4JS6A

Crystal structure of inhibitor-free hcaii h94d
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFDFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Metalloprotein-Inhibitor Binding: Human Carbonic Anhydrase II as a Model for Probing Metal-Ligand Interactions in a Metalloprotein Active Site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4js6A00
2VVBX 3U45X 1FR4A 3T5UA 3BETA 4IWZA 4XIWA 2QO8A 3SAXA 5L3OA 1YO1A 4Q06A 2EU2A 2NXTA 3P58A 3N3JA 1CVHA 2FOSA 3D93A 3IAIA 5DRSA 4QSAA 3D8WA 4ETQC 3MHLA 3T85A 1I9NA 1ZFKA 2ILIA 2FOUA 3DCSA 4MDMA 4QK3A 4Z1JA 1CNYA 1DMXA 4ITOA 1ZSBA 2EU3A 4XIXA 1Z9YA 1YDDA 3F7UA 4CNRA 1BNWA 4M2RA 3SBHA 1ZGEA 1CVFA 1V9IC 5FLTA 2X7TA 3MNJA 1OKLA 4YXIA 3K7KA 3RYYA 3S71B 1G0FA 1CAOA 1ZH9A 2H4NA 2HOCA 2NNVA 1KEQA 4MDGA 2FOVA 2QP6A 4PYXA 3MHOA 5SZ6A 5A6HA 2HKKA 1CAKA 4L5UA 4G0CA 4QJMA 4ILXA 3M5EA 5CLUA 1J9WA 3SAPA 4Z1EA 1XPZA 1UGEA 1BNNA 1CAIA 4WW8A 4Q7WA 3V5GA 4YGKA 1TEQX 5HPJA 1TBTX 4WW6A 4Q8ZA 3F8EA 4Q6EA 1Z97A 2CBCA 1G48A 1TG3A 3V3IB 4QJ0A 4YGNA 1TG9A 1FSNA 2ABEA 5BRUA 3ML5A 4YX4A 3KKXA 4E9OX 1TB0X 2CA2A 3NJ9A 4K0ZA 5JGSB 3OKUA 1ZSAA 3M5SA 1EOUA 3M67A 2OSFA 5EHWA 4DZ7A 4YXUA 4Q0LA 4YGJA 4Q08A 3S78B 2POVA 3HKQA 3GZ0A 4K13A 3M1QA 3OIMA 4JSAA 4KP5A 5BNLA 2WEGA 3P55A 4KUWA 4TWMA 3Q31A 1CNXA 3DCCA 5CJFA 4KV0A 1BICA 1MOOA 5BRWA 5DSJA 2X7SA 5EOIA 4UOVA 3P44A 2NN1A 5CACA 1CVAA 1UGCA 4GL1X 3T5ZA 1ZNCA 3HKTA 3DC9A 1OKMA 1OQ5A 1RZDA 4YYTA 2WD3A 3PJJA 2FNNA 4K0TA 4E5QA 4E4AA 1RJ5A 3HKUA 4RH2A 3RYJB 5E28A 2NWOA 5DSNA 5FLPA 1LUGA 5JG3B 5DSIA 1G52A 2WD2A 5EHVA 5J8ZA 3B1BA 1CNBA 4ZWXA 3PO6A 1RZBA 4YVYA 3IBLA 3TMJA 4K1QA 5SZ0A 5FLRA 5LMDA 5AMLA 3S8XA 3P3HA 4Q9YA 4RFCA 1BN3A 4ZWYA 3JXHC 3N0NA 3MNIA 1CVEA 3HFPA 3DD8A 5FNMA 5FLSA 3B4FA 1IF4A 3DA2A 4FU5A 4WUPA 1CALA 4YGLA 1THKA 3N4BA 3UYQA 4CNXA 2WEHA 5EIJA 1UGDA 4CNWA 3S74B 4IDRX 1FQMA 4HBAA 4R59A 1AM6A 1A42A 3V2JA 1HECA 1LZVA 4HEZA 1UGBA 3D0NA 1OKNA 5EZTX 5G0BA 4PYYA 1IF9A 4KUYA 5L6KA 4ZWZA 1G1DA 5FNKA 4ITPA 2GD8A 5E5RA 3RGEA 1FQLA 5JEPB 1BCDA 3HKNA 4X5SA 3IBUA 1HVAA 4Q83A 4CQ0A 4KNNA 3TVNX 