3D9ZA

Use of carbonic anhydrase ii, ix active-site mimic, for the purpose of screening inhibitors for possible anti-cancer properties
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Design of a carbonic anhydrase IX active-site mimic to screen inhibitors for possible anticancer properties
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3d9zA00
4MLXA 5DSNA 1TE3X 1CAZA 1DMYA 4JSAA 4KAPA 4CNWA 1CVFA 3S74B 3S9TA 4M2RA 3K34A 5JG5B 1CNBA 3DVCA 3MNJA 2GD8A 2X7UA 1TBTX 2EZ7A 3MZCA 4QJMA 4KNJA 3RZ8A 3U3AX 4YXOA 3DCCA 3R16A 4RN4A 5SZ3A 2WD3A 3MHLA 1CIMA 1UGDA 3V2MA 4Q8ZA 3DVBA 1AM6A 2HNCA 4XFWA 5FL4A 1CNXA 5SZ1A 1FSNA 4BCWA 5L6KA 3M1QA 1BNMA 5DSKA 4Q7VA 2NWZA 3V3JA 1CNWA 3SAXA 3DC9A 1H9NA 3ML5A 5SZ4A 4XIXA 1CNHA 5FNKA 1RZEA 5FNMA 1CINA 1CVDA 3K7KA 4ZWYA 4Q8YA 1RZDA 3R17B 4KNNA 2POVA 2CA2A 4K13A 1OKNA 3P3HA 1FQRA 1JCZA 1TG9A 3W6HA 1G54A 4WW8A 1CILA 5E2RA 1J9WA 1KOQA 1HEBA 4XE1A 1H9QA 3KWAA 5BRVA 4Q7WA 1IF8A 2Q1BA 2ZNCA 2QO8A 5JESB 4Y0JA 5G03A 1DCAA 4Q6EA 5FLSA 1LUGA 5JEGB 5C8IA 5G01A 1BICA 4KNMA 3MDZA 4K0SA 4FPTA 4JSWA 4QY3A 2CBCA 3T82A 4HF3A 1G52A 4BF1A 1YDCA 4MDLA 1XQ0A 1RJ6A 3T5ZA 5FL5A 4E5QA 1F2WA 3M2XA 3D93A 5EH8A 1ZFKA 3LXEA 3MMFA 1HECA 3S75B 1A42A 3CA2A 7CA2A 4MO8A 3S78B 1THKA 4L5WA 4RFDA 1G46A 5FNLA 1BN3A 4ITPA 5E28A 3HFPA 5JG3B 1RZCA 3S71B 3OIMA 4HU1A 5DRSA 5BRUA 3JXHC 3M2YA 5E5UA 4M2VA 3FFPX 3MWOA 1HEDA 1G1DA 3C7PA 4Z0QA 1IF7A 3SBIA 4L5UA 2CBBA 4IWZA 2AX2A 2NWYA 1CCUA 1LG5A 1UGCA 2FMGA 1DMXA 5JEHB 4QIZA 5FNIA 1I9MA 3KIGA 4ZAOA 1ZE8A 1BNNA 4TWLA 4WUPA 1BZMA 1KWRA 2WD2A 1CCTA 5FDCA 4HT0A 6CA2A 3M5SA 1TTMA 1G0FA 1I9OA 4ILXA 1YO0A 1CNYA 4HEZA 1FLJA 8CA2A 1TB0X 4QEFA 1I9QA 4QJPA 2Q38A 3DCSA 5EHEA 3CZVA 1BV3A 1BNTA 1KEQA 3DVDA 3ML2A 2FOYA 3M2NA 5EOIA 4RUZA 4PYYA 5DSJA 2FMZA 4Q8XA 4DZ7A 3IAIA 3FE4A 3D9ZA 4LHIA 4KUWA 3S72B 2NNSA 5SZ2A 5FLOA 4C3TA 4YX4A 4LP6A 5EIJA 3MNIA 3MNUA 3KOIA 4KUYA 1OKMA 4CA2A 9CA2A 3OIKA 4Q0LA 5DSLA 5FLRA 5CA2A 4N0XB 3V3IB 1CAHA 4ZX0A 4M2UA 3V2JA 2EU2A 1ZGFA 2GEHA 3EFIA 5E2KA 3IBIA 5E2MA 4QSIA 5DSMA 5JDVB 1CVHA 2NWOA 3MHMA 4RUXA 