3V5GA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with the 4-sulfamido-benzenesulfonamide inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Development of potent carbonic anhydrase inhibitors incorporating both sulfonamide and sulfamide groups.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3v5gA00
3EFIA 1V9EA 4Q6DA 2CBDA 3HLJA 4JSWA 1YDDA 3VBDA 6CA2A 1CNGA 3ML2A 3FW3A 4IDRX 2NNVA 4E3GA 5EH5A 1FLJA 3DVCA 5FDCA 1LZVA 3U7CA 1FR7A 3DAZA 1RAZA 4YX4A 1CNWA 4RFDA 3KOIA 5EH8A 4G7AA 3ML5A 3JXGA 1F2WA 4QY3A 5FL6A 3MHLA 1LG6A 2NWOA 3KLDB 3IEOA 4CNXA 2WEJA 3M14A 3S77B 4HEWA 1FQRA 4CA2A 3P4VA 4Z1NA 4M2WA 4K1QA 3B1BA 3F8EA 4DZ9A 4K0ZA 1RZBA 4E5QA 4QSBA 4CNRA 1G54A 1I91A 5CJFA 1IF7A 5FLPA 4ZWIA 1URTA 4RUZA 4E3HA 5EIJA 3HS4A 3UYQA 3S8XA 1OKNA 1UGCA 2FOVA 3KNEA 1UGFA 2EU2A 2X7SA 2GEHA 3SBHA 1BN3A 3DA2A 3N4BA 2GD8A 4CQ0A 3S74B 1CVAA 1TH9A 3RZ5A 1CAHA 1TG9A 1CAOA 4QIZA 3T5UA 1CCUA 2OSMA 3HKUA 1UGEA 2NWZA 4KNNA 5L3OA 4XIXA 4E3DA 2CABA 4QTLA 3HKTA 4RUYA 1BICA 4PZHA 3T82A 4XIWA 3TVOX 3DC3A 3MWOA 4Y0JA 1I9LA 4KNJA 1ZSBA 5EKMA 4CNVA 3M2NA 1Z97A 1LG5A 2NMXA 1CNXA 5DSKA 4ZX0A 5DSIA 1MUAA 4WW6A 1FQMA 4GL1X 4ZX1A 3MZCA 4HT0A 5IPZA 1TEUX 2CBEA 3M67A 4Q9YA 4PQ7A 3DV7A 3D9ZA 1YO0A 3KKXA 1RAYA 4QK3A 3B4FA 1HEBA 4QJPA 3N2PA 3RYZA 3S78B 2WEHA 1I9MA 1OKMA 4Z1EA 4LHIA 5G0CA 2QP6A 3OYSA 3HKQA 1FSQA 1ZH9A 4QEFA 5SZ6A 2NXSA 3T84A 5JG5B 1YO2A 1FQLA 4Q7VA 5SZ2A 1BZMA 4JSZA 1RJ6A 2POVA 1CRAA 4XZ5A 5EKHA 4KV0A 3M2YA 3OIMA 5E5RA 2X7TA 2CBAA 3S75B 3N3JA 1KOQA 1TBTX 4KAPA 3RG4A 1BNQA 3S97A 4WL4A 3GZ0A 1LUGA 3EFTA 5CLUA 3DCSA 2HL4A 1CAKA 3CA2A 2NXTA 12CAA 4PYXA 5A25A 2HKKA 1DMYA 4WUQA 4YHAA 5DRSA 3C7PA 4WUPA 1LGDA 2O4ZA 4K0SA 3MNJA 3T5ZA 5BRUA 3IGPA 1H9QA 1OQ5A 1CNIA 4HF3A 8CA2A 1CNCA 4TWLA 3P55A 3IBIA 5DSPA 4QJOA 3L14A 4QJMA 5FNKA 3V3HB 5DSQA 1TTMA 2WD2A 1CRMA 1HECA 3D92A 3K7KA 4HT2A 3RJ7A 3D93A 4FPTA 5JEHB 5JG3B 3PJJA 1G6VA 2NN7A 3IAIA 4QSAA 1I8ZA 1V9IC 2ZNCA 2NWPA 4XE1A 3V5GA 2CBCA 3PYKA 3MDZA 4R5BA 5FLRA 1G52A 2FOUA 1J9WA 1TEQX 1G4OA 1IF6A 4Q8ZA 3R17B 