3M5TA

Fragment tethered to carbonic anhydrase ii h64c mutant
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGCAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Fragment screening on Carbonic Anhydrase II via Tethering approach
rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3m5tA00
1CVFA 4QEFA 2WEHA 5EHWA 1I9LA 3P5LA 4ITPA 1CZMA 1I9PA 5SZ5A 3W6HA 3DD8A 3P58A 1OKLA 4HT0A 5CLUA 3HKQA 1G3ZA 3V3GB 2CA2A 3P44A 2Q1BA 1RAZA 3P5AA 3DC3A 2NWPA 3L14A 3DA2A 1JD0A 4Q06A 3W6IA 1IF7A 4Z1KA 4YGJA 4E9OX 3M5EA 4Y0JA 3T82A 4Q8XA 1XQ0A 2FOSA 3BETA 5EHEA 4RUXA 5G03A 1BZMA 2HOCA 3EFTA 1FQMA 1BNVA 3V3FA 3JXGA 3T85A 1BNMA 5IPZA 4BF6A 3K7KA 1FLJA 4QK1A 3RYJB 3U47A 3V2MA 4RFCA 4K0ZA 5AMGA 5SZ7A 1RZEA 4CQ0A 1UGGA 1F2WA 1URTA 1ZFQA 3M40A 4LHIA 2CBEA 2F14A 4RIUA 3EFIA 1CRAA 4BF1A 5JEGB 1TTMA 3GZ0A 3Q31A 4WR7A 4QY3A 3MNKA 5SZ1A 3SAXA 5G01A 5EKHA 2W2JA 4QSAA 5JGSB 5DOGA 1BV3A 5JEHB 4E3DA 1HUGA 1I9OA 3M5TA 3ML5A 4QTLA 5DSKA 1JCZA 3TMJA 5DSOA 5JDVB 5CACA 4YGFA 3VBDA 3S78B 3MNAA 4JS6A 5DRSA 4ZAOA 3RZ1B 4L5UA 4M2VA 3NB5A 5E2MA 3S8XA 4YX4A 1HCBA 3MNIA 3S76A 3M04A 1V9EA 5G0BA 5FLQA 2WEOA 3OYQA 3PJJA 4ZWZA 3DVBA 5SZ0A 1G4JA 1Z93A 5AMDA 2FOVA 3F7UA 1TEQX 3S73B 5J8ZA 5BRUA 1RZCA 3IBUA 4WL4A 3M1QA 4KP8A 4FVOA 4CA2A 4IDRX 2HD6A 1FSQA 1YO2A 4Z1NA 6CA2A 3DCSA 5JG3B 4M2WA 3RG4A 4RIVA 3S9TA 4Q7PA 3SBHA 5FL6A 4ZX0A 4XIXA 4MDGA 1CNYA 5FNMA 5EKMA 1G53A 1OQ5A 5DSRA 5EH5A 3JXFA 2NMXA 3ZP9A 1TEUX 1CIMA 4G7AA 4KUYA 3OKUA 3S74B 1RZAA 3N4BA 3MHLA 1G52A 2EU3A 1UGDA 1CAOA 3U45X 1CANA 3V3HB 1RZDA 5EZTX 4QJWA 1CNIA 5L3OA 4C3TA 3ZNCA 5EHVA 3CZVA 3DV7A 1ZSBA 1BNQA 4QJPA 1CA3A 3FW3A 4KP5A 2FNKA 5A25A 3V7XA 3P3JA 3M1WA 1DMYA 1IF8A 3N0NA 1V9IC 1CVBA 2NNGA 1HVAA 4FPTA 4PYYA 2CBDA 2FMZA 5E2NA 4PQ7A 1FQRA 3KOKA 1AZMA 1ZGFA 1KWRA 1OKNA 2HKKA 5E2RA 5G0CA 2HNCA 1CVDA 2EU2A 2FNMA 5FDCA 4PZHA 2ZNCA 3F4XA 1MOOA 3DBUA 1CCTA 4HBAA 4IWZA 4Q8YA 4ZWXA 5BRVA 3MNHA 2VVBX 4M2UA 1TBTX 3MMFA 4Q81A 4Z0QA 4YXOA 2NNOA 1RAYA 2OSFA 4QJXA 1YDBA 1Z9YA 1Z97A 1CAZA 4JSWA 5DSPA 4MLTA 3DVCA 4MDLA 3MNJA 3RYZA 3M14A 