3K7KA

Crystal structure of the complex between carbonic anhydrase ii and anions
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Carbonic anhydrase inhibitors. X-ray crystal studies of the carbonic anhydrase II-trithiocarbonate adduct-An inhibitor mimicking the sulfonamide and urea binding to the enzyme
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3k7kA00
3IAIA 5FNLA 3M2XA 3DV7A 3KKXA 3DA2A 2W2JA 4E3GA 1CNYA 1RAYA 2NNVA 1BCDA 1OKNA 3HFPA 3DCSA 5G0CA 3IGPA 2ABEA 4YXOA 2POUA 1CVCA 4CNWA 5DSQA 3M1WA 1CRAA 1LGDA 4E5QA 4FU5A 1H4NA 4K13A 3S73B 3MZCA 4IWZA 1IF5A 3SBIA 4RN4A 3IBNA 3VBDA 4WR7A 4YGJA 1I8ZA 5SZ7A 4CQ0A 4MLTA 4WW6A 1CRMA 1IF4A 5SZ0A 1CNGA 2NXTA 3RGEA 2EZ7A 3V7XA 3SAPA 1UGEA 7CA2A 3S8XA 3TVOX 3F7BA 3JXFA 5FNGA 4L5VA 1TB0X 4RIUA 1G3ZA 1IF6A 4WL4A 4Z1JA 4QSIA 1LZVA 4LU3A 4Q90A 5EOIA 5E5UA 3D8WA 4L5WA 4KP8A 3MMFA 4QJMA 4PZHA 4Q6DA 3S75B 2NWYA 4HEYA 4WUPA 2NWOA 1CVHA 2H15A 4HEZA 5BYIA 1XPZA 4FVNA 4CACA 1G45A 3KIGA 3IBLA 4Q09A 2HKKA 4WW8A 3NJ9A 3P3HA 4ZWIA 4MO8A 1IF7A 3L14A 1THKA 1ZSBA 3DC9A 1JD0A 5E5RA 3P58A 3RYXB 5JQ0A 1KWQA 1RZBA 4YXUA 4Q83A 4QSBA 1CNBA 1LG5A 4G7AA 4JSAA 2NXSA 3KONA 3M98A 4Q7SA 3S97A 1BICA 4YGFA 5IPZA 3M14A 2CBAA 1G4OA 3FE4A 4R5BA 1RJ6A 4Q6EA 2ZNCA 3R17B 2WEGA 5EH8A 4ZX1A 1BNTA 4JSSA 5E2MA 1YDAA 3DCWA 1FLJA 3P55A 2EU3A 5FNHA 2NWPA 3P44A 3M1JA 3MHIA 3N0NA 2HD6A 5FDIA 1TG9A 3DAZA 1KOPA 4QSJA 2FOSA 5G01A 3T85A 1JCZA 5SZ4A 3HS4A 3M2NA 1CVEA 5FLSA 1FQNA 4PYXA 1BNWA 4TWMA 5FNJA 1Z97A 3DVDA 3MNJA 4LP6A 4QJXA 1I9PA 1XQ0A 5BRWA 1TEUX 4Q87A 4QEFA 4Q0LA 3D0NA 1G1DA 3MNAA 4QJPA 2NN1A 3OILA 3KNEA 4K0ZA 2CA2A 4Q49A 3RZ1B 3DVBA 1G53A 3V3HB 5DVXA 4XE1A 4MDGA 4RFDA 1BNUA 1G54A 1Y7WA 3F7UA 4WUQA 5DSMA 2CBCA 1TE3X 1Z93A 4ZAOA 3FW3A 5JDVB 4Q08A 4Q8XA 5JESB 4QJOA 4Z1EA 1OKLA 1FQMA 1BV3A 1LG6A 3RG3A 5DSIA 4M2UA 2GEHA 5FNIA 5SZ5A 1BNQA 3D93A 1IF9A 2F14A 1BN3A 4Z0QA 3U45X 5A6HA 4QK3A 1KEQA 3M96A 3Q31A 3DBUA 5SZ2A 3RJ7A 4Q8YA 1RZAA 3CYUA 4YGNA 1FR7A 3S74B 3V5GA 4DZ7A 3B1BA 1DCAA 2X7UA 4ZWYA 3OY0A 4CNVA 3MHCA 4KUVA 1CCSA 1CAKA 3DD8A 5CJFA 