3V3IB

Kinetic and structural studies of thermostabilized mutants of hca ii.
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGFGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSHDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVSKFRKLNFNGEGEPEEPMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Kinetic and structural characterization of thermostabilized mutants of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 70
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3v3iB00
1ZFKA 3D0NA 1CCUA 4IWZA 1V9IC 5SZ0A 4CA2A 5DVXA 4FL7A 3M2XA 1BNWA 2WEJA 1KOPA 5SZ6A 3CAJA 1CVDA 4Y0JA 1TEQX 4Q83A 4Q8YA 1FQMA 3OY0A 3T5UA 3KWAA 1IF7A 4K0TA 1UGBA 4RIVA 1G4OA 1KWQA 3DVCA 6CA2A 3M67A 4YGJA 4XIXA 5G0CA 3RLDA 4CNXA 4G0CA 3MYQA 4FU5A 4FVOA 5CA2A 3L14A 4BF6A 3RGEA 1G4JA 3S97A 1CVBA 1CAZA 3DD0A 1H4NA 4ITPA 4QJ0A 4Q78A 4R5AA 1CVCA 3V3FA 4KNMA 4KNNA 4Q08A 1FQNA 3S76A 1ZFQA 3MNKA 3IGPA 1IF4A 4YVYA 1BNMA 5EHEA 4WUQA 5EZTX 1FQLA 4ILXA 3S72B 3OKVA 3MHIA 5E5UA 5FLRA 5JEHB 1LUGA 4LHIA 1ZSCA 1HEBA 1G0FA 1G3ZA 1G46A 1YDAA 5DOGA 3MNUA 1HEDA 3M3XA 3KONA 1FSRA 3HKQA 3OYSA 4ITOA 1CAOA 3P5LA 5E2KA 3FE4A 1TEUX 3IAIA 1IF9A 3HKNA 2HD6A 1CVAA 4K0ZA 4YGKA 3LXEA 1RJ5A 3N2PA 4E3HA 3KKXA 9CA2A 3S78B 5FDCA 1CNWA 4MLXA 4QSJA 1TE3X 1RZDA 1ZH9A 1BN1A 4WW6A 3RZ5A 3OILA 1DCAA 1TTMA 1RZCA 4RH2A 3S73B 4MO8A 4WR7A 1CNGA 1RZAA 1BNQA 2NXSA 3V5GA 2AX2A 4IDRX 1CCTA 3KIGA 4YXIA 4Z1KA 1XEVA 4YWPA 2HL4A 1CNKA 2WEGA 4MDLA 3RYYA 1OKLA 4QJWA 3F7BA 4WL4A 2GEHA 5SZ5A 3SAPA 1Z9YA 3M5SA 4LU3A 2FOSA 5SZ4A 4ETQC 1BNVA 4FPTA 5EH8A 1UGCA 1HUGA 4WW8A 4MDGA 4PQ7A 2ZNCA 3ML5A 3M5TA 1XEGA 1CNXA 3U7CA 4Z1NA 3CA2A 2H15A 1YDDA 4ZWZA 3MHCA 4Q7WA 5SZ1A 2X7SA 4Q49A 3HKUA 3IBLA 5E5RA 3RZ8A 3RJ7A 5DSKA 3BL0A 4E5QA 3D92A 5FL4A 5BRWA 4E3FA 4E3GA 1UGFA 2NWYA 4QSBA 1HUHA 3SBHA 1YO0A 4M2VA 2NMXA 5DSRA 1RAYA 3HLJA 5JGTB 4RN4A 5EKMA 3DC3A 3M98A 5BYIA 2GD8A 7CA2A 3SBIA 4TWMA 2CA2A 5DSMA 3Q31A 3GZ0A 3S77B 3MDZA 3MNHA 3V2MA 2WEOA 4JSZA 3NI5A 1CNCA 4YXUA 4QJPA 5FLSA 5SZ3A 5E2NA 4HEWA 4HT0A 4Q8XA 5EKJA 3DA2A 3OIKA 3RYZA 1FSQA 4L5VA 3DBUA 3EFTA 4N16A 4CQ0A 3QYKA 