3RYJB

Carbonic anhydrase complexed with 4-sulfamoyl-n-(2,2,2-trifluoroethyl)benzamide
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the "hydrophobic wall" of carbonic anhydrase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ryjB00
4CACA 3GZ0A 2FMGA 5SZ0A 3B4FA 4G0CA 5CLUA 3PO6A 3HKNA 1G3ZA 4Q6DA 1G54A 1KEQA 3M5EA 5EKMA 4E5QA 1DMYA 5LMDA 3DC3A 1XEVA 1CVDA 5BRWA 4QTLA 1I9LA 1CAJA 2FOVA 4FIKA 2FOSA 5DSIA 1G4OA 1YDCA 2WD2A 4ZWYA 1CAHA 4E9OX 4ZWXA 1CALA 5G0BA 4YXIA 5FL6A 4LHIA 1FQNA 2WEOA 3P58A 3U45X 5FDIA 3W6HA 3P5AA 2GEHA 4Q7WA 5A25A 2W2JA 2CBEA 2FOQA 1FQRA 5EH5A 5FNLA 3JXFA 3VBDA 5SZ6A 1Z93A 4RIUA 1CNIA 1IF7A 3TVNX 4QJWA 5SZ1A 4IDRX 1ZSCA 1YDAA 2VVBX 1CAMA 4QK2A 1CAZA 1V9IC 1CRMA 3CAJA 4CNVA 1HUHA 4QIYA 3DC9A 4JSAA 3KNEA 2O4ZA 2NNVA 4PXXA 5JG3B 4RFCA 3CYUA 3M5TA 1AM6A 1TEQX 1Z97A 2HL4A 1G48A 1UGBA 3D9ZA 2F14A 3M1KA 1CAOA 3M2YA 1OKLA 2NWZA 3MZCA 5E2NA 5G03A 3U7CA 5EIJA 1DCBA 4BF1A 2Q1BA 2Q1QA 5EH7A 5HPJA 3ZP9A 5SZ2A 4QJOA 5EKHA 5EHVA 1G0EA 5SZ4A 1FSNA 1CRAA 1IF4A 5JGTB 1KOQA 1ZFKA 1XQ0A 5FLPA 3RJ7A 5DSMA 4K0SA 4KNJA 3MNUA 2NWPA 3S97A 3P3HA 4PYXA 4R5BA 3IEOA 2X7SA 2NXRA 4L5VA 4CA2A 1G53A 4DZ7A 4Q7SA 4QIZA 2FMZA 4K13A 1TEUX 4Q08A 1BN4A 1ZSAA 4QY3A 4G7AA 1RZCA 1EOUA 2NMXA 4FVNA 4RH2A 1BV3A 4FRCA 1CVBA 4ITPA 1UGGA 1ZSBA 4QJXA 3V3GB 2WD3A 2NXSA 3RYZA 1JCZA 3MNJA 4Q49A 3IBNA 1BNWA 4QJ0A 4PYYA 1I9PA 3OKVA 5FL5A 2HD6A 3UYNA 3CZVA 3RLDA 1IF6A 2NWOA 1G4JA 2HFWA 4Q90A 4PZHA 5G0CA 1UGDA 3KOIA 3ML5A 5DRSA 4GL1X 3KKXA 1LGDA 3IBLA 5E2SA 4E3DA 1KWRA 3F8EA 2NXTA 3M3XA 3S75B 1HECA 3MHLA 4FU5A 2HKKA 2NNGA 1RZBA 4KP8A 4M2WA 1JD0A 3QYKA 3PJJA 4Z1KA 5JG5B 5AMDA 2NWYA 1THKA 3T85A 1CA3A 2POWA 4KUYA 4IWZA 5FLSA 5BRVA 3RYYA 1DMXA 1UGAA 1CNBA 1OKMA 4CNXA 1RZAA 5E28A 4Q9YA 3TVOX 3KONA 3HFPA 2EU2A 2VVAX 4M2UA 3C7PA 3LXEA 4Q83A 3ZNCA 2AW1A 1CVHA 4LP6A 2ABEA 5DVXA 3RYVB 1TE3X 4QSIA 3IBUA 3S78B 3ML2A 1G6VA 1TBTX 5C8IA 1TG3A 5IPZA 4Q8YA 4CNWA 1BN3A 1CINA 5FNGA 1FSRA 5SZ7A 3RGEA 3V3IB 4QEFA 2ZNCA 7CA2A 3P44A 4JSZA 4YWPA 5FLOA 