3IBLA

The crystal structure of the human carbonic anhydrase ii in complex with an aliphatic bis-sulfamate inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Carbonic anhydrase inhibitors. Comparison of aliphatic sulfamate/bis-sulfamate adducts with isozymes II and IX as a platform for designing tight-binding, more isoform-selective inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3iblA00
4FRCA 5SZ4A 5FL6A 3RZ8A 2CBCA 4QSIA 2QOAA 4QJ0A 2FMGA 4TWLA 4LP6A 1CNYA 3PYKA 1AM6A 4Q78A 1TTMA 3N2PA 3FFPX 3KNEA 5E2NA 3OKUA 3MHLA 4WR7A 3OIMA 3OYQA 4YYTA 3DCWA 1F2WA 1URTA 5BRWA 1G0FA 4Q87A 2ILIA 5FLTA 4E3DA 1CIMA 3V3JA 4R59A 3EFTA 1BNUA 1UGDA 1UGGA 3M2XA 1CVCA 3N0NA 4M2VA 1ZE8A 5CA2A 1UGFA 3S97A 3V3FA 3BETA 4HEZA 1IF4A 4KAPA 2Q38A 4Q7VA 3HKTA 1I90A 4Z1NA 3V7XA 5JESB 2FOQA 1IF5A 3UYNA 4QTLA 5FL4A 1BICA 3OYSA 2HKKA 1RZEA 2VVBX 4MO8A 4WW8A 5FLPA 3MYQA 4CNXA 1I9LA 2POWA 3OIKA 3DC3A 3P5AA 1CILA 3SAPA 2FNKA 3SAXA 3W6IA 4YX4A 4CNRA 3N3JA 1HCBA 1Y7WA 2F14A 4ETQC 2FOVA 3MWOA 3IBLA 3M1QA 4HU1A 3DV7A 4RIVA 3M5EA 1CCUA 1RAZA 4YHAA 5L3OA 1OQ5A 2WEJA 2FMZA 1CNJA 5DSKA 4UOVA 1G4OA 3PO6A 4KUYA 1G52A 3KS3A 3OY0A 5G03A 4BF1A 4ZWZA 5CJFA 2OSMA 1ZNCA 3MHOA 4KP8A 4JSAA 5JEGB 2POUA 4Z1EA 1YO1A 1IF7A 5A6HA 5JG5B 1Z97A 4G0CA 5FNHA 3DD8A 4Y0JA 3JXFA 4HT0A 1BNQA 3DCSA 1XEGA 4K0SA 3K2FA 3TMJA 1OKNA 4ZWXA 3U47A 4CNVA 4QIZA 2CBAA 4RFDA 3NI5A 4KV0A 3DVDA 3F7UA 3IBUA 4WUQA 2CA2A 3M2YA 4QK2A 4JS6A 3K34A 4Q49A 3KKXA 5SZ5A 5SZ3A 4Z0QA 3N4BA 1CANA 5FNLA 4LHIA 3RGEA 5HPJA 3M40A 1TB0X 1G46A 1I9QA 1CAZA 4KP5A 4M2UA 1G3ZA 4KUWA 4RUXA 3MNIA 7CA2A 4E4AA 5EHVA 4Q8XA 3P5LA 1CALA 5FNJA 3V3GB 4Q83A 3S9TA 4PZHA 3EFIA 3DD0A 4IDRX 5EKMA 1ZGEA 3D92A 3P55A 4XIXA 3GZ0A 1KOPA 1G0EA 2FOSA 5JQTA 2CBBA 1YDCA 2CABA 3RZ0B 4ZX0A 5EH5A 1CAJA 4E5QA 4FL7A 2NXRA 1CNXA 3S77B 4Q08A 5SZ7A 4LU3A 4YWPA 1CZMA 3RG4A 2WEOA 6CA2A 1J9WA 4MDGA 4M2WA 4Q99A 5EZTX 2QP6A 3T5ZA 5EKHA 3UYQA 1H9QA 1YDAA 1IF6A 1DMYA 3T5UA 2FOYA 4RN4A 5AMDA 1ZSCA 2NMXA 5EKJA 4PXXA 3RLDA 2HOCA 5JEHB 2HFWA 2NWOA 3M1KA 1I8ZA 5EHEA 5JEPB 3KOIA 4HEYA 12CAA 3D0NA 