2POUA 4Q90A 4HT2A 5AMDA 1AZMA 2X7TA 5HPJA 3T83A 2F14A 3F7UA 4IDRX 3Q31A 3KKXA 4QJXA 3TVOX 4Q7PA 3MNAA 4Q6DA 4ZWIA 5EHWA 3UYQA 1ZSAA 1XEGA 3N4BA 3M1JA 3PYKA 1CNKA 4KUVA 2H15A 3NB5A 1CRAA 5DSPA 12CAA 1FQNA 4Q07A 4YVYA 2NXRA 1FR4A 4Q09A 3P3JA 4FRCA 1TG3A 3F8EA 3RYVB 3MYQA 5G0CA 1LZVA 3DAZA 3RYZA 3V3FA 1I90A 1YO2A 5DSIA 2HKKA 2QP6A 4R5AA 3RG4A 1CANA 3DBUA 3MHIA 5BNLA 3T85A 4E3FA 1RAZA 4FL7A 4YYTA 3P4VA 1ZSBA 5JGSB 1CVEA 1FSRA 2ILIA 5FL6A 3D8WA 4E3DA 3RLDA 2O4ZA 3S97A 3W6IA 5JQ0A 4RUYA 1I9LA 2IT4A 1ZSCA 2FOUA 4HEYA 3RG3A 3M04A 3M5TA 3CYUA 2FNMA 3DD8A 1LGDA 3M1WA 1I9PA 4E3GA 1T9NA 3M5EA 5A6HA 1Z97A 1G6VA 3RZ7A 3OKUA 4ETQC 4KP5A 4JSZA 3U47A 3V3GB 4R59A 1UGGA 5JGTB 2NWPA 3JXFA 4Z1EA 2W2JA 5AMGA 5DSOA 2OSFA 1EOUA 3PJJA 1CAMA 3KLDB 2QOAA 4YGJA 4Z1KA 4QSAA 2WEGA 4PYXA 3UYNA 1XEVA 4Q7SA 1BNUA 1G4OA 3N0NA 4YHAA 5FLQA 4MDGA 4E3HA 4YXIA 3V3HB 2ABEA 3FW3A 3KOKA 4PZHA 3M14A 1BN4A 5DVXA 1CZMA 1AVNA 1HUHA 1DCBA 2WEHA 3F7BA 4FVOA 4YGNA 3IEOA 1IF4A 5FLPA 5CLUA 1HUGA 1ZFQA 2NXSA 2VVBX 1TEUX 4CNXA 5A25A 5IPZA 4QJWA 3OYQA 5DSRA 2OSMA 1CA2A 4XZ5A 4Z1JA 1G53A 3ZP9A 5CJFA 1Y7WA 5BYIA 3OYSA 4GL1X 4RH2A 3RZ0B 1IF6A 1YDAA 3SBHA 4ZWXA 3M98A 1G3ZA 4MLTA 1XPZA 2Q1QA 2CBDA 1Z9YA 4Q87A 4G7AA 1TH9A 5EKMA 3OY0A 3EFTA 1CNGA 1G0EA 3D92A 2FNKA 2HFWA 3M67A 3M3XA 4MDMA 3RYXB 1CRMA 2FOSA 2NMXA 1CCSA 3M2ZA 4M2WA 4CACA 4Z1NA 3NI5A 1I8ZA 4MTYA 1CA3A 1ZNCA 1YDDA 4JSSA 1UGFA 1UGEA 4QTLA 3T84A 5AMLA 1I91A 1JV0A 3B1BA 3HKNA 4N16A 1FR7A 5L3OA 5FNGA 5J8ZA 1CNIA 1UGBA 4CQ0A 4KP8A 3PO6A 4XIWA 1ZGEA 2NNGA 2WEJA 3DD0A 3P55A 4DZ9A 1CNCA 2NNOA 1KOPA 3CAJA 5CACA 2FNNA 5EKJA 5EKHA 3QYKA 1BNVA 2EU3A 4JS6A 5LMDA 5JEPB 3S76A 3RYJB 1G48A 3P5LA 5SZ6A 5DSQA 3HKUA 2CBEA 2VVAX 3P5AA 4WUQA 4ZX1A 3RYYA 3DA2A 4WL4A 4LU3A 4QK2A 2FOVA 4Q06A 2FW4A 1CAKA 3IBUA 2HOCA 3RJ7A 3KS3A 1FQMA 3MHOA 3TMJA 1OKLA 4HBAA 4Q83A 2NN1A 4YGFA 1RAYA 4RFCA 5EHVA 5FNHA 1FQLA 1CAJA 1CAOA 2FOQA 3F4XA 4QJOA 2H4NA 2HL4A 3V5GA 4QSBA 3NJ9A 1RZBA 3BL0A 3KONA 4ITOA 3RZ5A 1HEAA 1IF9A 3IBNA 4UOVA 4QIYA 4TWMA 1UGAA 4YGLA 1MOOA 4PQ7A 2AW1A 4R5BA 4KNIA 5SZ0A 1G4JA 