2NXRA 5SZ7A 5G01A 5FNGA 1FSNA 3U45X 5G0BA 1MOOA 1EOUA 5EKHA 5FNJA 3TVNX 4KV0A 4Q07A 4G7AA 4Q9YA 2Q38A 1OQ5A 3IBUA 3D93A 3MWOA 2EU3A 2NNSA 2FOVA 2POUA 3N4BA 1CNHA 2QOAA 3PJJA 1G54A 1BV3A 1H9QA 4FVNA 1UGAA 3OYQA 2FOUA 1JCZA 2Q1QA 3RYXB 2AW1A 5JESB 4ZX0A 1BNUA 3T82A 3DAZA 5E2SA 5FLPA 2FNKA 5JG3B 1YDBA 5FNKA 4Q7SA 5FLTA 3MNJA 3NB5A 5JGSB 3TVOX 2W2JA 2HKKA 3RZ0B 1RAZA 5AMLA 1BNTA 3M2NA 4COQA 4L5UA 5DSNA 3V3HB 3M04A 4QJOA 3D9ZA 4QK2A 3MZCA 2VVBX 5DSOA 1FR7A 2CBAA 4PXXA 2FOQA 3MHOA 1UGGA 1A42A 1KWRA 3P3JA 1CNJA 4FIKA 5BRVA 4RUZA 3F7UA 5BRUA 1UGEA 4QK3A 1V9EA 3M96A 1ZGFA 1CINA 1LZVA 2NN7A 3M14A 4JS6A 1T9NA 2ABEA 3T83A 4QSAA 4Q6EA 5AMGA 5FL6A 3V3GB 2QO8A 3RZ7A 3IBNA 4Q87A 3DCWA 4QSIA 4RUXA 3S71B 4WUPA 4N0XB 4HT2A 4QIZA 1HEAA 4X5SA 4XZ5A 4HF3A 3W6HA 5CACA 4CNVA 1MUAA 1AM6A 3BETA 3DC9A 4Z0QA 4XFWA 1BN3A 1CAKA 1TBTX 1YDCA 1BZMA 1CVFA 1UGDA 3DV7A 5C8IA 1BICA 4RUYA 4Q81A 4Z1EA 3F4XA 3ZNCA 1ZGEA 3MHLA 3V7XA 1XPZA 1CAMA 4HBAA 1CZMA 4Q06A 1THKA 2OSMA 3CYUA 3V3JA 1KOQA 4TWLA 4Q09A 12CAA 4E4AA 4CNWA 1FR4A 2POVA 3EFIA 4ZWIA 5G03A 4KNJA 1DMXA 3FFPX 4KUWA 3U47A 2VVAX 4BF1A 1IF8A 1CANA 1G45A 3T5ZA 4YXOA 5E28A 5FNMA 1RZBA 5E2MA 1HCAA 4KP8A 5J8ZA 4Q8ZA 4PYXA 1CVEA 4JSWA 5LMDA 4QIYA 5FLQA 3PYKA 3T84A 4DZ7A 1HVAA 2HNCA 5E2RA 2WEHA 3RG4A 1I8ZA 1FQRA 3RZ1B 3P3HA 5EHVA 4HEYA 4CNRA 4QY3A 1BN4A 4ZWXA 2CBCA 1AZMA 3B4FA 3IBIA 2FNNA 4KNIA 1I9PA 3S9TA 4Q90A 3K7KA 4JSSA 3T85A 2FNMA 5DSPA 2HOCA 2IT4A 5JG5B 3NJ9A 5JDVB 5JQ0A 4MLTA 3S75B 3N3JA 1IF6A 2CBEA 3DVBA 3V2JA 4XIWA 1TG3A 3P5AA 1BNNA 4M2RA 3KNEA 4K0SA 3R17B 3KOKA 1G52A 4QJMA 4E49A 5FDIA 5EH7A 5DSJA 1OKMA 2QP6A 1H9NA 4PZHA 4ZAOA 1G48A 1CIMA 4KUVA 4MTYA 5JQTA 1J9WA 5L3OA 5A6HA 1TB0X 1ZNCA 5FNIA 3R16A 4K13A 3HS4A 3TMJA 2OSFA 4K1QA 4YGFA 4YYTA 1TH9A 4PYYA 1CALA 1Z97A 1OKNA 1CNBA 4QTLA 4M2WA 4ZWYA 5DSLA 3P58A 5EH5A 3SAXA 2NWPA 1IF5A 2NWOA 3MNIA 2X7UA 1CA2A 3JXFA 2EU2A 5HPJA 3FW3A 4KUYA 5FNLA 5IPZA 4CACA 1G1DA 1I9QA 2HFWA 2FMZA 8CA2A 4RIUA 1BCDA 5JEPB 3KOIA 1CA3A 2FMGA 3KS3A 4HU1A 5EIJA 5EHWA 2CBBA 3RG3A 1CNYA 3MMFA 3UYNA 5BNLA 2CABA 3M40A 4KAPA 5DSQA 1I9LA 1CNIA 1LG6A 2X7TA 