4KNI | Genus

Total Genus 76

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	76
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__1663958335499878__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__1663958335499878__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4KNI/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__1663958335499878__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"1663958335499878","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4KNI/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__1663958335499878__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Benzenesulfonamides with pyrimidine moiety as inhibitors of human carbonic anhydrases I, II, VI, VII, XII, and XIII pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	76
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2013-05-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	4kniA00

4QIZA 3U7CA 4PZHA 4E3GA 4L5WA 5SZ5A 1CALA 3HS4A 3MHLA 4HT2A 4YGNA 1KEQA 4L5VA 3KLDB 1TG9A 3N0NA 4YXOA 1CILA 1BNWA 4XFWA 5FL5A 3S71B 3RLDA 4RUXA 3ML2A 3SAXA 4HT0A 1BN3A 3ZP9A 2CBAA 1CA2A 3DA2A 1G4OA 3S73B 4COQA 5DVXA 3W6IA 3CAJA 5EHVA 4RIUA 3V3FA 3T84A 4KUYA 2FNNA 4FRCA 3RG4A 3HKTA 3RZ7A 2NWOA 4PYYA 4CNWA 3BL0A 4E4AA 3FFPX 1YDBA 3ZNCA 4KNIA 3U45X 1CAHA 2AW1A 5L6KA 3D8WA 1XQ0A 1G1DA 4UOVA 3IAIA 1RZBA 3MHCA 1G46A 2EU3A 3OIMA 3FE4A 1H4NA 3TVNX 1LZVA 3ML5A 3L14A 1CNWA 5FLQA 3M2NA 3F4XA 4HEYA 3RZ0B 3M5TA 4WUQA 5EIJA 3V2MA 4Q49A 4RIVA 4PYXA 1IF4A 1ZNCA 1ZFKA 3V3JA 5JG3B 5E5UA 2HL4A 1FSRA 1CVDA 1CNBA 2EU2A 4YGLA 2Q1BA 4GL1X 3PO6A 4JS6A 1IF9A 3R16A 4R59A 3P5LA 4K0TA 3OILA 5E5RA 1BNMA 4QJPA 2HD6A 5G03A 8CA2A 3S77B 1HEAA 3V3IB 3DC3A 3JXGA 3KS3A 5LMDA 1FQNA 2CABA 3KKXA 1H9QA 4M2UA 5FDIA 4TWMA 1CRMA 4ZWZA 1G6VA 2FOQA 1BV3A 3SAPA 2AX2A 3RGEA 3B1BA 12CAA 2Q1QA 3M5EA 1G53A 5EHWA 1RJ6A 5FNLA 3P55A 1AVNA 1I90A 1IF8A 3M40A 1ZH9A 3N3JA 3CA2A 3OYSA 4KNMA 4WW6A 5L3OA 4YXIA 5C8IA 1DMYA 2NN7A 3DVBA 4ZX1A 4Q6DA 7CA2A 3DV7A 5SZ6A 2NNOA 4MDGA 3OYQA 4CNXA 4LU3A 3S9TA 1CNXA 3BETA 1I9MA 4IWZA 4N0XB 1CVAA 1UGFA 1CVHA 2X7TA 2WEOA 3F7BA 1Y7WA 2FOSA 2FMGA 1G0EA 4QY3A 2POUA 1ZFQA 2CA2A 3IBLA 2CBBA 3P5AA 4ILXA 1URTA 3OY0A 3EFIA 4Y0JA 1FR4A 1YO2A 1RZCA 