3DCWA

Use of carbonic anhydrase ii, ix active-site mimic, for the purpose of screening inhibitors for possible anti-cancer properties
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Design of a carbonic anhydrase IX active-site mimic to screen inhibitors for possible anticancer properties
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dcwA00
2NNSA 4KUYA 4CACA 3RYVB 1FQNA 1I9PA 4XIWA 1I90A 1AZMA 4KNJA 2ILIA 5DSJA 1IF8A 4ZX1A 4FU5A 5EHVA 1G0FA 4FIKA 2HNCA 1CAHA 1FSNA 5SZ3A 2NWOA 5SZ0A 3IGPA 3RZ5A 3F7UA 3M1WA 5E2SA 3ML2A 4YX4A 1G46A 1I9NA 1UGCA 3V3JA 3M98A 3EFIA 1CNWA 5DSOA 3RZ7A 4JSWA 3RZ8A 1AM6A 4K13A 3OYQA 3LXEA 3RG4A 4HF3A 1ZH9A 1RZAA 3MNKA 4L5VA 4C3TA 4LP6A 1OKMA 2WD2A 4L5WA 4MDGA 5E28A 3D93A 5FLOA 5AMDA 3MHOA 4Q83A 4RFDA 3M1QA 4CNWA 5E5RA 3F8EA 2AW1A 3L14A 3BETA 5EOIA 4QY3A 2NNOA 5AMGA 5FL4A 4QK2A 1BNTA 4Q8YA 1H9NA 5JQTA 5DRSA 4PYXA 1CILA 4G7AA 3K2FA 1FQRA 3RYXB 3V2JA 5BRWA 4QSAA 4BF1A 1CCSA 4IWZA 1ZSAA 1CAOA 4XIXA 2CBBA 5SZ6A 4ITPA 1CA2A 3OIKA 3D9ZA 3VBDA 1MUAA 3IAIA 3P4VA 2WEJA 4MDMA 5FNHA 2Q1BA 4XE1A 2CA2A 1ZGEA 3IEOA 3S8XA 1HUGA 5A6HA 1I8ZA 4HT2A 1FSQA 2WEHA 2WEGA 4XFWA 4ZAOA 3U7CA 3ZP9A 3U47A 4COQA 5G03A 3V5GA 1XEGA 3MNIA 4Q99A 1Z97A 1CVCA 1HEAA 1CAYA 1RZCA 1Y7WA 3U45X 5A25A 3R17B 2FNMA 1CNGA 3OIMA 3JXFA 3F4XA 4DZ9A 4RIVA 2EU2A 5E2RA 5EIJA 1JD0A 5HPJA 4WW6A 5EKHA 5J8ZA 1CAKA 5FDIA 3B1BA 4Q78A 4KV0A 1ZFKA 3OILA 1V9EA 4TWMA 5BRUA 3RGEA 3P58A 3DCCA 3S72B 1CRAA 1G4OA 4JS6A 3F7BA 3T85A 4YXOA 3CYUA 1A42A 4X5SA 3SBIA 3EFTA 4Q7VA 4QK3A 4Z1KA 1CRMA 4Q6EA 4LHIA 3W6HA 4JSSA 2HL4A 5L6KA 3T83A 4KNNA 1HUHA 3U3AX 1RAYA 3OKVA 2POVA 3V3IB 3OKUA 3Q31A 3MHCA 3KIGA 4HEZA 4QJWA 1TB0X 3KLDB 2CBCA 4QSIA 4KNMA 1RZDA 5FNJA 5DSLA 1RAZA 2W2JA 3FW3A 4Q7PA 3M3XA 2GD8A 4YGKA 3HS4A 1T9NA 1CAZA 2IT4A 1UGDA 2CBEA 2FOUA 3KS3A 3OY0A 4Q07A 4RFCA 3S76A 1RZBA 3HKUA 4Q90A 3M96A 4FVNA 3JXGA 1OKLA 4E5QA 1CVAA 4RUXA 5C8IA 5FLPA 1ZFQA 3MHIA 4RIUA 5EHWA 5CACA 4QSBA 3ML5A 1G54A 5EKJA 5FNLA 5DVXA 3HLJA 4E3FA 1DMYA 2FOQA 3HKQA 4E3GA 5FNKA 2GEHA 1CNXA 1BN3A 1ZGFA 4PQ7A 