3V3IB

Kinetic and structural studies of thermostabilized mutants of hca ii.
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGFGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSHDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVSKFRKLNFNGEGEPEEPMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Kinetic and structural characterization of thermostabilized mutants of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 70
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3v3iB00
5E28A 1IF4A 4Q7PA 1BN3A 4YGKA 3V7XA 5EH8A 2FMZA 4BF6A 2QOAA 4Q6EA 5DSIA 4FRCA 1G1DA 1CZMA 4KUVA 1CRMA 5AMDA 3M5TA 2AX2A 4QSBA 4E3FA 1UGFA 1AM6A 3MNKA 4YGJA 4ITPA 5BRVA 3U3AX 4Q78A 2NWOA 1CINA 5FLQA 4ZX1A 3T85A 4Z1JA 2NNGA 2F14A 3L14A 3UYNA 4M2RA 1I9OA 5FDIA 5FL6A 1AZMA 2NNVA 3M67A 2VVAX 4HBAA 4L5WA 2Q1BA 3RG4A 1FQLA 1HCAA 3V2MA 5SZ4A 1BCDA 4KNNA 4N0XB 3DCSA 3MHLA 4QSJA 5DSOA 1CNCA 3P3JA 1URTA 5FDCA 1CIMA 4QSAA 3M2ZA 1RZBA 5BRWA 1CVFA 3PYKA 3RZ1B 1XPZA 1FSNA 4FVNA 5SZ2A 5BYIA 5JQTA 4Z1NA 3DVCA 2OSFA 4KUWA 3HKTA 4Q7WA 5LMDA 5E5RA 1CA2A 4WW8A 2AW1A 2FOVA 1LZVA 5AMLA 3MNIA 1TTMA 4LU3A 4PYYA 5G03A 5EIJA 1G0EA 1G0FA 1FSQA 3V3IB 5JGTB 4KNJA 4KNIA 4YGFA 4MLXA 7CA2A 4RUZA 5JG3B 1BNVA 1G48A 1YO2A 1CNKA 1CVEA 4M2WA 1TEUX 3D8WA 3DA2A 4PZHA 1IF9A 4K13A 3RZ5A 3R16A 3ML5A 1TBTX 3DBUA 4WUPA 3TVOX 4FVOA 1G6VA 3DD8A 4E4AA 3MMFA 1ZSBA 4RFDA 1BNMA 1DCBA 3IBNA 2HFWA 1TG9A 4HT0A 5EHWA 5DSJA 1A42A 1FR7A 5FNLA 8CA2A 2FOQA 5EKMA 1BICA 3P58A 4BF1A 5EH5A 2HD6A 3B4FA 3BL0A 4RUXA 12CAA 4YXIA 5DOGA 3M1KA 1G3ZA 3KOIA 3ML2A 4KP5A 5JEPB 1DCAA 1HEBA 4ILXA 4QIZA 1BNQA 3M04A 2CBDA 3D93A 4YXUA 1XQ0A 1CALA 4QK2A 1UGAA 2POVA 5FLSA 4BCWA 3V3HB 2QP6A 5BNLA 5SZ0A 3RYVB 4Q81A 1BN4A 3CZVA 4ZAOA 3SBHA 5EZTX 2FNMA 1LGDA 5FLOA 3DC3A 1CAYA 3EFIA 3RYJB 3HLJA 1UGBA 4MDGA 4QEFA 4ZWYA 1BV3A 2EZ7A 3OYQA 3S76A 4MDLA 1CANA 3PO6A 4MTYA 3P44A 1KEQA 1FQRA 3T5UA 2H4NA 3DVDA 3RZ0B 1I9QA 4Q83A 1CA3A 3LXEA 1G54A 1TE3X 1ZE8A 1I9PA 3BL1A 3D9ZA 3FFPX 3MWOA 5JEHB 1RJ5A 2FMGA 2Q1QA 2WEGA 3S73B 1HEAA 1I90A 3OIMA 3SBIA 1HUGA 2HNCA 3V3FA 2FOYA 1BNWA 1KOQA 3NB5A 4QJ0A 