3W6HA

Crystal structure of 19f probe-labeled hcai in complex with acetazolamide
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Quantitative Comparison of Protein Dynamics in Live Cells and In Vitro by In-Cell 19F-NMR
rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 67
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3w6hA00
2HD6A 2NNGA 3NJ9A 3P44A 4Z1NA 3RYJB 4ZX0A 1J9WA 1RAYA 1OKNA 4Q7WA 3JXGA 5EH7A 3B4FA 3IGPA 5G0CA 3FFPX 1UGDA 3KS3A 1Z93A 5HPJA 3N0NA 3D8WA 4WL4A 3SAPA 5SZ6A 4FPTA 2HL4A 4KNMA 3SBIA 1CRMA 1HCBA 4XIXA 4CNXA 1HUHA 5FLQA 4Q7SA 1Z97A 1ZSCA 1YDAA 4Q7PA 1AM6A 1AZMA 3DCSA 4ZWXA 1G0FA 4E3DA 5SZ5A 3RZ5A 5FLOA 4Q09A 3BETA 1G46A 1G53A 1MUAA 3V3IB 4QJXA 5E2MA 3HKNA 4QK1A 4DZ9A 4HEZA 1CANA 4Q87A 4COQA 1CAMA 1BICA 2Q38A 1URTA 4PXXA 5FDIA 3DVBA 5DOHA 1CAKA 2FOVA 1BNTA 3RG4A 3MHMA 2FNKA 2NNOA 2NWPA 1FLJA 3DVDA 4HBAA 3M3XA 5DVXA 3RYZA 3DC3A 4K13A 3M67A 3QYKA 1CAIA 3MDZA 2X7UA 2F14A 3IBNA 3MHIA 1TBTX 1G48A 5EH8A 4YXIA 2H4NA 3CYUA 3LXEA 1G45A 4RFDA 2EU2A 2FNMA 1HEAA 1UGCA 4M2WA 4QIYA 4K0TA 1IF9A 3S75B 3DC9A 2CBCA 2EU3A 5JQTA 4IWZA 1BZMA 3V3FA 1THKA 3CAJA 3MMFA 5JEHB 4MDGA 1ZH9A 3IEOA 3IBUA 4RN4A 3RYXB 3PYKA 2CBEA 4FU5A 4Z0QA 3S74B 3K34A 4YXUA 2NNSA 3SAXA 5EKMA 3OYQA 1XEVA 5JESB 5AMDA 3S77B 3ZNCA 5L6KA 4GL1X 5AMLA 1T9NA 4L5WA 3RYVB 4E5QA 1BN4A 4CNRA 4XIWA 1BNNA 2HNCA 3MNIA 4MLXA 3MHCA 2NWOA 1RZAA 4JSWA 5FL4A 5CJFA 1Z9YA 4YXOA 1I8ZA 3N4BA 4ITPA 6CA2A 1CINA 4WUPA 3V3HB 4BF1A 2FMGA 1YO0A 3EFTA 3KKXA 1BNMA 1YDCA 3RG3A 3V3GB 5DSPA 5FDCA 5JEPB 1TTMA 3S97A 1LUGA 1EOUA 1CAJA 1HCAA 3CA2A 2ILIA 3M04A 4BF6A 1FR4A 4N0XB 4Q8ZA 1I90A 3OIKA 5EOIA 3S9TA 1I9LA 5DSKA 3DBUA 4E9OX 5FNLA 4MTYA 3RJ7A 1KOQA 5L3OA 1RJ6A 4G7AA 2FOUA 4TWMA 3KONA 4QSBA 4CA2A 5JQ0A 2GEHA 5JDVB 1CILA 4FRCA 1UGEA 4JSAA 4ZWZA 3MHOA 4E4AA 3HFPA 1LGDA 1CVFA 2NXSA 3HS4A 3Q31A 4KUWA 1OKLA 4ZX1A 1XEGA 1FQMA 5A6HA 1RZBA 5EKJA 4R5AA 1CAHA 4YGNA 2CABA 1JV0A 1G54A 5SZ2A 4YX4A 2NXRA 4JS6A 5G03A 5DSJA 1KWRA 3TMJA 5SZ3A 2W2JA 1CNJA 3PJJA 3DD0A 4LHIA 4XZ5A 3M5EA 3M5TA 4YGFA 3M1KA 