1CRMA 2GD8A 3KLDB 3N0NA 4QK3A 3N3JA 4QSBA 3V3FA 1RJ5A 4N16A 4Q83A 1UGAA 3IBLA 3RGEA 1FR4A 1BZMA 3IEOA 2NWYA 1IF9A 1KOPA 1OKMA 5AMGA 4XFWA 1CALA 1YDCA 4Q7VA 3FW3A 2FOVA 1Z9YA 2EZ7A 4K1QA 4WUPA 4BF6A 1YO0A 4QIYA 1TG9A 1CA2A 1CAMA 1CINA 3JXFA 1BNUA 3BL0A 3N2PA 3RZ8A 1IF5A 5DSPA 1YO1A 5BNLA 1JCZA 1CVEA 4ILXA 3DD0A 4Q87A 3M5SA 1TTMA 1CCTA 4Y0JA 3U7CA 3K7KA 4Q6DA 3DVDA 3F8EA 4M2WA 4Q06A 1OKLA 2FOQA 1CAKA 4YXIA 5FNIA 1CNYA 3KOKA 4HEYA 3RG4A 3M96A 4MO8A 5SZ2A 3IGPA 1CCSA 1G46A 1LZVA 4KNMA 4Q8YA 4HU1A 2FNKA 3MHMA 2NN7A 5FNHA 4COQA 5SZ5A 1ZSCA 3MZCA 1CAHA 4Z1JA 1AM6A 3M1KA 3PO6A 3MNUA 4PXXA 1HEBA 3DCCA 3S75B 3IAIA 4ZWZA 12CAA 1CRAA 2HD6A 4IDRX 3SBIA 4WL4A 3BL1A 3UYNA 4XZ5A 2FNNA 2AW1A 3DD8A 5EHWA 3V3HB 1H9QA 3EFIA 4RUYA 4JSWA 1CNJA 4FVNA 5A6HA 1KWRA 4R5BA 3M5EA 3CAJA 3DC3A 4QK2A 4YGKA 5DSJA 3RZ1B 5FDCA 3PJJA 4QJOA 5FLOA 4Z1KA 1CNWA 3DA2A 3HKQA 3M1WA 3OIKA 2HKKA 5SZ1A 2FNMA 1HUHA 5SZ7A 3V7XA 3GZ0A 3M1JA 1FQLA 2H15A 3D9ZA 2WD3A 1UGBA 3N4BA 3MHCA 1RJ6A 4LU3A 1BNWA 3ZP9A 1HEDA 3T82A 4ITPA 2AX2A 3M2YA 1I9QA 4E3DA 3MNAA 2NWZA 1TEUX 4YGLA 5J8ZA 3W6HA 4CACA 1CNGA 3K2FA 5EKHA 1HUGA 1XEVA 3P5LA 2CBDA 1ZNCA 4HF3A 3MWOA 4K13A 2X7UA 3S71B 1OKNA 1YDBA 3RZ7A 4R5AA 4WUQA 1EOUA 1V9EA 4TWLA 4ZX1A 5FL6A 4K0ZA 2POVA 5EHEA 1G53A 1CANA 2W2JA 2X7SA 2X7TA 1BNTA 3F7BA 2ILIA 1XEGA 1YDAA 4MLTA 3KIGA 4RUXA 5E28A 5DSKA 1BCDA 5FLRA 5EHVA 2WD2A 2F14A 5C8IA 2CBBA 1CNBA 2ZNCA 4CA2A 3DV7A 2POWA 4YWPA 4YX4A 3SAXA 1I8ZA 4ITOA 3OYSA 1G52A 2NNSA 3B1BA 4QJ0A 5DSLA 5DSOA 4WW8A 5DRSA 1BN3A 5FNKA 1BV3A 4BF1A 4M2RA 3HFPA 4PYXA 4Q78A 1BNVA 1BN1A 2CBEA 2NXTA 1V9IC 5EKMA 1URTA 5E2MA 1DMYA 1FQNA 3L14A 4CQ0A 4RFCA 4Q49A 2HOCA 2Q1QA 4K0TA 2CA2A 4Q7SA 1A42A 3DCSA 1CAIA 5CLUA 5DOGA 3R16A 4MTYA 1XQ0A 4E3HA 3SAPA 1CCUA 5G0BA 3V2JA 3P3JA 5L6KA 5JEPB 1Y7WA 4YGFA 3W6IA 1AVNA 4PZHA 5JG3B 3NB5A 3OYQA 4QSIA 2FOUA 4K0SA 4MDGA 3P5AA 4L5UA 5FL5A 2FMGA 4E49A 3F4XA 1FQRA 5E2KA 1TB0X 1G45A 1DCAA 4ZWIA 1ZFQA 3QYKA 2NNVA 3MHLA 2WEOA 4QJXA 4YGNA 2VVBX 3P3HA 4XE1A 3M5TA 5E2SA 3MYQA 4G0CA 4KUYA 5FLTA 3T5ZA 4M2VA 1TEQX 4XIXA 3M14A 4N0XB 1BNMA 1HEAA 4ZWXA 1JD0A 1UGGA 2IT4A 4KV0A 4QSAA 1ZGFA 3ZNCA 5EIJA 4QIZA 3DCWA 3OILA 4YGJA 1G4OA 5CA2A 3M2XA 1CAYA 5BRWA 1I91A 1CIMA 1YDDA 5E2RA 4JSZA 1G0FA 5FL4A 5SZ6A 3JXGA 4FPTA 5G0CA 4RIUA 1MOOA 2CBAA 2QO8A 5FNGA 1CNIA 3KWAA 3ML2A 1YO2A 3MDZA 5E5RA 1HVAA 3MHOA 1BNQA 3VBDA 3T85A 