2VVBX 5FNGA 4C3TA 3MNAA 1AZMA 3N2PA 5DRSA 5E2RA 4E3FA 5JDVB 3C7PA 3M67A 3HLJA 3KNEA 1DMXA 4RUZA 5DSNA 1LGDA 1G45A 5J8ZA 5SZ7A 1CA3A 1I91A 1CVBA 3NJ9A 5DOHA 2NNGA 4ITPA 4RFDA 5DSJA 1LG5A 4YGJA 4Q7VA 1KOQA 1CAMA 2CBDA 4M2RA 3D0NA 4E3HA 3IGPA 5JGSB 5CLUA 2HFWA 3D9ZA 3V2JA 1BNQA 1G4JA 4E5QA 3S8XA 1TEUX 4KNNA 3RYVB 3S75B 5AMLA 3RYZA 1YDAA 1CAJA 2F14A 3U3AX 1HEDA 1RZDA 3RZ5A 4E9OX 5EH5A 4R5BA 5FNIA 1RAZA 2OSFA 1CNKA 3Q31A 4Q0LA 2FOYA 2WD2A 2X7SA 4Q08A 1HECA 3K7KA 5SZ4A 3MHIA 1G48A 4DZ7A 5DSMA 3OKVA 3MYQA 1CAZA 1ZE8A 1A42A 3MNJA 4MLXA 5FLOA 3UYNA 1J9WA 3M2YA 4MLTA 1ZGFA 3M2XA 3F7UA 1BN1A 1FLJA 5E28A 5EKHA 5JQTA 3NB5A 1YDCA 1KOPA 1I8ZA 4Q09A 1BNNA 5DSIA 3FW3A 4K1QA 4Q7SA 3RZ1B 4Q87A 3MNUA 1Z93A 1BCDA 4G7AA 5EH8A 4CACA 3P4VA 2NNVA 1JCZA 4RH2A 4K0SA 4Z0QA 5E2MA 3V3GB 5FNJA 1CZMA 4Q7WA 1CNCA 3JXHC 4PQ7A 1XEGA 2QP6A 2GD8A 4QJWA 4BF6A 2NNSA 4N16A 3IBUA 1FQRA 4Q06A 2QOAA 3MHMA 2POVA 5BRUA 3DD0A 2O4ZA 5FLPA 3P58A 3KOKA 2ZNCA 1HEBA 2CBCA 2OSMA 1UGBA 4Q8ZA 3W6HA 5JGTB 2NXTA 5JEHB 4Z1NA 4FU5A 2FNMA 3TVOX 4QK1A 2NWZA 1HCAA 1Z9YA 3V7XA 1G52A 3B4FA 4ZAOA 2NMXA 5DSQA 1DCAA 4JSZA 4Z1JA 1TG3A 1OKMA 3M14A 4K13A 3KWAA 3DC9A 4QK2A 3MZCA 4KV0A 3T85A 4HEWA 1BN4A 3LXEA 1XEVA 2Q38A 1UGAA 4K0ZA 1FQLA 3M96A 5FNMA 2ABEA 1I9PA 5DSRA 3PYKA 4HEZA 4KP5A 1I9OA 3DCWA 4QEFA 4Z1EA 1TEQX 4HF3A 3DVDA 4QJMA 3P3JA 1H9NA 4G0CA 1CINA 4KNJA 2WEGA 3PJJA 2WD3A 5A6HA 1ZSCA 3DVCA 3S76A 1IF6A 4XZ5A 1HVAA 3RYXB 3DAZA 3EFTA 5EKJA 3HKQA 5FL6A 5IPZA 1CVEA 3K34A 3SBIA 1BICA 3MWOA 3HKNA 4M2VA 2NXSA 2GEHA 2H15A 5EZTX 1UGDA 4IDRX 3M2ZA 3T83A 3D92A 1RZEA 4RUYA 3K2FA 3R17B 3S74B 4FL7A 1TBTX 3RZ8A 3V5GA 3T5UA 5DOGA 5BYIA 4BF1A 5JEGB 4QSIA 5SZ2A 1BNTA 3IBNA 4FIKA 4XIWA 5DSLA 1CNJA 4Q83A 2HNCA 1CRAA 5DSKA 1CAYA 5EKMA 4MTYA 1TH9A 3HKUA 4YHAA 4Q6EA 4JSWA 4MDLA 2NWYA 1KWRA 5SZ3A 1F2WA 1IF7A 4QK3A 1RZAA 1FR7A 5EHEA 4MDMA 1CNGA 1V9EA 2WEHA 3M1KA 1YO1A 4JSSA 4Q78A 2FW4A 4CNRA 3MNHA 3DBUA 1ZSBA 4R5AA 2EZ7A 2QO8A 1CCUA 4KP8A 5FLRA 4Q8XA 5JQ0A 3M1QA 5A25A 1FSNA 3V3HB 3DD8A 3M1WA 3QYKA 4KUWA 1LG6A 1I9QA 3KOIA 3MMFA 5FDCA 3T5ZA 3MDZA 2CBEA 1MOOA 4YXUA 1RJ5A 4ZWXA 1UGEA 1Z97A 3P44A 1JD0A 4X5SA 3KONA 3RJ7A 4QSBA 3UYQA 4ZX0A 1IF5A 2POWA 3D93A 4QSJA 3U47A 4Q7PA 3HFPA 1KWQA 5FL4A 1CAOA 4LHIA 1CIMA 