3N2PA 4Q07A 3V5GA 3W6IA 1CNHA 1CALA 1I9MA 4Q06A 5DOGA 1G4OA 4JSSA 3ML2A 3KLDB 4K0ZA 4YGJA 4QSAA 1CNCA 1JCZA 3C7PA 3M1JA 4YGLA 1ZGFA 1YDBA 2AX2A 1BNVA 1CVEA 3RYYA 4XE1A 2FOQA 4QSJA 5DSIA 5FNJA 1TH9A 3DVCA 4KP5A 5JG5B 2NN7A 4QK2A 4RUYA 12CAA 1CCTA 1RJ5A 5DSRA 1BNQA 5CACA 3P5AA 5EZTX 4ITOA 3HKQA 3OKUA 3IBIA 4M2VA 1H9QA 1RAZA 2WEHA 4RIUA 5LMDA 5SZ1A 5G0BA 3GZ0A 4YWPA 3OILA 4HU1A 4CQ0A 3DCWA 1ZSAA 4Z1JA 1V9IC 2POUA 1FR7A 3MNJA 3PO6A 2QP6A 2WEJA 1IF5A 5FNHA 1LZVA 3DAZA 3L14A 5BNLA 5JGTB 1A42A 3R17B 1BN1A 3P3JA 3F8EA 5EKHA 5FNKA 4JSZA 1RZCA 2ZNCA 1BCDA 4L5UA 1G4JA 3MNUA 3U47A 3OY0A 1CA2A 3T85A 3M96A 4BCWA 3V7XA 3DV7A 3KWAA 5EHEA 5FNIA 3F7BA 1JD0A 1HEDA 1OKMA 3S71B 1Y7WA 3KOIA 4YVYA 3SBHA 3D9ZA 3P3HA 1TEUX 4MDLA 4QEFA 4QTLA 5E2SA 3IAIA 3KOKA 4FVOA 3D93A 4YYTA 1V9EA 4ILXA 4RUZA 1BV3A 5E5UA 5A25A 3RZ7A 4FIKA 5EHWA 1IF4A 4QJMA 2AW1A 5DSOA 1DMYA 1CVDA 1CNXA 1HVAA 4Q49A 2X7SA 3P5LA 5EIJA 2VVAX 5FL6A 3P4VA 5FLRA 5FL5A 3KNEA 5C8IA 4MO8A 9CA2A 5CLUA 5E2RA 2FNNA 3VBDA 1AVNA 1OQ5A 3D0NA 4KUVA 2WEGA 4HEWA 4RIVA 4R5BA 3M2ZA 4XFWA 3TVNX 3U7CA 3S8XA 1F2WA 3P55A 5DRSA 3RZ0B 5EHVA 1RZEA 3W6HA 2X7TA 5JG3B 2OSFA 2WD3A 1YO1A 1YDDA 4RUXA 3FE4A 1ZE8A 5FLPA 4Y0JA 4Q9YA 1CNIA 2NMXA 2Q1QA 4K0SA 1TG3A 4ZWYA 2CBDA 3S72B 4C3TA 3B1BA 7CA2A 3RZ8A 1KEQA 1HUGA 2EZ7A 4LU3A 4Q78A 1UGBA 4FVNA 5SZ4A 4Q7VA 3D92A 1CNYA 4CNWA 2Q1BA 4QK3A 3RLDA 5SZ7A 5AMGA 1G52A 2WD2A 3HKUA 1BNWA 1CVHA 3T84A 4E3GA 5BRVA 1CVAA 4QSIA 4LP6A 2FMZA 3U45X 5E28A 2CBBA 8CA2A 1I9PA 4MLTA 4Q83A 1CIMA 3M2YA 3CZVA 3F4XA 3V3JA 1H9NA 4Q8YA 4HF3A 4ZAOA 4KUYA 3UYQA 1UGGA 2VVBX 1BNUA 4WR7A 3S78B 1FQRA 3M14A 4RFCA 5E5RA 3UYNA 3M98A 4WW8A 3V2JA 4M2UA 3KIGA 4PZHA 3OIMA 4QJOA 5G01A 3M2NA 1I91A 2POWA 3U3AX 5JGSB 1FQNA 5DSLA 5FNMA 2HFWA 1CAZA 4Z1EA 1CAOA 4MDMA 1CNBA 1CAYA 2NWZA 2QO8A 3MNAA 4R59A 5DSNA 2NN1A 3M1QA 3V2MA 1TE3X 3BL1A 3DD8A 4HT2A 1XQ0A 2NXTA 1I9NA 4ZWIA 1G6VA 1G1DA 3MYQA 1CNKA 1UGFA 3OYSA 1G0EA 2FW4A 4PQ7A 1YO2A 5DSMA 1DMXA 1ZNCA 2FOYA 4KAPA 4QY3A 3MZCA 3MNKA 3FW3A 4QIZA 3BL0A 1CNWA 3JXHC 3NB5A 4Q6EA 2O4ZA 4M2RA 