4FRCA 2FW4A 1I9OA 4JSAA 3S74B 1ZE8A 4QJXA 4Q7PA 1FLJA 4HEZA 1CRAA 4YX4A 4Q99A 3ZP9A 4E3DA 2WD2A 3M1KA 2NNVA 1RZEA 4C3TA 3F8EA 3M1JA 3N0NA 3JXHC 1DCBA 4UOVA 4ZX1A 2NN1A 4YHAA 4Z1JA 2NWZA 1HCBA 5JEGB 1CAIA 3U3AX 3M1WA 3RYVB 1G0EA 3DCCA 4RFCA 3DVDA 1LG5A 1TG9A 1URTA 3DD8A 1G6VA 5DRSA 1JD0A 1I91A 4LP6A 5CLUA 5FLOA 3M2ZA 1DMYA 1CAYA 2NNGA 5FNHA 3KLDB 3CZVA 3UYQA 3K34A 4QEFA 5DOHA 3MHMA 1KEQA 1HECA 5EOIA 1XQ0A 3P44A 2Q1BA 1JV0A 4YGLA 4BCWA 4QK1A 4DZ9A 4YGNA 2FOYA 5L6KA 3C7PA 3OKUA 2NNOA 3RYJB 1I90A 1LGDA 5CJFA 3PO6A 1Z93A 2EZ7A 3HFPA 1CVHA 1ZSBA 3BL1A 1CRMA 3P4VA 5AMDA 4R59A 3HKTA 3MNAA 5A25A 4Q7VA 2H4NA 3ML2A 4E9OX 1I9NA 4Q0LA 2F14A 1I9MA 3IEOA 3M5EA 3DCSA 3M1QA 1YO2A 3D8WA 3W6IA 3VBDA 1F2WA 1YO1A 4R5BA 1CAJA 4XE1A 3JXGA 2O4ZA 2WD3A 1CILA 2NXTA 3S8XA 2POWA 1ZSAA 1CCSA 3M2YA 3P55A 4GL1X 4M2UA 1RJ6A 1CAHA 2CBDA 5DSIA 4L5WA 3B1BA 5SZ2A 3OIMA 3V3IB 4MDMA 1Y7WA 4RFDA 5FL5A 1AVNA 1G53A 3K2FA 4KP5A 2ILIA 4Q6DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZFK A;  3D0N A;  1CCU A;  4IWZ A;  1V9I C;  5SZ0 A;  4CA2 A;  5DVX A;  4FL7 A;  3M2X A;  1BNW A;  2WEJ A;  1KOP A;  5SZ6 A;  3CAJ A;  1CVD A;  4Y0J A;  1TEQ X;  4Q83 A;  4Q8Y A;  1FQM A;  3OY0 A;  3T5U A;  3KWA A;  1IF7 A;  4K0T A;  1UGB A;  4RIV A;  1G4O A;  1KWQ A;  3DVC A;  6CA2 A;  3M67 A;  4YGJ A;  4XIX A;  5G0C A;  3RLD A;  4CNX A;  4G0C A;  3MYQ A;  4FU5 A;  4FVO A;  5CA2 A;  3L14 A;  4BF6 A;  3RGE A;  1G4J A;  3S97 A;  1CVB A;  1CAZ A;  3DD0 A;  1H4N A;  4ITP A;  4QJ0 A;  4Q78 A;  4R5A A;  1CVC A;  3V3F A;  4KNM A;  4KNN A;  4Q08 A;  1FQN A;  3S76 A;  1ZFQ A;  3MNK A;  3IGP A;  1IF4 A;  4YVY A;  1BNM A;  5EHE A;  4WUQ A;  5EZT X;  1FQL A;  4ILX A;  3S72 B;  3OKV A;  3MHI A;  5E5U A;  5FLR A;  5JEH B;  1LUG A;  4LHI A;  1ZSC A;  1HEB A;  1G0F A;  1G3Z A;  1G46 A;  1YDA A;  5DOG A;  3MNU A;  1HED A;  3M3X A;  3KON A;  1FSR A;  3HKQ A;  3OYS A;  4ITO A;  1CAO A;  3P5L A;  5E2K A;  3FE4 A;  1TEU X;  3IAI A;  1IF9 A;  3HKN A;  2HD6 A;  1CVA A;  4K0Z A;  4YGK A;  3LXE A;  1RJ5 A;  3N2P A; 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