4MDMA

Nido-carborane carbonic anhydrase inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carborane-based carbonic anhydrase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4mdmA00
1CNHA 4CQ0A 3DVCA 3RJ7A 1CZMA 1OQ5A 5A25A 5DSPA 3BL0A 4RH2A 1AZMA 1G1DA 3M5SA 2Q38A 3JXFA 4KP8A 3DVDA 4IWZA 1BZMA 3IBNA 4FPTA 3P4VA 4Q0LA 5EOIA 1DMXA 4QSBA 4Q08A 1IF8A 2NXTA 1FLJA 4HEYA 4QJWA 4Q6EA 4BCWA 4Q83A 1H9QA 5E2MA 5E28A 5C8IA 4FL7A 4L5UA 2FMZA 3W6IA 4YGFA 3BL1A 3DBUA 5EH7A 4HT2A 8CA2A 5EH8A 5SZ3A 4MTYA 1ZNCA 3F7UA 2FNKA 5SZ2A 3KS3A 4M2UA 1FQLA 3V7XA 1KEQA 3UYNA 1CAYA 3S76A 3M5TA 3KONA 3D0NA 4RUXA 3M2NA 4HF3A 1ZGEA 3KKXA 5JEGB 4WUPA 2OSMA 3KLDB 1G54A 5FLTA 1BICA 4R59A 4G7AA 4DZ9A 4QSAA 2EZ7A 3M67A 5FLRA 1FSRA 1HVAA 5EKHA 3QYKA 3GZ0A 5JEHB 4ZX0A 1IF5A 4E3FA 5HPJA 3V3FA 2FNMA 1CCSA 3U47A 1ZSCA 1ZSBA 4CNRA 5BNLA 2NWPA 2NN7A 5DSMA 3OIMA 4TWMA 2IT4A 2CABA 1G46A 2QO8A 4ZWIA 3KOKA 3HKNA 3OKVA 3S77B 1EOUA 1CVFA 5E5UA 3RYZA 3DD0A 2NNSA 4E9OX 3JXHC 3M1WA 3V3JA 1LGDA 5DSKA 1G45A 5EKMA 3KIGA 5JESB 4E4AA 2HL4A 2X7UA 4RFDA 1OKNA 2NMXA 1CVEA 5AMLA 3SAXA 1RJ5A 4Q81A 3PJJA 3JXGA 1UGEA 1OKLA 3T83A 1CA3A 4QK1A 1KWQA 1TG9A 2FMGA 4BF1A 1FQMA 1HEAA 1BNUA 3NB5A 2NWZA 5EHVA 3P55A 4E3HA 5DSOA 1CIMA 3V3GB 1RZAA 3MHLA 2ABEA 3MYQA 2FOYA 1J9WA 2NN1A 3MNUA 3S9TA 1CNWA 1FSQA 4KNNA 4E5QA 2Q1BA 2H15A 2HNCA 2CBEA 3RGEA 1CNGA 4DZ7A 3HFPA 4WW6A 3MNHA 5CJFA 1KWRA 1JCZA 1LZVA 1HCAA 3EFTA 1G4JA 3S71B 4Q78A 5JQTA 4RUZA 5G01A 1TG3A 1LUGA 3MNJA 1CRAA 1FR7A 1BV3A 1HUHA 5FNGA 1BN4A 4K0SA 4K13A 4Z1EA 3T5ZA 1RZCA 3N2PA 5JG3B 1TTMA 2NNGA 3IBUA 1CCTA 1TEQX 1THKA 1TEUX 4QTLA 4M2RA 4Q8XA 2OSFA 1DMYA 1CNXA 4K0TA 2WEJA 1CA2A 3M1JA 4Z0QA 4COQA 2WD2A 9CA2A 2EU2A 5FLOA 5FNKA 5JGTB 1YDDA 1CVDA 4RFCA 4E49A 4XE1A 3P5LA 5FDIA 4XFWA 5AMGA 5FNHA 1I9PA 4RUYA 2WEOA 4FU5A 4ZWXA 2CBDA 4Q7WA 1LG6A 3IEOA 1CAIA 1Z97A 2CA2A 4ZX1A 1BNWA 4JSWA 3F7BA 1DCAA 2HKKA 4ZAOA 4XZ5A 3DCWA 3MZCA 3SBHA 3T82A 1CAMA 3RLDA 1G53A 5SZ0A 1CNYA 4UOVA 3LXEA 5EH5A 3VBDA 3S78B 3EFIA 