3P5LA

Human carbonic anhydrase complexed with sodium 4-cyano-4-phenylpiperidine-1-carbodithioate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Dithiocarbamates: a new class of carbonic anhydrase inhibitors. Crystallographic and kinetic investigations.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3p5lA00
1IF4A 1JV0A 5EKJA 3S74B 1CRMA 4QSJA 1BNWA 3S75B 5L3OA 3QYKA 1TEQX 3N4BA 3DVBA 3BETA 2CBEA 2VVBX 4Q99A 4QEFA 3RZ8A 1RZCA 1ZFQA 3FE4A 2NWZA 9CA2A 3MHLA 2FMZA 1HECA 3KWAA 3M3XA 4PQ7A 4Q83A 1HVAA 4WL4A 5EHWA 2EU2A 1BN4A 5G0CA 4BF1A 3P4VA 3C7PA 3F8EA 2EU3A 3T83A 2NN7A 4KNMA 3R17B 5CLUA 3K34A 1CVCA 2O4ZA 4CNVA 5DSJA 1FSNA 4FPTA 3M1JA 1CVDA 3EFIA 1XEVA 5FNGA 1LG6A 4XFWA 5DSMA 5E2MA 5G03A 1LG5A 3P44A 4Z0QA 4YVYA 1HEDA 3MNJA 5SZ1A 4RFCA 3RYYA 1I9MA 4QK1A 5JGSB 4CNXA 3DBUA 4YX4A 2NXRA 3KLDB 1BNNA 2FOQA 1DCAA 4HT2A 4KUYA 3T82A 1AVNA 1T9NA 1UGFA 1TG3A 2NMXA 4QJPA 2NNVA 4KNNA 1RJ5A 3DD8A 3RG3A 3S78B 3M96A 4QK2A 2X7TA 3DVDA 1ZGFA 5JG3B 3HKNA 5SZ6A 4HU1A 1AM6A 1RZAA 4KAPA 3HS4A 3RYVB 5CACA 1CNXA 4CQ0A 4QSBA 4JSZA 3V5GA 4K13A 1ZSAA 5A6HA 4FIKA 3ML5A 2POVA 4MDLA 3PYKA 4Q6DA 5BRVA 2IT4A 4MLTA 4XIXA 4M2RA 4ZWIA 1JCZA 3D8WA 3K7KA 3JXFA 3CA2A 5E5RA 1I90A 3RYZA 5EOIA 4RH2A 3V3JA 4QSAA 3BL1A 1CNCA 1KEQA 4Q08A 3PJJA 3P3JA 1G4OA 5E28A 3D0NA 4RIVA 5SZ4A 5EKHA 3M2XA 4Q7PA 5JQ0A 3S73B 4BCWA 5BNLA 4Q07A 3V3HB 1CVBA 3MHMA 2ILIA 3JXGA 1CCTA 3MDZA 4YYTA 3P5AA 2F14A 3RJ7A 4IDRX 3DD0A 1CVHA 3M5EA 1RZDA 3T84A 1G54A 1CVEA 3HLJA 1TH9A 3NB5A 4XIWA 3IBUA 3HKUA 4K1QA 4Q8YA 4RUXA 1TB0X 5SZ2A 3RGEA 1FR7A 1CNKA 1G1DA 1HUGA 2HD6A 1CAMA 3CAJA 1DMYA 5CJFA 1RAYA 3OILA 2FNMA 3DV7A 4ZWZA 1TG9A 5FL6A 2POUA 4ZWXA 1CAZA 1HUHA 2HL4A 3UYQA 4COQA 3ML2A 5HPJA 5DOGA 1G0FA 2POWA 1CNIA 1BV3A 1RZBA 1TEUX 2WEHA 3D93A 4YGLA 1RZEA 4GL1X 3U47A 1CAKA 5DVXA 4IWZA 4QJOA 3M2NA 4CA2A 3GZ0A 3JXHC 1IF5A 3RYXB 1CIMA 1ZSBA 4FU5A 1G52A 3M1QA 3SBIA 1H9QA 3OKVA 1I91A 4YGKA 1CILA 3SBHA 3DA2A 2EZ7A 3NI5A 3W6IA 1DCBA 3IBIA 4FVNA 3MZCA 4E49A 2WEOA 3OY0A 4KNJA 1UGAA 4KP8A 2NWPA 7CA2A 3U3AX 1OQ5A 