3M96A

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 5-{[(5-bromo-1h-benzimidazol-2-yl)sulfanyl]acetyl}-2-chlorobenzenesulfonamide
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Indapamide-like benzenesulfonamides as inhibitors of carbonic anhydrases I, II, VII, and XIII.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3m96A00
2X7UA 3MYQA 4E3FA 1I8ZA 4L5VA 4R5BA 4DZ7A 3MNJA 5JDVB 1RZBA 4ZAOA 5FNJA 3UYQA 5SZ7A 1CVFA 1G3ZA 3S77B 1FQMA 1IF9A 3OYSA 3P4VA 3OYQA 3M14A 3KS3A 5JEPB 3M3XA 1LG6A 1URTA 4CACA 4CA2A 4QY3A 5DSNA 5DSIA 4WR7A 1JV0A 4Q06A 5FNGA 1YDAA 2CABA 4Z1EA 1HUGA 3RLDA 1TEUX 4R59A 4KV0A 1CZMA 3RZ7A 3S9TA 3JXFA 5BYIA 3IBIA 4HT2A 4RFCA 1T9NA 5FL4A 1UGFA 1CILA 1FQNA 5JEGB 3M1WA 5FDCA 3K7KA 3JXHC 1HECA 4QSAA 3IGPA 3SAXA 5E2RA 1CVDA 3KOKA 3P44A 4KNIA 3V3GB 1I9NA 1UGGA 1KEQA 4YGLA 1XPZA 4YYTA 4ZWYA 5AMDA 3NI5A 2FNKA 2OSFA 4Z1NA 4WW6A 4YXUA 2POVA 4Q90A 3OKUA 3R17B 2Q1QA 3MMFA 5DSLA 4YHAA 5CA2A 3VBDA 4KUWA 5G0BA 3RZ8A 1BICA 1CNKA 4K0SA 3HS4A 1CVEA 1CRMA 5EHWA 1CVBA 5FLRA 1CIMA 4FVOA 4UOVA 1TE3X 1IF6A 3OKVA 5EH7A 1UGCA 3KOIA 4FU5A 4RUYA 5FL5A 2FOVA 5DRSA 4MDLA 4ITPA 4LU3A 3RJ7A 3P55A 4DZ9A 4MDGA 5CJFA 4Q09A 3S74B 3KNEA 1CAYA 3DV7A 5E5RA 1G6VA 3K34A 3DCWA 1CAKA 3IBUA 5E2NA 1G0FA 1HVAA 4HBAA 1HEAA 4KAPA 3MNIA 4FVNA 5EZTX 5C8IA 2CBCA 4L5WA 4WUQA 1G0EA 1KOPA 2GD8A 5JEHB 1FSQA 3D93A 3T84A 4CNVA 4E3HA 1XEVA 4QJOA 3V7XA 3OILA 3F8EA 2FMZA 5EH5A 3DAZA 4Q8XA 3HFPA 4WUPA 4E4AA 2HD6A 2QOAA 3M2YA 4XZ5A 4YXOA 4IWZA 1YO1A 7CA2A 5SZ2A 4K1QA 3N2PA 1G53A 2Q38A 3T5UA 3V2MA 2NMXA 4YGJA 1RZEA 4PYXA 3T82A 3M5EA 1I91A 1F2WA 5SZ3A 1YDCA 4Q07A 9CA2A 3IEOA 3UYNA 4YGFA 1ZSCA 1CRAA 2POUA 3OIKA 1BNMA 1G4JA 5FNLA 4CNXA 4RIUA 3RGEA 5EHEA 2NXSA 1H9QA 2WD3A 4LHIA 1CAIA 1BCDA 1BNUA 5JESB 2X7TA 1TB0X 4FIKA 2WEJA 2QP6A 1DCAA 4ZWIA 2NWOA 1FQRA 1ZGFA 4QSIA 8CA2A 3U7CA 4BF6A 2HKKA 4YX4A 1FLJA 4QIZA 1CCSA 4Q99A 5IPZA 5L3OA 5G03A 3V2JA 5L6KA 3M2ZA 1I9QA 3MNAA 5FLSA 1CALA 5DSQA 2GEHA 3M67A 5BRVA 4KNNA 1AM6A 4XIWA 5AMLA 5SZ4A 5AMGA 2NNGA 1G54A 2ILIA 4ITOA 3HKUA 4M2VA 