5EIJA 1H4NA 1KOQA 1YDBA 2POVA 5BRWA 3MNIA 1TE3X 3DC9A 4L5VA 4Q7VA 3C7PA 4YHAA 4KAPA 4ITOA 5DSNA 1TBTX 4QEFA 4YYTA 5FNIA 1CNCA 3B1BA 4Q09A 3RYXB 1BNMA 2GEHA 2FW4A 1ZFKA 1MUAA 3PO6A 4MO8A 4WR7A 3R17B 4CACA 2GD8A 3M2XA 3MNKA 1Z9YA 2H4NA 4M2WA 5JQ0A 4GL1X 4MDMA 3CA2A 4Q6DA 4CNWA 1XEVA 1Y7WA 4QSIA 1CCUA 3Q31A 7CA2A 3V3HB 4QJOA 1YDAA 1RAYA 1CAHA 1BCDA 1UGFA 4CNXA 5DSIA 4FRCA 4JS6A 4LU3A 3D93A 3M3XA 2NWYA 4N0XB 1CVAA 1TB0X 4HEZA 3S74B 4PYYA 3IBIA 4YXUA 1DCBA 4HEWA 5FDCA 1CILA 1CAOA 2VVBX 3K2FA 4L5WA 4LP6A 1LG5A 5G0BA 1YO2A 3DV7A 1HCBA 4KNJA 6CA2A 4M2VA 1I8ZA 3M2ZA 1CNIA 4KNMA 4Q87A 4FIKA 1XEGA 3D92A 4FVNA 3S75B 4QSJA 4QK2A 5DSLA 3S8XA 4Q8ZA 3IGPA 3OILA 3P5AA 3MWOA 1UGAA 4Y0JA 3OIKA 1IF4A 3KWAA 5EZTX 1G6VA 1BN1A 3M96A 4E3GA 3M2YA 3TMJA 3D8WA 12CAA 5DOGA 4HBAA 3DCCA 4YX4A 5DOHA 4ZWZA 5DSJA 1RZBA 1G48A 4YXIA 1BNVA 3HS4A 4CA2A 1CNKA 4YGKA 5FLQA 1FSNA 1I90A 4CNVA 3DA2A 5DRSA 1Z93A 3R16A 3OYSA 3PYKA 1I91A 4ITPA 5FLPA 3NJ9A 5CLUA 5E2RA 3FFPX 5SZ5A 5E2KA 3CAJA 3ZNCA 4KUYA 5E5RA 4RIUA 4R5AA 3N0NA 3SBIA 5JGSB 1HUGA 3FE4A 4Z1KA 1G3ZA 1FQNA 4K1QA 2HOCA 3V2MA 5BRVA 1YO1A 2Q1QA 1T9NA 3L14A 2NXRA 5FLSA 3W6HA 4JSAA 3F8EA 3M5EA 3UYQA 3M98A 5JDVB 3M1QA 1BN3A 1JD0A 3T5UA 1XPZA 2ZNCA 4ILXA 3HKTA 4YGNA 3RZ5A 3CYUA 5FNLA 4HT0A 3M1KA 4ETQC 1HECA 3RZ7A 2AW1A 4BF6A 1FQRA 4MDGA 4ZWYA 4YWPA 3KNEA 4RN4A 3U45X 5SZ7A 1ZSAA 4XIWA 2WEGA 1I9LA 1HEBA 3BETA 3P3JA 2X7TA 3TVNX 5SZ4A 4LHIA 4MDLA 5L6KA 2EU3A 3U3AX 3P44A 5SZ1A 2CBCA 4PYXA 3V3IB 1ZGFA 4KNIA 4KUVA 4QY3A 3MHMA 3U7CA 4E3DA 5CACA 1UGBA 4IDRX 1I9NA 2HFWA 2WD3A 1CAZA 3RZ0B 1CAJA 1IF6A 4MLXA 4QJXA 4Q90A 3B4FA 1BNNA 1CNJA 3MHIA 4HU1A 2POUA 4PZHA 4QJMA 4Z1JA 1I9QA 3MHCA 4Q7PA 3FW3A 1RZDA 3OKUA 1CINA 1G52A 2FOUA 2F14A 3V5GA 1CRMA 3HKUA 1CVHA 3IAIA 5BRUA 4KV0A 3S73B 1OKMA 1YDCA 1XQ0A 3MNAA 5CA2A 1JV0A 4C3TA 4XIXA 1IF9A 3ML5A 3HLJA 4KP5A 4K0ZA 1ZH9A 4JSSA 1YO0A 2QP6A 3K34A 1MOOA 5E2NA 3N3JA 1I9OA 5FL6A 1FR4A 4X5SA 5EHEA 3DCSA 4R5BA 1RZEA 3NI5A 5FNMA 1A42A 4Q7SA 5JG5B 1RJ6A 1URTA 