3V3GB

Kinetic and structural studies of thermostabilized mutants of hca ii.
Total Genus 71

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGFGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSHDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVSKFRKLNFNGEGEPEEPMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TII'2 (251-254)TIV2 (25-28)S12 (191-196)S1 (32-33)S8 (108-109)TIV3 (34-37)EMPTYS2 (39-40)S6 (78-82)TI3 (41-44)S3 (46-50)TI5 (74-77)TIV9 (176-179)TI4 (51-54)S5 (66-70)S4 (56-61)3H5 (164-166)AH3 (220-227)TIV4 (62-65)S9 (116-124)TIV5 (71-74)S7 (87-97)TIV6 (98-101)TI'1 (109-112)TI6 (100-103)TIV7 (105-108)TIV8 (108-111)3H3 (125-128)AH1 (131-135)TI7 (137-140)TVIa1 (200-203)S13 (207-212)3H6 (181-184)AH2 (158-163)TII1 (169-172)S11 (172-178)O1 (204-206)S14 (216-218)3H1 (13-19)TI1 (8-11)3H2 (21-24)S10 (141-150)3H4 (155-157)TII2 (233-236)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Kinetic and structural characterization of thermostabilized mutants of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 71
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3v3gB00
5DSNA 1I9QA 5E2RA 2VVAX 4RFCA 5E5RA 2EU2A 3CAJA 4QJPA 2QP6A 4QJWA 2FOQA 5LMDA 4K0ZA 3DA2A 4Q06A 3RG3A 4YGLA 1XQ0A 1CCSA 4Q9YA 4WUPA 5FLOA 3M1WA 1FQRA 3V3GB 3OYQA 12CAA 1UGGA 1Z93A 5EH5A 3CYUA 4K0TA 3NI5A 4FRCA 1FR4A 3D92A 3RZ7A 1BICA 4M2WA 3M3XA 4L5WA 2Q38A 2WEOA 4WL4A 3W6HA 2F14A 1AZMA 4RN4A 5BYIA 4Q99A 4GL1X 4QSBA 4JSAA 3IBLA 4ZX1A 3HKUA 4E4AA 3IAIA 2NNGA 2EU3A 1CZMA 4YGFA 3MNAA 1ZH9A 3FW3A 3CA2A 4QIZA 1BNVA 5AMLA 3S74B 1I9NA 1G46A 4RH2A 1CNKA 4LP6A 4RIUA 1LZVA 1ZGEA 4Z1KA 3V5GA 2WEHA 4Q0LA 1G0FA 4CNRA 1MOOA 1CILA 1CNXA 5C8IA 4KNMA 1TG9A 3S8XA 1G6VA 4HT2A 4KNIA 9CA2A 4WUQA 3RLDA 1BN3A 3M40A 4K0SA 3TVNX 2POVA 1BN4A 5FL5A 1MUAA 3SBHA 3JXHC 1JV0A 1IF4A 3MNJA 5FNHA 3RYYA 1UGDA 1XPZA 4YYTA 4QJMA 1G45A 4G0CA 1BNNA 3KONA 2ABEA 4QK3A 2CBEA 3T82A 1H9NA 3KNEA 1I90A 3MMFA 4LHIA 4MLXA 2OSMA 3QYKA 1F2WA 3RZ0B 3SAXA 4L5UA 3VBDA 4CNXA 4RIVA 1RJ6A 4WW6A 1OQ5A 3DCCA 1EOUA 5EKHA 1RAYA 1HEBA 2AX2A 2CBCA 4E49A 3M1KA 5E2KA 3D8WA 1CAJA 3MHCA 3ML5A 1OKLA 3M2XA 3DVCA 1HCAA 1YDDA 1YO1A 3FFPX 1ZNCA 3OYSA 5SZ2A 2HNCA 4E9OX 1KOQA 5JEGB 1URTA 5EIJA 5DRSA 3D0NA 4LU3A 1AM6A 1G3ZA 2FMZA 2NWPA 3V2MA 3PYKA 5EHVA 4KNNA 4N16A 4FL7A 1CVDA 1DCAA 4MDLA 