3S77 | Genus

Total Genus 75

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	75
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__7898471641352103__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__7898471641352103__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3S77/B/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__7898471641352103__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"7898471641352103","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3S77/B/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__7898471641352103__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Mechanism of the hydrophobic effect in the biomolecular recognition of arylsulfonamides by carbonic anhydrase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	75
structure length	258
sequence length	258
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2011-05-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3s77B00

3V5GA 3Q31A 1F2WA 4KNNA 2EU2A 2ABEA 3CAJA 3MHCA 4YGLA 1XEGA 1RZEA 1CVHA 4QY3A 3SBHA 1BNUA 3M67A 5JESB 1I9NA 3KIGA 1G6VA 2QO8A 4FIKA 1CA3A 3SAPA 4E49A 2WEJA 2FNNA 4Q6DA 3C7PA 1UGGA 5FLSA 1CVDA 5FNJA 3P5LA 2CBCA 1LG6A 1UGFA 3BL1A 1BNWA 4E3HA 1G46A 5DOHA 2WEGA 4QJXA 1CAHA 1H9QA 3MNKA 4YGNA 3PYKA 1I9PA 5JGTB 3V3HB 4HEWA 4Q8XA 5CACA 2HKKA 4XIXA 3RYZA 5EH8A 1TH9A 1FLJA 4COQA 4DZ9A 4E3GA 1HUHA 1YDAA 1XQ0A 4KNIA 1CRMA 5BYIA 5JQ0A 3RJ7A 1ZGEA 5E28A 1YO2A 3M3XA 3MZCA 3M2NA 4LP6A 5DSPA 4YXUA 4FRCA 4LU3A 4Q06A 5FDCA 5J8ZA 1HCBA 2POVA 4YXIA 3M14A 1TG3A 3T82A 4IDRX 4HT0A 1CAJA 1DMYA 3DV7A 3MNAA 1V9EA 3RG4A 4TWLA 5L6KA 3DCCA 4M2UA 3S77B 1AZMA 3JXHC 1I9QA 4K13A 1DCBA 5FL4A 3NI5A 1CANA 5JGSB 5FDIA 5AMLA 4ZAOA 3RYJB 3IAIA 3RZ0B 3S73B 4ZX0A 1CIMA 3OKVA 3S78B 3KLDB 4PYXA 5BRWA 1CILA 3GZ0A 1IF5A 4YXOA 4CNXA 1XPZA 4KAPA 3DBUA 5EH7A 2Q1QA 5E2RA 5FL6A 4MO8A 3V3IB 5JEPB 3QYKA 1CVFA 3SAXA 1CAZA 1G45A 3UYNA 4K0ZA 1TG9A 1G4JA 1TBTX 2ZNCA 2WD2A 4JSAA 4K1QA 2POWA 3U45X 4WR7A 4Q7SA 4Q0LA 1CNCA 3KKXA 