2WEOA

Thermodynamic optimisation of carbonic anhydrase fragment inhibitors
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Thermodynamic Optimisation in Drug Discovery: A Case Study Using Carbonic Anhydrase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2weoA00
1YO1A 2CBAA 5JGSB 4Z1EA 1HEAA 3DVCA 1BNQA 5A6HA 1JV0A 2HNCA 2O4ZA 5E5UA 2NXSA 5DSPA 2NWOA 5E28A 3MHOA 3P58A 3S9TA 5DRSA 1FR4A 3QYKA 1CNKA 3SBIA 4Q09A 2FNNA 2H15A 3V3FA 3S77B 3ML5A 1CNWA 5SZ3A 4CNWA 5EH8A 3P55A 2CABA 1BN3A 1ZSAA 4RH2A 1CILA 3K7KA 4E5QA 1AZMA 2CA2A 3F7BA 1YO2A 4MTYA 4Q8ZA 1HCAA 5FLOA 3RYVB 3D0NA 1I90A 3P44A 1FQNA 5JEGB 3NB5A 1G0FA 4FVOA 3OYSA 4FPTA 4QK1A 4UOVA 5AMLA 3EFIA 3LXEA 4ITOA 4RN4A 3MNJA 4WUPA 1FSNA 1CNJA 4KAPA 3TMJA 1I91A 3KONA 4IDRX 1IF8A 4JSAA 3RZ5A 5BRWA 1CAZA 5DSQA 5SZ4A 1JCZA 4QTLA 5FL6A 2F14A 1DMYA 1H4NA 4JSSA 2FMZA 4ILXA 1RZDA 2VVAX 5JG3B 2WD2A 3TVOX 3W6IA 1I8ZA 3MNAA 3MNIA 1I9QA 1CVFA 4WW6A 4ZAOA 1BV3A 5EIJA 1CNHA 1UGCA 4M2UA 1UGGA 1RZEA 1DCAA 1UGEA 4Q6DA 3RG3A 3KWAA 4ZWYA 1CVDA 4CA2A 3DC9A 4XFWA 1RAZA 1TG3A 3D92A 4Q07A 3RGEA 4YX4A 1LZVA 3K34A 4M2WA 1G54A 1ZGEA 3IBLA 3KS3A 4RUXA 1Z97A 1V9IC 4KNNA 4PXXA 3BL0A 5JESB 3MHIA 4YGNA 1FSRA 1CRMA 3MWOA 1CAIA 4FL7A 4JS6A 5J8ZA 4QJPA 3M2YA 4YVYA 4N0XB 1CCTA 12CAA 1FSQA 3F4XA 1HUGA 2EU2A 5EHVA 1TTMA 2X7TA 3S73B 4L5VA 1HEBA 1IF6A 5EHWA 4QK2A 5G0BA 5DSJA 4X5SA 3T5ZA 3DD0A 5BYIA 4R59A 1BNNA 5FNLA 4E3FA 1ZNCA 1AM6A 2NWYA 3M67A 4KP8A 5EKJA 1CAKA 1LUGA 1TEUX 1YDBA 5E2NA 2NNOA 3JXFA 3GZ0A 3RJ7A 2HKKA 3DVBA 3DC3A 1RZCA 1BNTA 1Z9YA 5JQ0A 3MNUA 5FLQA 4Q83A 1CNCA 3D93A 1CVAA 4HT2A 3IEOA 3JXHC 3MZCA 3M96A 3S74B 1KWQA 4K0SA 4QIZA 4L5WA 4Q6EA 1RAYA 1ZE8A 2AX2A 3S76A 3P3JA 3TVNX 5IPZA 1G1DA 4E4AA 5E2SA 1BN4A 1RJ6A 4WR7A 3UYNA 2CBEA 3KLDB 4BF6A 4E9OX 2POUA 5EKHA 2NXRA 2OSFA 4TWMA 1RZBA 1CNXA 5E2RA 3CA2A 4XZ5A 5A25A 1YDAA 4ZWZA 4KP5A 3FFPX 4E3DA 4QJOA 3S75B 3M5EA 3UYQA 4CQ0A 5DSNA 5E2KA 3BETA 1BN1A 4LU3A 3HKQA 1I9PA 2X7SA 4YHAA 4KNJA 1BNWA 4KUYA 3IBIA 4XIXA 3V2JA 1LG5A 2FMGA 3HKUA 4CACA 5CACA 