4WUPA 5E2KA 3S72B 4BCWA 4FVOA 4L5UA 4CNVA 5CA2A 4YGFA 4QJ0A 5SZ0A 4YWPA 5E2SA 4CQ0A 4RFCA 4Q90A 2X7UA 3CZVA 3RYJB 4LP6A 1UGGA 3T82A 4QIYA 3DCCA 4FVNA 1HUHA 5AMGA 5DSOA 1CCTA 4TWLA 1CVFA 1CANA 1HUGA 4XE1A 3VBDA 3SBHA 4JSAA 4CA2A 1G54A 5BRVA 4DZ9A 3S78B 4YGKA 4PXXA 4HU1A 5FNHA 3RYYA 1V9IC 1MUAA 1BNUA 4HBAA 5FLSA 1ZSAA 2FNKA 4WR7A 5FNKA 4YX4A 2HOCA 1G3ZA 5JEPB 1OQ5A 4QJOA 4YYTA 1UGCA 5BRWA 4QTLA 4YVYA 1DCBA 4QSAA 1HCBA 3MNIA 3M1JA 3MNKA 5EH7A 1CNYA 2FOVA 1EOUA 2HKKA 1FSQA 5G01A 1TE3X 1BZMA 1I9LA 5EOIA 1FQMA 4ETQC 4MO8A 5HPJA 3NI5A 4ZWIA 2IT4A 5JESB 2WEJA 3N4BA 3JXFA 5JG5B 1THKA 2ILIA 2NN1A 3F8EA 3OIKA 4KAPA 3BL1A 5E2NA 4ITOA 3S97A 3M04A 1TB0X 2W2JA 4E49A 1TTMA 3OKUA 3MHOA 5G0BA 1BNVA 5CJFA 5AMDA 1CCSA 3RG3A 4Q81A 2VVAX 3P3HA 3IBIA 4WW8A 4WL4A 5SZ1A 1RAYA 3KIGA 4XIXA 1CNIA 3GZ0A 1I9NA 4RN4A 3DCSA 1AM6A 5BNLA 1CVCA 4ZWYA 6CA2A 2H4NA 2FMZA 3M5SA 1OKLA 1G0FA 4FPTA 1CNHA 5FLTA 5G0CA 5CACA 2NWPA 3CYUA 3IEOA 1OKNA 1T9NA 1CAKA 1XPZA 5DSPA 4E3DA 2NXRA 4Z1KA 4M2WA 4Q07A 3M3XA 4Q99A 1YDDA 4Q8YA 1ZGEA 3M98A 1LUGA 1JV0A 3TMJA 9CA2A 4KUVA 4Q9YA 4QJXA 2FOUA 1CAIA 1YO0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4QIZ A;  3U7C A;  4PZH A;  4E3G A;  4L5W A;  5SZ5 A;  1CAL A;  3HS4 A;  3MHL A;  4HT2 A;  4YGN A;  1KEQ A;  4L5V A;  3KLD B;  1TG9 A;  3N0N A;  4YXO A;  1CIL A;  1BNW A;  4XFW A;  5FL5 A;  3S71 B;  3RLD A;  4RUX A;  3ML2 A;  3SAX A;  4HT0 A;  1BN3 A;  3ZP9 A;  2CBA A;  1CA2 A;  3DA2 A;  1G4O A;  3S73 B;  4COQ A;  5DVX A;  3W6I A;  3CAJ A;  5EHV A;  4RIU A;  3V3F A;  3T84 A;  4KUY A;  2FNN A;  4FRC A;  3RG4 A;  3HKT A;  3RZ7 A;  2NWO A;  4PYY A;  4CNW A;  3BL0 A;  4E4A A;  3FFP X;  1YDB A;  3ZNC A;  4KNI A;  3U45 X;  1CAH A;  2AW1 A;  5L6K A;  3D8W A;  1XQ0 A;  1G1D A;  4UOV A;  3IAI A;  1RZB A;  3MHC A;  1G46 A;  2EU3 A;  3OIM A;  3FE4 A;  1H4N A;  3TVN X;  1LZV A;  3ML5 A;  3L14 A;  1CNW A;  5FLQ A;  3M2N A;  3F4X A;  4HEY A;  3RZ0 B;  3M5T A;  4WUQ A;  5EIJ A;  3V2M A;  4Q49 A;  4RIV A;  4PYX A;  1IF4 A;  1ZNC A;  1ZFK A;  3V3J A;  5JG3 B;  5E5U A;  2HL4 A;  1FSR A;  1CVD A;  1CNB A;  2EU2 A;  4YGL A;  2Q1B A;  4GL1 X;  3PO6 A;  4JS6 A;  1IF9 A;  3R16 A;  4R59 A;  3P5L A;  4K0T A;  3OIL A;  5E5R A;  1BNM A;  4QJP A;  