5DSNA 5FNJA 1BNMA 4XIWA 3M1QA 3OIMA 3M96A 3NJ9A 5DSJA 1FLJA 1ZFQA 3RZ0B 5CACA 4FPTA 1MOOA 4MTYA 3S72B 3V3JA 1I91A 1FQLA 5JQ0A 3KS3A 3F7BA 4WL4A 3DCWA 4WW6A 1HCBA 1URTA 3S76A 4HBAA 1FR4A 4QJMA 3MNKA 2WEGA 4RUYA 2OSMA 1CNGA 5FLRA 1BNNA 3S74B 5DOHA 1I9NA 8CA2A 4R59A 5AMLA 2Q38A 12CAA 2FW4A 3V5GA 4JSSA 3UYQA 6CA2A 5E2RA 2ILIA 4E49A 5DSRA 1ZNCA 3SBHA 4Q07A 3NI5A 1RJ5A 4WUPA 4L5WA 1ZGFA 4ZX0A 3T5UA 4XFWA 3R16A 4N0XB 5E5RA 1XPZA 4ZX1A 1KWQA 5DOGA 3N2PA 4HEYA 4Q0LA 4Q81A 9CA2A 1G46A 1H9NA 3S8XA 3S73B 4E3HA 1BNUA 3N4BA 1HEDA 4Q8ZA 5FNHA 5JEGB 3K7KA 5J8ZA 4FL7A 3NB5A 1CCUA 3RZ5A 1OKNA 4E3GA 4YGNA 4QSAA 1CAYA 4X5SA 3EFTA 3D92A 3DD0A 3MNHA 1RAYA 5EZTX 2H4NA 2CABA 4Q78A 1IF8A 4MO8A 4ZAOA 3S71B 1RAZA 4XE1A 1V9EA 1G45A 1YO2A 1CA2A 1F2WA 4Q06A 3MNIA 1AVNA 4Z0QA 1CVEA 3HKTA 5FNKA 5CA2A 4Q7PA 3DCCA 3T83A 4YGLA 1CIMA 1A42A 2POUA 4HEZA 3FE4A 1JV0A 4KUVA 1Y7WA 3S77B 3T5ZA 1CANA 3BL0A 1G52A 1HCAA 3MWOA 4HEWA 5JEPB 3DA2A 2X7TA 2WEHA 1CAIA 3HS4A 3OYSA 4KV0A 3HKUA 5FLQA 5DSKA 2NN1A 5JQTA 5JEHB 3M2XA 3FW3A 3B1BA 1I9QA 3BETA 1BZMA 3RYXB 3P55A 4MDLA 4MDMA 4L5UA 3MHIA 4R5AA 3DAZA 1YDBA 3HLJA 1UGFA 4XIXA 3V3FA 4Q09A 1I9OA 1BN1A 1BNQA 1BNVA 3IAIA 1G1DA 2FNKA 4C3TA 2EU3A 2EZ7A 3P4VA 1TTMA 3DV7A 4WR7A 4RIVA 5FL4A 3RZ8A 4M2VA 4MLTA 1H9QA 4KP5A 3U47A 3M2NA 4Q99A 5FLTA 4N16A 4QJPA 1CVAA 3M40A 4ZWZA 4ETQC 4LU3A 2CBAA 4E4AA 5L6KA 2CBBA 1DCAA 4HU1A 1CILA 3M1JA 1YO1A 1BICA 4TWLA 3K2FA 3CA2A 3V2JA 4Q87A 5DSPA 5FNIA 3KIGA 4HT2A 1I9MA 4E3FA 5BRUA 1CCTA 3N0NA 4DZ9A 1TB0X 3DBUA 4Q6EA 5E5UA 3D8WA 4KNIA 3T82A 1ZGEA 4FVOA 4MDGA 3TMJA 3R17B 3M14A 5CJFA 4CQ0A 4WUQA 4WW8A 5BNLA 1CNYA 4RUZA 5AMGA 5DSOA 5EOIA 1TG9A 5FDCA 3M98A 2QOAA 3RG3A 4KNNA 1RZDA 4PQ7A 1KOPA 1CNJA 3D0NA 4QK3A 4COQA 1IF9A 1HEBA 2HNCA 4XZ5A 1UGEA 3DCSA 5G01A 5DSLA 1RJ6A 3JXHC 2NN7A 3V7XA 1CNXA 1HVAA 3KOKA 4YXOA 3M67A 3MHOA 4Q7VA 5EKJA 4ZWIA 5BYIA 1UGCA 2GD8A 4CNRA 5SZ3A 1YDDA 1I8ZA 2CA2A 3IGPA 4M2RA 5SZ5A 4YXUA 3MHMA 1FR7A 1HUGA 1I90A 4K1QA 3RG4A 3S9TA 3DD8A 5E2KA 5E2MA 4JS6A 4RUXA 3OKUA 