4XFWA 2NWPA 4RUXA 5FLRA 2VVAX 5EH5A 1RAYA 5JEGB 2NXTA 4CNWA 4BF1A 1CAMA 5E5RA 5FLPA 4Q6EA 5AMGA 1XEVA 3P4VA 5G0BA 5E5UA 3N3JA 1UGDA 6CA2A 4ITPA 3N0NA 1RZCA 3DD8A 3S97A 3HKTA 5IPZA 1BNQA 1Y7WA 4HEYA 3M5EA 4PYYA 5A6HA 5DSQA 3B4FA 5DSNA 1CNYA 3ML5A 1DMXA 1CNIA 4R5BA 3T5ZA 4WW6A 4WUQA 5DOGA 3U7CA 5E2NA 5DSLA 5EHWA 2HL4A 3N2PA 4M2WA 3R16A 2NWYA 5SZ1A 1CNHA 5BNLA 5DSJA 5BRVA 5C8IA 1UGEA 1A42A 3U47A 1CRAA 3K34A 3S9TA 5JG3B 9CA2A 4HU1A 1ZSCA 4CNRA 2NN7A 3S75B 3M2YA 5DVXA 3BETA 1RZBA 5EKMA 4E3DA 1Z97A 2CBAA 3M1WA 3M2ZA 1CNWA 1ZFKA 3DCWA 1CCSA 3OY0A 4Q83A 3SBIA 5CLUA 1CVAA 3D8WA 4E5QA 1JCZA 3OKUA 2CBDA 2HFWA 3OIMA 3M1QA 1CAOA 4ZWYA 2OSFA 3R17B 4WW8A 4YHAA 4M2RA 4Q81A 4Q49A 3M2XA 3M5SA 3LXEA 1YDBA 3P44A 1THKA 4Z1NA 3M98A 4PXXA 3V7XA 4PZHA 3CYUA 3JXGA 5DSRA 12CAA 5SZ3A 3FW3A 4QJOA 4LHIA 4YWPA 3T5UA 3V2MA 8CA2A 1FSQA 3IBIA 5JQTA 1OKNA 1I91A 4E3FA 4HBAA 4ZWXA 4XIWA 1H4NA 2AX2A 3M40A 4CA2A 1FSRA 1FR7A 1Z93A 3MHMA 5E2SA 3P55A 2WD3A 3IBLA 1I9OA 3NJ9A 4RUZA 1I9MA 3IGPA 1BV3A 4XZ5A 4JSSA 4YYTA 3D92A 2AW1A 4KP8A 1URTA 4RFCA 1BNNA 4Q09A 4E4AA 4Q7PA 1ZE8A 4Q9YA 4Z1EA 3D0NA 4CQ0A 4M2VA 5FNKA 4G7AA 3M04A 5EKJA 1LG5A 4JS6A 4QSJA 3P3HA 2NNVA 3CZVA 5DSOA 5SZ2A 2X7SA 3S72B 4MDMA 2X7UA 2FOUA 1ZFQA 1IF6A 1CNJA 3CA2A 1TEUX 1BZMA 1BN3A 1OKLA 3KONA 4YGKA 3MWOA 1ZSBA 1IF8A 4E9OX 4CACA 1BNMA 3DVDA 2NXRA 4RH2A 1CAKA 1HEBA 3IBNA 3L14A 3IEOA 4RUYA 4CNVA 3HKNA 3UYQA 2Q38A 3MNIA 4HEZA 2WEOA 4ZWIA 3MDZA 4FVOA 3RG3A 1KOQA 5JG5B 5SZ4A 5EHVA 3TMJA 3TVNX 3RZ5A 1BN4A 1CA2A 2HOCA 2X7TA 4MLTA 4PQ7A 4BCWA 1YO0A 4K0SA 3VBDA 1H9NA 2NXSA 4KV0A 7CA2A 1HUGA 4Q99A 1I8ZA 3RYXB 1FQMA 4ILXA 4L5VA 5CJFA 4ITOA 4IWZA 5FLOA 1EOUA 5HPJA 1HEAA 1BNVA 1IF7A 5BRUA 2FOQA 4Z0QA 1FSNA 3M1KA 3S71B 4JSWA 5FNMA 3K2FA 1BCDA 2FNKA 3MNHA 1HEDA 5SZ6A 5DSIA 4K0TA 2FMZA 4L5UA 3V2JA 4Q07A 1RZDA 3M1JA 4YX4A 5FL5A 1CCTA 5SZ5A 1CNXA 2HD6A 2GEHA 3W6HA 3MMFA 1RJ6A 1G53A 4Q78A 1I90A 3T83A 1CINA 3KOIA 3ML2A 1CCUA 3F8EA 3NB5A 4Q8ZA 1CVBA 3HKQA 4R5AA 5EOIA 2HNCA 2NN1A 1TEQX 5CA2A 3S76A 