3M67 | Genus

Total Genus 75

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	75
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__8387563512151335__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__8387563512151335__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3M67/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__8387563512151335__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"8387563512151335","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3M67/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__8387563512151335__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

Viewer cachePut cache://localLOAD_/file/5cff870cfb712924d8cd60fb/pdb.gz

Viewer cachePut https://genus.fuw.edu.pl/file/5cff870cfb712924d8cd60fb/pdb.gz

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Indapamide-like benzenesulfonamides as inhibitors of carbonic anhydrases I, II, VII, and XIII pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	75
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2010-03-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3m67A00

1YO2A 5EHVA 1CILA 4K0TA 4Z1JA 3HFPA 4E3HA 3M5SA 4E9OX 1RZDA 3CYUA 4ZX1A 5E2NA 1BNTA 1UGBA 1V9IC 1Z97A 3N2PA 1HUHA 3SBIA 3KOIA 1HEBA 4JSZA 3M1KA 3M1JA 3M5EA 1I91A 2NNVA 3U3AX 2VVAX 3DAZA 1I8ZA 4Q81A 4YGKA 1CVFA 3M40A 5BRUA 1CAJA 4R5AA 1CAHA 1RZAA 2ABEA 3T83A 2F14A 4WUQA 3P3HA 3K7KA 3U47A 5FDIA 1G52A 4Q78A 4C3TA 3MNAA 1RZBA 4BF6A 3M2ZA 3RYZA 5G0CA 5JG5B 1G46A 3U45X 5SZ3A 4CNRA 3DV7A 1YO0A 4X5SA 2ZNCA 1DCAA 2QP6A 3P5AA 5G03A 1BNQA 1CAKA 4FL7A 1BNUA 5JGSB 1YDAA 1G0EA 1FQRA 4QSJA 5DOHA 3KWAA 3F7UA 5E2SA 3MZCA 4CACA 3OY0A 3OIKA 4DZ9A 3M5TA 4YX4A 1ZFKA 3TMJA 1G1DA 5G0BA 3HKQA 3N3JA 3KLDB 4HF3A 3S75B 2NNSA 3DC9A 2NN1A 4L5VA 3F7BA 3C7PA 4MLTA 4PYYA 5EH7A 3R17B 5CJFA 4ITPA 3MNIA 3SBHA 1I9MA 2AW1A 1BCDA 4KNMA 3MMFA 1DCBA 1MOOA 4LU3A 1UGEA 5FL5A 4PYXA 3M2NA 2O4ZA 2HFWA 4KUYA 3LXEA 5FNMA 1TG9A 5DOGA 5DSKA 5LMDA 4ZWZA 1LG5A 4YGLA 3DD8A 1CVDA 4UOVA 3OKVA 1AM6A 4RUYA 5E28A 3T5ZA 7CA2A 4MO8A 5EKMA 4K0SA 3IEOA 5EIJA 1ZGEA 4KP5A 4Q7SA 2POUA 5SZ2A 3S97A 2OSMA 1CNYA 4Z1NA 1XQ0A 4K13A 4QJXA 1G0FA 3RGEA 2CBBA 3RYYA 1CNGA 4BF1A 3M67A 1Z93A 5EKJA 3M04A 1IF4A 1LUGA 3CAJA 3RZ1B 4Q6DA 4Q90A 3RZ5A 2NWPA 3PYKA 4CNXA 