1FR4A 4LP6A 2WEGA 5SZ0A 3OY0A 5FDIA 3P5AA 4Q83A 4HBAA 3P58A 3DD8A 5JGTB 1IF5A 5C8IA 4KUVA 2VVBX 1YDCA 5DSNA 2HD6A 3IBUA 5SZ1A 1Y7WA 3MHCA 4X5SA 4KUWA 5SZ7A 1CA3A 4YGJA 4ETQC 3M2XA 4IWZA 2FW4A 5FNJA 1CNBA 2POUA 4HEZA 4BF6A 1I90A 1XPZA 5JDVB 1CNJA 3RGEA 2Q1BA 2FNKA 1CNKA 3M1KA 3P5LA 1TE3X 3MNIA 4Z1JA 5LMDA 5EKJA 5E2RA 3NI5A 3KIGA 3MHIA 1CVEA 3P44A 2EZ7A 3D0NA 3HKNA 5SZ4A 3K2FA 1Z9YA 4RFCA 4DZ7A 1TG3A 1OKLA 3V3FA 1KEQA 3M2ZA 1UGGA 2HNCA 4ZWZA 5L6KA 4FVOA 2QOAA 4QSIA 4COQA 3TVNX 3ZP9A 3V3IB 1BNVA 1CAMA 3LXEA 5JGSB 4FU5A 4Q49A 5BRVA 3S9TA 3KOKA 4CACA 1CVHA 1CAYA 1G3ZA 1H4NA 4Q8YA 4Q06A 1DCAA 1KWQA 4L5UA 3SAPA 4WW8A 4ZWYA 1CA2A 1BNNA 5FL5A 3DBUA 1IF4A 4Q78A 5J8ZA 4KUYA 3DCCA 1G46A 4L5VA 4QK2A 2NNGA 5JEGB 4ZAOA 5G0BA 4Q6EA 2NWYA 3DD0A 1UGBA 5FL4A 4JS6A 4Q87A 3FFPX 4HEYA 5DSLA 4YGLA 5EH7A 1ZGFA 3MNUA 4E9OX 4Q99A 1CILA 4KNIA 2X7UA 4Q81A 4BCWA 2H15A 1JCZA 5G03A 1BNTA 9CA2A 2CBBA 3U3AX 1RZEA 2FMZA 5FNGA 3V3GB 4KNMA 3V2JA 3DC9A 5E5UA 3F4XA 1BNUA 1HCBA 2HOCA 3QYKA 4TWMA 5FLTA 1ZNCA 3RLDA 4Z0QA 3V2MA 1G4JA 4YYTA 1HEDA 4YGNA 4QJ0A 1ZE8A 3W6IA 4RH2A 1BN1A 2F14A 5FNHA 1BNMA 3UYNA 3F7UA 3N0NA 3S76A 2FNNA 4BF1A 4Q0LA 3P3HA 5DOHA 3MHOA 3RG3A 4MTYA 4ILXA 1I9QA 1KOPA 1G45A 4YXUA 4YWPA 4MLXA 1BN4A 4UOVA 1DMXA 1UGDA 1YO1A 4N16A 4E3FA 1YDBA 4LU3A 3DVBA 2ILIA 3S71B 1UGAA 3DVDA 3MNAA 5E2MA 1CIMA 3RZ7A 4RIUA 4HU1A 3M1JA 3BL1A 3S73B 3KS3A 4FIKA 1CCTA 3JXHC 5EZTX 3U45X 1CVBA 4Q08A 1RJ5A 3JXFA 5HPJA 1G1DA 4QJWA 1BCDA 1FQNA 1DCBA 4Z1KA 5DSMA 1AZMA 1G48A 3M5TA 3OYQA 2NXRA 4M2RA 4QIYA 1XEVA 4QJXA 3V3JA 4RIVA 5E2KA 1BNWA 1ZSCA 1ZFQA 3K34A 5DSOA 4QSJA 1ZFKA 3KONA 3HFPA 4QK1A 1XQ0A 5E28A 4G0CA 1I9NA 5SZ5A 2H4NA 4JSSA 3CYUA 5DOGA 1IF8A 4Q8XA 4PXXA 2FOYA 4YVYA 4C3TA 4Q90A 4KP8A 3M96A 1CNYA 1RZDA 3CAJA 2AW1A 3OKVA 1I9PA 1CVFA 1HUGA 3M40A 4YXIA 2NN1A 3M3XA 3RYVB 2FOQA 3MMFA 5EHEA 5FNMA 4MLTA 3RZ0B 1I9OA 3M5SA 1CVCA 4Q7SA 2FNMA 3M5EA 5JQ0A 1CAJA 4YGFA 5FNLA 5EOIA 3MHMA 2HFWA 3MYQA 3FE4A 5BNLA 1JV0A 5BYIA 3M1WA 5AMLA 5JEPB 3NJ9A 3OILA 4R5AA 5AMDA 1H9NA 4YGKA 2WEOA 4K13A 