1RAZA 1G54A 5JDVB 5FNLA 4YGFA 3MHOA 3HLJA 3MYQA 4Q7WA 2EU3A 2POUA 4N0XB 3EFTA 4QSIA 2ILIA 4RIUA 5EKHA 1CAYA 1IF4A 3RZ8A 3ZP9A 2CABA 4ZWZA 4QTLA 1AM6A 3TVOX 4R59A 1HVAA 1TTMA 2H4NA 3M5TA 3P5AA 1KEQA 4XE1A 5FNHA 4ETQC 1G4OA 5E2KA 2Q1BA 1G48A 1UGBA 2CBBA 2IT4A 3V3FA 3OYQA 4FL7A 4QK2A 1FQRA 4QJMA 4BF6A 1J9WA 4KP5A 5DSKA 1YDCA 1Z9YA 2NNGA 3JXFA 1FQLA 5A25A 1CZMA 5EIJA 1G3ZA 3F7BA 4MDGA 4YVYA 1G0EA 4KUWA 3U3AX 5G01A 1MUAA 5LMDA 3F7UA 4N16A 3FFPX 4ZX1A 5FNGA 2FOYA 1HCAA 1FR4A 4JSZA 1LGDA 1ZSAA 3HFPA 3RZ7A 5DSMA 3RZ1B 4RN4A 1G0FA 2CBEA 2OSMA 1I9LA 3OIKA 3PO6A 3DVCA 3DCSA 4MLXA 5DRSA 5G0CA 5G03A 1JD0A 4KUVA 4WUPA 3V3GB 4Z1KA 3HKUA 3MHIA 4FU5A 4QEFA 3N4BA 1UGCA 5FNIA 1FQNA 4Q87A 3OYSA 3RLDA 5FLQA 1KWQA 1MOOA 2QP6A 1CVCA 4QSAA 3DVBA 5L3OA 2VVBX 3P3JA 3V3JA 1HECA 1LUGA 4QIZA 1YO1A 1YDDA 2W2JA 3K7KA 4YGJA 1ZNCA 3FE4A 4WL4A 3DC9A 4C3TA 1TB0X 3BL0A 5FLTA 3S74B 1KOPA 3RGEA 4HT2A 2NWZA 1CNGA 1RJ5A 1TE3X 3M96A 4G0CA 2FOVA 5EHEA 4Q7VA 3P58A 4FVNA 3ZNCA 3KOKA 1BICA 3D9ZA 2NNOA 3RYVB 4QSBA 3DC3A 4KNJA 4X5SA 1BNTA 2QOAA 4Q08A 4HF3A 2EZ7A 1ZH9A 3MHLA 4MDLA 5AMDA 1CNBA 4Z1JA 2FW4A 3T84A 4QK3A 4FPTA 3DA2A 1G52A 3RYYA 3OILA 2H15A 4Y0JA 4QJWA 1CALA 3KNEA 5SZ7A 4TWMA 2FNMA 5E2MA 4QJPA 3T85A 5EZTX 3S8XA 1OKMA 1CAIA 1JV0A 3EFIA 3MNUA 5JEHB 3DAZA 3DD0A 1V9IC 3B1BA 3IBUA 4QK1A 2WEHA 1IF9A 1BN1A 1RZAA 2F14A 1OQ5A 4KUYA 2O4ZA 1CNKA 4Q8YA 3PJJA 1LZVA 3KWAA 2NWOA 5SZ0A 2FOSA 4KNMA 1ZGFA 3MNJA 1G1DA 4Q90A 3HS4A 2NNSA 4UOVA 3W6IA 4L5WA 2NMXA 4QIYA 4DZ7A 2CA2A 1T9NA 1AVNA 3F4XA 2FMGA 2GD8A 4QJ0A 1CVEA 1UGAA 4MTYA 1KWRA 4RFDA 4RIVA 3D93A 4GL1X 3KS3A 1DCAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3V5G A;  3Q31 A;  1F2W A;  4KNN A;  2EU2 A;  2ABE A;  3CAJ A;  3MHC A;  4YGL A;  1XEG A;  1RZE A;  1CVH A;  4QY3 A;  3SBH A;  1BNU A;  3M67 A;  5JES B;  1I9N A;  3KIG A;  1G6V A;  2QO8 A;  4FIK A;  1CA3 A;  3SAP A;  4E49 A;  2WEJ A;  2FNN A;  4Q6D A;  3C7P A;  1UGG A;  5FLS A;  1CVD A;  5FNJ A;  3P5L A;  2CBC A;  1LG6 A;  1UGF A;  3BL1 A;  1BNW