3HKU | Genus

Total Genus 75

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	75
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__390269818325467__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__390269818325467__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3HKU/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__390269818325467__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"390269818325467","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3HKU/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__390269818325467__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	S-Glycosyl Primary Sulfonamides-A New Structural Class for Selective Inhibition of Cancer-Associated Carbonic Anhydrases doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	75
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2009-05-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3hkuA00

4K0SA 4LU3A 3CZVA 3DD0A 3RZ0B 4KUYA 4XFWA 3DCCA 5E28A 4JSAA 5FLOA 3MNIA 4Q81A 4RH2A 1G3ZA 1YO2A 1IF4A 3S8XA 4Q7PA 3S76A 2CBCA 5G0CA 4YX4A 2NXRA 3M40A 4KNIA 3DA2A 1YDBA 2POWA 5EH8A 3S9TA 1IF7A 3SAPA 1DMXA 3OYQA 1CA3A 5JEPB 1BNVA 4Z1EA 4Q78A 3BETA 5JG5B 4QJOA 9CA2A 2QOAA 4COQA 4Q0LA 1MOOA 1UGBA 4WW8A 1I9LA 5CJFA 1TE3X 1RZDA 3IBIA 1FQRA 3P5AA 1CNXA 1CINA 1TBTX 1BNMA 4HBAA 1XEGA 2ABEA 3S72B 3U47A 4QIYA 4HT2A 1FR7A 4BCWA 4QJWA 2O4ZA 3DC3A 5DSIA 4L5VA 3V3GB 3FFPX 4QSJA 3RYZA 4E3GA 3MNUA 5J8ZA 2NNSA 3M2YA 4QEFA 3KIGA 5CA2A 3M2ZA 4MDLA 4JSWA 3ML2A 5FLPA 1TEUX 1YDDA 3V3HB 2FMZA 3CA2A 4QK1A 5EZTX 1CVEA 5SZ0A 7CA2A 3HS4A 1YO0A 3V3FA 3KOIA 3RZ1B 5SZ2A 4N16A 5FLTA 3NI5A 1HEDA 1CAJA 4WUPA 4MO8A 3HKTA 1CAZA 3D9ZA 1ZSBA 5DSNA 2HFWA 5DVXA 5EHEA 5BRVA 3OKVA 1T9NA 4XIXA 3TVNX 3L14A 4YGJA 4MTYA 5FNJA 2GEHA 4FU5A 1CCSA 1BN3A 3M2NA 4HU1A 3DV7A 3RJ7A 4E3HA 2NWYA 3OKUA 3P44A 3ZP9A 4Q08A 4K13A 4Q49A 2WEOA 3HKUA 2FNNA 3IBNA 3RG3A 2CBEA 1RZEA 3OY0A 3S77B 1HECA 5DOHA 4CNXA 2QO8A 5SZ3A 3U3AX 1CALA 3KOKA 3M3XA 5EOIA 