3N4BA 1HCBA 3KOIA 4IWZA 1T9NA 4QJ0A 2FNKA 4QY3A 5FNGA 1CA2A 4QK3A 4GL1X 1TE3X 3SBHA 3V7XA 5FDIA 1Z93A 6CA2A 4Z1JA 1ZFQA 3T83A 3M1QA 4KUVA 1HVAA 3B1BA 1XPZA 3FE4A 1FLJA 1I9MA 4Z1KA 3KOKA 3KIGA 1G52A 4QSIA 1BCDA 1G53A 5JDVB 4Q06A 1CVEA 5JEHB 4RUYA 3T85A 3D8WA 4HEWA 1G4OA 1A42A 2FOQA 3HKTA 2QO8A 4Z0QA 3RYZA 5EHEA 1I9OA 2CBCA 2EU3A 3S78B 3DA2A 2NWZA 1TG9A 2WEJA 1H9QA 3V3JA 4CNVA 4MDMA 2W2JA 1CAMA 5C8IA 8CA2A 5FNJA 1CAJA 3DCCA 4ZX0A 3IBUA 4L5UA 4Q7SA 2AW1A 4Q9YA 3BL1A 4MLXA 4YGLA 4JSZA 4R5BA 4JSWA 4HU1A 4ETQC 2FOSA 5EH5A 3RZ8A 5FNHA 4Q8XA 5SZ2A 4E49A 4FIKA 1FQRA 3Q31A 5FLRA 4CNRA 3PYKA 3NI5A 5DSMA 1XEVA 2VVBX 1JD0A 3CAJA 3ML2A 1CRAA 4RUZA 4QJXA 3KKXA 1LG6A 1CNYA 2FOYA 5SZ0A 5JGTB 4E3HA 5LMDA 3RYYA 1ZSCA 4Q7WA 3RG4A 4KUWA 3HKNA 3MHLA 4PQ7A 4Q0LA 5DSRA 3V5GA 1I9LA 3F7UA 4Q08A 1KWRA 2HOCA 2H4NA 3ZP9A 5FLPA 5CA2A 9CA2A 3S97A 1IF9A 1IF5A 1CVHA 1ZFKA 3DCWA 1G6VA 5JG5B 3JXGA 1CNIA 1CVCA 3NJ9A 1BNVA 5FL5A 1AVNA 5L3OA 3M2ZA 1EOUA 1V9EA 3IGPA 1ZSBA 3S8XA 4KV0A 3K2FA 1IF7A 5FLTA 2NXTA 4QEFA 4QSJA 4MLTA 1ZH9A 1H9NA 2NNVA 2OSMA 3DV7A 5L6KA 4COQA 3M1KA 2GD8A 4RIVA 4QJWA 2Q1BA 3HLJA 3DAZA 5CJFA 1MUAA 5EZTX 4G0CA 3M5SA 2POWA 1BZMA 5FNMA 2NNGA 2QP6A 5EOIA 1G4JA 2HFWA 4R5AA 5G01A 4YGFA 4Q78A 3W6HA 3IAIA 1UGAA 3PJJA 5CLUA 4BCWA 2NWPA 2NMXA 4WUQA 4Q8YA 3R17B 4Q87A 5DOHA 1G45A 1IF4A 3N3JA 2WEOA 4HF3A 5SZ5A 1RZAA 3C7PA 3MHCA 5FDCA 3RLDA 5BNLA 3KNEA 1BNMA 1RJ5A 2FNMA 4KNIA 1G48A 1BICA 2FOUA 1DCBA 4QSAA 3D9ZA 3FW3A 4N16A 1TEQX 2ABEA 5E2MA 4XE1A 1CAYA 2WEHA 5SZ6A 4RFCA 5FNIA 2HL4A 3P5AA 5FNKA 3M04A 4CNXA 4RIUA 4K0TA 4DZ9A 3EFTA 4M2RA 4PYXA 4Q7PA 1UGFA 2NN1A 5DVXA 1CAHA 3CZVA 3OYQA 4XIWA 1TB0X 2FOVA 1FR7A 1XEGA 3F8EA 5BRVA 1YDDA 1F2WA 5DSOA 1G3ZA 3IBNA 4ZWXA 4FU5A 5G03A 1OQ5A 2POVA 4M2VA 4BF1A 1CAOA 4YGKA 4ZX1A 3SAPA 1DMXA 1OKLA 1TBTX 2FW4A 3RYJB 3RZ1B 4Q81A 4Q7VA 5FL4A 5DOGA 3OY0A 5E5RA 3OIKA 3MNKA 3P4VA 4PYYA 4ZWIA 4YYTA 4Q49A 3M98A 3N2PA 3V3IB 3L14A 1CVBA 1CINA 3OILA 5JEPB 1UGDA 3DCSA 5SZ1A 3M1JA 4Q90A 1CA3A 3M14A 4PZHA 1YDCA 2Q38A 3OKUA 