A;  4E3H A;  1G46 A;  5DOH A;  2WEG A;  4QJX A;  1CAH A;  1H9Q A;  3MNK A;  4YGN A;  3PYK A;  1I9P A;  5JGT B;  3V3H B;  4HEW A;  4Q8X A;  5CAC A;  2HKK A;  4XIX A;  3RYZ A;  5EH8 A;  1TH9 A;  1FLJ A;  4COQ A;  4DZ9 A;  4E3G A;  1HUH A;  1YDA A;  1XQ0 A;  4KNI A;  1CRM A;  5BYI A;  5JQ0 A;  3RJ7 A;  1ZGE A;  5E28 A;  1YO2 A;  3M3X A;  3MZC A;  3M2N A;  4LP6 A;  5DSP A;  4YXU A;  4FRC A;  4LU3 A;  4Q06 A;  5FDC A;  5J8Z A;  1HCB A;  2POV A;  4YXI A;  3M14 A;  1TG3 A;  3T82 A;  4IDR X;  4HT0 A;  1CAJ A;  1DMY A;  3DV7 A;  3MNA A;  1V9E A;  3RG4 A;  4TWL A;  5L6K A;  3DCC A;  4M2U A;  3S77 B;  1AZM A;  3JXH C;  1I9Q A;  4K13 A;  1DCB A;  5FL4 A;  3NI5 A;  1CAN A;  5JGS B;  5FDI A;  5AML A;  4ZAO A;  3RYJ B;  3IAI A;  3RZ0 B;  3S73 B;  4ZX0 A;  1CIM A;  3OKV A;  3S78 B;  3KLD B;  4PYX A;  5BRW A;  1CIL A;  3GZ0 A;  1IF5 A;  4YXO A;  4CNX A;  1XPZ A;  4KAP A;  3DBU A;  5EH7 A;  2Q1Q A;  5E2R A;  5FL6 A;  4MO8 A;  3V3I B;  5JEP B;  3QYK A;  1CVF A;  3SAX A;  1CAZ A;  1G45 A;  3UYN A;  4K0Z A;  1TG9 A;  1G4J A;  1TBT X;  2ZNC A;  2WD2 A;  4JSA A;  4K1Q A;  2POW A;  3U45 X;  4WR7 A;  4Q7S A;  4Q0L A;  1CNC A;  3KKX A;  4XFW A;  2NWP A;  4RUX A;  5FLR A;  2VVA X;  5EH5 A;  1RAY A;  5JEG B;  2NXT A;  4CNW A;  4BF1 A;  1CAM A;  5E5R A;  5FLP A;  4Q6E A;  5AMG A;  1XEV A;  3P4V A;  5G0B A;  5E5U A;  3N3J A;  1UGD A;  6CA2 A;  4ITP A;  3N0N A;  1RZC A;  3DD8 A;  3S97 A;  3HKT A;  5IPZ A;  1BNQ A;  1Y7W A;  4HEY A;  3M5E A;  4PYY A;  5A6H A;  5DSQ A;  3B4F A;  5DSN A;  1CNY A;  3ML5 A;  1DMX A;  1CNI A;  4R5B A;  3T5Z A;  4WW6 A;  4WUQ A;  5DOG A;  3U7C A;  5E2N A;  5DSL A;  5EHW A;  2HL4 A;  3N2P A;  4M2W A;  3R16 A;  2NWY A;  5SZ1 A;  1CNH A;  5BNL A;  5DSJ A;  5BRV A;  5C8I A;  1UGE A;  1A42 A;  3U47 A;  1CRA A;  3K34 A;  3S9T A;  5JG3 B;  9CA2 A;  4HU1 A;  1ZSC A;  4CNR A;  2NN7 A;  3S75 B;  3M2Y A;  5DVX A;  3BET A;  1RZB A;  5EKM A;  4E3D A;  1Z97 A;  2CBA A;  3M1W A;  3M2Z A;  1CNW A;  1ZFK A;  3DCW A;  1CCS