2NN1A

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase i
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
PDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nn1A00
3DVBA 4WW6A 5C8IA 3NI5A 1CVEA 3M2ZA 3RZ8A 5SZ1A 2FNNA 4HBAA 3KIGA 2H4NA 2NXRA 5FNLA 4N0XB 5SZ5A 3U3AX 2HKKA 5EKJA 4IDRX 4Q6EA 3HFPA 4E3FA 3OKUA 5FNKA 4Z1NA 2Q1BA 4Q87A 4CNWA 4Z1KA 3ML5A 4JSAA 5EKHA 5G0BA 5FL6A 3K7KA 3HKTA 4CA2A 3M67A 3DC9A 4MLXA 3P5LA 1UGBA 4QY3A 4CQ0A 4E49A 1G3ZA 4Q09A 5JGSB 3LXEA 1CVCA 3P3JA 4PXXA 4RUZA 3M3XA 3D8WA 4XFWA 4LU3A 4ILXA 1CNIA 2CA2A 4WW8A 1CCSA 1URTA 1V9IC 3OYQA 4Q8YA 3U45X 4COQA 1T9NA 5DSPA 1TEQX 3HLJA 1I91A 5FNHA 4Q81A 4Q78A 4PZHA 4DZ7A 3UYQA 4HT2A 1FQMA 3KKXA 4Q7PA 1F2WA 3TVOX 5EKMA 4FU5A 4KUYA 4WUQA 4R5AA 4QSJA 1RZBA 1CANA 4L5WA 5CLUA 5EH5A 5FDCA 1Z93A 4FVOA 4Q8XA 2NWPA 3RG3A 4YGLA 3T84A 2X7SA 5A25A 1BNUA 1UGFA 5FLRA 4QJMA 1BNNA 3GZ0A 3MHLA 2EU2A 3OKVA 1RZEA 3F7BA 4ZWXA 5FLSA 3OYSA 1BNQA 1CINA 3M2NA 1UGCA 3MWOA 2IT4A 4Q7SA 5EHVA 3M5SA 2AX2A 4G7AA 2WEHA 3NJ9A 5DOGA 1BZMA 4Q07A 3CA2A 3SAPA 3W6IA 3S75B 3HKNA 3MNIA 4G0CA 6CA2A 1AZMA 5DSKA 4DZ9A 4MDLA 4GL1X 5FNMA 2Q1QA 3IBLA 3F4XA 4FPTA 4HEWA 5BRVA 5JEPB 5SZ4A 3M1JA 5JGTB 5BYIA 3CAJA 4HEYA 4XE1A 4QJPA 5AMLA 3RZ7A 4HU1A 3RZ5A 4K0TA 4QSAA 1G45A 1HECA 1HUGA 1TG9A 1G4OA 1HCAA 1ZFQA 3DVCA 2F14A 2FOVA 5G03A 3T5ZA 4QIZA 3KNEA 3HS4A 1J9WA 3V2JA 4ITPA 1RAYA 4E5QA 3M5EA 1G53A 3DAZA 1ZSAA 4KNIA 3KWAA 4C3TA 1OKLA 1CAZA 3MNHA 3N0NA 1BCDA 4PYYA 1IF9A 4ZWIA 3S74B 3T5UA 5G0CA 3S77B 1FSQA 4BF1A 3MHOA 2GD8A 1RZDA 4YGKA 4KV0A 5E2NA 1TG3A 1CNWA 1BICA 1CAYA 2EU3A 1HVAA 4MLTA 1HEDA 3D92A 4Q08A 1Z9YA 2CABA 4RUXA 1G0FA 4QIYA 1I9PA 3DV7A 3M5TA 5FNJA 1H9NA 4RN4A 1CALA 4JSSA 4N16A 4Q8ZA 2NNVA 3M40A 1FSRA 3DCCA 5SZ6A 2W2JA 4KNJA 3VBDA 3P44A 4Q7WA 1FSNA 3D0NA 4XIXA 1FQNA 3MNAA 4WR7A 3JXHC 5SZ3A 3IBUA 4Z0QA 3M2YA 5DSLA 5EHWA 5E2KA 3SAXA 5BRWA 1G48A 1CRAA 1H9QA 4E4AA 4Q7VA 3MHCA 2Q38A 5DRSA 3KOKA 3RYZA 4QK3A 4Q9YA 1I9NA 4KAPA 2O4ZA 1YDCA 3KS3A 2HOCA 5AMGA 