3D8WA 3DVDA 2CABA 4Q7VA 3T5UA 1I9QA 2POUA 1CALA 1FQNA 4ITOA 1CVHA 4TWMA 3MWOA 4RFDA 3SAPA 1H4NA 1TG9A 5EIJA 2FNNA 4RH2A 3P4VA 4Z1EA 4MDMA 3S71B 2NN7A 1HUHA 3FE4A 3IGPA 4XFWA 4Q7SA 3MYQA 4KNNA 5HPJA 4MTYA 3M5SA 1TB0X 3DCWA 3QYKA 4QK2A 4YXIA 2POWA 1H9QA 4JSAA 1I9NA 1RJ5A 3KS3A 4UOVA 3IBIA 9CA2A 4WUPA 4R5AA 5DSMA 1IF4A 3NJ9A 4Q07A 4YHAA 3U7CA 4LU3A 3SBIA 3D9ZA 8CA2A 3RZ7A 3UYNA 5FNJA 1G1DA 3DC9A 4CNVA 4KV0A 3P3HA 1DMXA 2NWYA 1HEBA 3RLDA 1UGEA 1YDCA 3S77B 4Q9YA 5DOHA 3HKUA 5FNLA 2NXRA 4Q49A 1UGFA 3MHOA 3CA2A 1G46A 3RYYA 1T9NA 1AVNA 1ZE8A 5EH7A 4XIWA 1BICA 1I91A 5FDIA 5JQTA 1CAMA 1ZGEA 1H9NA 1LGDA 2NNSA 3N2PA 4RN4A 1XEGA 3F8EA 1LG6A 1ZFKA 2X7SA 4Q7WA 3HLJA 2X7UA 1CCSA 5JEPB 4DZ7A 4QIYA 4ZX1A 1EOUA 2NWZA 1CRMA 1KEQA 1LZVA 4HT2A 3M96A 5JG5B 4RUZA 1Y7WA 1CILA 4HEWA 4R59A 1CNWA 2NN1A 3LXEA 3K34A 3HKNA 1XEVA 4QK3A 5BYIA 1DCAA 2QP6A 3KWAA 1IF6A 1ZNCA 4KNIA 5JESB 1CAJA 2X7TA 3R17B 4LP6A 3F7BA 4GL1X 1BCDA 1BN4A 4QJ0A 1G0FA 4E5QA 3M98A 1J9WA 1I8ZA 3V3JA 3RG3A 2QOAA 3DCCA 2FW4A 5A6HA 3KKXA 4Q83A 1OKMA 3M67A 5E2KA 2GD8A 5FLOA 5EKJA 2H15A 1YDDA 4KAPA 1FQLA 3B1BA 4XE1A 3T84A 4QSJA 5FNHA 4YGKA 3V5GA 1CVAA 2VVAX 4Q6DA 3IAIA 3M2ZA 1G0EA 5FL4A 3PO6A 1HEAA 4Q87A 4XZ5A 1DCBA 1IF9A 5BNLA 1G54A 2NXTA 3MZCA 3ML2A 1ZSCA 4Q78A 4K0SA 1CVEA 2QO8A 1CAYA 4WW6A 3M1JA 3M2YA 4E4AA 5FLRA 3S97A 1CAIA 1A42A 2ABEA 4QSBA 4E3HA 5C8IA 4PXXA 4ZWIA 1KOPA 2FMGA 2OSMA 1BNTA 1CNCA 4M2RA 4YGNA 3OY0A 3MHCA 4MLXA 3JXHC 4KUWA 4COQA 3RZ8A 4G0CA 1ZSAA 3BL0A 1CNKA 3B4FA 2IT4A 4Q99A 3M3XA 3RZ0B 4ILXA 1IF5A 1UGBA 5JGTB 3N3JA 4CNXA 5L6KA 1CA2A 2CBBA 3TVOX 1CCUA 3IBLA 1FR7A 5E5RA 3RGEA 3V3IB 4Q8ZA 5CJFA 12CAA 2WEGA 4QJOA 1YO0A 2FOUA 5DSIA 4HEYA 4R5BA 4YWPA 4YXUA 3HFPA 1CVCA 5E2SA 1CNHA 2POVA 3HKTA 1UGAA 4BCWA 3OIKA 1CNXA 4HEZA 3MNUA 3M2XA 1CNBA 3OILA 5FNGA 1CINA 5EH8A 5DSQA 2FOYA 5E28A 4TWLA 4YYTA 2H4NA 4HF3A 5DSLA 4CACA 5JQ0A 4K0TA 4E49A 4Q6EA 5AMLA 4CNRA 1FR4A 4Q09A 4QIZA 4KNMA 5FNIA 4QSIA 4L5VA 4JSZA 1CAHA 3D93A 5CA2A 4WW8A 4FU5A 3BL1A 3R16A 5SZ4A 3P55A 5DSNA 5SZ3A 1G4OA 3V2JA 1RZBA 4K13A 3NI5A 