A;  3OY0 A;  4Q83 A;  3SBI A;  5CLU A;  1CVA A;  3D8W A;  4E5Q A;  1JCZ A;  3OKU A;  2CBD A;  2HFW A;  3OIM A;  3M1Q A;  1CAO A;  4ZWY A;  2OSF A;  3R17 B;  4WW8 A;  4YHA A;  4M2R A;  4Q81 A;  4Q49 A;  3M2X A;  3M5S A;  3LXE A;  1YDB A;  3P44 A;  1THK A;  4Z1N A;  3M98 A;  4PXX A;  3V7X A;  4PZH A;  3CYU A;  3JXG A;  5DSR A;  12CA A;  5SZ3 A;  3FW3 A;  4QJO A;  4LHI A;  4YWP A;  3T5U A;  3V2M A;  8CA2 A;  1FSQ A;  3IBI A;  5JQT A;  1OKN A;  1I91 A;  4E3F A;  4HBA A;  4ZWX A;  4XIW A;  1H4N A;  2AX2 A;  3M40 A;  4CA2 A;  1FSR A;  1FR7 A;  1Z93 A;  3MHM A;  5E2S A;  3P55 A;  2WD3 A;  3IBL A;  1I9O A;  3NJ9 A;  4RUZ A;  1I9M A;  3IGP A;  1BV3 A;  4XZ5 A;  4JSS A;  4YYT A;  3D92 A;  2AW1 A;  4KP8 A;  1URT A;  4RFC A;  1BNN A;  4Q09 A;  4E4A A;  4Q7P A;  1ZE8 A;  4Q9Y A;  4Z1E A;  3D0N A;  4CQ0 A;  4M2V A;  5FNK A;  4G7A A;  3M04 A;  5EKJ A;  1LG5 A;  4JS6 A;  4QSJ A;  3P3H A;  2NNV A;  3CZV A;  5DSO A;  5SZ2 A;  2X7S A;  3S72 B;  4MDM A;  2X7U A;  2FOU A;  1ZFQ A;  1IF6 A;  1CNJ A;  3CA2 A;  1TEU X;  1BZM A;  1BN3 A;  1OKL A;  3KON A;  4YGK A;  3MWO A;  1ZSB A;  1IF8 A;  4E9O X;  4CAC A;  1BNM A;  3DVD A;  2NXR A;  4RH2 A;  1CAK A;  1HEB A;  3IBN A;  3L14 A;  3IEO A;  4RUY A;  4CNV A;  3HKN A;  3UYQ A;  2Q38 A;  3MNI A;  4HEZ A;  2WEO A;  4ZWI A;  3MDZ A;  4FVO A;  3RG3 A;  1KOQ A;  5JG5 B;  5SZ4 A;  5EHV A;  3TMJ A;  3TVN X;  3RZ5 A;  1BN4 A;  1CA2 A;  2HOC A;  2X7T A;  4MLT A;  4PQ7 A;  4BCW A;  1YO0 A;  4K0S A;  3VBD A;  1H9N A;  2NXS A;  4KV0 A;  7CA2 A;  1HUG A;  4Q99 A;  1I8Z A;  3RYX B;  1FQM A;  4ILX A;  4L5V A;  5CJF A;  4ITO A;  4IWZ A;  5FLO A;  1EOU A;  5HPJ A;  1HEA A;  1BNV A;  1IF7 A;  5BRU A;  2FOQ A;  4Z0Q A;  1FSN A;  3M1K A;  3S71 B;  4JSW A;  5FNM A;  3K2F A;  1BCD A;  2FNK A;  3MNH A;  1HED A;  5SZ6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3S77B

Total Genus

Knots found

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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