3U7CA

Crystal structure of the v143i mutant of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAILGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title crystal structure of the V143I mutant of human carbonic anhydrase II
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-10-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3u7cA00
5EKHA 5E28A 4Z1EA 1YDDA 4YXIA 1CNGA 3HS4A 4ITPA 4ZWZA 2F14A 2NXRA 2FOSA 4N0XB 3M5SA 1LG5A 4E3HA 1I90A 1RAYA 3IBLA 3V3IB 5DSQA 4Q9YA 5FL6A 4TWMA 3B4FA 4XE1A 5L6KA 5E2KA 3HFPA 1FSNA 4Q99A 4Y0JA 5CACA 3FE4A 3M98A 3RZ5A 3UYNA 4E9OX 5JQTA 5SZ4A 2AX2A 1ZGFA 3U7CA 1CAOA 1CVAA 1RJ5A 4M2UA 1KWQA 1I9NA 4MLTA 3B1BA 1YO1A 1LZVA 4YGLA 3M2NA 1UGDA 1LG6A 3OIMA 1BNWA 3MNUA 4QJOA 4R5BA 5CLUA 3SBHA 4QSJA 1Y7WA 4FIKA 1CCTA 3F4XA 4QIYA 1G4OA 5SZ7A 3K7KA 3DC3A 3PO6A 4XFWA 3BL0A 1XEGA 5A25A 1FSRA 4YWPA 3DVDA 2NWZA 2Q1BA 2WD2A 3SAPA 2FMGA 3TMJA 4QJXA 3V3JA 5BNLA 1I9LA 4E49A 1BNNA 1G0FA 7CA2A 2NMXA 4KNMA 4FRCA 3OIKA 4BF1A 3P3HA 4WW8A 1G45A 1ZSCA 4M2VA 3DD0A 3KONA 5DVXA 3W6HA 1TB0X 3ZP9A 8CA2A 1YDBA 3N4BA 4K13A 2NWYA 2NXTA 5E2MA 5FNKA 2NN1A 1OQ5A 1XPZA 3ZNCA 1BNVA 2CBDA 4M2WA 1HECA 1LUGA 3CA2A 4COQA 4E3FA 5FLPA 3JXGA 4YX4A 4Q8YA 1CVHA 3LXEA 1I9PA 1I8ZA 5JGTB 4X5SA 3ML5A 1RZAA 4ZWYA 5EZTX 4QIZA 4QSIA 1MUAA 3MYQA 3EFTA 2GEHA 3DD8A 1FR7A 5BRWA 1LGDA 2FNKA 3S97A 4JSSA 3HKTA 1IF8A 1CNXA 2HL4A 1IF6A 1TEUX 5JEPB 5L3OA 1CINA 1CVCA 3BL1A 3K2FA 4QY3A 4IWZA 1CCSA 3RZ8A 2H4NA 3DAZA 5DSPA 4QK1A 3V2JA 1YO2A 4FU5A 5EOIA 5DSRA 3N2PA 3SBIA 3NJ9A 3MHIA 1CVDA 1CVFA 2NNVA 3IBIA 4YXUA 4DZ9A 4RFDA 1A42A 5JG5B 3M40A 5AMDA 3S76A 5JQ0A 5G0CA 1IF9A 3JXHC 5BRVA 2QOAA 1BNUA 1KOPA 1ZH9A 3L14A 3P44A 3RGEA 3N3JA 4K0ZA 2FNNA 1THKA 4ZAOA 5G0BA 5FL4A 2CBEA 5AMGA 3U47A 4JSZA 1CAHA 4RFCA 1ZFQA 4LHIA 4KP5A 4WL4A 4E3GA 1CNKA 3TVNX 4KP8A 3D0NA 4Q87A 1TE3X 1UGGA 5FNIA 1UGAA 1CRMA 1UGCA 3P55A 1RJ6A 2QO8A 1DMXA 1BNQA 3DV7A 4YXOA 4CNVA 5DSKA 1CAKA 3M1KA 1RZCA 3MNHA 4R5AA 5JEGB 1UGFA 2FMZA 4KUVA 3T5UA 1UGEA 5G01A 1F2WA 4HT2A 4KUWA 2NWOA 1BN4A 3P5LA 6CA2A 1I91A 3PJJA 3M2XA 3RYVB 