4LU3A 1G53A 5BNLA 1THKA 3DVBA 5JEHB 5FL5A 1ZSBA 4K1QA 3K34A 1YO2A 3PJJA 4HU1A 5G0CA 5IPZA 5E2KA 4JSAA 4ZWXA 3BL1A 4MDLA 1CVDA 1BNQA 4HT0A 3MNHA 5JGTB 1G4JA 4Q87A 4G0CA 4XZ5A 1OQ5A 3DC3A 3TVOX 3DV7A 1H4NA 3V2MA 2ZNCA 3PO6A 2FNKA 2AX2A 1DCAA 3TMJA 3CZVA 2FMZA 1CNHA 1HEDA 1DMXA 1URTA 2QP6A 3T82A 4KUWA 5FLTA 3RYJB 3K7KA 3N3JA 4DZ7A 4MO8A 4Q09A 4QJMA 1I9QA 3QYKA 3KONA 4YYTA 5CLUA 4ETQC 2ABEA 1UGEA 5FL6A 2Q1QA 1RJ5A 3V3HB 1HCBA 5FNIA 1XPZA 2Q38A 2NWYA 1CIMA 3M2YA 4MLTA 1HCAA 1BZMA 1CNBA 4YVYA 1BN4A 2O4ZA 3CAJA 1CINA 1F2WA 1JCZA 3SAPA 1CNCA 4TWLA 4WUQA 3T84A 1BN1A 1CNKA 4E3HA 3IBIA 3KWAA 3KOIA 1KOQA 4CA2A 4FRCA 3S78B 1LGDA 3V3GB 1IF9A 4ILXA 4RUZA 3RLDA 2EZ7A 4YGFA 1CCUA 3S9TA 3N2PA 2QOAA 1LUGA 3KNEA 3IBNA 2FOSA 5CA2A 1KOPA 2POUA 3M1KA 1UGFA 1KEQA 4ZWIA 3S77B 1TEQX 4KUVA 4Z0QA 3MWOA 5G0BA 3UYNA 1Z93A 3BL0A 3NJ9A 1FSRA 3V3FA 3M67A 4BF6A 2X7TA 3SAXA 5EKMA 2FOYA 4Z1NA 4BCWA 3SBHA 4Q8XA 1CALA 5JESB 3MZCA 3P55A 3R16A 3RZ1B 5L3OA 1FR7A 2X7UA 1LZVA 4Q6DA 3S97A 4E4AA 1JV0A 4CQ0A 4KAPA 4RN4A 2H4NA 3IBLA 3JXHC 1BV3A 3NB5A 7CA2A 4CNRA 1FR4A 5FNGA 4Q0LA 4QEFA 3S73B 3T5ZA 4Q7WA 5E5UA 1G48A 3RYZA 3MNJA 3N4BA 1I9MA 2NNVA 3B4FA 4QK1A 3N0NA 2NWZA 4ZWZA 1HEBA 2CBAA 1CVFA 4E3DA 1CVHA 5FDCA 4KNIA 1IF4A 1BNUA 5SZ1A 5SZ4A 1CNYA 4WR7A 2NN1A 4Q08A 1CANA 2HD6A 1J9WA 4Z1EA 4K0SA 1CNJA 4WL4A 3TVNX 5DOHA 1BNNA 4L5UA 1DCBA 1HVAA 4YGNA 4MLXA 3D8WA 5EH7A 4QSJA 2NMXA 1ZSCA 3W6IA 4Q06A 2FOVA 1YDAA 3M2XA 4Q8ZA 1TH9A 5SZ7A 1G52A 4FVOA 12CAA 2H15A 1CAMA 4YHAA 4QJPA 1KWQA 1XQ0A 3PYKA 1CNIA 2X7SA 1YDBA 5LMDA 1FQMA 4QIZA 5JEGB 3HKTA 5DOGA 4PXXA 3M2NA 5G01A 1RZEA 2POWA 4N16A 4Q7SA 3RYYA 2EU3A 1CVEA 3UYQA 1CA3A 3P5AA 4R59A 1LG5A 4WUPA 4M2WA 4QJXA 4R5BA 4HEWA 3DC9A 4YGJA 1TE3X 5FNMA 2FMGA 2NNGA 4M2UA 5EHEA 1G1DA 4E49A 4Z1JA 1XEVA 2NN7A 1AVNA 4CNVA 3HKNA 3MNAA 1BCDA 5EH5A 4RUYA 1H9QA 1TTMA 1ZE8A 1G3ZA 3KKXA 1I9OA 2NXRA 4R5AA 3S71B 3M5SA 3V7XA 3D92A 1IF6A 5DSKA 5JEPB 1YDDA 1YDCA 4KP8A 1EOUA 3IBUA 1RJ6A 4K0TA 4ZWYA 2CABA 2VVBX 1ZNCA 1CAJA 5E2NA 3M5EA 3C7PA 4MTYA 6CA2A 4M2RA 1UGBA 4K0ZA 3MYQA 