3KKXA

Neutron structure of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Neutron structure of human carbonic anhydrase II: implications for proton transfer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3kkxA00
3V7XA 1I91A 4KNJA 1G46A 1XEVA 1CNKA 3LXEA 3V3HB 2H4NA 5SZ2A 4MLXA 4PZHA 4COQA 1RZEA 1H9NA 1G6VA 4JSAA 1CNYA 3HLJA 5CACA 5JEHB 3M5EA 5SZ7A 4QIZA 3HKQA 3F7BA 2NXSA 5EKMA 3RZ0B 4HT0A 3S97A 3M2NA 1CAJA 4CNVA 3V3FA 3TMJA 3DC9A 4Q8YA 1BV3A 3IBUA 5CJFA 3FE4A 2AX2A 1BN1A 4WR7A 4QSAA 1CAYA 4XE1A 3R16A 1AZMA 3CYUA 1IF6A 4Q7WA 5DRSA 2FOSA 5AMDA 1DMYA 4QSIA 2Q1QA 2EZ7A 1I9PA 2ZNCA 2X7SA 4KP8A 3DBUA 4DZ7A 1ZSCA 1I8ZA 5FL6A 4BF6A 3VBDA 1IF4A 3DV7A 2ILIA 3W6IA 2NWZA 3V5GA 4LU3A 4Q08A 3T83A 2O4ZA 4QSBA 3MZCA 4FU5A 1YDDA 4L5WA 4E4AA 2FOYA 4RIVA 1BNQA 2QO8A 5E5RA 7CA2A 1CNCA 1CNJA 2CBAA 3NJ9A 2CABA 4YVYA 3CA2A 4FIKA 4FPTA 3P58A 1CVFA 3MDZA 4HF3A 3S72B 3MHMA 3S73B 3CAJA 4MDGA 5JDVB 1MUAA 3M96A 5BRVA 3UYNA 1BNWA 3S78B 2HOCA 2NNOA 3MNJA 3V2MA 4Q07A 3DCSA 4XZ5A 4Q78A 4QJOA 5EOIA 1CRMA 1ZE8A 2POWA 4K0SA 4JSSA 5EIJA 2NXRA 3U3AX 3D9ZA 4XFWA 1YDAA 3JXGA 5FDIA 4Q7VA 4ITPA 4QK3A 4YXUA 3P55A 4MDLA 1XEGA 1G52A 2FNNA 4Q7PA 4YGFA 3SAPA 2ABEA 3DCWA 4QIYA 3QYKA 5DSRA 3DD0A 2F14A 3IAIA 3DD8A 4Q87A 5C8IA 3HKUA 4HU1A 3N2PA 4G7AA 1J9WA 2WD2A 4KNNA 1RJ6A 1CAHA 1BN3A 5FLRA 1OKLA 2VVBX 5DVXA 1KWQA 3HKTA 9CA2A 2QOAA 5BNLA 4YGKA 4R59A 1CCSA 3S77B 5E5UA 3M14A 5FNJA 3RZ1B 4YGJA 3RZ8A 1FQNA 4QJMA 4HEYA 5SZ3A 5SZ0A 1TG9A 4K0ZA 5JESB 1URTA 4M2VA 2NWPA 1JV0A 1CILA 4UOVA 4XIXA 5FNHA 4CNWA 3OY0A 4QEFA 4ZWYA 4RFCA 4K1QA 1T9NA 5EHWA 1BNUA 2NNVA 3HS4A 4Q0LA 5DSLA 1IF8A 2NMXA 1G48A 3RYJB 4DZ9A 3K7KA 3U45X 3MHLA 3Q31A 1ZH9A 5IPZA 1YO1A 2FOUA 3OYSA 3MHIA 3DC3A 3MNUA 2X7TA 3DA2A 3T82A 5FL5A 1BNMA 1HEDA 4YGLA 5EHVA 3T85A 3MNHA 3M2ZA 4Q09A 3F4XA 1I90A 1RZCA 4Q9YA 5SZ5A 4ZX0A 4HBAA 3S71B 3M04A 1V9IC 4Q83A 5G03A 3KNEA 3M5SA 1I9QA 1CALA 3RJ7A 1BNNA 5FNLA 4CQ0A 1CA3A 3DCCA 3UYQA 3P44A 4N0XB 3V3IB 4TWMA 3T84A 5JGSB 3R17B 1ZGEA 1IF7A 3N0NA 1OKNA 