4YXUA 2FW4A 5EKJA 3OIKA 4Q7WA 5EH7A 5EIJA 4FPTA 3T84A 1KOQA 5IPZA 4DZ7A 4QSIA 1KWQA 4Z1JA 4Q06A 4M2UA 1BICA 1H9NA 5CLUA 5AMGA 3DBUA 2NWOA 4PQ7A 1G4OA 4KNNA 4KNJA 4RUZA 1BN4A 1HEBA 2CBDA 2OSFA 5E2RA 2CA2A 1RJ5A 1TTMA 3TMJA 5FL6A 5BYIA 5JGSB 4KNMA 2WEGA 1DMYA 4WUQA 4YXOA 5E5UA 1XQ0A 3MNAA 3SBHA 4Q6EA 2NWPA 2NN1A 3DAZA 1FQNA 4Z0QA 2CBAA 1FSQA 1IF5A 4QJPA 5SZ4A 5LMDA 5G01A 3MWOA 1KOPA 2VVBX 3M14A 3U45X 1RJ6A 1AM6A 1ZSCA 2NXTA 4XE1A 1HCAA 1F2WA 4K1QA 1RZAA 4CA2A 3F8EA 4JSZA 1G53A 3W6HA 5DSLA 1RAZA 3ZNCA 4KP8A 4RUXA 3SBIA 2NNVA 4YGLA 1CNHA 1I90A 5FNIA 3T5UA 5E2MA 1ZGFA 3KWAA 1XPZA 1LG6A 1RZCA 5EHWA 4ITPA 2FMGA 5E2NA 2POUA 4HT0A 5JEGB 5DSMA 5FNKA 4MDGA 4YVYA 1TG9A 4ILXA 2F14A 1IF8A 1V9EA 1CVBA 3OYSA 3N4BA 4Q83A 5JG3B 4R5AA 2FOQA 1YDAA 3GZ0A 4TWMA 4Q09A 4RIVA 2EU2A 2NNOA 4LHIA 1ZE8A 2EZ7A 3M1WA 1HUHA 4PYXA 5DSKA 4M2WA 3BL1A 3M98A 4FRCA 3UYNA 3D0NA 3F7UA 2ILIA 1BNQA 2CABA 4YHAA 3M67A 2FOUA 4GL1X 5E5RA 4Q8ZA 4Q8YA 3M1QA 4L5UA 1Z9YA 4R5BA 3S74B 4CQ0A 4MLXA 4K0TA 5JQTA 1XEVA 2Q38A 1JV0A 3D92A 3DC9A 1UGDA 3JXFA 1TB0X 3T82A 1TG3A 1BNWA 3HFPA 5HPJA 1KWRA 1BNUA 1G52A 3RZ7A 3RYYA 5FLQA 2HNCA 4E4AA 5JGTB 3MDZA 2WD2A 2EU3A 1OKMA 3M04A 3KNEA 1LUGA 4Z1KA 1UGGA 3K2FA 3MHLA 1ZGEA 4ETQC 2AW1A 4BF6A 4BF1A 1FQMA 4CNWA 1OQ5A 3RG4A 1BNTA 4WW6A 5DOGA 2FNMA 4QJXA 3V7XA 8CA2A 4JSSA 1OKNA 5EH5A 1BNNA 3S73B 1G48A 4PYYA 2WD3A 4QJMA 4ITOA 3EFIA 2NMXA 2AX2A 3KLDB 4YWPA 3W6IA 1RZBA 2HOCA 3DD8A 5FLSA 3V2JA 1BZMA 4CNRA 2ZNCA 3P58A 1G0EA 4HEZA 1CNYA 1URTA 4RUYA 4YYTA 3N3JA 5EKMA 3MNKA 6CA2A 5C8IA 4YXIA 3HLJA 3M96A 1ZH9A 2X7UA 5JDVB 5JQ0A 1CIMA 1CVFA 1V9IC 2NXSA 4N0XB 3DVDA 4RFDA 4IWZA 1CZMA 2FOYA 1CILA 3IGPA 3M1KA 4QSAA 4E5QA 1CRMA 2FOSA 1HEAA 4QK3A 2W2JA 1UGFA 4K0ZA 4RN4A 4E3DA 5DSRA 1CAOA 4E3FA 1FQLA 1CCTA 5SZ1A 4TWLA 1MUAA 2H15A 4JS6A 1CNWA 1HVAA 4FIKA 2NNGA 4WL4A 1UGAA 3T83A 4ZX1A 3F7BA 5DSPA 3VBDA 1G46A 4Q99A 3S78B 4YGNA 2X7TA 3R16A 1CAIA 3D93A 4RIUA 3RZ8A 4MLTA 1IF6A 1A42A 1Z93A 3M5TA 5A6HA 1CNGA 5FLRA 1G54A 4Q6DA 2OSMA 4YGFA 