1RZAA 1CNKA 1XPZA 3C7PA 4Y0JA 4PQ7A 4KUVA 1LUGA 2WD2A 3U47A 4CACA 1CNYA 3RYXB 1G52A 3P58A 1CAOA 2CBAA 5EOIA 4BF6A 3DC3A 3IGPA 2VVBX 2NWOA 3SBIA 4QSIA 5E5RA 3P4VA 1CAJA 1LGDA 4QJOA 4UOVA 4JS6A 4YWPA 5BNLA 5DSMA 2H15A 5JEHB 3MNUA 4FVNA 4QK1A 3FW3A 5CA2A 1G46A 2X7TA 1XEVA 4RIVA 3T83A 1KWQA 1YDBA 2EZ7A 3D93A 5SZ7A 4YGNA 4IWZA 4KNMA 3RJ7A 5JG3B 3DD8A 4FRCA 1CVAA 4K13A 4XZ5A 5SZ2A 1G4JA 1AM6A 4E3DA 3RYYA 2POWA 3PYKA 3K34A 5E28A 2OSFA 1CZMA 3F8EA 4QJ0A 4QK2A 1RAZA 1CCUA 2CBEA 1IF6A 3DBUA 5CJFA 3U7CA 3IEOA 5FL4A 1TB0X 3DCWA 1CVBA 4R59A 3M1QA 1DCBA 3V5GA 1UGGA 1CVDA 1OKNA 3CYUA 2ABEA 4YYTA 1CNJA 3S8XA 3RLDA 4M2WA 1LZVA 2FW4A 4MDGA 4KUWA 5J8ZA 1I90A 4ZAOA 1EOUA 2NXSA 1ZFKA 1KEQA 3BETA 1ZE8A 2QOAA 3M96A 5G01A 5JG5B 5LMDA 4Q0LA 4Z1JA 4YVYA 3V3FA 1JCZA 3PJJA 1JV0A 1H4NA 1G6VA 4HT0A 3RGEA 5JQ0A 1ZSCA 2ZNCA 3P55A 2NWYA 4JSWA 3BL0A 3M14A 1YO0A 1LG6A 2WEJA 5DSOA 3FFPX 5BRUA 1KWRA 5E2MA 1RZCA 2NWZA 4WL4A 4ETQC 1YO2A 4TWLA 3OIKA 3TVNX 1Y7WA 5DSJA 1IF7A 2NMXA 1LG5A 3B1BA 5FLPA 5E2SA 1XEGA 3IBNA 4RIUA 5JESB 3DA2A 1YDDA 5AMDA 2NNSA 2WD3A 12CAA 4RFDA 3S78B 4TWMA 3M98A 1HUHA 3MZCA 4Q90A 4QSBA 5EIJA 3KLDB 1G0EA 5A6HA 2WEOA 1FR4A 3ZNCA 5IPZA 4LP6A 4PYXA 4E3GA 3IAIA 3RYJB 1TE3X 3M1KA 1CVHA 3BL1A 3T85A 3S71B 5JEGB 1CNHA 1G1DA 3KOIA 4FIKA 1FLJA 2POUA 1AVNA 1THKA 3W6HA 2FMGA 1I9OA 3M1WA 3DD0A 3V3JA 3B4FA 1FQRA 1CNXA 4M2RA 3F7UA 3L14A 4HEZA 1BN4A 1IF5A 1YO1A 3MNKA 4ZWZA 5FNIA 2ILIA 3N3JA 4YX4A 3S76A 3V7XA 1XQ0A 3DVDA 4LHIA 3RZ0B 2OSMA 2QO8A 1CNBA 4FL7A 1CNCA 1IF4A 5EH8A 3MHMA 2GEHA 3K2FA 2HFWA 3PO6A 4Z1EA 3IBIA 3HKUA 1CAHA 1V9EA 3EFTA 1BNVA 4ITOA 1KOQA 3MHIA 4MO8A 1I9MA 1ZNCA 4CNXA 1CCTA 1OQ5A 3R16A 4Q83A 4RH2A 3V2MA 4QEFA 1RJ6A 2X7UA 1BNWA 1CA2A 3RYVB 2HNCA 5SZ0A 3N2PA 1CVFA 3FE4A 4YGFA 4M2UA 3M04A 1HEAA 7CA2A 1JD0A 4RUYA 4K0ZA 3KONA 5FLQA 5DSQA 4K1QA 2QP6A 4L5VA 3DCSA 5EHEA 1BV3A 4ZX0A 1Z97A 3MDZA 4E9OX 1OKMA 4M2VA 1IF8A 1ZH9A 1BNTA 2AW1A 4YXOA 1YDAA 1UGEA 1FR7A 2FOYA 5EH7A 1G54A 4HF3A 1MUAA 4QJWA 5FDIA 1CIMA 1CRMA 