2IT4A

X ray structure of the complex between carbonic anhydrase i and the phosphonate antiviral drug foscarnet
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Phosph(on)ate as a zinc-binding group in metalloenzyme inhibitors: X-ray crystal structure of the antiviral drug foscarnet complexed to human carbonic anhydrase I.
pubmed doi rcsb
total genus 71
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2it4A00
4L5WA 1TBTX 1I91A 4M2WA 1RZAA 1OKLA 4RIUA 5EOIA 1CAJA 4KNJA 1I90A 1CAYA 3CA2A 3W6IA 3UYQA 5A6HA 1TG3A 1Y7WA 3RGEA 3BETA 1CCSA 3ML5A 3FE4A 3P3HA 4PZHA 5SZ5A 3RZ8A 4QJWA 1BNUA 3RYZA 1H9NA 4QSIA 4MDGA 4UOVA 4YVYA 4TWLA 3V3FA 4RN4A 3KOIA 4Q9YA 1CAIA 1TG9A 3GZ0A 3P4VA 5FDIA 3RG4A 1IF5A 3M98A 3MNJA 3IBLA 1H9QA 2EU2A 1CA3A 4HT2A 3RG3A 1F2WA 1G0FA 3DVDA 3P44A 5SZ6A 4ZWZA 6CA2A 3RZ1B 4Z1KA 2FOYA 3D93A 3HS4A 4QJ0A 2FOUA 4ILXA 4MO8A 4QK1A 1BICA 3KKXA 3U3AX 4KP5A 4KNNA 5EHVA 5G01A 1RJ6A 3LXEA 5FLSA 2ZNCA 3DCWA 2QOAA 3M5SA 1CINA 1G1DA 1CA2A 1BN3A 2Q1QA 1MUAA 1TTMA 2EU3A 1FSRA 4YGNA 1FSNA 4WR7A 5EH7A 2FNKA 5FNIA 5DSNA 4M2RA 1HEAA 4Q6EA 1HVAA 3HKTA 3QYKA 4YGLA 4YGJA 2POWA 4ZX1A 5HPJA 1KOPA 1BZMA 4Q8XA 2FOQA 5AMGA 4Q7PA 1G3ZA 1CVEA 2W2JA 4K0ZA 4RFCA 1AZMA 2CBDA 3KOKA 3PO6A 4WUQA 3F4XA 3RZ0B 1UGGA 2FOSA 3KLDB 3B4FA 1KWRA 1RZDA 4QJMA 1CCTA 1OKMA 2O4ZA 3DCCA 4KAPA 1ZSCA 4XZ5A 3U45X 5JEPB 5EHWA 1MOOA 1JCZA 1CNCA 2Q1BA 3ML2A 5FNKA 1I9OA 3P55A 4N16A 4MLTA 4M2UA 5JESB 4FU5A 5CLUA 1TH9A 5G0CA 3M1JA 3SBHA 5SZ1A 5FL5A 4Q0LA 1OKNA 1AVNA 1URTA 4PYYA 1CAOA 4L5UA 3RYJB 1TEUX 1T9NA 1YDAA 3MHIA 4DZ7A 4E4AA 3M67A 5SZ0A 3S74B 2GD8A 2H4NA 4Q6DA 5DSRA 4ETQC 5J8ZA 3V3HB 2NWZA 1DCAA 1I9LA 5BYIA 12CAA 1RJ5A 1Z9YA 4QTLA 1XEVA 3ZP9A 4E9OX 1IF7A 4ZX0A 2NNGA 1G4OA 2X7TA 3MDZA 1I8ZA 5FNLA 4L5VA 3S72B 3S77B 4COQA 2HOCA 2NWPA 3TMJA 1CAZA 2CBAA 5DVXA 3S73B 3F7UA 3L14A 3M2ZA 3VBDA 9CA2A 1UGDA 5FDCA 1FR7A 1CRAA 1CALA 4FIKA 1ZE8A 2VVBX 2NXTA 3M3XA 5AMLA 4YHAA 3T5ZA 3OY0A 5E2RA 1ZFKA 4HEZA 3V5GA 3R16A 2NNSA 4HEWA 4JSSA 5EZTX 4MDLA 4QEFA 1BNQA 4HEYA 1I9MA 2AW1A 1CILA 5E2NA 3FFPX 3KS3A 3T84A 5DRSA 3RZ7A 2NMXA 3EFIA 