4QSBA 3FW3A 4UOVA 1G4JA 3RGEA 3IAIA 2POVA 1G1DA 1FLJA 3HKQA 4DZ9A 3K34A 2HL4A 2Q1QA 2WEHA 3OIMA 1CVAA 3KKXA 5L3OA 5CACA 1FR4A 3HKNA 3Q31A 3QYKA 1KEQA 3S97A 4ZAOA 1AVNA 1J9WA 4KV0A 3RYXB 4CNVA 4Z1NA 3P3HA 1HUGA 3N2PA 3IBUA 1ZFQA 4XIWA 3V3JA 3V2MA 3FE4A 1CAKA 4QK2A 1UGEA 4IDRX 1AZMA 1FSRA 3MHMA 4FL7A 5JEHB 1THKA 1CVCA 4XZ5A 5G03A 4QTLA 3MYQA 1CNCA 4Q9YA 4ZWXA 3CYUA 1LGDA 1DCBA 3P4VA 3C7PA 4FVOA 1JD0A 3KS3A 1Y7WA 1CAHA 3MHCA 5EHVA 1CCUA 3RYJB 1IF9A 3PYKA 1CNIA 3F4XA 3K7KA 3DCSA 1FSNA 3JXHC 1HCBA 1ZFKA 3PJJA 3B1BA 1DCAA 3M1JA 4ZWZA 1TH9A 2GD8A 4M2VA 5FNMA 3T85A 5FNGA 1I9MA 1CA2A 2IT4A 2NN7A 3EFTA 4Q7SA 5BNLA 1CNJA 4KUVA 4Q8XA 1CANA 5DRSA 1EOUA 2Q1BA 2QP6A 5BRWA 5DSQA 5FDIA 1YDCA 5E2KA 4G0CA 3IBLA 2FOVA 4QY3A 1CAMA 3DCWA 3NJ9A 3MMFA 4QJ0A 1RAYA 3T5ZA 4MDMA 5BRUA 3MNHA 4ZWYA 1H9QA 3DVBA 3UYQA 1CVDA 4HEYA 3S71B 3M2XA 4X5SA 4E9OX 2HD6A 1I9NA 1I9OA 5FNHA 4M2RA 5SZ5A 3ML5A 2NWZA 3MHOA 1CRAA 4YGKA 4G7AA 1LZVA 4R59A 5L6KA 4KAPA 4FVNA 1ZSAA 1I8ZA 3KONA 3SAXA 4RFCA 1TEQX 3TVOX 5AMLA 3D8WA 3P5LA 3R17B 12CAA 4KP5A 3PO6A 5G0BA 4WR7A 1H4NA 4LP6A 5EKHA 1BCDA 2VVAX 4Q7VA 1G6VA 4HEWA 3P55A 4Q07A 3V5GA 3JXGA 3BL0A 3M5SA 1BV3A 4HF3A 1CNBA 5DSOA 5SZ7A 3LXEA 5FNLA 3V3IB 1CNKA 4Q87A 4E49A 5JESB 3MNJA 3P3JA 4Y0JA 3U7CA 3DVCA 2HKKA 5AMDA 1JCZA 1I9PA 4KUWA 1I9QA 5FL4A 3NB5A 4QIZA 4PXXA 2H4NA 5DSJA 5SZ6A 1OKLA 1G0FA 1Z97A 3RZ5A 5FL5A 3OILA 4ZX0A 4Q90A 2CBBA 4ZWIA 1I91A 2X7SA 2WEJA 4L5WA 3RYVB 1LG5A 1G45A 1UGCA 3N0NA 1CVHA 4PZHA 4C3TA 5A25A 1CAYA 3IEOA 4CACA 3S75B 1YO1A 3MZCA 3M5EA 3CAJA 2FNKA 3RLDA 5FDCA 3B4FA 3MHIA 1BN1A 1ZNCA 5E2SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4K0S A;  4LU3 A;  3CZV A;  3DD0 A;  3RZ0 B;  4KUY A;  4XFW A;  3DCC A;  5E28 A;  4JSA A;  5FLO A;  3MNI A;  4Q81 A;  4RH2 A;  1G3Z A;  1YO2 A;  1IF4 A;  3S8X A;  4Q7P A;  3S76 A;  2CBC A;  5G0C A;  4YX4 A;  2NXR A;  3M40 A;  4KNI A;  3DA2 A;  1YDB A;  2POW A;  5EH8 A;  3S9T A;  1IF7 A;  3SAP A;  1DMX A;  3OYQ A;  1CA3 A;  5JEP B;  1BNV A;  