5CACA 2NXRA 1I90A 2Q38A 3MHOA 4L5UA 3V2MA 3OIKA 3ML2A 4UOVA 5AMLA 2FNNA 4Q78A 4RIVA 3MWOA 4R59A 1EOUA 4QIYA 1CVAA 1CVBA 4QJWA 4BF1A 4Q81A 2H4NA 1CA3A 5DSRA 5G03A 1BNMA 3BL0A 1CNWA 4K0TA 5DSOA 4COQA 5FL5A 1CVDA 1F2WA 4KNNA 3QYKA 5EH5A 1CAHA 3S71B 4YXIA 4FVOA 3FFPX 5SZ6A 1DMXA 4Q7WA 4G0CA 3OYQA 5JGSB 1CANA 1ZSCA 1I9NA 3D92A 1RZDA 4QK1A 1KWRA 4Q07A 3RG4A 3ZNCA 3LXEA 1TEQX 4K0SA 3KLDB 3OKUA 3N4BA 1ZSAA 2AW1A 5EKMA 3K2FA 5JEPB 3MDZA 4Z1KA 5HPJA 2Q1QA 1V9EA 2OSMA 1RZEA 2WD3A 3P3JA 3S72B 5CA2A 5FLTA 5CLUA 1CALA 2NNSA 3JXHC 4MDLA 4N16A 3S9TA 1IF8A 4Q7PA 1ZH9A 3M5TA 8CA2A 1I91A 3KS3A 1ZGEA 3PO6A 1A42A 4KNJA 1YO0A 2FOUA 3M1KA 2VVBX 5DSNA 4FRCA 1CAJA 4M2RA 4RUYA 1RZCA 4MLXA 1AZMA 3RZ8A 1CAYA 1HUGA 1ZFQA 1BZMA 3M67A 3U7CA 5FNMA 5BNLA 3V3JA 5FLPA 5C8IA 3NI5A 3T5ZA 2WD2A 2FW4A 5FNKA 5DOGA 1YDDA 2X7TA 3P4VA 1CNKA 1UGCA 3RYJB 1JV0A 3EFIA 3M5SA 4QIZA 4KV0A 1ZFKA 1CAMA 4JSZA 4FL7A 1CINA 3M5EA 4FPTA 5EKHA 5G0BA 5L3OA 3SAXA 1CNHA 1TBTX 4ITOA 2WEOA 4C3TA 1HCAA 5JEHB 4KAPA 3RYVB 4LHIA 5EHEA 3OIMA 1DCBA 4XIWA 5E28A 4XFWA 1MUAA 5SZ3A 5JG3B 5FLRA 1FSNA 1ZNCA 1OKMA 3W6IA 3K7KA 3T5UA 1CZMA 3F4XA 4Q06A 4CNXA 5SZ1A 1CAIA 3N2PA 1CCUA 3C7PA 4DZ9A 4Z1NA 1FR4A 2HFWA 4ITPA 2WEJA 3BETA 4R5AA 1FQLA 2FNKA 1UGFA 2O4ZA 3MHLA 3KOKA 1RAZA 4E49A 1CAZA 3V3GB 4Q9YA 1FSQA 1G48A 3P5LA 4YHAA 4PYYA 5DSLA 4YVYA 3JXGA 1FQRA 3S78B 3T83A 1XEGA 3DCCA 3RZ0B 4E9OX 3UYNA 4HF3A 1HEAA 3P5AA 5E2KA 4FIKA 3NB5A 1CILA 3HKTA 1BN4A 1UGBA 2GD8A 1HUHA 6CA2A 3HKNA 1HVAA 1CNCA 1ZGFA 5DOHA 3HKUA 3T82A 4PQ7A 4YX4A 4RFCA 1I9MA 3MNHA 3ML5A 3M04A 1G0FA 2X7SA 2NMXA 4KNMA 3GZ0A 3IBIA 4QSAA 4ZWXA 3S76A 3U47A 2POVA 5A25A 3S77B 4CA2A 4HT0A 4RUZA 3MHMA 1BNNA 4Q8ZA 9CA2A 4HBAA 4E3HA 1CNJA 1CNIA 4YGLA 5EHVA 1TG3A 4E3FA 5J8ZA 4ZX0A 2Q1BA 3HLJA 2QOAA 4M2WA 1UGDA 3K34A 1Z9YA 3MNKA 2NWZA 1YO2A 5DSPA 1HCBA 1XEVA 1YDCA 5EKJA 1BNVA 4KP5A 3MNUA 4MDMA 4PXXA 3KOIA 1HECA 1V9IC 1UGGA 1G4JA 4HU1A 4E4AA 1HEDA 3IEOA 2NN7A 1CCTA 3M2ZA 12CAA 5JEGB 2CABA 1G6VA 3PJJA 4ETQC 3B4FA 3UYQA 3ZP9A 3EFTA 4Q7VA 1FSRA 3OKVA 1J9WA 2OSFA 3MNIA 5EH7A 3T84A 