2WEGA 3W6IA 3K34A 1G1DA 1I9QA 1J9WA 1OKNA 4KNJA 4Q6EA 3IAIA 1Z9YA 3HKQA 4Q8XA 1DMYA 3MMFA 1CZMA 3V2MA 4CNXA 3RZ0B 3RG3A 4RH2A 1I9OA 4C3TA 3IBNA 1CAMA 1ZE8A 5DSJA 4K1QA 4Q06A 4FL7A 3MHCA 4Q6DA 3KOIA 2NXSA 3M96A 3OKUA 3T84A 4UOVA 3EFIA 3HKUA 3T82A 2WEOA 4Q8ZA 2X7TA 4G7AA 2ILIA 1BV3A 3ML2A 3MNKA 4E5QA 1CNJA 4XZ5A 3R16A 3KWAA 2FOUA 1IF5A 5G03A 5C8IA 1BCDA 5BYIA 4JSAA 1CAJA 1TEQX 1V9IC 2NNOA 5FNMA 3M5EA 2HNCA 3R17B 4Q81A 1FR4A 3D93A 3HKNA 3MDZA 4KNNA 2O4ZA 4HT0A 5JESB 3DCWA 3F7UA 5FDIA 3DVBA 5HPJA 3FW3A 4QJ0A 1XEVA 4Z1JA 1FLJA 2FOYA 4Q07A 4RIUA 4QJPA 3OYQA 4WUPA 5DSMA 5SZ2A 5FNJA 4WW6A 5DOGA 3N0NA 4WUQA 2CBAA 1CILA 1EOUA 1URTA 5JG3B 2NNSA 1MOOA 1CAIA 4MDGA 5FNGA 4G0CA 5SZ6A 3P58A 3M04A 4ZX0A 3S74B 1Z93A 2Q1QA 4MO8A 5A6HA 1XQ0A 4L5VA 1RZBA 5EKMA 4Q08A 2CBBA 5LMDA 2CA2A 4JSWA 3OILA 3FFPX 4R59A 3RZ1B 2GD8A 5FDCA 4TWLA 3U3AX 2FNMA 1JD0A 1I9MA 5FLSA 2ABEA 2EZ7A 3U45X 1T9NA 4LP6A 2EU2A 3F8EA 3DCSA 1KWRA 2HOCA 1HCAA 1V9EA 4L5UA 1G53A 3M2ZA 3MHLA 4RIVA 1UGBA 5EH8A 5EHEA 3CAJA 1HEDA 4Q49A 4ITOA 1CNYA 4FVNA 3MHOA 2WD3A 3M67A 3MHMA 4M2RA 4YHAA 3RYJB 3S77B 5CJFA 5EHVA 3V3HB 5EIJA 3QYKA 1BICA 1AVNA 3V5GA 1HEBA 2POVA 2OSFA 3NB5A 3M3XA 2X7UA 3V3FA 1ZSAA 4FPTA 3JXFA 4GL1X 5AMLA 1FSQA 5CA2A 1G6VA 4Q09A 1HCBA 3PYKA 4HEYA 3DBUA 1CA2A 1OKMA 3MWOA 3S78B 4ZWIA 3DVCA 4PZHA 2FOQA 4Q83A 1Z97A 1KOQA 5E2NA 3D92A 5JDVB 1OKLA 2OSMA 3OKVA 1G3ZA 3DCCA 1CNIA 5J8ZA 4ETQC 4QSAA 3IGPA 2POWA 4MDLA 4BF6A 5DSNA 4E4AA 4K0TA 3D9ZA 4IDRX 3RLDA 1G46A 1BN1A 5EH5A 4KUYA 4QJMA 4Q78A 1G52A 3RG4A 1TH9A 3KNEA 3V7XA 3RJ7A 3S75B 4MTYA 3RYXB 1JCZA 4Q7WA 3MNIA 1DCAA 5FNLA 4LU3A 1JV0A 4Z1NA 3S73B 5DSIA 5DOHA 5E2SA 4K0SA 1CCUA 4QEFA 4CNWA 2X7SA 3KLDB 3MNJA 3OYSA 4HEZA 4PYXA 1BNTA 1YDCA 3CYUA 3MNAA 1G54A 4HU1A 4MDMA 1CIMA 5DRSA 3C7PA 4CNRA 1BN3A 5E2RA 4CA2A 2HFWA 1CANA 3NI5A 3RZ7A 4DZ7A 4QK2A 1IF4A 1HUHA 2HKKA 3RYYA 4KV0A 1CVEA 3KIGA 4RUXA 5SZ1A 5SZ0A 4L5WA 1HVAA 2NNGA 4Z0QA 9CA2A 1ZFKA 4XIWA 4ZWXA 2AW1A 1CAZA 3S8XA 4PYYA 1IF7A 3M5TA 2H15A 5E5RA 2HD6A 3OY0A 3RYZA 1FQMA 2FOVA 3KS3A 3P5AA 2Q38A 3VBDA 3T5ZA 4FVOA 4Q7SA 