2POWA 3MHIA 4RUZA 1RAYA 3MHOA 4YWPA 4YXIA 5BRVA 4RUXA 5FLQA 4PQ7A 3IBLA 4E3GA 1I9LA 1I9PA 2WEOA 5E2RA 4LP6A 1BN3A 4XE1A 3T84A 5FL4A 1CCSA 5EH5A 4LHIA 3P55A 4HEZA 1G4OA 4E3FA 4KV0A 2OSFA 3RZ0B 2X7SA 5FL6A 4G7AA 1KOPA 4L5UA 1CNHA 4QJMA 5FNLA 3N0NA 4R5BA 5A6HA 1BN1A 1XEVA 4Q8ZA 4GL1X 1YDCA 3BL1A 1HUGA 1XPZA 1UGCA 4FPTA 4Q99A 3MHLA 1CA3A 4QJPA 3S74B 3P4VA 3FE4A 1ZGFA 1RJ5A 3P44A 5E2MA 1FQMA 1LZVA 1J9WA 2EZ7A 1CCTA 3S9TA 1I9QA 4ITOA 5SZ7A 3TVNX 3U7CA 1FLJA 1CAZA 3PJJA 4CNWA 4QK1A 4FRCA 1ZFQA 4CQ0A 1THKA 4QSBA 4RIVA 4E5QA 1UGAA 4ILXA 2FOUA 1H9NA 2NMXA 1IF5A 1HVAA 4MLXA 3M2XA 3D0NA 3BL0A 1RJ6A 5DSMA 3RJ7A 4HT2A 2FNKA 4WL4A 4YHAA 2HL4A 1TE3X 3T82A 1YO1A 3V3GB 4HEWA 1TH9A 1TEUX 3RYVB 4WUPA 1KWQA 5BYIA 3S71B 2FOVA 5FLSA 3DC3A 1CVHA 2FOQA 4RN4A 3V5GA 6CA2A 4CNVA 1CINA 3BETA 4Q06A 1JD0A 3HKUA 3UYQA 8CA2A 3M96A 5DSRA 1ZE8A 3KKXA 4XFWA 5A25A 5JEGB 1FSRA 2X7TA 3KNEA 1XEGA 3FW3A 4PXXA 4L5WA 3VBDA 5DSPA 3DVBA 1V9EA 3V3FA 12CAA 1YDBA 3RG3A 4MDLA 4Q7VA 4QTLA 4M2RA 3NB5A 1CNBA 3S72B 2CBDA 5DSIA 1KWRA 3DA2A 2EU3A 2H15A 3EFTA 3K34A 3M1WA 9CA2A 2H4NA 1ZSAA 5DSQA 2GEHA 2NNGA 4N16A 3MHCA 2AX2A 3TVOX 3MYQA 4Q07A 3F8EA 2NNOA 3KONA 5JEHB 5JGTB 5L3OA 1TTMA 4G0CA 1ZSCA 4Y0JA 4QJWA 1BNMA 5DSOA 4YGNA 3QYKA 1CNCA 1BV3A 3RG4A 1RZEA 2NXTA 1IF9A 3RYJB 4KUVA 1KEQA 1CNJA 5EZTX 3K2FA 4QIYA 1AZMA 3M2YA 3M1QA 2NXRA 1I90A 1ZH9A 4RFCA 5C8IA 3KOKA 1FSQA 1H9QA 2HKKA 4MDMA 4KNIA 2WEHA 2X7UA 3MWOA 3Q31A 5FDCA 4Q0LA 4QIZA 3IBUA 2IT4A 3RLDA 4Z1EA 3MNHA 4YVYA 2NXSA 3M3XA 2CA2A 5BRWA 1CAOA 4YGJA 3RYXB 1EOUA 4M2UA 2WD2A 5DRSA 2GD8A 5G01A 4RFDA 3IBNA 4MDGA 4E49A 5FNHA 4CA2A 1OKMA 4YXUA 2CBEA 4QSAA 5FNGA 1CNIA 4QEFA 4IWZA 1I9NA 4Q08A 4COQA 3ML2A 5HPJA 1G4JA 1CRMA 1CA2A 4Q7PA 4Q9YA 4KAPA 4R59A 4ZWYA 5E5RA 3UYNA 3B1BA 3ZNCA 4FU5A 1JV0A 3V3HB 1CVAA 5SZ0A 4M2VA 2WEGA 4K1QA 3V3JA 1FR4A 3S78B 5EKHA 3B4FA 4M2WA 5DVXA 1IF7A 2NWYA 3P58A 5FLPA 1CAMA 1CNKA 1CAIA 4RIUA 1UGFA 1DMXA 5E2KA 4Q83A 4N0XB 4JSAA 2HD6A 5JEPB 5AMGA 3KS3A 2FOSA 4FVNA 5JG3B 3FFPX 4JSSA 1CVBA 1H4NA 2NN7A 5JQ0A 4QY3A 1IF6A 3V7XA 1G6VA 4HT0A 3DBUA 2WD3A 3D92A 5JESB 4Z1KA 5AMDA 1Z9YA 4YXOA 3V2JA 2QO8A 1DMYA 1TB0X 2Q1BA 4IDRX 2Q1QA 3HLJA 4ZX0A 1CAYA 3HS4A 1G53A 1FSNA 1CVEA 4Q8XA 2FNMA 1HCAA 3F4XA 5CLUA 3D93A 5SZ6A 3CZVA 3V2MA 2HNCA 1I9OA 1HEAA 5IPZA 1FR7A 3KIGA 5SZ1A 