4KNNA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 2-chloro-4-[(pyrimidin-2-ylsulfanyl)acetyl]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Benzenesulfonamides with pyrimidine moiety as inhibitors of human carbonic anhydrases I, II, VI, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4knnA00
4KUWA 1CRAA 4C3TA 3S9TA 3TMJA 3DVBA 5DSRA 4K0TA 4QK3A 5FL4A 3W6IA 4M2VA 1I9MA 12CAA 4Q78A 1FSQA 1XEGA 4FPTA 1HEBA 3HS4A 3NI5A 5JG3B 3T5UA 4TWLA 1CVCA 4WW6A 3S76A 3P4VA 1FQMA 3JXGA 5AMGA 1FQNA 5EH7A 3PO6A 1CAYA 3M2XA 3OYSA 3RZ7A 1UGBA 4JSWA 1G54A 4FRCA 1BV3A 3DD8A 3RYYA 1RZCA 4XE1A 1XQ0A 3F7BA 1CNGA 5E2RA 5FNKA 1I91A 3V7XA 5JQ0A 3OKVA 5JQTA 3U47A 4LHIA 5DSLA 3CA2A 1DCBA 4Q8ZA 5SZ5A 3RZ5A 4BF1A 4DZ7A 4RIUA 1CVDA 2CBCA 3T83A 2HFWA 1KEQA 1V9IC 4N16A 1MOOA 3RG3A 7CA2A 1BNQA 3IBLA 4QSBA 2NMXA 1OQ5A 1BNVA 4WUQA 4K0ZA 4YYTA 4ILXA 4L5UA 4Z1EA 4RUZA 2HD6A 4Q9YA 1H9QA 4Q7PA 4MTYA 4QJMA 3V3JA 2Q38A 4KP5A 5G01A 3BETA 2FNNA 4Q06A 4UOVA 3OKUA 5CA2A 4CNXA 4XZ5A 4YXOA 4KNIA 1LGDA 4M2UA 5FLQA 2GEHA 3K34A 1CVBA 5FDCA 4HT2A 5FL6A 1G46A 5G0BA 1CVHA 3SBIA 3MNIA 4RN4A 5FNJA 1CNYA 2CBEA 4Q7WA 3B1BA 1ZH9A 3M1KA 4PXXA 3MNAA 4JSAA 1G6VA 4MLXA 1BICA 5DOHA 3HKTA 1CRMA 3MWOA 3M96A 5SZ3A 4L5VA 1I9NA 3JXHC 4LU3A 4QEFA 1TH9A 3SBHA 3B4FA 2NWZA 2IT4A 3M1QA 3HKUA 9CA2A 1CCSA 3CAJA 2FOSA 2HKKA 3MHCA 3DAZA 5DRSA 1CAMA 1CIMA 5DVXA 3UYQA 2NNSA 3MNKA 1JD0A 4E4AA 1I9LA 1CA2A 4WL4A 2CBAA 4RUXA 3KOKA 3RYZA 2X7UA 1Z97A 5EZTX 5JEGB 3M14A 3U7CA 2Q1BA 1CAHA 4Q7VA 4JS6A 3S73B 1G53A 3ML2A 5EHVA 3MHOA 1UGFA 5SZ2A 3R17B 4KNNA 2QOAA 4COQA 2VVBX 3OY0A 4HEWA 1UGDA 2H15A 1BZMA 1G4OA 4ZX1A 1CNHA 1CANA 2ILIA 5BRWA 4HEZA 3VBDA 4Z0QA 1G45A 1FLJA 1G0FA 1IF6A 3M40A 1OKMA 1RZAA 3D93A 3DA2A 3EFTA 3EFIA 3MNHA 4XIWA 4LP6A 3QYKA 4Q81A 1DMXA 3KKXA 4RFDA 4WUPA 1V9EA 2NXSA 4YGFA 5DSPA 3F7UA 2NXRA 5EKMA 1LUGA 4G0CA 5DSNA 3DCSA 3K2FA 4QSIA 5E28A 3RG4A 1I9PA 1ZSAA 3M04A 2FNKA 4Q7SA 4QJXA 1JV0A 1YDCA 3R16A 3ZNCA 3IBUA 1FQRA 3SAXA 5JG5B 4Q83A 3MHIA 4Z1JA 4FIKA 3RYVB 1ZNCA 1KOPA 3BL0A 4PQ7A 3V3FA 