3T83A 1TG3A 3KOKA 3FE4A 4JSWA 1Z97A 4R5AA 3ZNCA 3RJ7A 1FQNA 3D0NA 1TB0X 1TEQX 5DSMA 5DSQA 4RIVA 3DD0A 2NNOA 4YX4A 1BZMA 1ZGFA 5IPZA 3HKQA 1OQ5A 1YDAA 1LG6A 5DSLA 4QSIA 5L6KA 4QJOA 2IT4A 2W2JA 1CRAA 4N16A 4RN4A 5EHEA 3F8EA 1CILA 3JXGA 4Z0QA 2CABA 3RZ8A 5FL4A 4ZWIA 3KNEA 1JD0A 3KWAA 2NXSA 3JXFA 1HVAA 4WR7A 3HKNA 1CNYA 3PJJA 1CAZA 1YDDA 1FSRA 4QIYA 4QJMA 3M1WA 1IF7A 4CNRA 4RFCA 3IBUA 4YYTA 3DAZA 4ITOA 5G01A 3DCWA 3DC9A 4KV0A 5G0CA 4QY3A 1I91A 4ZX0A 5SZ6A 1FR4A 3OYSA 3CYUA 5JGSB 3K7KA 3T82A 5EHVA 1CNWA 4RIUA 1ZFKA 1HCBA 3V5GA 3QYKA 1FQMA 2FOSA 4RH2A 4YVYA 1I8ZA 4WUQA 3P5LA 1CVBA 5EKJA 3M1QA 4FPTA 2X7UA 2WD2A 3OILA 3MYQA 1KOPA 1XEVA 4JSSA 9CA2A 2EU2A 2HKKA 2WD3A 1CVCA 4E3HA 1ZSAA 4HEWA 5FNHA 1UGEA 3K2FA 2ABEA 4QJPA 1I9NA 1KWQA 4Q08A 1CAKA 3W6HA 4LP6A 1I9MA 4MDMA 4Z1EA 4Q87A 4FIKA 1MUAA 2X7SA 4M2UA 1CAJA 4E49A 2WEOA 4Q90A 4E3GA 3RZ7A 3RYXB 4TWLA 3S75B 5J8ZA 4Q06A 1RZDA 4Q49A 4YWPA 2Q38A 3V2JA 2HOCA 5FLTA 3W6IA 4YXOA 3M2NA 1G52A 4WW6A 3S74B 5EH7A 4CACA 5A25A 5FNGA 1CCUA 3OY0A 1RAZA 2WEHA 4KAPA 2GD8A 3KONA 5CLUA 4ETQC 3SAPA 5A6HA 3T84A 1G4OA 4CA2A 5SZ3A 1V9EA 1YO0A 4KUYA 1G46A 4CNWA 3M1JA 4PQ7A 1Y7WA 5C8IA 4L5UA 1LG5A 3F7BA 2EU3A 4CNXA 5CJFA 4Q0LA 3CA2A 3KLDB 5EOIA 5DSPA 1LUGA 4G7AA 3KIGA 4XIWA 1DMXA 3IBIA 3P55A 4IDRX 4FU5A 3M5SA 3S71B 3S78B 4IWZA 1UGCA 3IGPA 1XEGA 2FW4A 5FNJA 1IF6A 4K0ZA 5FNIA 3P5AA 1J9WA 2NXRA 5CACA 5E5UA 2NN7A 4MLTA 5FNMA 3MNAA 3OKVA 3TVNX 4XIXA 1IF5A 4M2VA 3V3JA 2QO8A 2X7TA 5E2SA 4HF3A 3V3GB 4QJXA 1YO1A 2FNKA 1OKMA 5FLPA 1I9LA 2NXTA 3DVBA 4MO8A 3MNUA 1CCSA 1FLJA 1HECA 1AVNA 3IEOA 3NI5A 3NJ9A 1EOUA 3CAJA 1H4NA 3P3HA 3RYYA 3N3JA 4Q8ZA 5JESB 3FW3A 4R5BA 3JXHC 3MNJA 1RZEA 3M14A 5E2MA 3MHOA 1ZNCA 1ZH9A 3U7CA 5E2NA 5DSKA 4R59A 5DSRA 1HEDA 1Z93A 3HKUA 1F2WA 3N2PA 3S72B 3B1BA 3KKXA 2O4ZA 1CNJA 3K34A 3M96A 2GEHA 5FLRA 1RZAA 2NWYA 3BETA 4X5SA 2POWA 4Q99A 1THKA 5FNKA 4TWMA 3M2YA 1CAHA 5BRUA 4CQ0A 3U47A 3MNHA 5HPJA 1CNXA 3N4BA 2FNNA 5CA2A 3M40A 4XFWA 3MHIA 1BN1A 1G4JA 4E5QA 3RYZA 2NWZA 1G45A 2WEJA 4HU1A 4YHAA 5SZ1A 4YGLA 4FL7A 3S77B 2CBBA 3M98A 5SZ7A 5FL5A 1TH9A 3RGEA 3DCCA 5DSNA 3OIKA 