4N16A 5JEPB 4E3DA 1TEUX 5BRWA 5G01A 1CVHA 5JG5B 2AW1A 3BETA 5E2RA 4YXIA 1CNXA 4Q6EA 5DSIA 3OIKA 1CAIA 1CANA 3D8WA 3KLDB 1JCZA 4MTYA 5SZ6A 1HCAA 4E9OX 2OSMA 3P4VA 3M1QA 4Q99A 3IGPA 5CLUA 3KIGA 4K0TA 3P3HA 2GD8A 5DSPA 1LUGA 3B1BA 3TVOX 3HFPA 1UGEA 1UGAA 3DVDA 1CNIA 3DVCA 4RUYA 4R5AA 1G4OA 1YDBA 2FNMA 5EH7A 1BNTA 3IBLA 4FL7A 5G0CA 2NWOA 3S76A 4HEZA 1CIMA 4WUQA 4Q81A 5L6KA 1OKMA 4MLTA 5BRUA 3SAXA 3EFIA 1MOOA 5FLQA 1Z9YA 5FLTA 5FLOA 3M67A 1H4NA 5SZ4A 5DSMA 3JXHC 4JSWA 3MHCA 3FFPX 4Z1EA 3IBNA 3OKVA 1FLJA 4MDMA 5FNGA 1CRAA 1CVBA 4PXXA 1CAKA 5DSKA 4WL4A 4HT2A 1DCAA 3P3JA 5G0BA 2FMZA 2HL4A 5A25A 1XQ0A 5FL4A 1LG6A 5DOGA 3MNKA 1CNGA 1OQ5A 1CVAA 2NN1A 3PO6A 4Z0QA 3TVNX 1Z97A 3MNIA 3P5AA 3T5UA 3V2JA 3V3JA 4E5QA 5EH8A 4Y0JA 4ETQC 4Z1NA 2Q1BA 3ZNCA 5FNMA 1JD0A 2FMGA 4IWZA 4Q8ZA 3RYYA 4Q90A 4YYTA 2NNGA 3JXFA 3IBIA 1I9LA 1THKA 3B4FA 1ZSAA 3D93A 3MMFA 4M2UA 3N3JA 3DVBA 3BL1A 4CNRA 1HECA 5FLPA 1RJ5A 4E3FA 4PYXA 3RG3A 2FW4A 2NXTA 4CA2A 1CAMA 4YGNA 4BCWA 5AMLA 5EKHA 1DMXA 4QK2A 1FSRA 2EU2A 4XIWA 1Z93A 4KNIA 4QJPA 4GL1X 4WW8A 2Q38A 1HEBA 3SBIA 4IDRX 5EKJA 1CINA 1G1DA 1ZSBA 2WEOA 1HUGA 2H15A 2VVAX 3IEOA 2EU3A 5AMGA 5L3OA 1YO2A 5DSJA 3KS3A 1CNWA 1TB0X 3RYVB 1CVCA 1G0FA 1HUHA 2CBCA 3KONA 3SBHA 3KKXA 3ML5A 3ZP9A 1H9QA 2CBDA 4Z1KA 3RGEA 1LGDA 1HEAA 2CA2A 3M2YA 1UGDA 3MYQA 1G3ZA 3NB5A 1CZMA 5FNIA 5FDCA 4ZWXA 1FQLA 1LG5A 2POVA 2CBEA 3S9TA 1HCBA 5JQ0A 4KV0A 4KUYA 4LP6A 2CBBA 1BZMA 2NN7A 1TTMA 5BYIA 3L14A 5HPJA 4ITOA 4Q06A 4LHIA 1G45A 2QP6A 1FR4A 5EH5A 1CNHA 4WUPA 5DSQA 4Q49A 3RZ7A 5E28A 3PYKA 4JS6A 1FQMA 4KAPA 5E2SA 3RZ5A 4ZX1A 4KNMA 4KUWA 1RZDA 4FVNA 1UGGA 1BN4A 4ZWIA 1TBTX 2NNSA 3D0NA 3KWAA 3GZ0A 3U47A 1YDCA 3BL0A 4KP5A 4QSJA 4QJXA 1V9EA 3F7UA 3S8XA 12CAA 3D92A 1CVDA 5A6HA 4YXOA 4ZAOA 1G53A 4QJ0A 4L5UA 4PYYA 1F2WA 2FOQA 1TE3X 1UGBA 1G0EA 3OIMA 5EZTX 3U7CA 5JEGB 3M1KA 4MO8A 1CCTA 4Q7SA 1BICA 4M2RA 1ZNCA 1HVAA 4BF1A 2HKKA 3RYZA 2HFWA 5DSNA 1BCDA 4E49A 5E2NA 4YX4A 5DSOA 4C3TA 3T5ZA 4ZWZA 5FLSA 3KOIA 2WEJA 4HEWA 4QY3A 4CNXA 