2HD6 A;  5G03 A;  8CA2 A;  3S77 B;  1HEA A;  3V3I B;  3DC3 A;  3JXG A;  3KS3 A;  5LMD A;  1FQN A;  2CAB A;  3KKX A;  1H9Q A;  4M2U A;  5FDI A;  4TWM A;  1CRM A;  4ZWZ A;  1G6V A;  2FOQ A;  1BV3 A;  3SAP A;  2AX2 A;  3RGE A;  3B1B A;  12CA A;  2Q1Q A;  3M5E A;  1G53 A;  5EHW A;  1RJ6 A;  5FNL A;  3P55 A;  1AVN A;  1I90 A;  1IF8 A;  3M40 A;  1ZH9 A;  3N3J A;  3CA2 A;  3OYS A;  4KNM A;  4WW6 A;  5L3O A;  4YXI A;  5C8I A;  1DMY A;  2NN7 A;  3DVB A;  4ZX1 A;  4Q6D A;  7CA2 A;  3DV7 A;  5SZ6 A;  2NNO A;  4MDG A;  3OYQ A;  4CNX A;  4LU3 A;  3S9T A;  1CNX A;  3BET A;  1I9M A;  4IWZ A;  4N0X B;  1CVA A;  1UGF A;  1CVH A;  2X7T A;  2WEO A;  3F7B A;  1Y7W A;  2FOS A;  2FMG A;  1G0E A;  4QY3 A;  2POU A;  1ZFQ A;  2CA2 A;  3IBL A;  2CBB A;  3P5A A;  4ILX A;  1URT A;  3OY0 A;  3EFI A;  4Y0J A;  1FR4 A;  1YO2 A;  1RZC A;  2VVB X;  5FNG A;  4C3T A;  3MNA A;  1AZM A;  3N2P A;  5DRS A;  5E2R A;  4E3F A;  5JDV B;  3C7P A;  3M67 A;  3HLJ A;  3KNE A;  1DMX A;  4RUZ A;  5DSN A;  1LGD A; 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 4Q7W A;  1CNC A;  3JXH C;  4PQ7 A;  1XEG A;  2QP6 A;  2GD8 A;  4QJW A;  4BF6 A;  2NNS A;  4N16 A;  3IBU A;  1FQR A;  4Q06 A;  2QOA A;  3MHM A;  2POV A;  5BRU A;  3DD0 A;  2O4Z A;  5FLP A;  3P58 A;  3KOK A;  2ZNC A;  1HEB A;  2CBC A;  2OSM A;  1UGB A;  4Q8Z A;  3W6H A;  5JGT B;  2NXT A;  5JEH B;  4Z1N A;  4FU5 A;  2FNM A;  3TVO X;  4QK1 A;  2NWZ A;  1HCA A;  1Z9Y A;  3V7X A;  1G52 A;  3B4F A;  4ZAO A;  2NMX A;  5DSQ A;  1DCA A;  4JSZ A;  4Z1J A;  1TG3 A;  1OKM A;  3M14 A;  4K13 A;  3KWA A;  3DC9 A;  4QK2 A;  3MZC A;  4KV0 A;  3T85 A;  4HEW A;  1BN4 A;  3LXE A;  1XEV A;  2Q38 A;  1UGA A;  4K0Z A;  1FQL A;  3M96 A;  5FNM A;  2ABE A;  1I9P A;  5DSR A;  3PYK A;  4HEZ A;  4KP5 A;  1I9O A;  3DCW A;  4QEF A;  4Z1E A;  1TEQ X;  4HF3 A;  3DVD A;  4QJM A;  3P3J A;  1H9N A;  4G0C A;  1CIN A;  4KNJ A;  2WEG A;  3PJJ A;  2WD3 A;  5A6H A;  1ZSC A;  3DVC A;  3S76 A;  1IF6 A;  4XZ5 A;  1HVA A;  3RYX B;  3DAZ A;  3EFT A;  5EKJ A;  3HKQ A;  5FL6 A;  5IPZ A;  1CVE A;  3K34 A;  3SBI A;  1BIC A;  3MWO A;  3HKN A; 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4KNIA

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