4JSAA 3M96A 3R16A 2W2JA 4QJPA 3S78B 4ZX1A 3V3IB 1HEBA 1UGEA 2HFWA 3M04A 5DSKA 3W6HA 1UGBA 1BNNA 5SZ6A 4QEFA 4YGKA 1BNWA 4TWMA 5A25A 1G52A 3TVNX 1ZSBA 4YWPA 1RAZA 4Q6EA 5FDIA 4QSBA 4Z1JA 1OQ5A 4ZWZA 3RYXB 4BCWA 5E2MA 2NNOA 4QK3A 2NWZA 5CACA 1I9MA 3T5ZA 1I9LA 4Z1KA 3RYZA 4L5UA 3P5AA 3NB5A 1FR7A 3FFPX 4WW8A 4E9OX 1G1DA 1TTMA 1RAYA 1A42A 3DA2A 3GZ0A 3PO6A 3S75B 1IF4A 2ZNCA 4Q7WA 1KWQA 4Q8YA 3IAIA 4JSZA 1CNYA 1TBTX 5JQTA 1BNTA 2NXRA 4E3DA 4BF1A 5JG5B 3DCSA 1CANA 1XEGA 1OKLA 3CZVA 5FNHA 1CAMA 1J9WA 2NNVA 3D8WA 3KWAA 3DBUA 3V3HB 5JGSB 3S76A 1Z9YA 2FW4A 4ILXA 4CQ0A 1BZMA 1CVCA 2AX2A 1HUHA 5FNMA 3MHOA 4YVYA 4YXIA 2FOQA 4ETQC 2H15A 1CAJA 5FNKA 3RYVB 2AW1A 4M2WA 1ZFQA 3DVDA 5JQ0A 3MNKA 3HKTA 4N16A 2NXTA 3D9ZA 4IDRX 3HKQA 3M2NA 3M2XA 4LP6A 2FOSA 3KIGA 4Q6DA 1AZMA 3MHLA 1BN3A 4Q83A 1UGDA 1HCBA 4Q7VA 3M5TA 4KUVA 2Q1BA 5E5UA 2NWPA 2IT4A 2CBDA 1FSNA 1DCBA 2HNCA 3OIMA 3P3HA 4Q78A 5EKMA 3MNUA 1CNCA 1G46A 1MUAA 3P3JA 3P5LA 3DVBA 4QK2A 3LXEA 4CNWA 1ZNCA 3ML2A 3DD0A 4N0XB 4FRCA 4RUXA 1ZH9A 2F14A 3F7BA 1IF5A 5FNIA 5DSOA 1ZGEA 1BN1A 3M98A 5EOIA 3S8XA 5JG3B 5HPJA 1CVAA 1CVHA 4JS6A 3MDZA 1CNHA 1CNJA 4G0CA 1DMYA 4Y0JA 1FSRA 1RZDA 5BRWA 3C7PA 4KUYA 1TG9A 3S71B 5DOGA 1LGDA 1UGAA 4QJMA 3U45X 1BV3A 1CCTA 3NJ9A 1CNIA 5G01A 5FL6A 1TEQX 3M1JA 5CLUA 5E2KA 4E3GA 3KKXA 4XFWA 4HU1A 3P58A 3L14A 1JD0A 3D0NA 5A6HA 4MLTA 4QTLA 1V9IC 5FLOA 1V9EA 3M1KA 3FE4A 4QIYA 1MOOA 3IBLA 3PYKA 4HF3A 2O4ZA 4FL7A 4RFDA 1FQLA 4FPTA 5SZ5A 2H4NA 3S73B 4Q0LA 3W6IA 4C3TA 4K0TA 1IF8A 1G48A 4HEZA 3EFIA 1ZE8A 5SZ1A 1G45A 4Q8ZA 3M5SA 3OY0A 1CNBA 1CAHA 3B1BA 3V3JA 3DCCA 2VVBX 1RJ6A 4MTYA 4Q87A 3RZ1B 1H4NA 1CAZA 4MDMA 4K0ZA 3MZCA 2WEGA 4M2UA 4ZX0A 3K2FA 5SZ0A 5DVXA 3DC3A 3CAJA 4Q7PA 1CA2A 1CNXA 2NN1A 5BRUA 1YO2A 2FNNA 2CBAA 4Q9YA 4ZWXA 5JGTB 1YDDA 3MHCA 3TVOX 4RN4A 1DMXA 2NWYA 3DVCA 3JXGA 4R5AA 3M1QA 4K13A 1IF7A 4YGNA 1THKA 5DSJA 1H9NA 2WEHA 2POWA 2WEOA 1EOUA 3V3FA 3ZP9A 1BN4A 3QYKA 3BL0A 1CA3A 3MWOA 3S72B 4RUZA 3CYUA 4G7AA 4QJWA 1Z97A 1I9PA 3RZ0B 3BETA 3DC9A 1Y7WA 2FNMA 3MHIA 3N3JA 2EZ7A 1CAOA 4Q08A 