3S8XA 1OKNA 5DVXA 3UYQA 3C7PA 1CVDA 5JEGB 3T5ZA 4QJWA 1CNHA 3HFPA 1CCTA 2CBAA 3IBLA 3OKUA 4JSZA 4Q07A 5AMGA 1RJ6A 3F4XA 1YDBA 4ZWXA 3MHMA 4K0SA 2H15A 2POUA 3KS3A 4LHIA 1UGDA 3GZ0A 4E3DA 2ZNCA 1CAOA 4L5VA 4JS6A 1BNTA 1RZCA 5JG5B 1CVHA 4Q7VA 2HL4A 1Z9YA 3EFTA 1G53A 4HEYA 5DOHA 3M2XA 1DMYA 1T9NA 4DZ9A 3P4VA 3R17B 4PXXA 5JDVB 3IAIA 1CNBA 4ZWZA 4YGNA 2FOUA 2ILIA 1CNGA 3U45X 4KP8A 4JSAA 5EKHA 5JQ0A 3S9TA 5L3OA 1RAYA 2NNSA 4HEZA 2CA2A 3RG3A 3TMJA 1ZFQA 4KNMA 4Q8YA 4Y0JA 5E2RA 4G0CA 4QK3A 4UOVA 4Q8XA 2NMXA 1HUHA 1BNNA 5SZ5A 2NWPA 1JCZA 4C3TA 1CNIA 2CBCA 2OSMA 1MOOA 3DV7A 6CA2A 1CAIA 4GL1X 5E2KA 5DRSA 4QK1A 4WL4A 4Z1KA 1BNUA 1V9IC 5G0BA 3MZCA 1YDCA 3RLDA 3ZP9A 3SAXA 1ZSCA 1ZGEA 1H9NA 4K0TA 4CNVA 3M5EA 3VBDA 4HT2A 3F7UA 1KWRA 4RUYA 3HS4A 1CAMA 3D92A 4PYXA 4Q7SA 2NN1A 3N0NA 1UGGA 3S97A 4Q9YA 4Q6DA 1JV0A 1IF8A 3M3XA 1OKLA 2VVBX 3MHCA 4Q09A 4COQA 4E9OX 1CVAA 4K1QA 3MDZA 2CBEA 4XZ5A 1H9QA 4DZ7A 4QTLA 3Q31A 4XE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5E28 A;  1IF4 A;  4Q7P A;  1BN3 A;  4YGK A;  3V7X A;  5EH8 A;  2FMZ A;  4BF6 A;  2QOA A;  4Q6E A;  5DSI A;  4FRC A;  1G1D A;  1CZM A;  4KUV A;  1CRM A;  5AMD A;  3M5T A;  2AX2 A;  4QSB A;  4E3F A;  1UGF A;  1AM6 A;  3MNK A;  4YGJ A;  4ITP A;  5BRV A;  3U3A X;  4Q78 A;  2NWO A;  1CIN A;  5FLQ A;  4ZX1 A;  3T85 A;  4Z1J A;  2NNG A;  2F14 A;  3L14 A;  3UYN A;  4M2R A;  1I9O A;  5FDI A;  5FL6 A;  1AZM A;  2NNV A;  3M67 A;  2VVA X;  4HBA A;  4L5W A;  2Q1B A;  3RG4 A;  1FQL A;  1HCA A;  3V2M A;  5SZ4 A;  1BCD A;  4KNN A;  4N0X B;  3DCS A;  3MHL A;  4QSJ A;  5DSO A;  1CNC A;  3P3J A;  1URT A;  5FDC A;  1CIM A;  4QSA A;  3M2Z A;  1RZB A;  5BRW A;  1CVF A;  3PYK A;  3RZ1 B;  1XPZ A;  1FSN A;  4FVN A;  5SZ2 A;  5BYI A;  5JQT A;  4Z1N A;  3DVC A;  2OSF A;  4KUW A;  3HKT A;  4Q7W A;  5LMD A;  5E5R A;  1CA2 A;  4WW8 A;  2AW1 A;  2FOV A;  1LZV A;  5AML A;  3MNI A;  1TTM A;  4LU3 A;  4PYY A;  5G03 A;  5EIJ A;  1G0E A;  1G0F A;  1FSQ A;  3V3I B;  5JGT B;  4KNJ A;  4KNI A;  4YGF A;  4MLX A;  7CA2 A;  4RUZ A; 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