3S8XA 2FOUA 1MUAA 1CRAA 1YO2A 2QO8A 1ZSBA 3MMFA 3V3HB 2POVA 4PYXA 3HKQA 1DMXA 1MOOA 4Z1KA 2NNGA 4COQA 2ZNCA 1EOUA 3RZ5A 3U3AX 5E2MA 1CAOA 1TG3A 3F8EA 4HBAA 4PYYA 3P44A 5L6KA 3M1WA 4BF6A 2NWZA 1OKMA 2VVAX 3DA2A 1KOQA 1G54A 1IF8A 3IAIA 1LG6A 3SBHA 1HEAA 2NWPA 1CNGA 1FQRA 1LG5A 1HUGA 5EIJA 5LMDA 1V9EA 4QSAA 5E28A 5EH8A 2HL4A 4RH2A 1THKA 1FQMA 4RFCA 2FNNA 2WEHA 4GL1X 2W2JA 8CA2A 3R16A 2EU3A 4MDLA 4HEWA 5CACA 5C8IA 4ZWIA 4XZ5A 3S71B 1XPZA 1A42A 3B1BA 1BNNA 5G0BA 5E5RA 4Q6DA 4C3TA 3S72B 4CNWA 5SZ0A 3P3HA 1G45A 5DSMA 3D8WA 3DVCA 3NB5A 5DSRA 1CVFA 3S75B 5DSNA 1CNIA 3V5GA 4QJPA 1I9PA 2GEHA 2WD3A 3M3XA 1BN1A 2X7TA 3RJ7A 5E2SA 3S78B 4E3GA 1FQNA 1AVNA 3P4VA 4QK1A 1G1DA 5FNGA 2Q1QA 3ZP9A 4HT2A 1CVBA 3SBIA 4YGFA 3MHIA 1G53A 5EH7A 4Q09A 3HKNA 1HVAA 4MLTA 1RAYA 2FW4A 3MNJA 4CQ0A 4QK3A 3IBNA 4QJXA 4KNJA 1HCAA 2IT4A 3P3JA 5JQ0A 1TBTX 1BN4A 1YO0A 3M96A 3CYUA 5FL5A 3DVBA 1XQ0A 1ZH9A 2NNVA 3FE4A 2FNMA 5DOHA 2X7SA 3V2MA 1TH9A 3IEOA 4PQ7A 4K13A 2WEGA 3HLJA 5SZ6A 1HUHA 5SZ1A 1BCDA 3D9ZA 1H4NA 3F4XA 5G0CA 4MDMA 1KWRA 1CRMA 1UGEA 1JCZA 4QEFA 3JXHC 4YXUA 2HD6A 2HNCA 1TG9A 3NJ9A 1TEQX 5DSLA 1CAMA 3M04A 2OSFA 3PJJA 3VBDA 1I9NA 1CVDA 2ABEA 1RJ5A 4MLXA 1KEQA 3KLDB 5BNLA 1ZFKA 3M5SA 4M2RA 4Q06A 1ZFQA 4BCWA 5JGSB 5DSIA 1IF9A 3CAJA 2WD2A 4KNMA 1BZMA 3ZNCA 1YDBA 4WUPA 1TEUX 1CA3A 4JSWA 4QSJA 3DBUA 4ILXA 4L5WA 1H9NA 1UGCA 4Q07A 3RYXB 1BNTA 1I9OA 3TVNX 4Q0LA 3BL1A 1CNCA 3KOKA 4FPTA 4QSBA 4K0TA 1RJ6A 5E5UA 5BYIA 4R5AA 1BV3A 1FR7A 3JXGA 3V2JA 2X7UA 4X5SA 2Q1BA 3RYZA 1LUGA 4Q90A 2NNSA 5CLUA 3S74B 1G6VA 3MNAA 4K0ZA 4Q9YA 4QY3A 2O4ZA 3U7CA 1I91A 1CNWA 4FU5A 1DCBA 2NN1A 3M2NA 2NXTA 1CNBA 4TWMA 3MDZA 1T9NA 5JDVB 4Q81A 3Q31A 5J8ZA 2AX2A 3L14A 1CCTA 5DOGA 4YVYA 1BN3A 5EOIA 4JSSA 4Z1JA 3RG3A 3K7KA 1I9MA 3M1JA 1DCAA 1CAIA 3DCCA 3S76A 4DZ7A 3MNKA 3U45X 1FLJA 4Q7SA 4R5BA 1CAKA 4IWZA 4Q6EA 2CBEA 3TVOX 5DSPA 5FDIA 4QJWA 4CA2A 3T82A 5BRUA 5G01A 2NXSA 1BNVA 4L5UA 5JGTB 1JD0A 1Z93A 2CBDA 1FSNA 1RZBA 4YXIA 3RZ1B 2EU2A 5AMLA 3T84A 4CACA 1RZDA 1G4JA 5FLOA 2EZ7A 5DSJA 3FW3A 3RYYA 3V3IB 4QJMA 1JV0A 5EHWA 4QIYA 