4CNVA 1TH9A 5FNJA 1TB0X 1UGBA 1YDCA 3DAZA 1CVFA 4WR7A 1AVNA 3DD8A 5EZTX 4ITOA 4TWMA 3V7XA 2POWA 3SAPA 8CA2A 1I8ZA 5SZ7A 4YXUA 4KP5A 4RUXA 1CNBA 4E3GA 1HCBA 1TEUX 3IBUA 4MLTA 5DSJA 1CNYA 4QTLA 5AMGA 3NB5A 1G4JA 1KEQA 3M04A 4XE1A 5IPZA 1V9IC 4FVOA 1TEQX 2FNNA 1CAHA 1FSQA 2FOUA 3V3IB 2X7SA 1G0EA 3IGPA 4ZWZA 1OKMA 3RYZA 5EKMA 2HD6A 2IT4A 5CLUA 2AW1A 3S76A 5FNKA 4N0XB 5FDCA 1ZFKA 1I9PA 3ML2A 5EH8A 4FIKA 4RUYA 4QEFA 4MTYA 2NN7A 5JESB 3D93A 5JEPB 1RZBA 1CIMA 4Q81A 4QJXA 5AMDA 3MZCA 1CVBA 2EZ7A 1HUHA 4K13A 4M2UA 1HEAA 5FDIA 4CACA 3MHMA 3N3JA 4ZWIA 5FLQA 1RZEA 3M5TA 3MNIA 3T84A 4FU5A 1RZCA 3MYQA 2CBAA 1G53A 1H4NA 4PYXA 5FL6A 3TMJA 2ILIA 3M1QA 4JSZA 5CACA 2NXSA 1A42A 3N2PA 3V3HB 3MHIA 1BNWA 3KS3A 4YWPA 4WW8A 4K1QA 1CAZA 5G0CA 4KP8A 4YGKA 1CA3A 2Q1QA 5DSOA 2Q1BA 1Z9YA 5DSLA 3RG4A 1KWQA 1G1DA 5FLRA 5DSPA 3C7PA 3P58A 4Q07A 5FNIA 5A6HA 2NMXA 2CBDA 3M5EA 5L6KA 1LG5A 1CNHA 1TTMA 5FLPA 3P4VA 3RYJB 4UOVA 3W6IA 1I9LA 5BRUA 3BL1A 1BNUA 5CA2A 2GD8A 5SZ4A 3IEOA 2QOAA 4M2RA 3BETA 4BF1A 3MWOA 2HKKA 5L3OA 4XFWA 1TG3A 5DOHA 5DSQA 1CRAA 1XEVA 4HT0A 1CVEA 2X7TA 1RZDA 4PQ7A 1G48A 2OSFA 4JSWA 4QIYA 4PYYA 3ZNCA 3P5AA 3F8EA 5JG5B 5HPJA 1FSRA 5FL4A 5JGTB 5FNGA 4Q49A 4XIXA 5E2SA 3HKQA 1BV3A 3F4XA 5SZ6A 3TVOX 3MHOA 4ETQC 4DZ7A 3S72B 4E3HA 1FR7A 3RJ7A 5DSMA 5BNLA 4YXOA 2HL4A 1TBTX 1ZE8A 4HU1A 1HEDA 1DMYA 3IBIA 5EH7A 1ZGFA 4YGJA 7CA2A 3CZVA 4Q83A 3S73B 1DCBA 4Q08A 3MDZA 1RAZA 1G54A 1HUGA 1OKNA 4FPTA 1CAIA 2NXRA 4KV0A 1FQNA 3P5LA 3M2NA 3OIMA 2NN1A 2CBBA 2O4ZA 1ZFQA 4IWZA 4BCWA 3KIGA 3U3AX 3EFIA 3M5SA 4E5QA 4QSJA 5EOIA 4Q8XA 1KWRA 1CALA 5BRWA 4ZWXA 1LUGA 4KUWA 4Q6DA 3F7BA 3B4FA 3V3FA 1CANA 1HECA 4KNJA 3DCSA 3OILA 4HEWA 3F7UA 4R5AA 4Q90A 6CA2A 3RZ1B 5JDVB 4XIWA 5FLTA 5DOGA 1IF5A 1YDBA 4DZ9A 3UYNA 1UGEA 1CCUA 1BNMA 5FLSA 5E5UA 2HOCA 1BZMA 3KWAA 2X7UA 3ZP9A 2POUA 5EHWA 5EHEA 4CQ0A 3M1JA 1T9NA 3R16A 3T5UA 4CNWA 5JQ0A 2NNVA 4Q7WA 1CVCA 5CJFA 4ITPA 5E2MA 3JXGA 4HF3A 3OIKA 2FW4A 2FNKA 1I91A 1THKA 2W2JA 3M98A 1RZAA 4FVNA 5DVXA 4COQA 1LGDA 3HLJA 4Q6EA 2NNOA 1JCZA 5JG3B 5JEHB 4Z1EA 5JQTA 4YX4A 3OY0A 1DMXA 3R17B 5SZ0A 3HS4A 1FQMA 4KUYA 5FNLA 3RYXB 1Z97A 1V9EA 2NWZA 4MO8A 2H4NA 4QSAA 5J8ZA 1IF6A 3RGEA 3EFTA 1IF9A 3M2ZA 4Q7VA 4TWLA 3P3JA 1CAYA 3M96A 3NJ9A 4Q09A 4Z1JA 1FQLA 3D9ZA 3K34A 3MNKA 4HBAA 4YGNA 2ZNCA 4RFDA 4YXIA 4Q78A 3IBNA 4ZAOA 2FNMA 1ZSAA 5SZ5A 