3ZP9A 3U45X 2Q1QA 1UGCA 5FLRA 2NWPA 1CA3A 5FLOA 5G03A 5EHEA 4RH2A 3V5GA 1BCDA 1H4NA 1KWQA 1ZSBA 2WEJA 4MDGA 4WR7A 4Q8YA 4YGJA 1RZEA 5L6KA 4E3GA 2NWYA 1IF4A 1IF9A 1KOQA 1LG6A 2AW1A 4KNMA 3N4BA 4YXUA 1YDDA 4GL1X 3MNJA 5FLPA 3RJ7A 2CBBA 2OSFA 2HL4A 3T5ZA 4Q87A 1XPZA 2POVA 4YGKA 4DZ9A 4Q90A 4ITPA 5JESB 1CALA 2FW4A 1OKLA 3OILA 3FFPX 1AVNA 1UGGA 3K7KA 4K0SA 5DSKA 1HCAA 4KP8A 3DCCA 3S78B 1CNJA 4ETQC 1Z93A 2ZNCA 5SZ4A 5E2NA 1BN1A 2NNGA 3M5EA 3RLDA 1G48A 3M5TA 2W2JA 1CAKA 3HKNA 3KONA 3P3JA 4FVOA 4QJOA 4XIXA 4YGNA 1JCZA 3DVCA 4XFWA 1YDAA 3KLDB 3S72B 2CABA 3Q31A 5E5UA 2NN7A 1I8ZA 4QK2A 1TB0X 4YX4A 5DSQA 1I9OA 1YO0A 2QO8A 5A25A 1ZGEA 4HU1A 4CNRA 3IBNA 5EHWA 1T9NA 5EKHA 3MZCA 5JEHB 2F14A 4TWMA 3GZ0A 3RZ0B 1YO1A 4E3DA 2FOVA 1CNXA 1HEAA 5HPJA 4CA2A 5JGTB 1A42A 4ITOA 3RZ8A 3KOIA 1RJ6A 1KWRA 1XEVA 4JSSA 5SZ6A 5FNIA 3T82A 3NB5A 3DCWA 1HUHA 4JSZA 5FDIA 4ZWXA 3IAIA 1HECA 2FMZA 4R5AA 1HCBA 1BN3A 1RJ5A 3OYQA 1RAYA 4FL7A 4KNJA 1CNWA 4ZWZA 1CAIA 4CNVA 4YVYA 3M2YA 4KUYA 1RZBA 4M2WA 1BNNA 1HEDA 3DBUA 1J9WA 3MMFA 4RUYA 1I9QA 5JEPB 1YO2A 5E5RA 3F4XA 5SZ7A 2QP6A 1DCAA 3P5AA 4MLTA 2NXTA 3OIMA 1CZMA 1CCTA 1CVEA 1HUGA 8CA2A 1CILA 1UGEA 3M3XA 1CVFA 1YDBA 2WD3A 5DSIA 4FVNA 2HOCA 1FQLA 3S8XA 3DD0A 1CVAA 2FOUA 3PYKA 1UGAA 3KIGA 4YWPA 4Q6DA 5FLSA 5LMDA 2WD2A 4ZAOA 3KS3A 4Q0LA 3T85A 1TEUX 3RGEA 4Z1KA 1CINA 2FOQA 4Q49A 3V3IB 1CAZA 5J8ZA 3IEOA 3DC3A 4HBAA 2EU2A 2WEGA 3W6HA 1CNCA 5EKJA 1BN4A 1G1DA 3M67A 3OIKA 2GD8A 4PYYA 4HF3A 5FNLA 5BRVA 1H9NA 1CNBA 3N0NA 1ZE8A 1BNTA 3UYNA 1LZVA 3ML5A 3P55A 3KNEA 3TVOX 4MDMA 4QTLA 3P3HA 5JDVB 5AMDA 4CQ0A 5BYIA 4E3FA 2HNCA 1TG9A 4N0XB 3FE4A 5FNHA 2CA2A 1FR7A 4KUVA 5DOGA 2FMGA 1HVAA 5EH5A 5E2KA 1FSNA 1LG5A 1CCUA 1TBTX 3SAPA 5EOIA 2FOYA 3D9ZA 2WEHA 3MHMA 4G7AA 5IPZA 3S74B 2ABEA 4RIVA 1G3ZA 3N3JA 1BNMA 3C7PA 2CBDA 4FU5A 4K1QA 5FLTA 1EOUA 5AMLA 1DMYA 2OSMA 1MUAA 3V2JA 3RYXB 4ZWYA 4E49A 4BF6A 1TE3X 3CYUA 4QJPA 1AM6A 3IGPA 4E9OX 4QJ0A 4WW8A 4K13A 2O4ZA 4Q08A 3S75B 3D92A 3M2NA 1Y7WA 1FSRA 4Q8XA 1TTMA 3N2PA 1OKNA 2WEOA 3V3HB 3MNUA 5SZ0A 