4FL7A 5DSMA 5SZ2A 1G6VA 4KP5A 5JDVB 1IF5A 3RG3A 1BNMA 4GL1X 4QTLA 5CJFA 1LG6A 3DAZA 3DVDA 5JG3B 1MOOA 1CZMA 4FPTA 3P5LA 5BRVA 3KOKA 2FW4A 4HEYA 1IF7A 3MHMA 4M2VA 3P44A 4IDRX 5FLSA 5EZTX 3MDZA 3FFPX 4Q9YA 5DSRA 4YXUA 5JGSB 4Y0JA 3RZ0B 3GZ0A 1CCTA 4QJ0A 4PYYA 3M40A 5JG5B 3CA2A 4CNXA 3M1JA 5SZ5A 1G0EA 2NWPA 1TG9A 3OYSA 5JQ0A 2QO8A 3DCSA 3D0NA 2NXTA 3P3HA 5DSNA 3MNUA 3ZNCA 3DVCA 2CBDA 5FLQA 4E9OX 3FE4A 3T5UA 1TEUX 4ITOA 2FNNA 1Z9YA 4RH2A 4ZX0A 3M14A 1CVBA 1I9LA 4YXIA 8CA2A 5DSPA 2F14A 1UGGA 2WD3A 5DSQA 4Q49A 3M04A 1BNWA 3HFPA 4Q81A 5EH8A 1KWRA 4QJOA 4PZHA 3S74B 3DD0A 2HKKA 1CAIA 1V9IC 5AMLA 2VVAX 2NXSA 5DSIA 1BICA 3MHLA 1FQLA 3DA2A 1TG3A 3MMFA 9CA2A 1TBTX 5FLRA 1I91A 3DD8A 4UOVA 2HFWA 4JSZA 4N0XB 2WEOA 5E2MA 3RJ7A 1FLJA 1YO1A 4YGLA 5BYIA 1BNVA 4HBAA 3M5TA 3DCWA 1UGAA 4WW8A 1HECA 4YWPA 3S75B 3NI5A 2HOCA 1YO0A 2OSMA 3M2ZA 3P3JA 1OKNA 1G45A 3DBUA 2OSFA 4QIYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NNS A;  4KUY A;  4CAC A;  3RYV B;  1FQN A;  1I9P A;  4XIW A;  1I90 A;  1AZM A;  4KNJ A;  2ILI A;  5DSJ A;  1IF8 A;  4ZX1 A;  4FU5 A;  5EHV A;  1G0F A;  4FIK A;  2HNC A;  1CAH A;  1FSN A;  5SZ3 A;  2NWO A;  5SZ0 A;  3IGP A;  3RZ5 A;  3F7U A;  3M1W A;  5E2S A;  3ML2 A;  4YX4 A;  1G46 A;  1I9N A;  1UGC A;  3V3J A;  3M98 A;  3EFI A;  1CNW A;  5DSO A;  3RZ7 A;  4JSW A;  3RZ8 A;  1AM6 A;  4K13 A;  3OYQ A;  3LXE A;  3RG4 A;  4HF3 A;  1ZH9 A;  1RZA A;  3MNK A;  4L5V A;  4C3T A;  4LP6 A;  1OKM A;  2WD2 A;  4L5W A;  4MDG A;  5E28 A;  3D93 A;  5FLO A;  5AMD A;  3MHO A;  4Q83 A;  4RFD A;  3M1Q A;  4CNW A;  5E5R A;  3F8E A;  2AW1 A;  3L14 A;  3BET A;  5EOI A;  4QY3 A;  2NNO A;  5AMG A;  5FL4 A;  4QK2 A;  1BNT A;  4Q8Y A;  1H9N A;  5JQT A;  5DRS A;  4PYX A;  1CIL A;  4G7A A;  3K2F A;  1FQR A;  3RYX B;  3V2J A;  5BRW A;  4QSA A;  4BF1 A;  1CCS A;  4IWZ A;  1ZSA A;  1CAO A;  4XIX A;  2CBB A;  5SZ6 A;  4ITP A;  1CA2 A;  3OIK A;  3D9Z A;  3VBD A;  1MUA A;  3IAI A;  3P4V A;  2WEJ A;  4MDM A;  5FNH A;  2Q1B A; 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