3DBUA

Use of carbonic anhydrase ii, ix active-site mimic, for the purpose of screening inhibitors for possible anti-cancer properties
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Design of a carbonic anhydrase IX active-site mimic to screen inhibitors for possible anticancer properties
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dbuA00
2WD2A 3Q31A 1HCBA 1TTMA 3CAJA 4YXIA 4YWPA 4QK1A 3P44A 2X7TA 3RYXB 5J8ZA 5DSOA 3KWAA 5FDCA 5FLPA 3DC9A 3M2XA 1CAJA 2WEJA 3MNAA 5E2RA 4K0SA 4Y0JA 5E2NA 4RUXA 1G54A 3DVBA 4BCWA 5DSIA 3V7XA 3D92A 4G7AA 4Q7SA 4E3HA 1TG9A 2WD3A 3S75B 1CA3A 1CAIA 3MNHA 2OSMA 4MDMA 5FL5A 3M04A 4Q7VA 1TB0X 1CVFA 3M67A 1BNMA 5EHVA 3T5ZA 4RIVA 3RZ8A 4JSWA 1HUGA 3JXGA 1IF4A 1BICA 5EKMA 3ZNCA 1AM6A 4DZ7A 3N3JA 4QTLA 2X7SA 3W6HA 1T9NA 4FIKA 4FVOA 5FNMA 3P5LA 2NWPA 1BCDA 1CAOA 1UGAA 3OIKA 1ZH9A 4LP6A 1G0FA 3HKNA 4YYTA 4ILXA 3CYUA 1G3ZA 4KNJA 3V3JA 2FOQA 4QSJA 1BNNA 4FL7A 4YGKA 1CAHA 4WUQA 1XPZA 4MLXA 6CA2A 3RZ5A 3V3FA 1CANA 1YO0A 4ZX1A 5FNKA 1RZAA 1G53A 1UGEA 1I8ZA 4ZAOA 1CZMA 4ITOA 3HKUA 1FSRA 4RUZA 4ZWYA 1G6VA 1CRAA 3D8WA 3MHLA 1CIMA 3K2FA 5E28A 2NXRA 4R5BA 3SAPA 4ITPA 2Q1BA 4FU5A 5E5RA 1V9IC 1FQRA 4KAPA 4Z1JA 4R5AA 2X7UA 1EOUA 1URTA 2POWA 2WEGA 2CBAA 4M2RA 4E5QA 1I90A 1UGCA 4K13A 3KOIA 3M5EA 1OKMA 5C8IA 4MO8A 4HU1A 3NB5A 4IWZA 4TWMA 4KUVA 5EH5A 1I9NA 4CQ0A 1CVBA 4M2WA 3IGPA 4Q8XA 1UGDA 2CBEA 1TG3A 5AMDA 7CA2A 3OKUA 5DVXA 4LU3A 3ML5A 3HLJA 5FLSA 4YGLA 3M5TA 5DSPA 4E3FA 1ZSCA 1J9WA 5DRSA 1ZFKA 1IF5A 1CALA 1BZMA 3M14A 3U45X 1G45A 4CACA 4Q7PA 1FQMA 1BNTA 4Q8YA 3K34A 3LXEA 4QJXA 4Q49A 5DSJA 3DVDA 1CRMA 3OKVA 1TEQX 3U3AX 3VBDA 4KNMA 1ZNCA 5EKJA 1KOQA 1ZGEA 4HF3A 2CA2A 4RN4A 3P4VA 4RUYA 4KUWA 2POUA 3N2PA 4QJPA 2QOAA 3KIGA 4TWLA 1CNKA 4YXOA 12CAA 1CVDA 3DCWA 1Y7WA 1CINA 2H4NA 3DAZA 1CNWA 1ZFQA 3M2ZA 2FNMA 2FMGA 1I9MA 1DCAA 5BYIA 4Q87A 3MHMA 1RJ6A 3M5SA 3IBIA 1FQLA 4KV0A 1CNHA 5A25A 5DSRA 5SZ1A 3W6IA 3MNJA 1XEGA 3T85A 4HT2A 5L6KA 8CA2A 1I9LA 4GL1X 1F2WA 5CJFA 3CZVA 1RZEA 4QEFA 1YO1A 4Q09A 2HFWA 9CA2A 1CNBA 1CAYA 2NXSA 4JSZA 5G01A 