4LP6A

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with a quinoline oligoamide foldamer
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of a complex formed by a protein and a helical aromatic oligoamide foldamer at 2.1 angstrom resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4lp6A00
1OKLA 5E28A 4QJOA 4IWZA 1TE3X 4XFWA 1I90A 3JXGA 4WR7A 1CAHA 1CNXA 1H4NA 2HD6A 2X7UA 1IF5A 5CLUA 5FDIA 3Q31A 5EKHA 3M67A 4E3DA 3S71B 3CAJA 3NB5A 2NWZA 2QP6A 1ZE8A 7CA2A 5JEGB 3ML5A 2WD2A 1G45A 1XQ0A 1YDBA 3FE4A 4JSSA 4E3HA 5DVXA 1YDDA 5JESB 1CVFA 4LP6A 1G54A 1T9NA 3DC9A 5CJFA 3PYKA 2WEGA 4Q7SA 4L5UA 4QY3A 2GEHA 1FQRA 4QIYA 1RJ5A 2IT4A 1H9NA 4WW8A 5J8ZA 1J9WA 4QSBA 4Q8ZA 4BF6A 3L14A 3RGEA 1FQLA 4FVOA 3MNAA 3HS4A 3EFTA 4M2WA 4FRCA 2W2JA 3U47A 4QEFA 4PYXA 1I9PA 5G01A 2X7SA 3IBIA 4M2VA 3RYXB 3W6HA 2FOQA 4QK3A 2OSFA 2NXTA 1TEUX 4ZWIA 3KKXA 3GZ0A 4L5VA 2CABA 2FOVA 2QOAA 4RUXA 3SBHA 4YWPA 5DSIA 1G3ZA 4Q06A 4HT0A 4KP8A 4RUYA 4Q87A 4QJXA 1G0FA 1CRAA 2O4ZA 4ZWYA 5G03A 5FLQA 1CNIA 4RFCA 3MNKA 5DSJA 1I9MA 4MDMA 5DSPA 1FR7A 2CBEA 3M1QA 5FDCA 1CVAA 3KNEA 3DBUA 5JG5B 4WL4A 4QJ0A 3P5LA 9CA2A 1DCBA 5AMGA 1CVCA 3DD8A 3S76A 5EOIA 1FLJA 1XPZA 1FSRA 4K0ZA 4R59A 2HNCA 2VVBX 5FNJA 4ZAOA 3OKVA 1CILA 3DCWA 3SBIA 5FNHA 3MMFA 3U3AX 4JS6A 1HCAA 4QTLA 5SZ1A 3D0NA 3MNHA 5FNMA 5BYIA 4MDLA 1XEVA 3HFPA 4KAPA 2NNVA 4Q81A 3OIMA 1BICA 3RZ8A 1IF6A 1TG9A 3MYQA 3S73B 1CAJA 2GD8A 3KOIA 3DA2A 5E2NA 5CA2A 1CALA 3U45X 3MDZA 5E2SA 3HKUA 4Q7PA 4HEWA 4TWLA 3MHOA 3UYNA 1ZFQA 1DCAA 2NNSA 2CBDA 3DD0A 1CAKA 3S8XA 3MHLA 1CNCA 4RIVA 1Z9YA 3RG3A 1TEQX 5DSRA 1BN4A 5EH7A 1V9IC 4RH2A 1G46A 4YGKA 3M1WA 4XIXA 3IBUA 3V3JA 3DVBA 3W6IA 4E49A 3MHMA 1RAZA 3P4VA 1TH9A 3T5UA 2ABEA 4L5WA 3QYKA 3M2YA 5JGSB 1XEGA 2NWYA 4WUPA 2Q38A 4Q7VA 3V3FA 4JSZA 4WUQA 5EH8A 5FLOA 5FNGA 4MO8A 5AMLA 3RYJB 1ZFKA 4MLTA 3NJ9A 1AM6A 4BF1A 1TBTX 1CCTA 3TVOX 1CA3A 3M5TA 5FLPA 1HEDA 1KWQA 2NXRA 1HUHA 1YO0A 3SAXA 3S75B 3V2JA 3V2MA 1UGGA 1Z93A 3EFIA 3M1JA 1AVNA 1OKMA 2AW1A 4YVYA 3RYZA 2Q1QA 1BNMA 1LGDA 2POVA 4FPTA 5JEHB 3IBLA 1CVHA 