2NN1A 5SZ1A 3M2ZA 3MHLA 3PJJA 4KAPA 4QK1A 5CACA 2FNMA 4PZHA 4IDRX 5DSOA 1G0EA 1G4JA 2H4NA 3KWAA 5FNGA 5A6HA 4CNWA 4QIYA 4HT0A 1RAZA 1I90A 1IF8A 1TEQX 3V3GB 3DV7A 1ZGFA 4QSAA 4E5QA 4CACA 2EU3A 3DC9A 3P5LA 1URTA 4R5BA 4PYXA 1G52A 5CJFA 6CA2A 3V2MA 1BNWA 3M98A 1CNKA 1ZFQA 1BNUA 4M2RA 4QY3A 5L3OA 4MO8A 3M1WA 3L14A 3MYQA 5EH8A 4QIZA 3D0NA 4BCWA 4YGLA 3TVNX 3IBIA 4YXIA 3CZVA 3F8EA 3D8WA 4ZX0A 4RFCA 1CAOA 4QSJA 4R59A 2POUA 5DSMA 3BL1A 3LXEA 1ZSCA 5JGSB 2AX2A 1AZMA 1THKA 3M1JA 4MDLA 3T84A 4KV0A 1F2WA 4IWZA 3P58A 3M5SA 5G0CA 2VVAX 3DVDA 3HFPA 4Q07A 4Q6EA 5DSJA 1CAJA 2POWA 1RZDA 3RYJB 2EZ7A 3U3AX 3S71B 2X7TA 4L5WA 2NNVA 2NNOA 5FNMA 4ZWIA 1IF5A 3MDZA 3S77B 5E2MA 5EIJA 4Q09A 3S97A 1FR4A 2X7SA 5BNLA 5E2SA 3RZ1B 1Z9YA 3HLJA 1IF7A 3JXFA 4Z1NA 4E3HA 3HKQA 5CLUA 5C8IA 4YHAA 5BRUA 2NWOA 1ZFKA 1TG3A 4X5SA 4QJWA 3P44A 3NJ9A 5FL5A 3FW3A 4HEYA 4Q99A 4Y0JA 1CNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KUW A;  1CRA A;  4C3T A;  3S9T A;  3TMJ A;  3DVB A;  5DSR A;  4K0T A;  4QK3 A;  5FL4 A;  3W6I A;  4M2V A;  1I9M A;  12CA A;  4Q78 A;  1FSQ A;  1XEG A;  4FPT A;  1HEB A;  3HS4 A;  3NI5 A;  5JG3 B;  3T5U A;  4TWL A;  1CVC A;  4WW6 A;  3S76 A;  3P4V A;  1FQM A;  3JXG A;  5AMG A;  1FQN A;  5EH7 A;  3PO6 A;  1CAY A;  3M2X A;  3OYS A;  3RZ7 A;  1UGB A;  4JSW A;  1G54 A;  4FRC A;  1BV3 A;  3DD8 A;  3RYY A;  1RZC A;  4XE1 A;  1XQ0 A;  3F7B A;  1CNG A;  5E2R A;  5FNK A;  1I91 A;  3V7X A;  5JQ0 A;  3OKV A;  5JQT A;  3U47 A;  4LHI A;  5DSL A;  3CA2 A;  1DCB A;  4Q8Z A;  5SZ5 A;  3RZ5 A;  4BF1 A;  4DZ7 A;  4RIU A;  1CVD A;  2CBC A;  3T83 A;  2HFW A;  1KEQ A;  1V9I C;  4N16 A;  1MOO A;  3RG3 A;  7CA2 A;  1BNQ A;  3IBL A;  4QSB A;  2NMX A;  1OQ5 A;  1BNV A;  4WUQ A;  4K0Z A;  4YYT A;  4ILX A;  4L5U A;  4Z1E A;  4RUZ A;  2HD6 A;  4Q9Y A;  1H9Q A;  4Q7P A;  4MTY A;  4QJM A;  3V3J A;  2Q38 A;  4KP5 A;  5G01 A;  3BET A;  2FNN A;  4Q06 A;  4UOV A;  3OKU A;  5CA2 A;  4CNX A;  4XZ5 A;  4YXO A;  4KNI A;  1LGD A; 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