5EOIA 3C7PA 3HS4A 3OIMA 4KNJA 3KLDB 1CAKA 1G48A 2Q1QA 2WD3A 2EZ7A 3IEOA 4FL7A 2CBAA 3U3AX 3KNEA 1CNGA 1LUGA 3D0NA 1RJ6A 1G45A 1I90A 3RJ7A 3OYSA 5E5UA 1I9MA 1JV0A 3KONA 2AW1A 3D92A 3DD0A 4X5SA 5LMDA 4L5WA 1TG3A 3RZ5A 1TE3X 5DVXA 3K2FA 1BNUA 3KOIA 4CNWA 3RYXB 3M1KA 3M2NA 1YDAA 2WD2A 1UGCA 2GEHA 4QJMA 3UYQA 3S75B 2AX2A 7CA2A 4N16A 1TH9A 2FOQA 4Z1JA 4ETQC 4Q08A 4MO8A 5FLSA 4FVNA 1BNWA 4FRCA 3S72B 2Q38A 5FL5A 2NNVA 3T5ZA 1YO1A 4DZ9A 2WEJA 3FFPX 1BNNA 1BN1A 5SZ2A 1KOQA 4ZWYA 4FIKA 4K1QA 4Q0LA 1KWQA 3MHMA 3MDZA 5FNKA 1FSNA 1LG5A 4WUQA 5FLPA 1HCAA 4E3FA 4YGLA 4N0XB 3RYVB 5BRWA 2NXSA 2HL4A 2NWOA 1HECA 1THKA 3CYUA 1MUAA 4RUYA 3TVNX 4PYXA 4E3GA 1HEDA 1XPZA 1BN3A 5DSJA 4HU1A 3CAJA 1AM6A 4KUVA 3OKVA 2HFWA 3MHIA 2ILIA 3IBNA 3T83A 4JSSA 1ZH9A 3KIGA 3DAZA 4YVYA 4Q90A 1G6VA 5SZ6A 3PYKA 1FSRA 2O4ZA 1CNJA 2CBCA 5FLTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CVF A;  4QEF A;  2WEH A;  5EHW A;  1I9L A;  3P5L A;  4ITP A;  1CZM A;  1I9P A;  5SZ5 A;  3W6H A;  3DD8 A;  3P58 A;  1OKL A;  4HT0 A;  5CLU A;  3HKQ A;  1G3Z A;  3V3G B;  2CA2 A;  3P44 A;  2Q1B A;  1RAZ A;  3P5A A;  3DC3 A;  2NWP A;  3L14 A;  3DA2 A;  1JD0 A;  4Q06 A;  3W6I A;  1IF7 A;  4Z1K A;  4YGJ A;  4E9O X;  3M5E A;  4Y0J A;  3T82 A;  4Q8X A;  1XQ0 A;  2FOS A;  3BET A;  5EHE A;  4RUX A;  5G03 A;  1BZM A;  2HOC A;  3EFT A;  1FQM A;  1BNV A;  3V3F A;  3JXG A;  3T85 A;  1BNM A;  5IPZ A;  4BF6 A;  3K7K A;  1FLJ A;  4QK1 A;  3RYJ B;  3U47 A;  3V2M A;  4RFC A;  4K0Z A;  5AMG A;  5SZ7 A;  1RZE A;  4CQ0 A;  1UGG A;  1F2W A;  1URT A;  1ZFQ A;  3M40 A;  4LHI A;  2CBE A;  2F14 A;  4RIU A;  3EFI A;  1CRA A;  4BF1 A;  5JEG B;  1TTM A;  3GZ0 A;  3Q31 A;  4WR7 A;  4QY3 A;  3MNK A;  5SZ1 A;  3SAX A;  5G01 A;  5EKH A;  2W2J A;  4QSA A;  5JGS B;  5DOG A;  1BV3 A;  5JEH B;  4E3D A;  1HUG A;  1I9O A;  3M5T A;  3ML5 A;  4QTL A;  5DSK A;  1JCZ A;  3TMJ A;  5DSO A;  5JDV B;  5CAC A;  4YGF A;  3VBD A;  3S78 B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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