3U3AX 3S72B 5EKMA 2X7UA 4HBAA 3V3HB 2QOAA 3U7CA 3SAXA 2IT4A 4YXUA 5BRUA 4K0ZA 5AMDA 4WW8A 2WD3A 4WL4A 3HS4A 1CIMA 3DD8A 3R16A 4Q99A 4HEZA 1YO0A 4MO8A 2ZNCA 3N0NA 4G7AA 3T5UA 1J9WA 1MOOA 3OIMA 1G46A 4Z1NA 4YGJA 5DSKA 3DBUA 1CANA 3P3HA 2CBBA 5JQTA 3MDZA 1G0EA 3M5TA 1KEQA 3RYXB 5AMGA 5EH7A 3VBDA 4YXIA 1ZGFA 3MNHA 4MDGA 3V2MA 4FVNA 4TWLA 3U47A 1TH9A 4YXOA 1CCSA 1HEDA 3M1WA 4FRCA 4RFDA 3CYUA 3M40A 4C3TA 1CALA 1HUHA 1Y7WA 1KOQA 2ILIA 3M3XA 1CCUA 3P5LA 4DZ7A 4LHIA 5HPJA 1UGBA 5SZ7A 1URTA 4QIYA 3B4FA 3PO6A 1KOPA 2GEHA 5G0CA 1THKA 4ITPA 2WEGA 3MHMA 4KNMA 1I9NA 2CBDA 3RZ0B 4MDLA 1CNGA 3MYQA 4K1QA 2Q1QA 1FQMA 4Y0JA 4HT0A 2HD6A 5FLSA 7CA2A 3RZ7A 1CNBA 2NN7A 1FQLA 1HECA 3U45X 1OKMA 4K13A 4E3GA 4YWPA 1CZMA 1LGDA 1OKNA 2EZ7A 3M2NA 3T82A 5DSLA 4QSBA 5DSIA 2NNSA 3V3GB 3T84A 3S71B 1XQ0A 4HEYA 4QJMA 4LP6A 3DVDA 3ZNCA 3HFPA 3M2XA 3MMFA 3OKVA 1BNUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YO1 A;  2CBA A;  5JGS B;  4Z1E A;  1HEA A;  3DVC A;  1BNQ A;  5A6H A;  1JV0 A;  2HNC A;  2O4Z A;  5E5U A;  2NXS A;  5DSP A;  2NWO A;  5E28 A;  3MHO A;  3P58 A;  3S9T A;  5DRS A;  1FR4 A;  3QYK A;  1CNK A;  3SBI A;  4Q09 A;  2FNN A;  2H15 A;  3V3F A;  3S77 B;  3ML5 A;  1CNW A;  5SZ3 A;  4CNW A;  5EH8 A;  3P55 A;  2CAB A;  1BN3 A;  1ZSA A;  4RH2 A;  1CIL A;  3K7K A;  4E5Q A;  1AZM A;  2CA2 A;  3F7B A;  1YO2 A;  4MTY A;  4Q8Z A;  1HCA A;  5FLO A;  3RYV B;  3D0N A;  1I90 A;  3P44 A;  1FQN A;  5JEG B;  3NB5 A;  1G0F A;  4FVO A;  3OYS A;  4FPT A;  4QK1 A;  4UOV A;  5AML A;  3EFI A;  3LXE A;  4ITO A;  4RN4 A;  3MNJ A;  4WUP A;  1FSN A;  1CNJ A;  4KAP A;  3TMJ A;  1I91 A;  3KON A;  4IDR X;  1IF8 A;  4JSA A;  3RZ5 A;  5BRW A;  1CAZ A;  5DSQ A;  5SZ4 A;  1JCZ A;  4QTL A;  5FL6 A;  2F14 A;  1DMY A;  1H4N A;  4JSS A;  2FMZ A;  4ILX A;  1RZD A;  2VVA X;  5JG3 B;  2WD2 A;  3TVO X;  3W6I A;  1I8Z A;  3MNA A;  3MNI A;  1I9Q A;  1CVF A;  4WW6 A;  4ZAO A;  1BV3 A;  5EIJ A;  1CNH A;  1UGC A;  4M2U A;  1UGG A; 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