3M14A 4QIYA 1I9MA 5DVXA 2X7SA 5FL4A 1G0EA 4N16A 1UGGA 2FNNA 2QOAA 5EKJA 1BNQA 2AX2A 1CVBA 3SAPA 1IF7A 3MMFA 5E2SA 3MDZA 3IBLA 4Q9YA 4Z1NA 1CVCA 5SZ6A 1V9EA 4PQ7A 1RAZA 5BYIA 4Q99A 5EHWA 2FOQA 4PXXA 2POWA 2FOVA 1CALA 1G4OA 2NWOA 3RG3A 1HEDA 3OYQA 4MLTA 3OY0A 4RIVA 1CNBA 3RG4A 3N4BA 4KUWA 3P58A 5J8ZA 1ZE8A 4YXOA 3F4XA 3RZ8A 4FVOA 1AVNA 1AM6A 5DSQA 3T84A 1BNTA 1H9NA 5JEPB 1F2WA 4Q8YA 3DC3A 2NXSA 4YGJA 4G0CA 2NNOA 3DAZA 3T85A 3ML2A 3M04A 1UGCA 2CBAA 1G0FA 1V9IC 1CAKA 3RZ1B 4WW8A 2CBBA 5L3OA 4QIZA 1ZFQA 2NNVA 4WL4A 2WEHA 3V2JA 3DD8A 4Q49A 3HKQA 2HD6A 4QJPA 3K7KA 4YGLA 3DVBA 2FOSA 3D9ZA 2VVAX 5LMDA 4WUQA 5FL5A 3S72B 3TVOX 3KOIA 5G0CA 3RYJB 3S97A 1TH9A 5AMDA 3ZP9A 1UGDA 5DSRA 4YVYA 2O4ZA 4QK3A 3RYVB 5IPZA 1KOPA 5FNJA 1CANA 2W2JA 4TWLA 3MHOA 5G03A 4Q07A 2ILIA 3RYYA 5A6HA 3M40A 3CZVA 4JSZA 4Q06A 3P3HA 4QJ0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CNH A;  4CQ0 A;  3DVC A;  3RJ7 A;  1CZM A;  1OQ5 A;  5A25 A;  5DSP A;  3BL0 A;  4RH2 A;  1AZM A;  1G1D A;  3M5S A;  2Q38 A;  3JXF A;  4KP8 A;  3DVD A;  4IWZ A;  1BZM A;  3IBN A;  4FPT A;  3P4V A;  4Q0L A;  5EOI A;  1DMX A;  4QSB A;  4Q08 A;  1IF8 A;  2NXT A;  1FLJ A;  4HEY A;  4QJW A;  4Q6E A;  4BCW A;  4Q83 A;  1H9Q A;  5E2M A;  5E28 A;  5C8I A;  4FL7 A;  4L5U A;  2FMZ A;  3W6I A;  4YGF A;  3BL1 A;  3DBU A;  5EH7 A;  4HT2 A;  8CA2 A;  5EH8 A;  5SZ3 A;  4MTY A;  1ZNC A;  3F7U A;  2FNK A;  5SZ2 A;  3KS3 A;  4M2U A;  1FQL A;  3V7X A;  1KEQ A;  3UYN A;  1CAY A;  3S76 A;  3M5T A;  3KON A;  3D0N A;  4RUX A;  3M2N A;  4HF3 A;  1ZGE A;  3KKX A;  5JEG B;  4WUP A;  2OSM A;  3KLD B;  1G54 A;  5FLT A;  1BIC A;  4R59 A;  4G7A A;  4DZ9 A;  4QSA A;  2EZ7 A;  3M67 A;  5FLR A;  1FSR A;  1HVA A;  5EKH A;  3QYK A;  3GZ0 A;  5JEH B;  4ZX0 A;  1IF5 A;  4E3F A;  5HPJ A;  3V3F A;  2FNM A;  1CCS A;  3U47 A;  1ZSC A;  1ZSB A;  4CNR A;  5BNL A;  2NWP A;  2NN7 A;  5DSM A;  3OIM A;  4TWM A;  2IT4 A;  2CAB A;  1G46 A; 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