1YDBA 5AMGA 4HEZA 4X5SA 1DMYA 4YGNA 2QO8A 2VVAX 4JSSA 1G46A 4CNVA 3T84A 3RZ0B 4E9OX 3M1JA 5JQ0A 2FOYA 1CNJA 4ZX0A 5BNLA 4Z1NA 1HEDA 3DVCA 2HOCA 3UYNA 5E2MA 1FR7A 1AVNA 2WEOA 1THKA 4Q8ZA 1KOPA 3RJ7A 5JGTB 3RZ7A 4XFWA 4DZ9A 5FLRA 3KOKA 3RYVB 1ZE8A 1CVEA 2EZ7A 5SZ0A 3ML2A 4PYXA 2EU2A 2F14A 4KP8A 3DBUA 3QYKA 1CNYA 4RFDA 1BNQA 3DCCA 3RGEA 5JG3B 3M96A 2GEHA 1G0EA 1CNGA 4KNIA 4N16A 1BN1A 1RZBA 1YDAA 5JQTA 3MNIA 3T5UA 2NWYA 3RYZA 3K7KA 1MUAA 2W2JA 2GD8A 4ZWXA 3SBHA 1Z97A 1HVAA 4BF1A 4PYYA 3EFTA 5L3OA 2EU3A 1JCZA 4QIZA 3F4XA 2POVA 2HD6A 4KNNA 4RIUA 3ZP9A 2ABEA 3KNEA 3HKQA 3MHOA 1KEQA 1TE3X 4HBAA 1LZVA 4CA2A 3C7PA 5FDIA 4Q06A 5IPZA 5SZ7A 4WW8A 1OKLA 1YO2A 3IEOA 3MYQA 1H9QA 4K1QA 1MOOA 5BRUA 3BL1A 1I91A 3U47A 5EKHA 2Q38A 4FVNA 3SAXA 2FNNA 5FLOA 5FNIA 4YXUA 3F7BA 5G0CA 3KLDB 4Q83A 1BNWA 1CAZA 3OYQA 1BNUA 2NNVA 3S72B 3S71B 4Q0LA 5EOIA 3S73B 3S76A 1JV0A 2HNCA 4Q6EA 4CNWA 1FQNA 2NNSA 3MNKA 4G0CA 4QJWA 1YDDA 1KWQA 5EH7A 2O4ZA 5FL6A 2FOSA 4PZHA 1OQ5A 4IDRX 3RG3A 3M98A 1FR4A 3MHCA 3M1WA 1HEBA 3HKTA 3N4BA 5SZ5A 1CNCA 4Q08A 1RAZA 4HEYA 5A6HA 5DSQA 4R59A 3MZCA 1CCSA 4Q9YA 3MMFA 4QSIA 1LGDA 3FE4A 4WR7A 5EH8A 4ZWZA 3IBNA 4ZWIA 4QK3A 4XE1A 1RZDA 3TMJA 3KONA 2FMZA 4WL4A 3CA2A 5G03A 1AZMA 3RYYA 3KS3A 5DOGA 4E3GA 4MLTA 1BN4A 3D9ZA 1CVCA 4WUPA 2VVBX 4CNXA 1Z93A 3UYQA 4M2UA 4QY3A 4Z0QA 2OSFA 1LUGA 5LMDA 3B1BA 3P3JA 3S9TA 5EIJA 5AMLA 1CVHA 3IBLA 1DMXA 3NI5A 3NJ9A 4JSAA 3P55A 3F8EA 2Q1QA 4YX4A 2NMXA 5JEGB 5E2KA 5HPJA 3DA2A 3HFPA 1G1DA 4Q78A 3L14A 5EZTX 5BRVA 5SZ4A 4Q99A 3S8XA 1CVAA 5CA2A 3MNUA 1IF6A 4RH2A 1I9PA 1IF9A 5E5UA 1RAYA 3RZ1B 1CCUA 4YGFA 3S78B 2FOUA 2WEHA 3HS4A 5JDVB 4KP5A 4PQ7A 1I9OA 5EHWA 3V3HB 3S74B 2QP6A 2CABA 4ETQC 1ZSAA 4QJ0A 3RYJB 1UGFA 5G0BA 3S77B 4JS6A 3OY0A 4BF6A 1Z9YA 3OIMA 3SBIA 4L5UA 3P3HA 5JG5B 1UGGA 5FNHA 3DCSA 2NWOA 2ZNCA 4PXXA 3BETA 3FW3A 3IAIA 3DV7A 4MTYA 4LHIA 3M1QA 4E3DA 5SZ3A 5CLUA 2HL4A 4L5WA 4Z1KA 3RG4A 1HECA 1ZSBA 3N0NA 5DSKA 4COQA 1TBTX 2AW1A 3OYSA 3JXFA 3R16A 4M2VA 2NNGA 3TVOX 1FSNA 1RJ5A 1ZGFA 4YHAA 3T82A 3D0NA 5DSLA 3V3GB 1CNIA 3RLDA 