1CZMA 1CANA 3HKNA 4Q6EA 4QK3A 4ZWXA 5FLTA 3IGPA 2FMGA 2FNNA 1CRAA 3CA2A 1F2WA 5DSLA 1MUAA 4WW6A 1YDDA 4PZHA 5FNIA 3OKUA 1CCUA 2FW4A 1AVNA 1G45A 3W6HA 3ML5A 5EOIA 1JCZA 4Q8YA 4XIWA 3DVDA 3S73B 1UGDA 4KP8A 1BICA 2ILIA 1T9NA 2HOCA 5CACA 2CBCA 1HECA 5EHWA 3GZ0A 4JS6A 1HCBA 1BNWA 3DD0A 4QJ0A 4QSIA 4HU1A 3P3JA 4QJOA 4WR7A 2FMZA 4ETQC 4FVOA 3MHMA 3IBIA 1Y7WA 2NWOA 5BNLA 3DCCA 5DSJA 5JDVB 5E5UA 2CBAA 3W6IA 1OKNA 3M98A 3MDZA 4Z0QA 3S76A 4Q7WA 5CA2A 1FQNA 1OKLA 1ZSBA 2EU2A 3R16A 3EFIA 1CNWA 4YYTA 1A42A 3JXFA 4JSWA 3T5UA 3OIMA 3OYQA 1URTA 1HEDA 1TBTX 1BNNA 4RH2A 3JXGA 3MNUA 1RAZA 4HBAA 4K0ZA 3SAXA 2NWZA 4QK2A 4E4AA 4YGFA 3L14A 3T85A 5AMLA 3PO6A 5FNKA 3M14A 5DSNA 2POVA 4KUWA 5J8ZA 1LGDA 3NI5A 3N4BA 1G54A 1CALA 3MNKA 2Q38A 3RZ8A 5L6KA 1CNXA 2WEJA 1CIMA 3JXHC 4TWLA 3D9ZA 3DCWA 1RZCA 1BZMA 1BNVA 4ZAOA 1OQ5A 3OILA 3ZP9A 1G3ZA 5EHEA 4HEYA 4DZ7A 5EH8A 5SZ4A 2FOYA 5SZ5A 4ZWIA 1CVCA 4BCWA 4XIXA 3D8WA 3P5LA 3OYSA 1BN4A 1UGGA 5FLOA 3SAPA 4Q09A 4Q87A 3S77B 1FQLA 2QOAA 2CABA 4KNJA 1TG3A 4FIKA 1G48A 2W2JA 1ZNCA 3NJ9A 5FLRA 1LG6A 3HKTA 4Q49A 3MNJA 4MTYA 3V3IB 3DVCA 1KOQA 4XZ5A 5JQTA 3S8XA 4TWMA 3RZ7A 3IAIA 1TEQX 3DCSA 5FNJA 4E3DA 2VVBX 4WW8A 1IF8A 4KNNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YO2 A;  5EHV A;  1CIL A;  4K0T A;  4Z1J A;  3HFP A;  4E3H A;  3M5S A;  4E9O X;  1RZD A;  3CYU A;  4ZX1 A;  5E2N A;  1BNT A;  1UGB A;  1V9I C;  1Z97 A;  3N2P A;  1HUH A;  3SBI A;  3KOI A;  1HEB A;  4JSZ A;  3M1K A;  3M1J A;  3M5E A;  1I91 A;  2NNV A;  3U3A X;  2VVA X;  3DAZ A;  1I8Z A;  4Q81 A;  4YGK A;  1CVF A;  3M40 A;  5BRU A;  1CAJ A;  4R5A A;  1CAH A;  1RZA A;  2ABE A;  3T83 A;  2F14 A;  4WUQ A;  3P3H A;  3K7K A;  3U47 A;  5FDI A;  1G52 A;  4Q78 A;  4C3T A;  3MNA A;  1RZB A;  4BF6 A;  3M2Z A;  3RYZ A;  5G0C A;  5JG5 B;  1G46 A;  3U45 X;  5SZ3 A;  4CNR A;  3DV7 A;  1YO0 A;  4X5S A;  2ZNC A;  1DCA A;  2QP6 A;  3P5A A;  5G03 A;  1BNQ A;  1CAK A;  4FL7 A;  1BNU A;  5JGS B;  1YDA A;  1G0E A;  1FQR A;  4QSJ A;  5DOH A;  3KWA A;  3F7U A;  5E2S A;  3MZC A;  4CAC A;  3OY0 A;  3OIK A;  4DZ9 A;  3M5T A;  4YX4 A;  1ZFK A;  3TMJ A;  1G1D A;  5G0B A;  3HKQ A;  3N3J A;  3KLD B;  4HF3 A;  3S75 B;  2NNS A;  3DC9 A;  2NN1 A;  4L5V A;  3F7B A;  3C7P A;  4MLT A;  4PYY A;  5EH7 A;  3R17 B;  5CJF A;  4ITP A;  