3M5SA 1ZFQA 3T83A 5E2NA 4IDRX 3ZP9A 1DCAA 2NWYA 3S76A 5BRWA 5DSQA 4YGKA 4Q81A 1HEBA 2NNVA 3NI5A 3T5UA 2FOSA 1KOPA 2CA2A 4L5VA 4X5SA 3N3JA 3M40A 4TWLA 4CACA 4CNVA 3EFIA 3M2XA 3T82A 3P58A 4QJPA 3MHLA 3M1WA 4WW6A 1CA3A 3HKTA 3TVOX 5E2KA 3HLJA 5SZ0A 1MOOA 1I9QA 1IF6A 2OSMA 3JXFA 4DZ7A 4ETQC 5CA2A 3F7UA 4FL7A 1ZGEA 5JEGB 4HT0A 4E49A 1KWQA 1HECA 4N16A 1I9OA 2QOAA 1ZFKA 1H4NA 1UGAA 1XPZA 3R16A 3K7KA 5FNGA 4KNJA 4KV0A 4E3FA 3OKVA 1IF7A 1CVBA 2POVA 2ABEA 4K1QA 4KNNA 3RZ1B 4Q6DA 3S73B 1TEQX 5IPZA 1IF8A 1FQLA 4Q8XA 4PYYA 3DCCA 4RH2A 4UOVA 4QJ0A 4QJWA 5BYIA 1CRAA 4E3HA 1TB0X 5FLSA 1DCBA 1FSQA 1FSRA 4YHAA 1FSNA 1LG6A 5J8ZA 5BRUA 2HKKA 4PYXA 4HEYA 2HOCA 3DA2A 3ML5A 1CVCA 4Q08A 4WUQA 1CCUA 2H15A 3K2FA 3T5ZA 1G3ZA 4KNIA 1ZSBA 2IT4A 4Q99A 3MWOA 4Z1KA 5FLTA 1BN3A 3RGEA 3MNHA 1CNGA 1CCSA 4Q90A 1RZDA 4Q0LA 3IBLA 2CBAA 1TG9A 1LG5A 2WEOA 4G0CA 4KP8A 1CZMA 5EH5A 2GD8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HD6 A;  2NNG A;  3NJ9 A;  3P44 A;  4Z1N A;  3RYJ B;  4ZX0 A;  1J9W A;  1RAY A;  1OKN A;  4Q7W A;  3JXG A;  5EH7 A;  3B4F A;  3IGP A;  5G0C A;  3FFP X;  1UGD A;  3KS3 A;  1Z93 A;  5HPJ A;  3N0N A;  3D8W A;  4WL4 A;  3SAP A;  5SZ6 A;  4FPT A;  2HL4 A;  4KNM A;  3SBI A;  1CRM A;  1HCB A;  4XIX A;  4CNX A;  1HUH A;  5FLQ A;  4Q7S A;  1Z97 A;  1ZSC A;  1YDA A;  4Q7P A;  1AM6 A;  1AZM A;  3DCS A;  4ZWX A;  1G0F A;  4E3D A;  5SZ5 A;  3RZ5 A;  5FLO A;  4Q09 A;  3BET A;  1G46 A;  1G53 A;  1MUA A;  3V3I B;  4QJX A;  5E2M A;  3HKN A;  4QK1 A;  4DZ9 A;  4HEZ A;  1CAN A;  4Q87 A;  4COQ A;  1CAM A;  1BIC A;  2Q38 A;  1URT A;  4PXX A;  5FDI A;  3DVB A;  5DOH A;  1CAK A;  2FOV A;  1BNT A;  3RG4 A;  3MHM A;  2FNK A;  2NNO A;  2NWP A;  1FLJ A;  3DVD A;  4HBA A;  3M3X A;  5DVX A;  3RYZ A;  3DC3 A;  4K13 A;  3M67 A;  3QYK A;  1CAI A;  3MDZ A;  2X7U A;  2F14 A;  3IBN A;  3MHI A;  1TBT X;  1G48 A;  5EH8 A;  4YXI A;  2H4N A;  3CYU A;  3LXE A;  1G45 A;  4RFD A;  2EU2 A;  2FNM A;  1HEA A;  1UGC A;  4M2W A;  4QIY A; 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