4Z1E A;  4Q78 A;  3BET A;  5JG5 B;  4QJO A;  9CA2 A;  2QOA A;  4COQ A;  4Q0L A;  1MOO A;  1UGB A;  4WW8 A;  1I9L A;  5CJF A;  1TE3 X;  1RZD A;  3IBI A;  1FQR A;  3P5A A;  1CNX A;  1CIN A;  1TBT X;  1BNM A;  4HBA A;  1XEG A;  2ABE A;  3S72 B;  3U47 A;  4QIY A;  4HT2 A;  1FR7 A;  4BCW A;  4QJW A;  2O4Z A;  3DC3 A;  5DSI A;  4L5V A;  3V3G B;  3FFP X;  4QSJ A;  3RYZ A;  4E3G A;  3MNU A;  5J8Z A;  2NNS A;  3M2Y A;  4QEF A;  3KIG A;  5CA2 A;  3M2Z A;  4MDL A;  4JSW A;  3ML2 A;  5FLP A;  1TEU X;  1YDD A;  3V3H B;  2FMZ A;  3CA2 A;  4QK1 A;  5EZT X;  1CVE A;  5SZ0 A;  7CA2 A;  3HS4 A;  1YO0 A;  3V3F A;  3KOI A;  3RZ1 B;  5SZ2 A;  4N16 A;  5FLT A;  3NI5 A;  1HED A;  1CAJ A;  4WUP A;  4MO8 A;  3HKT A;  1CAZ A;  3D9Z A;  1ZSB A;  5DSN A;  2HFW A;  5DVX A;  5EHE A;  5BRV A;  3OKV A;  1T9N A;  4XIX A;  3TVN X;  3L14 A;  4YGJ A;  4MTY A;  5FNJ A;  2GEH A;  4FU5 A;  1CCS A;  1BN3 A;  3M2N A;  4HU1 A;  3DV7 A;  3RJ7 A;  4E3H A;  2NWY A;  3OKU A;  3P44 A;  3ZP9 A;  4Q08 A;  4K13 A;  4Q49 A;  2WEO A;  3HKU A;  2FNN A;  3IBN A;  3RG3 A;  2CBE A;  1RZE A;  3OY0 A;  3S77 B;  1HEC A;  5DOH A;  4CNX A;  2QO8 A;  5SZ3 A;  3U3A X;  1CAL A;  3KOK A;  3M3X A;  5EOI A;  4YXU A;  2FW4 A;  5EKJ A;  3OIK A;  4Q7W A;  5EH7 A;  5EIJ A;  4FPT A;  3T84 A;  1KOQ A;  5IPZ A;  4DZ7 A;  4QSI A;  1KWQ A;  4Z1J A;  4Q06 A;  4M2U A;  1BIC A;  1H9N A;  5CLU A;  5AMG A;  3DBU A;  2NWO A;  4PQ7 A;  1G4O A;  4KNN A;  4KNJ A;  4RUZ A;  1BN4 A;  1HEB A;  2CBD A;  2OSF A;  5E2R A;  2CA2 A;  1RJ5 A;  1TTM A;  3TMJ A;  5FL6 A;  5BYI A;  5JGS B;  4KNM A;  2WEG A;  1DMY A;  4WUQ A;  4YXO A;  5E5U A;  1XQ0 A;  3MNA A;  3SBH A;  4Q6E A;  2NWP A;  2NN1 A;  3DAZ A;  1FQN A;  4Z0Q A;  2CBA A;  1FSQ A;  1IF5 A;  4QJP A;  5SZ4 A;  5LMD A;  5G01 A;  3MWO A;  1KOP A;  2VVB X;  3M14 A;  3U45 X;  1RJ6 A;  1AM6 A;  1ZSC A;  2NXT A;  4XE1 A;  1HCA A;  1F2W A;  4K1Q A;  1RZA A;  4CA2 A;  3F8E A;  4JSZ A;  1G53 A;  3W6H A;  5DSL A;  1RAZ A;  3ZNC A;  4KP8 A;  