3F4XA 4KNJA 4GL1X 3KLDB 3SBHA 4QK1A 5EHVA 5EIJA 4JSWA 4E5QA 4QJ0A 5LMDA 4PQ7A 3RYJB 5DSMA 3ML5A 4PYYA 4Q49A 3RG4A 3HLJA 3SBIA 2OSMA 3T83A 3MNHA 4Q7SA 2EU3A 1TH9A 4HEYA 2CBBA 4PZHA 1OKNA 5E2SA 1Z93A 1CNWA 3FW3A 5FLQA 3CA2A 2EU2A 1TG3A 4RIVA 5DSPA 5EH8A 1CCUA 4COQA 1JCZA 4RH2A 1HCAA 5EKHA 1LZVA 4Z0QA 3PJJA 2ABEA 4KP5A 3RYYA 1G4OA 3KONA 2X7SA 4X5SA 1HEDA 3MHMA 4QSJA 3F7UA 3HKNA 3EFTA 1YO0A 1I90A 4JSSA 5FLPA 1I9OA 4E49A 3SAPA 3T85A 6CA2A 1XQ0A 2HL4A 3U3AX 4MO8A 2NNSA 1AVNA 4KP8A 1RZCA 3M40A 2FOUA 4QJXA 3TMJA 4TWLA 3Q31A 3ZNCA 1OKMA 3U47A 2QO8A 3DD8A 1KOQA 3N4BA 2CBEA 1LUGA 1RZAA 1ZFKA 2WD2A 3RG3A 1CINA 4Q81A 12CAA 5E28A 2VVAX 3RZ5A 3IBNA 4XIXA 5FLTA 5G0CA 4M2RA 4PXXA 1KWRA 4KNMA 3B4FA 2FMGA 4HEWA 1ZSAA 4CNRA 4MLXA 5DSRA 4WL4A 3V5GA 1RJ5A 1FR4A 2FOYA 4HT0A 3D92A 3N0NA 5EKJA 2HOCA 2NN7A 5DOHA 2CA2A 1CNGA 1BNVA 5J8ZA 5BNLA 1BNQA 1LG5A 3S97A 3BL1A 4XE1A 1YDBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2X7U A;  3MYQ A;  4E3F A;  1I8Z A;  4L5V A;  4R5B A;  4DZ7 A;  3MNJ A;  5JDV B;  1RZB A;  4ZAO A;  5FNJ A;  3UYQ A;  5SZ7 A;  1CVF A;  1G3Z A;  3S77 B;  1FQM A;  1IF9 A;  3OYS A;  3P4V A;  3OYQ A;  3M14 A;  3KS3 A;  5JEP B;  3M3X A;  1LG6 A;  1URT A;  4CAC A;  4CA2 A;  4QY3 A;  5DSN A;  5DSI A;  4WR7 A;  1JV0 A;  4Q06 A;  5FNG A;  1YDA A;  2CAB A;  4Z1E A;  1HUG A;  3RLD A;  1TEU X;  4R59 A;  4KV0 A;  1CZM A;  3RZ7 A;  3S9T A;  3JXF A;  5BYI A;  3IBI A;  4HT2 A;  4RFC A;  1T9N A;  5FL4 A;  1UGF A;  1CIL A;  1FQN A;  5JEG B;  3M1W A;  5FDC A;  3K7K A;  3JXH C;  1HEC A;  4QSA A;  3IGP A;  3SAX A;  5E2R A;  1CVD A;  3KOK A;  3P44 A;  4KNI A;  3V3G B;  1I9N A;  1UGG A;  1KEQ A;  4YGL A;  1XPZ A;  4YYT A;  4ZWY A;  5AMD A;  3NI5 A;  2FNK A;  2OSF A;  4Z1N A;  4WW6 A;  4YXU A;  2POV A;  4Q90 A;  3OKU A;  3R17 B;  2Q1Q A;  3MMF A;  5DSL A;  4YHA A;  5CA2 A;  3VBD A;  4KUW A;  5G0B A;  3RZ8 A;  1BIC A;  1CNK A;  4K0S A;  3HS4 A;  1CVE A;  1CRM A;  5EHW A;  1CVB A;  5FLR A;  1CIM A;  4FVO A;  4UOV A; 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