4K0ZA 1CNXA 4Q90A 4HEWA 2NWZA 1KWRA 4FPTA 5CACA 2CBDA 5EHEA 5DSNA 3MHIA 4MDLA 4C3TA 1LG5A 2IT4A 1HUHA 3IBUA 3F7UA 3T83A 4Q81A 3TVNX 3KKXA 3MDZA 3P58A 5DSMA 5JGSB 4Z1EA 4QSAA 5SZ6A 4RFCA 3V5GA 1CCTA 3FFPX 3PO6A 4N0XB 3DD8A 3EFIA 2FNKA 2FW4A 4Q6DA 4QJMA 3OILA 4Q07A 1BN3A 4XIXA 3D93A 5FLQA 1LG6A 3MWOA 1CAKA 1G48A 1IF7A 3M40A 3M3XA 2NXTA 1CA2A 3R17B 4UOVA 4E49A 2CBCA 4YVYA 3PJJA 2HKKA 4YGJA 1H4NA 1G4OA 4QSBA 1H9NA 4K0TA 5SZ2A 4FRCA 2FOVA 5BRWA 5FLTA 3V2MA 1V9EA 3V3IB 1HCAA 1XEVA 5FNGA 5FL4A 4KUYA 1A42A 4Q7WA 4XIWA 1TEUX 2NN1A 1BNVA 1IF8A 2H15A 3GZ0A 1BV3A 4QK2A 3DC3A 5E2SA 1RZCA 2NN7A 3V2JA 1G4JA 5DOHA 4E4AA 3DD0A 2CBBA 5JEPB 3U7CA 1TH9A 1CAMA 5JESB 1OKNA 3P5AA 1JD0A 3S97A 1UGBA 2AX2A 3JXHC 5FNLA 3PYKA 4WW6A 3B4FA 1I9QA 3M2NA 5FNJA 2NNOA 4HT0A 1HEAA 4L5VA 1YDCA 4CNRA 1FSQA 2ILIA 1FLJA 1XQ0A 3BL0A 3M2YA 5JEHB 1G52A 4XZ5A 4MDGA 4QJOA 4QIYA 3M1KA 1CILA 1DCBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WD2 A;  3Q31 A;  1HCB A;  1TTM A;  3CAJ A;  4YXI A;  4YWP A;  4QK1 A;  3P44 A;  2X7T A;  3RYX B;  5J8Z A;  5DSO A;  3KWA A;  5FDC A;  5FLP A;  3DC9 A;  3M2X A;  1CAJ A;  2WEJ A;  3MNA A;  5E2R A;  4K0S A;  4Y0J A;  5E2N A;  4RUX A;  1G54 A;  3DVB A;  4BCW A;  5DSI A;  3V7X A;  3D92 A;  4G7A A;  4Q7S A;  4E3H A;  1TG9 A;  2WD3 A;  3S75 B;  1CA3 A;  1CAI A;  3MNH A;  2OSM A;  4MDM A;  5FL5 A;  3M04 A;  4Q7V A;  1TB0 X;  1CVF A;  3M67 A;  1BNM A;  5EHV A;  3T5Z A;  4RIV A;  3RZ8 A;  4JSW A;  1HUG A;  3JXG A;  1IF4 A;  1BIC A;  5EKM A;  3ZNC A;  1AM6 A;  4DZ7 A;  3N3J A;  4QTL A;  2X7S A;  3W6H A;  1T9N A;  4FIK A;  4FVO A;  5FNM A;  3P5L A;  2NWP A;  1BCD A;  1CAO A;  1UGA A;  3OIK A;  1ZH9 A;  4LP6 A;  1G0F A;  3HKN A;  4YYT A;  4ILX A;  3CYU A;  1G3Z A;  4KNJ A;  3V3J A;  2FOQ A;  4QSJ A;  1BNN A;  4FL7 A;  4YGK A;  1CAH A;  4WUQ A;  1XPZ A;  4MLX A;  6CA2 A;  3RZ5 A;  3V3F A;  1CAN A;  1YO0 A;  4ZX1 A;  5FNK A;  1RZA A;  1G53 A;  1UGE A;  1I8Z A;  4ZAO A;  1CZM A;  4ITO A;  3HKU A;  1FSR A; 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