4K1QA 1ZGFA 3B4FA 5DRSA 5FNKA 1FQLA 3M2ZA 4RIUA 3W6HA 4DZ9A 4Q8YA 4E9OX 1HEDA 3F7BA 1G48A 2NWYA 4YXOA 1CNHA 4JSZA 5FLRA 3C7PA 4HF3A 4FVOA 3MHMA 1YDDA 3D93A 4YGKA 1V9IC 2NNOA 3M5TA 1CNKA 1LZVA 1HECA 1XEVA 1Z9YA 4RUYA 3KIGA 4FVNA 4ZX1A 1FR4A 2NN7A 1CCSA 4Q8ZA 4QJOA 1FSQA 3ML5A 5JG3B 1CA2A 4WL4A 3LXEA 4ITPA 4YGNA 2H15A 5IPZA 2GD8A 4ZAOA 4N16A 3DAZA 5DSQA 4KNIA 3HKUA 1UGBA 3RYVB 3CZVA 4XIWA 1BNMA 3KWAA 4ITOA 3RZ7A 3OKVA 1CAHA 1CINA 4MTYA 5E2KA 3M98A 3R17B 1RZCA 5FNIA 5FDCA 1KWQA 3T85A 3S73B 2H4NA 1HEBA 1CAYA 4L5VA 9CA2A 4RUZA 4N0XB 3KONA 4KNNA 2AW1A 5FLSA 4Q7WA 4YGLA 1CVEA 5FNMA 5E2RA 3BL0A 3M67A 1RZAA 5FLQA 4ZWYA 5SZ2A 1FSRA 4Q7PA 3M14A 3T83A 5DVXA 4XFWA 4E49A 1BNWA 3CA2A 3IBIA 3ML2A 1UGAA 3MHCA 5DSOA 3HS4A 5BRVA 1TE3X 3P58A 4FIKA 3IGPA 3DC9A 4XE1A 3RYJB 4WW6A 5A25A 3HFPA 4E3FA 5AMGA 1AZMA 1LGDA 3MNUA 1ZSAA 1OKLA 1CVHA 4KUVA 3QYKA 3MZCA 3MNHA 3OILA 4G7AA 4YGJA 4E3HA 1CVAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4FRC A;  5SZ4 A;  5FL6 A;  3RZ8 A;  2CBC A;  4QSI A;  2QOA A;  4QJ0 A;  2FMG A;  4TWL A;  4LP6 A;  1CNY A;  3PYK A;  1AM6 A;  4Q78 A;  1TTM A;  3N2P A;  3FFP X;  3KNE A;  5E2N A;  3OKU A;  3MHL A;  4WR7 A;  3OIM A;  3OYQ A;  4YYT A;  3DCW A;  1F2W A;  1URT A;  5BRW A;  1G0F A;  4Q87 A;  2ILI A;  5FLT A;  4E3D A;  1CIM A;  3V3J A;  4R59 A;  3EFT A;  1BNU A;  1UGD A;  1UGG A;  3M2X A;  1CVC A;  3N0N A;  4M2V A;  1ZE8 A;  5CA2 A;  1UGF A;  3S97 A;  3V3F A;  3BET A;  4HEZ A;  1IF4 A;  4KAP A;  2Q38 A;  4Q7V A;  3HKT A;  1I90 A;  4Z1N A;  3V7X A;  5JES B;  2FOQ A;  1IF5 A;  3UYN A;  4QTL A;  5FL4 A;  1BIC A;  3OYS A;  2HKK A;  1RZE A;  2VVB X;  4MO8 A;  4WW8 A;  5FLP A;  3MYQ A;  4CNX A;  1I9L A;  2POW A;  3OIK A;  3DC3 A;  3P5A A;  1CIL A;  3SAP A;  2FNK A;  3SAX A;  3W6I A;  4YX4 A;  4CNR A;  3N3J A;  1HCB A;  1Y7W A;  2F14 A;  4ETQ C;  2FOV A;  3MWO A;  3IBL A;  3M1Q A;  4HU1 A;  3DV7 A;  4RIV A;  3M5E A;  1CCU A;  1RAZ A;  4YHA A;  5L3O A;  1OQ5 A;  2WEJ A;  2FMZ A;  1CNJ A;  5DSK A;  4UOV A; 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