4HF3A 1KEQA 3TVOX 1KWQA 3M5EA 3OYSA 4YXOA 1CNIA 3NI5A 4QJPA 5DSMA 4QIZA 3DCSA 4XFWA 5SZ3A 3M1WA 4E49A 3M2YA 3RYYA 1CANA 3S78B 5JGSB 5FLPA 2AX2A 3JXFA 5EHEA 3ZNCA 4ZWYA 1EOUA 1V9EA 3DA2A 3OYQA 2ABEA 3RJ7A 3MNHA 3BL0A 4E3HA 1UGEA 1ZGEA 4YYTA 1UGAA 2FW4A 3D8WA 3HKNA 3V3JA 1G0EA 1CNXA 1G6VA 4HT0A 1HEBA 4RIVA 3OIMA 4YGFA 5C8IA 3S8XA 3N2PA 5SZ7A 1CNGA 2OSFA 5DSLA 4IDRX 2NXRA 5E5RA 2IT4A 3MNKA 5SZ2A 1LG5A 3OILA 2NN1A 3MHCA 2H15A 4IWZA 2CA2A 8CA2A 4QK2A 4KUYA 4QY3A 3HKUA 5LMDA 1CAKA 4M2VA 5FLRA 4Q8ZA 1IF6A 4X5SA 5EIJA 3NJ9A 5E2MA 5FLTA 4RUXA 3IGPA 1G52A 2VVAX 1YO1A 3OKUA 1IF4A 2QO8A 4E3GA 1XQ0A 2NN7A 3V3GB 4ITOA 3IBIA 4RUZA 5JQ0A 2WEOA 3DVBA 1I9PA 1HUGA 4QSAA 4BCWA 2WD3A 3V2MA 1BNVA 1Z97A 3JXHC 3UYNA 1BN1A 1CCUA 1LGDA 5BRVA 4DZ9A 4JSAA 5E28A 1TEQX 1BNMA 5L3OA 3M5TA 5DSJA 4MTYA 3B1BA 3S9TA 4BF6A 4Z0QA 1AM6A 3MHOA 4K1QA 1LUGA 4KUWA 3MNAA 1YDBA 5SZ4A 1CVAA 2WEHA 2POVA 3M2XA 3S75B 4R5BA 4HBAA 4K13A 5DSOA 3V3IB 3DVCA 2FNNA 3DD8A 1CVCA 1XPZA 4WL4A 2HL4A 2Q38A 4FVOA 4KUVA 4LP6A 2EZ7A 4GL1X 5FNMA 4Q87A 4Q8YA 2FOVA 1RZBA 1CAHA 1G4JA 4YGKA 4C3TA 3KIGA 1BN4A 2OSMA 4WUPA 4XIXA 1RAZA 1HECA 4HU1A 5BRWA 4LU3A 5G0BA 5DSKA 2FMZA 1G53A 2NWOA 4TWMA 3OIKA 3KONA 3PJJA 3DC3A 1FQNA 4PYXA 7CA2A 3N0NA 5EH8A 3OKVA 4JSZA 4JSWA 1G45A 3NB5A 2X7SA 5JG5B 3K7KA 4CQ0A 3CZVA 4JS6A 1LZVA 2HD6A 5IPZA 1BCDA 4PQ7A 1TE3X 5FNHA 3IBUA 4QSJA 2NNVA 4KNMA 4RUYA 4KP8A 5FNGA 5FNJA 1CVDA 1G54A 4CA2A 4G0CA 4PXXA 5DOHA 4QSBA 3N4BA 3W6HA 1ZSAA 2GEHA 1YO2A 2F14A 5DSQA 3T5UA 3MHMA 1FSQA 1CRMA 5E2KA 5EKJA 4YXIA 4KV0A 3BL1A 3K2FA 4KNIA 4YWPA 3P5AA 4Q07A 3MZCA 1V9IC 2HFWA 1XEGA 4FVNA 3V7XA 4WW8A 1CNHA 4Q7SA 3SAPA 1DMXA 3MNUA 4Q83A 4WW6A 1FLJA 3IBNA 1ZSBA 4K0TA 2NWYA 2WEJA 1CNKA 3N3JA 1CAMA 4CNWA 4ZWXA 3M14A 3CYUA 1CNJA 4Q81A 3PYKA 1UGCA 3TVNX 5BNLA 4Q09A 4RFDA 1CNBA 3M1KA 1YO0A 1J9WA 3HLJA 3M96A 1RZCA 2HKKA 5EKHA 5EKMA 5DSPA 3M2NA 4E3FA 1YDDA 4R5AA 1I9NA 3KNEA 3P5LA 4Y0JA 4CACA 3F8EA 3U47A 3KWAA 4Q78A 1FQLA 2ILIA 4MLXA 1TB0X 3T82A 1BNWA 2FMGA 3MMFA 3EFTA 4G7AA 3FW3A 5L6KA 5E2SA 5JG3B 1CNYA 1JD0A 4XE1A 2WD2A 1CVHA 1IF8A 1UGBA 1THKA 3D92A 1YDCA 