3EFTA

Crystal structure of the complex between carbonic anhydrase ii and a spin-labeled sulfonamide incorporating tempo moiety
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
256
structure length
255
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Dissecting the Inhibition Mechanism of Cytosolic versus Transmembrane Carbonic Anhydrases by ESR
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
total genus 77
structure length 255
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3eftA00
5DRSA 3M67A 4Z0QA 5BRVA 5EKHA 1FQMA 5JG3B 3KONA 5E5RA 1CAOA 5FNLA 2POUA 2X7UA 5BRUA 3RYZA 1CVFA 3M2XA 2ZNCA 3PO6A 4Q07A 4Q06A 1CZMA 2POWA 4IDRX 2NNVA 4Q90A 5BYIA 4QJ0A 1ZGEA 9CA2A 1CIMA 2NWZA 5FLSA 5AMDA 1I9QA 4PZHA 3PYKA 1CCSA 5JQTA 5FNJA 4R5AA 4ZWIA 5E2SA 3HLJA 4PQ7A 3T84A 1YDBA 4QJPA 1CVDA 1EOUA 1OQ5A 4QSAA 4JSWA 5FNHA 5J8ZA 1G53A 4CNWA 4KNIA 3HFPA 3MMFA 3HS4A 1CAJA 4L5VA 1CNXA 4TWMA 2OSMA 3DAZA 3DVBA 3T5UA 2FNKA 4QK1A 3V3GB 3IBUA 4K0SA 5FL4A 4YYTA 5SZ2A 4M2RA 1CNJA 3C7PA 3K34A 4GL1X 1TBTX 4JSAA 1BNVA 3DCCA 4LU3A 1H4NA 1ZNCA 5SZ0A 1G4OA 2X7SA 4Q81A 2WD2A 3NB5A 3IEOA 1KOPA 3F7UA 1DCBA 4E3FA 1CNBA 2NNSA 3KNEA 3MHLA 4Q8XA 4WL4A 5DSOA 5E5UA 3IBLA 1IF4A 3N2PA 4C3TA 5JESB 1G48A 4M2UA 3MWOA 4HT0A 4Q78A 5JGSB 2WEHA 1RAZA 3EFTA 1KWQA 1IF6A 1FSNA 2FNNA 4Q99A 3V3HB 1TTMA 3KLDB 1TEQX 1BNMA 1I91A 1XEVA 3OKUA 4FVOA 4KP8A 1BNTA 1V9EA 4YGJA 1CNCA 4E3HA 3V3JA 1BZMA 3D0NA 3U3AX 1KOQA 4JSSA 2EZ7A 3LXEA 1Z97A 3U45X 3RZ7A 3HKTA 1CNKA 2NXTA 2VVBX 5FLOA 4G0CA 4HEZA 4Q49A 3PJJA 1HUGA 3F4XA 3RYJB 2HFWA 3RJ7A 3S71B 4MLXA 5FL6A 1OKMA 1CA3A 1I9NA 4Q08A 5FDIA 4XZ5A 1H9QA 4N16A 1AM6A 1BNUA 1HEBA 3M98A 4KUWA 1YO2A 2QOAA 4YGKA 5CACA 1CNGA 3HKQA 3DBUA 4RFCA 1JV0A 1CANA 1T9NA 4RIUA 4R5BA 4ZWZA 4FRCA 4Q7PA 3UYQA 2NN1A 4JS6A 3OIMA 1G45A 5G03A 2FOSA 3OIKA 5EOIA 4YXIA 2FOVA 3P55A 3ML2A 4KUVA 1LG6A 3V7XA 4RUZA 1ZH9A 1I9OA 4CNRA 3N3JA 3MHCA 2CABA 2F14A 5SZ4A 4KAPA 3DCSA 4ILXA 2CBEA 3ZNCA 1CRMA 2FMZA 2NNGA 4Q83A 4QSBA 2HD6A 3MHIA 5SZ6A 1G0EA 4XE1A 3RGEA 3B4FA 1Z9YA 4YXOA 5DSMA 1CVCA 5DSIA 4QJMA 1FQNA 4Q87A 4HBAA 4YGFA 4KNMA 1LZVA 3N4BA 4WW8A 3DCWA 3W6HA 1I9PA 4WR7A 1CNYA 1DMXA 2POVA 3RZ5A 1G46A 1CCUA 4ITOA 4YHAA 1I8ZA 3MZCA 3T5ZA 2AW1A 5JEGB 3R16A 3M1KA 1AVNA 4QSJA 2CBDA 3MNHA 2Q1QA 1AZMA 4CQ0A 3FW3A 5E2MA 5JEPB 4E49A 1BN1A 4BCWA 5JGTB 4CACA 1F2WA 3OY0A 3KKXA 5CJFA 3RYYA 4ETQC 4Z1NA 2Q1BA 5CLUA 5JQ0A 2HKKA 4HEWA 5SZ7A 1TG9A 2QO8A 3MDZA 4CA2A 1YDAA 4Z1KA 1CRAA 4LP6A 1UGCA 3N0NA 3M04A 1IF5A 2H15A 3M1WA 1CAHA 3SAPA 4E4AA 3S9TA 2NWYA 1YDCA 2NNOA 4PYXA 5SZ3A 1FSQA 3IBIA 1OKLA 5DOHA 5EHEA 5EH8A 4KUYA 3M40A 4Q8YA 3V5GA 4QK3A 4Q6EA 4E5QA 