1FQRA 1G3ZA 5FNLA 4ZWIA 2Q1QA 1YDAA 5DSPA 5FDIA 4WR7A 5DSMA 4Q7VA 1YO0A 3OY0A 1I9LA 3NB5A 1G0EA 5AMDA 3P5AA 3P5LA 1CAMA 7CA2A 1HCBA 3DVDA 1HUGA 3FE4A 3QYKA 1JV0A 3M1WA 1AVNA 4Z0QA 5SZ2A 1HEAA 4E3FA 2NWZA 1I9MA 5E2RA 3RJ7A 1Z93A 4QIZA 1ZE8A 1CA2A 2EZ7A 1CA3A 1AZMA 3M04A 4G7AA 1CILA 3MNHA 4QJPA 4RIVA 4BF1A 3IGPA 3V3JA 2IT4A 4RFDA 1CAJA 4MLTA 4RUYA 3U3AX 1BNQA 3M2ZA 1YDCA 4MLXA 3OILA 3KNEA 8CA2A 3RZ1B 2AW1A 1I8ZA 4PXXA 3KLDB 4QK1A 3V3HB 4Z1KA 1UGFA 3M2NA 5DSLA 5DSQA 5FNGA 3VBDA 4QTLA 3L14A 1CVBA 2Q38A 1F2WA 3W6HA 5JEGB 4COQA 5E2NA 3DVCA 5AMGA 3MZCA 1CNCA 3BL0A 3T83A 4FRCA 1CVCA 3S76A 5EKMA 3T82A 4FIKA 5G0CA 3S75B 4Q09A 3HS4A 3DBUA 3DC3A 5DOGA 4BCWA 3MWOA 4Y0JA 4YWPA 5DSRA 4E49A 5DVXA 4KNIA 3F4XA 3EFIA 1TEUX 3JXFA 4WUQA 3HLJA 3KOIA 3UYNA 1KWQA 3S73B 3RYZA 1BNTA 4ZX1A 3F7BA 4KUVA 4ZAOA 1G45A 5SZ5A 5EHEA 4N16A 5C8IA 1ZGFA 1XQ0A 5SZ4A 1CCUA 1TE3X 3M2YA 1BNVA 3MDZA 2VVAX 2FOYA 3KIGA 1CINA 5EH7A 4QSIA 4RUZA 3V3GB 4YXOA 1RJ6A 3S97A 1HEDA 1CRMA 4DZ9A 1CNJA 2NXSA 3DD0A 3MNAA 1YO2A 5FLOA 1CNWA 2NWYA 3IEOA 4QSBA 1HCAA 3OIKA 4Q90A 1LG5A 1T9NA 1DMYA 2FNKA 1RZAA 3IBNA 2POWA 5EH8A 4WL4A 6CA2A 1CZMA 5FNHA 3V2MA 2NNGA 3RLDA 1CAYA 5SZ3A 1IF5A 3RG3A 3TVOX 4MDLA 4FVNA 1I90A 1XEGA 5DSKA 1IF7A 1UGAA 1URTA 4HT2A 5FNJA 4E3GA 1RAYA 1CRAA 9CA2A 1FR7A 3M2XA 1H9QA 3BL1A 2HD6A 4BF6A 5BRVA 1HEBA 2NWPA 3MHMA 1CIMA 1YDBA 2H15A 4RN4A 4TWLA 2NN7A 5G03A 4HF3A 4Q8XA 5FDCA 3JXGA 3D92A 1LGDA 3V7XA 2CABA 3ZNCA 1H9NA 1Y7WA 4QEFA 3DVBA 2QOAA 4R5AA 3MHCA 1BV3A 1TH9A 4MTYA 4CNVA 3V3FA 4C3TA 3EFTA 3S72B 1FQNA 1I9OA 2NXRA 2FMZA 3C7PA 4FL7A 4Q78A 4QK2A 5EKJA 5FNIA 5JDVB 5FL4A 3M3XA 4XE1A 3ML2A 3RG4A 3M96A 1CAZA 2WEJA 1BN1A 4JSWA 5JQ0A 1BNUA 1IF8A 4M2VA 1ZFQA 4FPTA 3FW3A 4RIUA 4KNMA 4FVOA 1BZMA 1RAZA 1UGGA 3S77B 1G54A 1RZEA 4JSSA 3K2FA 4R5BA 4XZ5A 3U7CA 4QJWA 5SZ1A 1BN4A 4PQ7A 4QSJA 3MNKA 3DAZA 1HUHA 3T84A 3CZVA 4JSZA 5DOHA 4Q07A 3RZ8A 4YGFA 4Q7SA 5EH5A 3OKVA 2NMXA 1I91A 2FOQA 2CBDA 3P4VA 4LU3A 5FL5A 2HL4A 5IPZA 2Q1BA 5EKHA 1BNMA 4M2UA 2GEHA 5FL6A 3IBIA 3OYSA 3RZ0B 1CNKA 3RYVB 1JCZA 1G4JA 5CA2A 5JGTB 4HT0A 1FLJA 