4RUX A;  3SBI A;  2NNV A;  4YGL A;  1CNH A;  1I90 A;  5FNI A;  3T5U A;  5E2M A;  1ZGF A;  3KWA A;  1XPZ A;  1LG6 A;  1RZC A;  5EHW A;  4ITP A;  2FMG A;  5E2N A;  2POU A;  4HT0 A;  5JEG B;  5DSM A;  5FNK A;  4MDG A;  4YVY A;  1TG9 A;  4ILX A;  2F14 A;  1IF8 A;  1V9E A;  1CVB A;  3OYS A;  3N4B A;  4Q83 A;  5JG3 B;  4R5A A;  2FOQ A;  1YDA A;  3GZ0 A;  4TWM A;  4Q09 A;  4RIV A;  2EU2 A;  2NNO A;  4LHI A;  1ZE8 A;  2EZ7 A;  3M1W A;  1HUH A;  4PYX A;  5DSK A;  4M2W A;  3BL1 A;  3M98 A;  4FRC A;  3UYN A;  3D0N A;  3F7U A;  2ILI A;  1BNQ A;  2CAB A;  4YHA A;  3M67 A;  2FOU A;  4GL1 X;  5E5R A;  4Q8Z A;  4Q8Y A;  3M1Q A;  4L5U A;  1Z9Y A;  4R5B A;  3S74 B;  4CQ0 A;  4MLX A;  4K0T A;  5JQT A;  1XEV A;  2Q38 A;  1JV0 A;  3D92 A;  3DC9 A;  1UGD A;  3JXF A;  1TB0 X;  3T82 A;  1TG3 A;  1BNW A;  3HFP A;  5HPJ A;  1KWR A;  1BNU A;  1G52 A;  3RZ7 A;  3RYY A;  5FLQ A;  2HNC A;  4E4A A;  5JGT B;  3MDZ A;  2WD2 A;  2EU3 A;  1OKM A;  3M04 A;  3KNE A;  1LUG A;  4Z1K A;  1UGG A;  3K2F A;  3MHL A;  1ZGE A;  4ETQ C;  2AW1 A;  4BF6 A;  4BF1 A;  1FQM A;  4CNW A;  1OQ5 A;  3RG4 A;  1BNT A;  4WW6 A;  5DOG A;  2FNM A;  4QJX A;  3V7X A;  8CA2 A;  4JSS A;  1OKN A;  5EH5 A;  1BNN A;  3S73 B;  1G48 A;  4PYY A;  2WD3 A;  4QJM A;  4ITO A;  3EFI A;  2NMX A;  2AX2 A;  3KLD B;  4YWP A;  3W6I A;  1RZB A;  2HOC A;  3DD8 A;  5FLS A;  3V2J A;  1BZM A;  4CNR A;  2ZNC A;  3P58 A;  1G0E A;  4HEZ A;  1CNY A;  1URT A;  4RUY A;  4YYT A;  3N3J A;  5EKM A;  3MNK A;  6CA2 A;  5C8I A;  4YXI A;  3HLJ A;  3M96 A;  1ZH9 A;  2X7U A;  5JDV B;  5JQ0 A;  1CIM A;  1CVF A;  1V9I C;  2NXS A;  4N0X B;  3DVD A;  4RFD A;  4IWZ A;  1CZM A;  2FOY A;  1CIL A;  3IGP A;  3M1K A;  4QSA A;  4E5Q A;  1CRM A;  2FOS A;  1HEA A;  4QK3 A;  2W2J A;  1UGF A;  4K0Z A;  4RN4 A;  4E3D A;  5DSR A;  1CAO A;  4E3F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3HKUA

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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