3CYUA 3MYQA 4L5WA 3MMFA 1KWQA 3F7BA 3CZVA 3MHIA 3VBDA 5E2RA 4N16A 5AMLA 1OKMA 3IBLA 4Q7SA 4FVOA 5G01A 3DC3A 1OKNA 3RZ1B 4YHAA 3K2FA 5DSQA 3MWOA 1FSQA 5FL5A 3OYSA 3ZNCA 4HF3A 5FDIA 4ITPA 1I9OA 1H9NA 1I8ZA 2FNKA 3OIMA 3V3GB 2QOAA 3ZP9A 4CACA 1G6VA 1IF7A 2GD8A 1BNQA 1CAYA 1YO1A 4PYYA 4Q06A 3V7XA 4YGNA 4HEWA 5E5UA 3RZ0B 3M67A 4Q78A 4C3TA 5A25A 5IPZA 1YO0A 2OSFA 1ZNCA 5JDVB 5FNMA 5LMDA 4JSSA 5DSLA 3RG4A 2WEJA 5DSKA 3KOKA 1YDAA 4R59A 5FLPA 1CNYA 5BRWA 4QJWA 3P5LA 2OSMA 1BCDA 1DMXA 3KIGA 4ZAOA 4E9OX 3IBNA 1G53A 4KUVA 4ITOA 1ZGEA 1CNHA 2ZNCA 4QJMA 4E3HA 1CNBA 3HKQA 1TBTX 1G3ZA 5FNIA 3HFPA 2GEHA 4MTYA 5JEGB 1BN3A 4QIYA 5DSOA 2WD3A 3B4FA 4G7AA 3V2MA 2HOCA 4RUYA 4TWLA 5SZ5A 5J8ZA 2FOVA 4YWPA 3BL0A 4FRCA 2Q1QA 3LXEA 5DSPA 3M2ZA 12CAA 4ILXA 1EOUA 1HCAA 4M2UA 2HFWA 4LU3A 4CNWA 3SAXA 3DCCA 1YDBA 1G46A 1FQLA 5SZ7A 2HNCA 3FFPX 3UYNA 4KNIA 5JEHB 5FLTA 2X7SA 2FOSA 3RLDA 1ZH9A 5FNKA 4Q87A 5EZTX 5FNHA 1CALA 1CVFA 1FQMA 1TE3X 2QO8A 4RIUA 5DRSA 4RUZA 1BNMA 5G0BA 2HKKA 3TMJA 2NNSA 4K0TA 4CNRA 4QTLA 4L5UA 1KOPA 4QK3A 1UGBA 3S76A 2VVAX 2FW4A 4E5QA 1CNJA 1CZMA 4Q90A 3N2PA 3M04A 2H4NA 2NNOA 3M2YA 3R16A 4DZ9A 4ZWYA 4E3DA 1UGEA 1CRAA 5FDCA 4R5BA 4ZX0A 3RYJB 1UGCA 4Q9YA 1CAHA 3M1WA 2CBCA 3NJ9A 5FLQA 3M1KA 3P58A 2NWYA 1I9QA 2FOYA 4E3GA 1CAJA 1YDDA 2H15A 2ABEA 3MNIA 3D9ZA 1HEBA 1YDCA 4QJ0A 2NNGA 3S71B 5E2NA 1LUGA 1CAIA 3B1BA 3N0NA 5SZ3A 1BNUA 4Q49A 1I9LA 4MDMA 5JEPB 3KONA 1CA3A 4Q6EA 3S72B 3SAPA 4Z1EA 4Q09A 4PZHA 3FW3A 1I9PA 2FMGA 1G48A 4LHIA 5EH5A 4HT0A 4Z1NA 4E3FA 3P3HA 2NWOA 4QSIA 5EKMA 5FNLA 4M2WA 3M40A 4L5VA 3N3JA 2CABA 4WR7A 3S8XA 4R5AA 4MO8A 4G0CA 4HEYA 3F4XA 4Y0JA 1I9NA 1CVAA 3IGPA 3S77B 1BICA 1RAZA 4KP5A 4KUWA 5AMDA 4XZ5A 4JS6A 1BZMA 1A42A 3MNUA 4Q8ZA 5AMGA 1ZSCA 4WW6A 1Z93A 4HBAA 3V2JA 4K0SA 3DC9A 4RN4A 4X5SA 4BF6A 5BRUA 5L6KA 3EFTA 5JQTA 3MNAA 4RFDA 1LGDA 2AW1A 1G4JA 1V9EA 1FLJA 1FSRA 2Q38A 4UOVA 5FLRA 4YXIA 4MDGA 1H4NA 2CBAA 1URTA 5DSIA 5SZ0A 1Y7WA 3S97A 1AZMA 1V9IC 3D92A 1FR4A 1JD0A 1RJ6A 1CAOA 3MHOA 1KOQA 3M5SA 5DOHA 3DAZA 4N0XB 2CBBA 1ZE8A 4E4AA 