2EU3A 1ZH9A 3P55A 5JESB 3OIMA 3P4VA 1KEQA 3M98A 2NWPA 1TE3X 3FFPX 4FRCA 2NWOA 1IF4A 5E5UA 2NXSA 1G48A 3T5UA 2VVAX 3HKUA 1RZAA 4Q8ZA 3S9TA 3CA2A 4PQ7A 3SBHA 3D8WA 1CNKA 3T83A 1I9OA 3FE4A 4QK1A 1JV0A 3U45X 3C7PA 4M2UA 4E3GA 1FQMA 3D93A 4UOVA 4YXOA 2NN1A 3DVBA 5JGSB 3RYXB 4QJWA 2OSMA 4DZ7A 5BRUA 5JG5B 4FU5A 4C3TA 1ZE8A 1KWQA 1CNHA 4LP6A 3RYJB 3U3AX 1G0EA 4XIWA 2Q1BA 4HT0A 4Q99A 4X5SA 3M3XA 1FSRA 3LXEA 4KNJA 3DAZA 3P58A 5LMDA 4CNRA 4Z1NA 1RZDA 1Z97A 3MNJA 4L5VA 3MNIA 5SZ3A 3S73B 4YVYA 5E2NA 5FLPA 5AMDA 7CA2A 4KP5A 3S78B 5FLQA 1I9PA 4Z0QA 4ETQC 4JS6A 1G1DA 2FMZA 2FOSA 3OKVA 3DC9A 4PYYA 4FIKA 5IPZA 5EH8A 2OSFA 4L5WA 2ABEA 4Q81A 3D92A 1RZBA 1MUAA 1FSQA 1CVHA 1LG6A 1RZCA 1TG3A 3MNHA 5EKJA 5FDIA 1BN4A 4KNNA 2GEHA 3KOIA 4KNIA 3U47A 1CNXA 1XPZA 3RZ5A 1RAZA 1TH9A 2H4NA 4CNWA 4YYTA 1UGDA 3Q31A 1FR7A 4RH2A 5EOIA 4YXUA 4HT2A 5L3OA 3MHIA 2NNGA 2NMXA 1CAZA 4CNXA 1CAOA 4FVOA 4QTLA 4Q07A 4RFDA 3P44A 3DBUA 3JXHC 2NNOA 6CA2A 4KUWA 1CA3A 4IWZA 4MDMA 1CAJA 1DMXA 1H9NA 4YHAA 5FLSA 5CACA 4LHIA 4FL7A 5JGTB 3DVCA 5FNMA 3TVNX 4QSJA 3HKNA 2FW4A 3KKXA 1ZSBA 1BNNA 2O4ZA 1HECA 1LGDA 1ZFKA 4KAPA 3S72B 1RZEA 1I9NA 4Q7WA 3CYUA 4BCWA 3B4FA 5JEHB 3M04A 4E9OX 1BICA 4Q6EA 1FLJA 4G7AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q0L A;  1CVD A;  5AML A;  4Q8X A;  3V2M A;  4WW6 A;  4JSA A;  3V3J A;  5JQT A;  5DSQ A;  4ZX0 A;  3OKU A;  3R17 B;  2WEG A;  4TWM A;  1IF7 A;  3M2Z A;  3PYK A;  5DOH A;  1CVC A;  3IBU A;  5DSN A;  3EFT A;  1I9L A;  4QJM A;  3RYY A;  1IF6 A;  3CZV A;  1G3Z A;  5DVX A;  5FNL A;  3M1Q A;  1HCA A;  1CVA A;  1FSN A;  2Q38 A;  4RUZ A;  3OY0 A;  1UGE A;  4RIV A;  1CZM A;  4QEF A;  4KUV A;  4Z1E A;  5SZ0 A;  4CNV A;  3BET A;  4KP8 A;  1LG5 A;  5DSR A;  2NXR A;  1DCB A;  3RLD A;  3TMJ A;  3UYQ A;  5DSI A;  1OQ5 A;  3IBI A;  4Q90 A;  1KOQ A;  3D0N A;  4QY3 A;  4HEW A;  4HBA A;  9CA2 A;  5G03 A;  2HNC A;  2CBC A;  3RZ0 B;  3S76 A;  5JQ0 A;  4WR7 A;  1G4J A;  4ZAO A;  1ZGE A;  2FOY A;  3V3G B;  3ML5 A;  1CNC A;  4QJP A;  3KS3 A;  3NJ9 A;  4Q9Y A;  5BYI A;  2EU2 A;  1H4N A;  4Q09 A;  1CVF A;  1I90 A;  3KON A;  1RAY A;  5JDV B;  3KNE A;  4Q7P A;  5DSM A;  3RYZ A;  3M67 A;  5EH5 A;  2HFW A;  5SZ4 A;  4HEZ A;  1UGC A;  5EH7 A;  5A25 A;  3RJ7 A;  1T9N A;  4Q08 A;  3RG3 A;  1CVB A;  4R59 A;  3IBN A;  5EZT X; 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