4CACA 4LHIA 1CNGA 4Q8YA 2AX2A 4HEWA 4E3DA 3KWAA 1XEVA 5SZ7A 4KAPA 3M40A 4Q6DA 1MUAA 3ZP9A 4Q7PA 2CBEA 2F14A 4KNJA 3DV7A 1RZCA 2O4ZA 4Z1NA 3P3JA 4HU1A 5E2MA 5JEHB 2POUA 4L5WA 2W2JA 3M1JA 1IF6A 4QY3A 4N0XB 4QJOA 3RYXB 4ZX0A 3CYUA 1CNHA 3OYQA 1FSQA 4JS6A 5E2KA 4M2WA 2HFWA 5G01A 5JESB 3PYKA 3LXEA 4YHAA 3M98A 1CANA 3M1KA 2NNOA 12CAA 2NNSA 4XFWA 5FLQA 2X7UA 4QJXA 3CAJA 2OSMA 3S9TA 3MYQA 2FW4A 5E5UA 3R17B 1FSRA 3U47A 4L5VA 1DCAA 1CAHA 1LG6A 3MMFA 4HEYA 3DCWA 3W6IA 1KOPA 4E3HA 4PZHA 2CBAA 1CVDA 3NI5A 3SBIA 3D9ZA 3MNUA 5BYIA 1TTMA 5E2SA 1G46A 3K34A 4K0SA 1I9PA 2ZNCA 1G6VA 3CA2A 4Q49A 5A25A 2HNCA 1ZSCA 3RZ5A 1H4NA 1CCSA 1KWRA 1V9EA 3R16A 3RZ7A 1G4OA 4KP8A 4Q81A 1CNIA 2CBBA 1KOQA 3KOKA 4RUXA 4QIYA 1I9QA 5DSOA 2WEOA 4LP6A 3N2PA 4MO8A 1JD0A 2FMGA 3M14A 1CCTA 4CA2A 5JQTA 2FNMA 3KS3A 1DCBA 4Q87A 3FFPX 4Q99A 3MHIA 5JG5B 3M5TA 1G53A 3KONA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VVB X;  3U45 X;  1FR4 A;  3T5U A;  3BET A;  4IWZ A;  4XIW A;  2QO8 A;  3SAX A;  5L3O A;  1YO1 A;  4Q06 A;  2EU2 A;  2NXT A;  3P58 A;  3N3J A;  1CVH A;  2FOS A;  3D93 A;  3IAI A;  5DRS A;  4QSA A;  3D8W A;  4ETQ C;  3MHL A;  3T85 A;  1I9N A;  1ZFK A;  2ILI A;  2FOU A;  3DCS A;  4MDM A;  4QK3 A;  4Z1J A;  1CNY A;  1DMX A;  4ITO A;  1ZSB A;  2EU3 A;  4XIX A;  1Z9Y A;  1YDD A;  3F7U A;  4CNR A;  1BNW A;  4M2R A;  3SBH A;  1ZGE A;  1CVF A;  1V9I C;  5FLT A;  2X7T A;  3MNJ A;  1OKL A;  4YXI A;  3K7K A;  3RYY A;  3S71 B;  1G0F A;  1CAO A;  1ZH9 A;  2H4N A;  2HOC A;  2NNV A;  1KEQ A;  4MDG A;  2FOV A;  2QP6 A;  4PYX A;  3MHO A;  5SZ6 A;  5A6H A;  2HKK A;  1CAK A;  4L5U A;  4G0C A;  4QJM A;  4ILX A;  3M5E A;  5CLU A;  1J9W A;  3SAP A;  4Z1E A;  1XPZ A;  1UGE A;  1BNN A;  1CAI A;  4WW8 A;  4Q7W A;  3V5G A;  4YGK A;  1TEQ X;  5HPJ A;  1TBT X;  4WW6 A;  4Q8Z A;  3F8E A;  4Q6E A;  1Z97 A;  2CBC A;  1G48 A;  1TG3 A;  3V3I B;  4QJ0 A;  4YGN A;  1TG9 A;  1FSN A;  2ABE A;  5BRU A;  3ML5 A;  4YX4 A;  3KKX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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