1G45A 4DZ7A 4QIZA 5DSRA 5EH7A 5CA2A 3DCWA 2W2JA 4Q0LA 3U7CA 1J9WA 3IEOA 4LP6A 3T85A 4QJXA 5JG5B 1CINA 4ZX1A 2Q1BA 3MHCA 4WW8A 1MOOA 1Z97A 4JSAA 1CNWA 3KS3A 3M98A 5EHEA 1XQ0A 4YGFA 2AX2A 5C8IA 4KV0A 4M2VA 3KNEA 2QP6A 2CA2A 2X7UA 3W6HA 4Z1KA 5JGTB 1MUAA 5E2KA 1FQRA 2NN1A 3L14A 3U45X 4Q8XA 4MLXA 3OYQA 1F2WA 1IF6A 1IF9A 3RZ7A 3KKXA 3MNHA 5EH8A 3T5UA 3S9TA 1CANA 4FL7A 1BNTA 3Q31A 3RZ5A 5FLSA 3TVOX 1ZFKA 1BN1A 5EIJA 4JSWA 1CNGA 1HEAA 1IF8A 1CCUA 1FQNA 4YXOA 5FLOA 3PO6A 4PXXA 1G0EA 3F7UA 3P55A 4TWMA 1YO2A 2NXTA 5JESB 1CCSA 1BNVA 4Q7VA 4WUQA 2NXSA 3HKTA 1CA2A 5DSNA 3OKUA 4WUPA 1UGGA 1LZVA 1TTMA 4ETQC 3M14A 4YGJA 3V3IB 4K0ZA 5FL4A 4HEZA 1THKA 4Q7WA 1Z9YA 3TVNX 3IAIA 3OIKA 4Z1JA 2FNNA 3DVCA 1KWRA 2CBDA 2WD2A 5EHVA 4QY3A 1HCBA 4YXUA 6CA2A 2WEGA 3KOIA 5FNJA 2FOUA 3DCSA 4PYXA 1XPZA 4XE1A 3MNKA 4Q81A 5BYIA 1UGDA 3M5TA 1OKLA 5E2SA 3T5ZA 8CA2A 1XEGA 3V3FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IF4 A;  1JV0 A;  5EKJ A;  3S74 B;  1CRM A;  4QSJ A;  1BNW A;  3S75 B;  5L3O A;  3QYK A;  1TEQ X;  3N4B A;  3DVB A;  3BET A;  2CBE A;  2VVB X;  4Q99 A;  4QEF A;  3RZ8 A;  1RZC A;  1ZFQ A;  3FE4 A;  2NWZ A;  9CA2 A;  3MHL A;  2FMZ A;  1HEC A;  3KWA A;  3M3X A;  4PQ7 A;  4Q83 A;  1HVA A;  4WL4 A;  5EHW A;  2EU2 A;  1BN4 A;  5G0C A;  4BF1 A;  3P4V A;  3C7P A;  3F8E A;  2EU3 A;  3T83 A;  2NN7 A;  4KNM A;  3R17 B;  5CLU A;  3K34 A;  1CVC A;  2O4Z A;  4CNV A;  5DSJ A;  1FSN A;  4FPT A;  3M1J A;  1CVD A;  3EFI A;  1XEV A;  5FNG A;  1LG6 A;  4XFW A;  5DSM A;  5E2M A;  5G03 A;  1LG5 A;  3P44 A;  4Z0Q A;  4YVY A;  1HED A;  3MNJ A;  5SZ1 A;  4RFC A;  3RYY A;  1I9M A;  4QK1 A;  5JGS B;  4CNX A;  3DBU A;  4YX4 A;  2NXR A;  3KLD B;  1BNN A;  2FOQ A;  1DCA A;  4HT2 A;  4KUY A;  3T82 A;  1AVN A;  1T9N A;  1UGF A;  1TG3 A;  2NMX A;  4QJP A;  2NNV A;  4KNN A;  1RJ5 A;  3DD8 A;  3RG3 A;  3S78 B;  3M96 A;  4QK2 A;  2X7T A;  3DVD A;  1ZGF A;  5JG3 B;  3HKN A;  5SZ6 A;  4HU1 A;  1AM6 A;  1RZA A;  4KAP A;  3HS4 A; 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