1CA2A 4RFDA 1CCUA 4L5VA 4RUXA 1TG3A 1KOQA 2GEHA 4X5SA 1DCBA 5CA2A 4RN4A 1FQRA 1ZGFA 2NWYA 3M98A 5FNKA 2POUA 1IF9A 8CA2A 3M40A 1RZAA 4ILXA 4QTLA 2WEHA 4YHAA 4QJWA 3MWOA 3RYXB 2OSFA 2FOVA 1UGCA 4RUZA 3RG4A 5EHEA 1TH9A 1CAZA 4Q8XA 6CA2A 3FW3A 4E3HA 1I9NA 3RLDA 1EOUA 3V3GB 1KEQA 1I9OA 1RZBA 3ML2A 4QK1A 5DOHA 1IF5A 3W6HA 2FNKA 5E2KA 2W2JA 1G54A 1FSQA 4YWPA 3MHOA 1UGFA 4WW6A 5LMDA 3C7PA 3OYQA 3S74B 5JQTA 4Z1JA 4M2WA 1RAYA 1TEQX 2WD3A 1AM6A 1XPZA 4RIUA 3M5TA 3P5LA 3OKUA 1BNVA 1YO0A 4RH2A 4PQ7A 1FR7A 3K2FA 2IT4A 4Q6DA 3DAZA 3HKNA 3KOKA 4KUVA 2WEGA 3MNAA 4FVOA 3M1WA 1RAZA 1CVEA 1Y7WA 1G4JA 1ZFKA 4K13A 1AVNA 5JGTB 1CNBA 4TWLA 3M2XA 3NI5A 3F8EA 3PJJA 4R5BA 4E3GA 4FRCA 3M3XA 4JSZA 5SZ1A 5JG3B 3N4BA 1CAOA 2HD6A 1KWRA 3K34A 3CZVA 3EFTA 3OILA 1KOPA 3M1JA 3S75B 2HNCA 1FSNA 1ZFQA 4CACA 4G0CA 1A42A 5J8ZA 2X7UA 1LZVA 5E2MA 1I9MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3V7X A;  1I91 A;  4KNJ A;  1G46 A;  1XEV A;  1CNK A;  3LXE A;  3V3H B;  2H4N A;  5SZ2 A;  4MLX A;  4PZH A;  4COQ A;  1RZE A;  1H9N A;  1G6V A;  4JSA A;  1CNY A;  3HLJ A;  5CAC A;  5JEH B;  3M5E A;  5SZ7 A;  4QIZ A;  3HKQ A;  3F7B A;  2NXS A;  5EKM A;  3RZ0 B;  4HT0 A;  3S97 A;  3M2N A;  1CAJ A;  4CNV A;  3V3F A;  3TMJ A;  3DC9 A;  4Q8Y A;  1BV3 A;  3IBU A;  5CJF A;  3FE4 A;  2AX2 A;  1BN1 A;  4WR7 A;  4QSA A;  1CAY A;  4XE1 A;  3R16 A;  1AZM A;  3CYU A;  1IF6 A;  4Q7W A;  5DRS A;  2FOS A;  5AMD A;  1DMY A;  4QSI A;  2Q1Q A;  2EZ7 A;  1I9P A;  2ZNC A;  2X7S A;  4KP8 A;  3DBU A;  4DZ7 A;  1ZSC A;  1I8Z A;  5FL6 A;  4BF6 A;  3VBD A;  1IF4 A;  3DV7 A;  2ILI A;  3W6I A;  2NWZ A;  3V5G A;  4LU3 A;  4Q08 A;  3T83 A;  2O4Z A;  4QSB A;  3MZC A;  4FU5 A;  1YDD A;  4L5W A;  4E4A A;  2FOY A;  4RIV A;  1BNQ A;  2QO8 A;  5E5R A;  7CA2 A;  1CNC A;  1CNJ A;  2CBA A;  3NJ9 A;  2CAB A;  4YVY A;  3CA2 A;  4FIK A;  4FPT A;  3P58 A;  1CVF A;  3MDZ A;  4HF3 A;  3S72 B;  3MHM A;  3S73 B;  3CAJ A;  4MDG A;  5JDV B; 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