3DD0A 4XZ5A 4GL1X 3U3AX 3OYSA 2HNCA 1ZE8A 2FMGA 4X5SA 3W6HA 4Y0JA 4YYTA 4QK2A 3D9ZA 2CBEA 3BL1A 1CNXA 3M1QA 1DMYA 5L6KA 1CVFA 1T9NA 5DSKA 1TH9A 3RZ5A 5FLOA 4XIXA 5AMGA 4JS6A 5LMDA 3HKQA 4TWLA 3M40A 1G0EA 4CNRA 3RYYA 3DC3A 1TTMA 2VVAX 5EZTX 4QY3A 1G46A 3R16A 3M2YA 3KWAA 1LUGA 2FMZA 1CIMA 2CBDA 3SBHA 1HEBA 3N3JA 4ILXA 1URTA 5JG5B 5EIJA 1RJ5A 4RUXA 4IDRX 5JQTA 4QTLA 1I9OA 4N0XB 3IBUA 4KUYA 2HL4A 4HEWA 1UGAA 5E2RA 2IT4A 4YWPA 4JSWA 3RZ7A 3CA2A 3RLDA 4YGKA 3CZVA 1CA2A 3M3XA 4KUWA 1I9LA 4BCWA 2NNOA 2FOVA 1CAOA 2FOQA 4QJ0A 1BN1A 2ILIA 3TMJA 1YO1A 5EHWA 5FL4A 4K1QA 5DRSA 4MTYA 2WEHA 1I9QA 1MOOA 3CAJA 3DVCA 5DSJA 3V2JA 1KOQA 1G52A 1AM6A 4RH2A 4KNIA 3TVNX 3V3FA 3PYKA 1OQ5A 4ZWZA 5FDCA 2NNGA 4M2VA 5BRUA 4Q99A 2FOYA 4HT2A 5FL6A 1H9NA 2POWA 3F8EA 3MYQA 2HOCA 5JGTB 5AMDA 4E3DA 2QP6A 5E2NA 3RYZA 2QO8A 2EU2A 3V3IB 2FNMA 5FLQA 5E2SA 1AVNA 1YDBA 2CBBA 2AX2A 4BF6A 5BRVA 1H9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IAI A;  5FNL A;  3M2X A;  3DV7 A;  3KKX A;  3DA2 A;  2W2J A;  4E3G A;  1CNY A;  1RAY A;  2NNV A;  1BCD A;  1OKN A;  3HFP A;  3DCS A;  5G0C A;  3IGP A;  2ABE A;  4YXO A;  2POU A;  1CVC A;  4CNW A;  5DSQ A;  3M1W A;  1CRA A;  1LGD A;  4E5Q A;  4FU5 A;  1H4N A;  4K13 A;  3S73 B;  3MZC A;  4IWZ A;  1IF5 A;  3SBI A;  4RN4 A;  3IBN A;  3VBD A;  4WR7 A;  4YGJ A;  1I8Z A;  5SZ7 A;  4CQ0 A;  4MLT A;  4WW6 A;  1CRM A;  1IF4 A;  5SZ0 A;  1CNG A;  2NXT A;  3RGE A;  2EZ7 A;  3V7X A;  3SAP A;  1UGE A;  7CA2 A;  3S8X A;  3TVO X;  3F7B A;  3JXF A;  5FNG A;  4L5V A;  1TB0 X;  4RIU A;  1G3Z A;  1IF6 A;  4WL4 A;  4Z1J A;  4QSI A;  1LZV A;  4LU3 A;  4Q90 A;  5EOI A;  5E5U A;  3D8W A;  4L5W A;  4KP8 A;  3MMF A;  4QJM A;  4PZH A;  4Q6D A;  3S75 B;  2NWY A;  4HEY A;  4WUP A;  2NWO A;  1CVH A;  2H15 A;  4HEZ A;  5BYI A;  1XPZ A;  4FVN A;  4CAC A;  1G45 A;  3KIG A;  3IBL A;  4Q09 A;  2HKK A;  4WW8 A;  3NJ9 A;  3P3H A;  4ZWI A;  4MO8 A;  1IF7 A;  3L14 A;  1THK A;  1ZSB A;  3DC9 A;  1JD0 A;  5E5R A;  3P58 A;  3RYX B; 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