3V2JA 1IF9A 4QJOA 3DBUA 1ZH9A 2QP6A 3SBIA 4CNXA 1CZMA 4Q90A 5E5UA 1DCBA 4YXUA 3T83A 1CVBA 2HNCA 5JQTA 3HKQA 1OQ5A 3T85A 4BF1A 1FQRA 4K0SA 5BRUA 3IEOA 4FPTA 3DD0A 3MWOA 1KOQA 4QIYA 1G48A 4QK3A 2NXSA 1CVFA 3S71B 1RAYA 4Q7VA 1Z93A 3DAZA 3DV7A 5EH5A 1ZGFA 2WEGA 1BNNA 3S97A 1DMYA 2CABA 1ZFQA 5FL6A 5DSIA 1CIMA 1UGFA 1HCBA 2CBEA 5CJFA 3F7BA 4FL7A 5JEGB 5AMDA 3D9ZA 1HEDA 1FQMA 4Q49A 1HCAA 3C7PA 3JXGA 4Q06A 4Q08A 3D0NA 4CNRA 5G03A 4Q99A 4ZAOA 4Z1EA 3R17B 2POUA 3HFPA 3MYQA 1LG6A 3M04A 3MNIA 1JV0A 3RLDA 1BV3A 4R59A 5JGTB 4Z1NA 4RH2A 2FNMA 2X7UA 3K34A 4E5QA 4QJXA 4MDMA 1RZEA 3IAIA 3RYXB 1ZNCA 4ZWIA 3Q31A 5JDVB 3SAXA 2CBCA 5JEHB 3M40A 4LHIA 1A42A 4Q7WA 3RZ5A 3S76A 5A25A 4Z1JA 3U7CA 2NNOA 4E3DA 3P58A 3DC9A 1I9QA 4ITPA 1BNTA 4FRCA 5CA2A 3RYVB 4CNVA 4YX4A 4N0XB 4XIWA 5FLQA 1G46A 3CAJA 3M1QA 1CNWA 5FL4A 1FR4A 1HUHA 5DOGA 5FLOA 5CACA 3MHLA 3P3JA 1H4NA 2CBBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4L5W A;  1TBT X;  1I91 A;  4M2W A;  1RZA A;  1OKL A;  4RIU A;  5EOI A;  1CAJ A;  4KNJ A;  1I90 A;  1CAY A;  3CA2 A;  3W6I A;  3UYQ A;  5A6H A;  1TG3 A;  1Y7W A;  3RGE A;  3BET A;  1CCS A;  3ML5 A;  3FE4 A;  3P3H A;  4PZH A;  5SZ5 A;  3RZ8 A;  4QJW A;  1BNU A;  3RYZ A;  1H9N A;  4QSI A;  4MDG A;  4UOV A;  4YVY A;  4TWL A;  3V3F A;  4RN4 A;  3KOI A;  4Q9Y A;  1CAI A;  1TG9 A;  3GZ0 A;  3P4V A;  5FDI A;  3RG4 A;  1IF5 A;  3M98 A;  3MNJ A;  3IBL A;  1H9Q A;  2EU2 A;  1CA3 A;  4HT2 A;  3RG3 A;  1F2W A;  1G0F A;  3DVD A;  3P44 A;  5SZ6 A;  4ZWZ A;  6CA2 A;  3RZ1 B;  4Z1K A;  2FOY A;  3D93 A;  3HS4 A;  4QJ0 A;  2FOU A;  4ILX A;  4MO8 A;  4QK1 A;  1BIC A;  3KKX A;  3U3A X;  4KP5 A;  4KNN A;  5EHV A;  5G01 A;  1RJ6 A;  3LXE A;  5FLS A;  2ZNC A;  3DCW A;  2QOA A;  3M5S A;  1CIN A;  1G1D A;  1CA2 A;  1BN3 A;  2Q1Q A;  1MUA A;  1TTM A;  2EU3 A;  1FSR A;  4YGN A;  1FSN A;  4WR7 A;  5EH7 A;  2FNK A;  5FNI A;  5DSN A;  4M2R A;  1HEA A;  4Q6E A;  1HVA A;  3HKT A;  3QYK A;  4YGL A;  4YGJ A;  2POW A;  4ZX1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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