3MNAA 2OSFA 4N0XB 3MNUA 5DSLA 5E2RA 3RG4A 1G6VA 2NWPA 1RZEA 2Q38A 2GD8A 3MYQA 5DSPA 8CA2A 5FLRA 4KP5A 3D93A 5DOGA 3S76A 1HECA 1OKNA 1TE3X 1TEUX 1HCBA 3RYXB 5JEHB 1RAYA 5E28A 1ZSAA 4L5UA 4XIWA 1TB0X 3D92A 3V2JA 1DMYA 2NWOA 3S8XA 4WUPA 3JXHC 4YVYA 4ZWXA 4XIXA 1HUHA 1THKA 2CA2A 4YXUA 2AX2A 4YGNA 3M1JA 3OILA 3ML5A 4ZAOA 4QIYA 2GEHA 3TVOX 1V9IC 5L6KA 2CBAA 4Q9YA 3NI5A 1UGEA 4FVNA 3IBNA 3F7BA 4WUQA 4X5SA 1CVHA 1KWRA 3F8EA 4M2VA 1RZCA 2HL4A 3S97A 1CILA 3MHMA 4Q7WA 4ZWYA 3MNJA 1YDDA 4E9OX 5HPJA 1RJ5A 5DSJA 1UGDA 2QP6A 3HKUA 3M2ZA 1ZFQA 3M5EA 5IPZA 1CAZA 5G0CA 2FOQA 4Z1EA 1CAMA 5BNLA 2FMGA 5L3OA 1DCAA 3DD0A 3S73B 5FLPA 2WEOA 2EU2A 2HNCA 5EHWA 2CBBA 4Q0LA 4HU1A 1RZBA 3M2YA 5FNMA 4COQA 5FNGA 5EKJA 4LHIA 1CVEA 4QTLA 3DD8A 4MDLA 3P58A 1G52A 1I90A 4QY3A 4KNJA 5DSRA 3B1BA 4MTYA 1CALA 4QIZA 4RUYA 3S72B 4CNXA 1FR7A 4MDGA 3SAXA 3U47A 1J9WA 1CVBA 4RFDA 3D9ZA 3SBHA 3KIGA 5SZ5A 4UOVA 3TMJA 4QEFA 1G0FA 1CAIA 1FR4A 4K0ZA 3P5AA 4JSZA 1ZE8A 4YGLA 1BCDA 2VVAX 3S77B 1MUAA 3BETA 2W2JA 1MOOA 4BF6A 1BV3A 1UGBA 4CNVA 7CA2A 1TG3A 2NXSA 1JCZA 4MDMA 4MLTA 4K1QA 3MNIA 1XQ0A 5G01A 1RZAA 1KEQA 3BL0A 3P5LA 3S75B 1TH9A 4K0TA 4L5WA 4QJXA 1BN4A 4Q8ZA 4WW6A 5AMLA 5C8IA 4TWLA 3RZ1B 3M5SA 1ZSCA 3RYVB 5JG5B 1Z93A 2X7TA 1CINA 3K2FA 1BICA 1CCTA 1FSRA 1FQRA 3FFPX 3MHOA 3BL1A 3RZ8A 5FLTA 3TVNX 3OYSA 1G54A 3V3FA 3RG3A 4K13A 1HVAA 3CAJA 2ILIA 3R17B 3P3JA 1HEAA 1XEGA 3DVDA 3V2MA 3P44A 1BN3A 4G7AA 3M5TA 4Q09A 4HEYA 5BRWA 5DSKA 1HEDA 5EHVA 5E2NA 3W6IA 1CNWA 4Q6DA 5EIJA 1RJ6A 1ZSBA 3UYNA 3VBDA 1A42A 3OYQA 1CNIA 5G0BA 3V3IB 2FNMA 5CA2A 3T82A 3FE4A 1ZGFA 3DV7A 5FNIA 5EZTX 3DC3A 2WD3A 3D8WA 4ZX1A 1I9MA 3P4VA 4DZ9A 3P3HA 4KNNA 4RIVA 1UGFA 1ZFKA 4QK2A 4FPTA 5DVXA 3M1QA 1YO1A 4PYYA 1LUGA 5AMGA 3OKVA 3U7CA 2FW4A 4RN4A 5EH7A 6CA2A 5EH5A 1Y7WA 1YO0A 1BNWA 4IWZA 4YX4A 1HCAA 2FOUA 3NJ9A 3DA2A 3M3XA 3T85A 3RZ0B 1FQLA 3Q31A 1H9NA 1IF9A 1LGDA 3EFIA 3KS3A 5FNKA 5SZ1A 5DSQA 3CYUA 2O4ZA 1CAKA 1LG5A 4FL7A 4R59A 4DZ7A 1G4JA 4PXXA 3S74B 3DVCA 2NN7A 3KWAA 1UGGA 3QYKA 5A25A 1IF7A 5JDVB 1G3ZA 3IAIA 1CNHA 3L14A 4RH2A 1G1DA 4M2WA 2ABEA 2WEGA 3CZVA 4MO8A 1URTA 3MNKA 4FU5A 1CA2A 4ITPA 3JXGA 3ZP9A 1CVAA 3S78B 1IF8A 4E3DA 4BF1A 4Y0JA 12CAA 2EU3A 2FOYA 1RZDA 2H4NA 3KOKA 5FL5A 5A6HA 2NMXA 3K7KA 3KOIA 3RLDA 1BNNA 1FLJA 4FIKA 2NXRA 5EKMA 5FDCA 3JXFA 1JD0A 3DC9A 4QJOA 4XFWA 5FLQA 3M96A 1BNQA 4HF3A 4ZX0A 2WEJA 1I9LA 3T83A 2HOCA 1CAYA 2CBCA 4Q7SA 3M14A 5E2KA 4Q7VA 3SBIA 2IT4A 1XPZA 3IGPA 4E3GA 5DSNA 3CA2A 4YWPA 5LMDA 3M2NA 4QJWA 4HT2A 3GZ0A 4Z1JA 1UGAA 4QSIA 4KV0A 3HKNA 4RUXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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