3TVOX 4E3DA 12CAA 4Q0LA 4Q7VA 3S9TA 3M1JA 1CNHA 2VVBX 2IT4A 2WEJA 5EH7A 4JS6A 4Z1KA 1HUGA 5DSOA 5FLQA 4YYTA 1FQLA 3M1QA 3M14A 1H9NA 4YGKA 5JEHB 3P3JA 1TBTX 3F7BA 5FNHA 1CNCA 1CA3A 3UYQA 1ZSBA 1H4NA 3CZVA 3Q31A 4Q90A 4KNIA 5EHWA 3S71B 4HF3A 4PQ7A 2NWPA 4BCWA 4RN4A 4QTLA 1CALA 4ZX1A 3SAXA 1AM6A 3M1WA 5DSLA 2CABA 4RUZA 4HEWA 3S72B 1FQNA 1TG9A 3DC9A 1G4JA 3IEOA 5FLRA 1CAYA 5FL5A 2ZNCA 4CACA 4Q7PA 2VVAX 4YVYA 4YGNA 2CBCA 4ILXA 1CRAA 3D8WA 3T85A 1RZDA 5SZ3A 5JGSB 3DA2A 3IBUA 1YO0A 5EKJA 1G0EA 2NN7A 2QP6A 1CNWA 3KKXA 3MZCA 3T83A 1G48A 3P4VA 1AZMA 4QK3A 1KEQA 3V3GB 4QJWA 1ZNCA 1YDAA 2EU3A 4RUYA 2W2JA 1HEAA 1CVBA 3GZ0A 3M2YA 4QSBA 4XIXA 1TG3A 4KAPA 5FLOA 1RAZA 4YGFA 4N16A 4CQ0A 5SZ5A 1DCBA 1RZEA 2FW4A 3KOKA 4PXXA 5IPZA 4MLXA 4YGJA 3BETA 3HLJA 1TTMA 4HBAA 1H9QA 5E5UA 2WEHA 1FQRA 2POUA 1BZMA 1CNBA 1BNMA 1ZGEA 4WR7A 5FLTA 5BRUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EKH A;  5E28 A;  4Z1E A;  1YDD A;  4YXI A;  1CNG A;  3HS4 A;  4ITP A;  4ZWZ A;  2F14 A;  2NXR A;  2FOS A;  4N0X B;  3M5S A;  1LG5 A;  4E3H A;  1I90 A;  1RAY A;  3IBL A;  3V3I B;  5DSQ A;  4Q9Y A;  5FL6 A;  4TWM A;  3B4F A;  4XE1 A;  5L6K A;  5E2K A;  3HFP A;  1FSN A;  4Q99 A;  4Y0J A;  5CAC A;  3FE4 A;  3M98 A;  3RZ5 A;  3UYN A;  4E9O X;  5JQT A;  5SZ4 A;  2AX2 A;  1ZGF A;  3U7C A;  1CAO A;  1CVA A;  1RJ5 A;  4M2U A;  1KWQ A;  1I9N A;  4MLT A;  3B1B A;  1YO1 A;  1LZV A;  4YGL A;  3M2N A;  1UGD A;  1LG6 A;  3OIM A;  1BNW A;  3MNU A;  4QJO A;  4R5B A;  5CLU A;  3SBH A;  4QSJ A;  1Y7W A;  4FIK A;  1CCT A;  3F4X A;  4QIY A;  1G4O A;  5SZ7 A;  3K7K A;  3DC3 A;  3PO6 A;  4XFW A;  3BL0 A;  1XEG A;  5A25 A;  1FSR A;  4YWP A;  3DVD A;  2NWZ A;  2Q1B A;  2WD2 A;  3SAP A;  2FMG A;  3TMJ A;  4QJX A;  3V3J A;  5BNL A;  1I9L A;  4E49 A;  1BNN A;  1G0F A;  7CA2 A;  2NMX A;  4KNM A;  4FRC A;  3OIK A;  4BF1 A;  3P3H A;  4WW8 A;  1G45 A;  1ZSC A;  4M2V A;  3DD0 A;  3KON A;  5DVX A;  3W6H A;  1TB0 X;  3ZP9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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