2CA2A 4MO8A 4Q09A 4E4AA 3F7BA 2IT4A 5JQTA 4Q07A 1G53A 4R59A 5FNIA 1FSNA 4M2VA 7CA2A 5FLQA 3R16A 1Z93A 1JD0A 4FVNA 4PYYA 1YDAA 4RUXA 1CVDA 2Q1QA 4ITPA 4L5WA 1THKA 2POWA 5EHVA 3ZNCA 5DVXA 4YXOA 1KWRA 3RYJB 1CANA 3S72B 1TB0X 4CNWA 2Q38A 3OKUA 1CALA 3W6HA 3TMJA 4JSAA 4XFWA 5EHWA 4KP5A 4WR7A 3CZVA 4ZWXA 4E49A 1ZGEA 3NB5A 2NNSA 4Q7PA 2OSFA 1CINA 3IBNA 1XEGA 2NNOA 5DSJA 3D8WA 5FLSA 1CNHA 2VVAX 5E2NA 1CZMA 1CCSA 1HCAA 5SZ3A 3RZ8A 3M98A 1BV3A 4M2UA 1RZAA 3RYXB 1HUHA 4ITOA 2WD3A 2QO8A 3BL0A 1MOOA 3OIKA 3KWAA 1AM6A 4MDLA 2AX2A 3RYYA 2FOSA 1CAZA 1FSRA 3T85A 4Q7WA 3BETA 1A42A 4N0XB 1IF9A 5A6HA 3IBLA 1RZCA 4RN4A 3SBIA 3U47A 5JESB 5G01A 3RZ1B 3PO6A 1ZSAA 3Q31A 5AMGA 4MDGA 5FLOA 3DCWA 3M1QA 1CAIA 4MDMA 1AVNA 5BRWA 3P3JA 1EOUA 5CACA 3M04A 5CA2A 1HVAA 4K0TA 1G0EA 2EU3A 3SAXA 2W2JA 5DSRA 5E2SA 4FL7A 3T83A 2ABEA 1G0FA 4FRCA 1HEAA 3MNKA 2FMGA 3V7XA 3MNHA 1T9NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EFI A;  1V9E A;  4Q6D A;  2CBD A;  3HLJ A;  4JSW A;  1YDD A;  3VBD A;  6CA2 A;  1CNG A;  3ML2 A;  3FW3 A;  4IDR X;  2NNV A;  4E3G A;  5EH5 A;  1FLJ A;  3DVC A;  5FDC A;  1LZV A;  3U7C A;  1FR7 A;  3DAZ A;  1RAZ A;  4YX4 A;  1CNW A;  4RFD A;  3KOI A;  5EH8 A;  4G7A A;  3ML5 A;  3JXG A;  1F2W A;  4QY3 A;  5FL6 A;  3MHL A;  1LG6 A;  2NWO A;  3KLD B;  3IEO A;  4CNX A;  2WEJ A;  3M14 A;  3S77 B;  4HEW A;  1FQR A;  4CA2 A;  3P4V A;  4Z1N A;  4M2W A;  4K1Q A;  3B1B A;  3F8E A;  4DZ9 A;  4K0Z A;  1RZB A;  4E5Q A;  4QSB A;  4CNR A;  1G54 A;  1I91 A;  5CJF A;  1IF7 A;  5FLP A;  4ZWI A;  1URT A;  4RUZ A;  4E3H A;  5EIJ A;  3HS4 A;  3UYQ A;  3S8X A;  1OKN A;  1UGC A;  2FOV A;  3KNE A;  1UGF A;  2EU2 A;  2X7S A;  2GEH A;  3SBH A;  1BN3 A;  3DA2 A;  3N4B A;  2GD8 A;  4CQ0 A;  3S74 B;  1CVA A;  1TH9 A;  3RZ5 A;  1CAH A;  1TG9 A;  1CAO A;  4QIZ A;  3T5U A;  1CCU A;  2OSM A;  3HKU A;  1UGE A;  2NWZ A;  4KNN A;  5L3O A;  4XIX A;  4E3D A;  2CAB A;  4QTL A;  3HKT A;  4RUY A;  1BIC A;  4PZH A;  3T82 A;  4XIW A; 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