1CNIA 4ZX0A 4HEYA 3FE4A 4PZHA 5E2NA 4YHAA 3DVBA 1CAMA 4KAPA 4QSIA 5E28A 3N0NA 4QK1A 1FLJA 1UGFA 2CA2A 2FOVA 4PXXA 1BN1A 1IF7A 3S77B 2QO8A 1LG6A 4Z1NA 4JS6A 1CRMA 5G0BA 3GZ0A 3HFPA 3KLDB 4M2VA 4XZ5A 4QJ0A 1XEGA 3DVDA 4QY3A 3DBUA 4IDRX 3V3JA 3S71B 3DC3A 4Q8ZA 1H9QA 3S9TA 5BRVA 2WEGA 3U45X 3BL0A 1KOPA 4QK2A 4Q8YA 2WEJA 1CAKA 2WD3A 3M14A 2WD2A 3DV7A 1HVAA 1UGCA 3OKVA 3T83A 4E3DA 2VVBX 3MHLA 1J9WA 4MDGA 3S97A 4X5SA 4C3TA 2CABA 1CVHA 3P44A 4R59A 1IF8A 4RUZA 1CINA 3MNHA 4ZWYA 1UGAA 3KOIA 5DSKA 4YVYA 4Y0JA 3Q31A 1CVAA 1YDAA 3T85A 3U47A 2NWOA 1TE3X 1BCDA 4HEZA 4Q7SA 3L14A 1CA2A 1BNTA 1CNWA 2FOSA 3KOKA 4QJOA 3N4BA 1FSNA 1ZSBA 4G7AA 4MDMA 5FNMA 1CNJA 5G03A 2FMGA 1Y7WA 3S78B 5A25A 1CAOA 3P55A 3PO6A 4BF6A 1CNCA 3PJJA 3SBIA 3LXEA 1I9MA 5DSIA 5DSRA 1YO2A 2NWYA 3JXFA 2H15A 1RJ5A 3M67A 4Q87A 1I9OA 5JGSB 3DCWA 3DC9A 3UYQA 4ILXA 4L5VA 3RZ5A 3M2YA 4E3FA 3S75B 3U7CA 1JD0A 3DD0A 3V2JA 3B1BA 4Q7PA 3T5ZA 1G4OA 3HKTA 2NXTA 3MNUA 5EKJA 3KKXA 1G52A 3K2FA 1CNGA 1CCTA 4R5BA 5SZ3A 3RYVB 5SZ1A 3P3HA 1YO0A 1ZSCA 3OKUA 4Z0QA 2GEHA 2FOYA 3RZ8A 4CA2A 4JSSA 1BNQA 3K7KA 5G01A 2NNSA 2HFWA 3HKNA 4KUVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DSN A;  1I9Q A;  5E2R A;  2VVA X;  4RFC A;  5E5R A;  2EU2 A;  3CAJ A;  4QJP A;  2QP6 A;  4QJW A;  2FOQ A;  5LMD A;  4K0Z A;  3DA2 A;  4Q06 A;  3RG3 A;  4YGL A;  1XQ0 A;  1CCS A;  4Q9Y A;  4WUP A;  5FLO A;  3M1W A;  1FQR A;  3V3G B;  3OYQ A;  12CA A;  1UGG A;  1Z93 A;  5EH5 A;  3CYU A;  4K0T A;  3NI5 A;  4FRC A;  1FR4 A;  3D92 A;  3RZ7 A;  1BIC A;  4M2W A;  3M3X A;  4L5W A;  2Q38 A;  2WEO A;  4WL4 A;  3W6H A;  2F14 A;  1AZM A;  4RN4 A;  5BYI A;  4Q99 A;  4GL1 X;  4QSB A;  4JSA A;  3IBL A;  4ZX1 A;  3HKU A;  4E4A A;  3IAI A;  2NNG A;  2EU3 A;  1CZM A;  4YGF A;  3MNA A;  1ZH9 A;  3FW3 A;  3CA2 A;  4QIZ A;  1BNV A;  5AML A;  3S74 B;  1I9N A;  1G46 A;  4RH2 A;  1CNK A;  4LP6 A;  4RIU A;  1LZV A;  1ZGE A;  4Z1K A;  3V5G A;  2WEH A;  4Q0L A;  1G0F A;  4CNR A;  1MOO A;  1CIL A;  1CNX A;  5C8I A;  4KNM A;  1TG9 A;  3S8X A;  1G6V A;  4HT2 A;  4KNI A;  9CA2 A;  4WUQ A;  3RLD A;  1BN3 A;  3M40 A;  4K0S A;  3TVN X;  2POV A;  1BN4 A;  5FL5 A;  1MUA A;  3SBH A;  3JXH C;  1JV0 A;  1IF4 A;  3MNJ A;  5FNH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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