3OY0A 1CNWA 1CVCA 3DVBA 5EHEA 3SBIA 1FQMA 4RFDA 3RZ1B 2QP6A 2X7UA 5EH8A 1OQ5A 5JESB 3M5SA 2OSFA 3N3JA 5JGSB 3T84A 3P5LA 4K0ZA 1CNHA 4HT0A 2CBCA 4Z1EA 3V3HB 3L14A 4YGJA 4QK1A 5JDVB 4K0TA 1LUGA 1CAKA 1J9WA 1Z9YA 4YGKA 4YVYA 4HF3A 3Q31A 3EFIA 3OYQA 5L3OA 5A6HA 5EHWA 2HOCA 3IBIA 2QO8A 3KLDB 3F4XA 3RZ7A 4Z1JA 1CCSA 3MYQA 4RN4A 4KNMA 1YO0A 3M1WA 2FNNA 4YX4A 3FFPX 3OILA 1IF5A 3F7UA 1LZVA 3P3JA 1BNTA 3DVDA 3MNAA 3SAXA 1HEAA 1LG5A 4ILXA 1RZEA 4MLXA 4QSBA 1H4NA 1LG6A 2NNSA 3D93A 1MUAA 5DSQA 4ITOA 2FOYA 4JSWA 1CVFA 3MHCA 4UOVA 1CNKA 3V2MA 4YHAA 1CNCA 1CZMA 1TH9A 3M2ZA 1XEGA 4Y0JA 2WEJA 3DVCA 3PYKA 3U3AX 2NNOA 3HKQA 5FNMA 4BCWA 1ZE8A 2IT4A 3KWAA 3MDZA 3JXGA 3RYJB 2FOUA 4Q8XA 1BCDA 3M04A 4Z1NA 3OIKA 1T9NA 1G0FA 2H15A 4KAPA 1AZMA 2FNMA 4YGFA 4BF6A 3K34A 3MMFA 3BL1A 4QSJA 2CBDA 2AX2A 4TWMA 4KUWA 3W6IA 3SAPA 1ZH9A 1FSQA 4YYTA 2POVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CAC A;  3GZ0 A;  2FMG A;  5SZ0 A;  3B4F A;  4G0C A;  5CLU A;  3PO6 A;  3HKN A;  1G3Z A;  4Q6D A;  1G54 A;  1KEQ A;  3M5E A;  5EKM A;  4E5Q A;  1DMY A;  5LMD A;  3DC3 A;  1XEV A;  1CVD A;  5BRW A;  4QTL A;  1I9L A;  1CAJ A;  2FOV A;  4FIK A;  2FOS A;  5DSI A;  1G4O A;  1YDC A;  2WD2 A;  4ZWY A;  1CAH A;  4E9O X;  4ZWX A;  1CAL A;  5G0B A;  4YXI A;  5FL6 A;  4LHI A;  1FQN A;  2WEO A;  3P58 A;  3U45 X;  5FDI A;  3W6H A;  3P5A A;  2GEH A;  4Q7W A;  5A25 A;  2W2J A;  2CBE A;  2FOQ A;  1FQR A;  5EH5 A;  5FNL A;  3JXF A;  3VBD A;  5SZ6 A;  1Z93 A;  4RIU A;  1CNI A;  1IF7 A;  3TVN X;  4QJW A;  5SZ1 A;  4IDR X;  1ZSC A;  1YDA A;  2VVB X;  1CAM A;  4QK2 A;  1CAZ A;  1V9I C;  1CRM A;  3CAJ A;  4CNV A;  1HUH A;  4QIY A;  3DC9 A;  4JSA A;  3KNE A;  2O4Z A;  2NNV A;  4PXX A;  5JG3 B;  4RFC A;  3CYU A;  3M5T A;  1AM6 A;  1TEQ X;  1Z97 A;  2HL4 A;  1G48 A;  1UGB A;  3D9Z A;  2F14 A;  3M1K A;  1CAO A;  3M2Y A;  1OKL A;  2NWZ A;  3MZC A;  5E2N A;  5G03 A;  3U7C A;  5EIJ A;  1DCB A;  4BF1 A;  2Q1B A;  2Q1Q A; 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