3JXFA 2CBBA 2FMZA 4E3HA 4K0SA 3MMFA 2NNGA 5FLOA 5EZTX 2FOUA 3ZP9A 3CZVA 3M2XA 4BCWA 3NB5A 9CA2A 4X5SA 5HPJA 1HCBA 4ZX1A 3MNJA 3OILA 1ZGEA 1FQLA 2FOQA 1I8ZA 4R5BA 5DVXA 1DCAA 1DMYA 1HEBA 4Q99A 3N4BA 5JQTA 5FL5A 1BNMA 5CACA 4MTYA 4KP8A 5DOHA 3V3HB 5JDVB 5FNGA 1MOOA 5L6KA 4MDMA 1KOPA 1UGAA 3JXGA 3S9TA 2HL4A 3RZ1B 4JSZA 1I9QA 1CAKA 4Q6DA 1CA3A 3EFIA 5E5UA 3RG4A 1DMXA 8CA2A 3S72B 3V3GB 3ML2A 4KNNA 2FNKA 3T82A 2WEGA 1CNGA 2POVA 2CBCA 4YXUA 5FLTA 1A42A 1I9LA 2FOSA 2CBDA 4KP5A 2FNMA 4Q49A 4ZWYA 2NXTA 4YHAA 3S97A 1BN3A 4YGJA 1CAMA 1RJ5A 4RFCA 3HKQA 4QJXA 4CNVA 3V3IB 3D9ZA 2NNOA 4YXIA 4Q06A 1ZSBA 3QYKA 4CNRA 4WUPA 1CILA 4QTLA 5DSNA 5DSIA 5E2RA 3P3HA 3Q31A 1TBTX 3TMJA 5DSRA 1ZGFA 3UYNA 1TTMA 3P5AA 3OY0A 3SBHA 1CAIA 1TH9A 2HD6A 2NN7A 3R17B 3MYQA 3S73B 1TEUX 4L5UA 1BN1A 2VVAX 1UGDA 4XIWA 3OIMA 5L3OA 2NN1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DVB A;  4WW6 A;  5C8I A;  3NI5 A;  1CVE A;  3M2Z A;  3RZ8 A;  5SZ1 A;  2FNN A;  4HBA A;  3KIG A;  2H4N A;  2NXR A;  5FNL A;  4N0X B;  5SZ5 A;  3U3A X;  2HKK A;  5EKJ A;  4IDR X;  4Q6E A;  3HFP A;  4E3F A;  3OKU A;  5FNK A;  4Z1N A;  2Q1B A;  4Q87 A;  4CNW A;  4Z1K A;  3ML5 A;  4JSA A;  5EKH A;  5G0B A;  5FL6 A;  3K7K A;  3HKT A;  4CA2 A;  3M67 A;  3DC9 A;  4MLX A;  3P5L A;  1UGB A;  4QY3 A;  4CQ0 A;  4E49 A;  1G3Z A;  4Q09 A;  5JGS B;  3LXE A;  1CVC A;  3P3J A;  4PXX A;  4RUZ A;  3M3X A;  3D8W A;  4XFW A;  4LU3 A;  4ILX A;  1CNI A;  2CA2 A;  4WW8 A;  1CCS A;  1URT A;  1V9I C;  3OYQ A;  4Q8Y A;  3U45 X;  4COQ A;  1T9N A;  5DSP A;  1TEQ X;  3HLJ A;  1I91 A;  5FNH A;  4Q81 A;  4Q78 A;  4PZH A;  4DZ7 A;  3UYQ A;  4HT2 A;  1FQM A;  3KKX A;  4Q7P A;  1F2W A;  3TVO X;  5EKM A;  4FU5 A;  4KUY A;  4WUQ A;  4R5A A;  4QSJ A;  1RZB A;  1CAN A;  4L5W A;  5CLU A;  5EH5 A;  5FDC A;  1Z93 A;  4FVO A;  4Q8X A;  2NWP A;  3RG3 A;  4YGL A;  3T84 A;  2X7S A;  5A25 A;  1BNU A;  1UGF A;  5FLR A;  4QJM A;  1BNN A; 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