1I91A 5BRVA 1UGCA 5L6KA 1TTMA 4LU3A 1CCSA 1ZH9A 1G1DA 3T82A 3F8EA 3PO6A 4N0XB 1ZNCA 8CA2A 3B4FA 1UGEA 4QJPA 2H4NA 2WEJA 4G7AA 4Q0LA 4RN4A 5C8IA 1ZSBA 5JDVB 4K0TA 1HVAA 4YXOA 4Z0QA 3M40A 3M5EA 4YGLA 3MNIA 4XIWA 1I9OA 3DCSA 3F4XA 5DSLA 3S77B 5FLRA 4FL7A 2WEOA 3C7PA 3FFPX 3HKNA 3OYSA 1CINA 3P55A 4Q8XA 3RZ7A 2FOUA 5AMDA 1BNWA 1G48A 1YDAA 5SZ7A 2CBAA 1URTA 2ZNCA 1CNWA 1JCZA 1HCBA 5SZ2A 3UYQA 1BV3A 2OSMA 4MDGA 4KP5A 4Q49A 5JQ0A 4N16A 2NNGA 3HKTA 3M2XA 4MTYA 3M96A 1BZMA 1CIMA 1CZMA 4QJWA 1CNBA 1A42A 4QSIA 4Q6EA 3RYVB 1HEAA 5EHWA 1JV0A 1THKA 3D92A 3HLJA 5E5UA 1CVDA 4ETQC 4RFDA 4Q9YA 3LXEA 3R17B 5SZ5A 3MWOA 5E2MA 3OILA 4CNVA 1HECA 1G52A 2CBBA 5EKJA 3S78B 4PZHA 1ZGFA 4CNXA 4QK1A 3V7XA 3CYUA 4CQ0A 2AX2A 5FNKA 1CAYA 3M2ZA 3V3HB 1BN1A 1G4JA 3DV7A 1LZVA 1KWRA 2FW4A 3M1KA 4X5SA 1CANA 4XZ5A 3S97A 5FNLA 4CNRA 3KS3A 4QSAA 1FQMA 1CNYA 1YO1A 4HBAA 1RZAA 3OKUA 3CZVA 2EZ7A 3KLDB 1MOOA 1YO2A 4HF3A 1JD0A 1G6VA 4K13A 5SZ3A 6CA2A 1CA2A 1KOPA 3OYQA 1CCUA 1CVBA 3K34A 4YGNA 1BNUA 2Q1BA 3S74B 4FIKA 3MHCA 1UGFA 4KNMA 5IPZA 1EOUA 4XE1A 2NWPA 3OIKA 1UGAA 1AZMA 3T84A 4CNWA 4K1QA 2WD3A 3NI5A 2ILIA 2FOYA 1DMYA 4QIZA 5DSMA 5JEPB 3JXFA 1F2WA 4LHIA 1LG6A 5DOHA 1CNHA 5JGTB 2CA2A 4ITPA 3M2NA 2CBCA 1CNJA 3M3XA 4R5AA 5FL6A 1I8ZA 3DVCA 5G0CA 5DOGA 1RJ6A 2NXSA 3ZP9A 2POUA 3IAIA 5BRWA 4QSJA 1BN3A 2FMGA 12CAA 3CA2A 1TG3A 2FNNA 4YX4A 1OKNA 5DSNA 1I9QA 3V3IB 3DAZA 3P58A 4Z1JA 4FU5A 4GL1X 4JSWA 4M2RA 4KV0A 3IGPA 1CNKA 5SZ6A 2F14A 3JXHC 4HU1A 1UGBA 3N0NA 5FLTA 4E9OX 2FOSA 4PXXA 4HT2A 4Z1EA 1FSNA 2HL4A 1YDCA 1ZGEA 5SZ4A 3RYYA 4RUZA 1G53A 2X7TA 3MZCA 3RZ5A 3T83A 1FQNA 3KIGA 4G0CA 3MHIA 1IF7A 3P5AA 2HKKA 3DC3A 4YGJA 1CNGA 2H15A 3TMJA 4PQ7A 4E4AA 5EHVA 5EZTX 3SAPA 2EU3A 3PJJA 4ILXA 3VBDA 4CACA 4DZ9A 1RZBA 4RIUA 1RZEA 4TWMA 2FNKA 5EH5A 4R5BA 3TVNX 4Z1NA 4KUYA 3RZ1B 5FNIA 2VVAX 5A6HA 3P3JA 1RZCA 5EIJA 4Q07A 4Z1KA 4ZWZA 1BNQA 5E5RA 1BNVA 4E3GA 4FVNA 4YYTA 4Q83A 4QJMA 3P3HA 3RZ0B 3R16A 3M14A 3FW3A 5EKMA 3P44A 3MNJA 1BNNA 3B1BA 3N4BA 5LMDA 1G0EA 3IBNA 1CAIA 3HKQA 3RLDA 1CAMA 5E2RA 3V3GB 4PYYA 4YXUA 