3MNI A;  3SBH A;  1I9M A;  2AW1 A;  1BCD A;  4KNM A;  3MMF A;  1DCB A;  1MOO A;  4LU3 A;  1UGE A;  5FL5 A;  4PYX A;  3M2N A;  2O4Z A;  2HFW A;  4KUY A;  3LXE A;  5FNM A;  1TG9 A;  5DOG A;  5DSK A;  5LMD A;  4ZWZ A;  1LG5 A;  4YGL A;  3DD8 A;  1CVD A;  4UOV A;  3OKV A;  1AM6 A;  4RUY A;  5E28 A;  3T5Z A;  7CA2 A;  4MO8 A;  5EKM A;  4K0S A;  3IEO A;  5EIJ A;  1ZGE A;  4KP5 A;  4Q7S A;  2POU A;  5SZ2 A;  3S97 A;  2OSM A;  1CNY A;  4Z1N A;  1XQ0 A;  4K13 A;  4QJX A;  1G0F A;  3RGE A;  2CBB A;  3RYY A;  1CNG A;  4BF1 A;  3M67 A;  1Z93 A;  5EKJ A;  3M04 A;  1IF4 A;  1LUG A;  3CAJ A;  3RZ1 B;  4Q6D A;  4Q90 A;  3RZ5 A;  2NWP A;  3PYK A;  4CNX A;  2POW A;  3MHI A;  4RUZ A;  1RAY A;  3MHO A;  4YWP A;  4YXI A;  5BRV A;  4RUX A;  5FLQ A;  4PQ7 A;  3IBL A;  4E3G A;  1I9L A;  1I9P A;  2WEO A;  5E2R A;  4LP6 A;  1BN3 A;  4XE1 A;  3T84 A;  5FL4 A;  1CCS A;  5EH5 A;  4LHI A;  3P55 A;  4HEZ A;  1G4O A;  4E3F A;  4KV0 A;  2OSF A;  3RZ0 B;  2X7S A;  5FL6 A;  4G7A A;  1KOP A;  4L5U A;  1CNH A;  4QJM A;  5FNL A;  3N0N A;  4R5B A;  5A6H A;  1BN1 A;  1XEV A;  4Q8Z A;  4GL1 X;  1YDC A;  3BL1 A;  1HUG A;  1XPZ A;  1UGC A;  4FPT A;  4Q99 A;  3MHL A;  1CA3 A;  4QJP A;  3S74 B;  3P4V A;  3FE4 A;  1ZGF A;  1RJ5 A;  3P44 A;  5E2M A;  1FQM A;  1LZV A;  1J9W A;  2EZ7 A;  1CCT A;  3S9T A;  1I9Q A;  4ITO A;  5SZ7 A;  3TVN X;  3U7C A;  1FLJ A;  1CAZ A;  3PJJ A;  4CNW A;  4QK1 A;  4FRC A;  1ZFQ A;  4CQ0 A;  1THK A;  4QSB A;  4RIV A;  4E5Q A;  1UGA A;  4ILX A;  2FOU A;  1H9N A;  2NMX A;  1IF5 A;  1HVA A;  4MLX A;  3M2X A;  3D0N A;  3BL0 A;  1RJ6 A;  5DSM A;  3RJ7 A;  4HT2 A;  2FNK A;  4WL4 A;  4YHA A;  2HL4 A;  1TE3 X;  3T82 A;  1YO1 A;  3V3G B;  4HEW A;  1TH9 A;  1TEU X;  3RYV B;  4WUP A;  1KWQ A;  5BYI A;  3S71 B;  2FOV A;  5FLS A;  3DC3 A;  1CVH A;  2FOQ A;  4RN4 A;  3V5G A;  6CA2 A;  4CNV A;  1CIN A;  3BET A;  4Q06 A;  1JD0 A;  3HKU A;  3UYQ A;  8CA2 A;  3M96 A;  5DSR A;  1ZE8 A;  3KKX A;  4XFW A;  5A25 A;  5JEG B;  1FSR A;  2X7T A;  3KNE A;  1XEG A;  3FW3 A;  4PXX A;  4L5W A;  3VBD A;  5DSP A;  3DVB A;  1V9E A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3M67A

Total Genus

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Chain Sequence

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