1Z93A 3JXGA 3HKTA 4G0CA 4BF6A 3MNKA 1CVBA 1OQ5A 1LG6A 3OKVA 4HEWA 4FVNA 1V9EA 3D0NA 1I9NA 2NN7A 1CAIA 1H4NA 2POWA 4QK1A 3BL1A 4Q49A 1HVAA 1RZAA 1BNWA 5G0BA 1G45A 5FDIA 2WEOA 5FNJA 5FLTA 4WW6A 1KWQA 1ZH9A 1CNJA 1URTA 4X5SA 3DCWA 3VBDA 5BRWA 3MNHA 5EZTX 4COQA 2CBAA 4Q9YA 3M96A 3K2FA 3HS4A 3KNEA 4YWPA 4Q08A 3MHCA 1CVAA 4QJ0A 4CNRA 1RJ5A 2HD6A 4Q99A 4K1QA 3DC3A 2X7SA 3OILA 3P44A 5E5RA 4QSJA 1MUAA 3IBLA 3U7CA 4RIVA 1CVCA 1YDBA 3HKQA 4RIUA 4WR7A 5DOHA 3U45X 1HCBA 5JQTA 3S8XA 1FSQA 4CNVA 3RGEA 3TVNX 3GZ0A 5SZ7A 1JD0A 4E9OX 3RZ1B 3DV7A 2CABA 4E49A 1BN1A 4FU5A 3V7XA 4L5VA 3P58A 4FIKA 5E2NA 4YXUA 3M40A 4QK3A 1BCDA 5SZ5A 3N2PA 4ZWZA 5DOGA 3ZNCA 4KV0A 4K0ZA 4E4AA 1CAYA 2NNVA 3HLJA 3IGPA 5EH7A 3S73B 3T5UA 1TEQX 4K0TA 4YGKA 3L14A 5E2SA 5EH5A 1YO1A 1HCAA 3SAPA 4PXXA 3B4FA 1CALA 4Q78A 3N3JA 1BNQA 1IF5A 4Q81A 3BETA 3S77B 1V9IC 2NXTA 3M1KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4MLX A;  5DSN A;  1TE3 X;  1CAZ A;  1DMY A;  4JSA A;  4KAP A;  4CNW A;  1CVF A;  3S74 B;  3S9T A;  4M2R A;  3K34 A;  5JG5 B;  1CNB A;  3DVC A;  3MNJ A;  2GD8 A;  2X7U A;  1TBT X;  2EZ7 A;  3MZC A;  4QJM A;  4KNJ A;  3RZ8 A;  3U3A X;  4YXO A;  3DCC A;  3R16 A;  4RN4 A;  5SZ3 A;  2WD3 A;  3MHL A;  1CIM A;  1UGD A;  3V2M A;  4Q8Z A;  3DVB A;  1AM6 A;  2HNC A;  4XFW A;  5FL4 A;  1CNX A;  5SZ1 A;  1FSN A;  4BCW A;  5L6K A;  3M1Q A;  1BNM A;  5DSK A;  4Q7V A;  2NWZ A;  3V3J A;  1CNW A;  3SAX A;  3DC9 A;  1H9N A;  3ML5 A;  5SZ4 A;  4XIX A;  1CNH A;  5FNK A;  1RZE A;  5FNM A;  1CIN A;  1CVD A;  3K7K A;  4ZWY A;  4Q8Y A;  1RZD A;  3R17 B;  4KNN A;  2POV A;  2CA2 A;  4K13 A;  1OKN A;  3P3H A;  1FQR A;  1JCZ A;  1TG9 A;  3W6H A;  1G54 A;  4WW8 A;  1CIL A;  5E2R A;  1J9W A;  1KOQ A;  1HEB A;  4XE1 A;  1H9Q A;  3KWA A;  5BRV A;  4Q7W A;  1IF8 A;  2Q1B A;  2ZNC A;  2QO8 A;  5JES B;  4Y0J A;  5G03 A;  1DCA A;  4Q6E A;  5FLS A;  1LUG A;  5JEG B;  5C8I A;  5G01 A;  1BIC A;  4KNM A;  3MDZ A;  4K0S A;  4FPT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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