1I9LA 5DSOA 3BL0A 5CACA 1HEBA 4ZX1A 2NN1A 4HEZA 2HFWA 1DMXA 5BNLA 3ML2A 4DZ7A 1BNTA 4Q09A 1Y7WA 5JG3B 1KOQA 4E5QA 3RJ7A 2POWA 3S9TA 5JQTA 3K2FA 4Q6DA 4COQA 4Q8YA 5EHEA 4KUWA 1RAYA 4MLXA 3U7CA 3ZNCA 2NMXA 3D9ZA 3KOKA 3M5SA 4KNIA 1FSQA 5L3OA 1FR4A 2NWOA 5DRSA 4KUVA 1CAZA 4KNNA 5E2KA 1ZSAA 2NN7A 4HEYA 4Q7WA 2NNOA 5G0BA 1IF9A 4YHAA 3S72B 4Q90A 4Q08A 1HUGA 4Q78A 3OY0A 1LUGA 1OQ5A 4M2UA 3T5ZA 5FL4A 1ZSCA 1H9QA 4WW6A 3RG4A 2QO8A 3KWAA 4UOVA 5FL5A 3BETA 4ITOA 5DSQA 2FNMA 3M98A 5BRUA 3IEOA 2FMZA 4JSAA 1Z97A 1CAOA 4QK2A 1BCDA 5A25A 3DCCA 3F7BA 3T85A 3BL1A 3KONA 1LG5A 2WEHA 1CVEA 4C3TA 1I9NA 4K0SA 5DSKA 4KNJA 5FLSA 4IDRX 4YGFA 2EU2A 3V5GA 3N3JA 1TB0X 4Y0JA 5SZ0A 1MUAA 3N2PA 3DVDA 4ZX0A 3F7UA 1IF8A 1CRMA 3MNUA 1G4OA 1V9EA 3D93A 2HOCA 5HPJA 4ZWXA 4E3FA 1RZDA 4YXIA 1UGDA 1KEQA 1IF4A 3D8WA 4CA2A 4Q99A 3M04A 3K7KA 4BCWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OKL A;  5E28 A;  4QJO A;  4IWZ A;  1TE3 X;  4XFW A;  1I90 A;  3JXG A;  4WR7 A;  1CAH A;  1CNX A;  1H4N A;  2HD6 A;  2X7U A;  1IF5 A;  5CLU A;  5FDI A;  3Q31 A;  5EKH A;  3M67 A;  4E3D A;  3S71 B;  3CAJ A;  3NB5 A;  2NWZ A;  2QP6 A;  1ZE8 A;  7CA2 A;  5JEG B;  3ML5 A;  2WD2 A;  1G45 A;  1XQ0 A;  1YDB A;  3FE4 A;  4JSS A;  4E3H A;  5DVX A;  1YDD A;  5JES B;  1CVF A;  4LP6 A;  1G54 A;  1T9N A;  3DC9 A;  5CJF A;  3PYK A;  2WEG A;  4Q7S A;  4L5U A;  4QY3 A;  2GEH A;  1FQR A;  4QIY A;  1RJ5 A;  2IT4 A;  1H9N A;  4WW8 A;  5J8Z A;  1J9W A;  4QSB A;  4Q8Z A;  4BF6 A;  3L14 A;  3RGE A;  1FQL A;  4FVO A;  3MNA A;  3HS4 A;  3EFT A;  4M2W A;  4FRC A;  2W2J A;  3U47 A;  4QEF A;  4PYX A;  1I9P A;  5G01 A;  2X7S A;  3IBI A;  4M2V A;  3RYX B;  3W6H A;  2FOQ A;  4QK3 A;  2OSF A;  2NXT A;  1TEU X;  4ZWI A;  3KKX A;  3GZ0 A;  4L5V A;  2CAB A;  2FOV A;  2QOA A;  4RUX A;  3SBH A;  4YWP A;  5DSI A;  1G3Z A;  4Q06 A;  4HT0 A;  4KP8 A;  4RUY A;  4Q87 A;  4QJX A;  1G0F A;  1CRA A;  2O4Z A;  4ZWY A;  5G03 A;  5FLQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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